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基于转录组的油茶DHHC型锌指蛋白基因家族的鉴定及分析被引量：2: 1; 作者徐嘉娟朱亚艳 +2 位作者李芳许杰王港《西北林学院学报》 CSCD 北大核心 2022年第1期81-88,共8页; DHHC型锌指蛋白参与细胞内蛋白质的棕榈酰化修饰,对植物的生长发育、器官形成、生殖发育及胁迫响应等生命活动具有重要的调控作用。基于油茶叶片转录组数据,筛选出23个DHHC型锌指蛋白基因,应用生物信息学方法对其蛋白理化性质、结构域... 展开更多; 关键词油茶 dhhc型锌指蛋白家族蛋白质酰基转移酶生物信息学分析; 在线阅读下载PDF 职称材料

冷胁迫下普通油茶CCCH型锌指蛋白基因家族的鉴定和分析被引量：2: 2; 作者邢凯峰姚杏子 +5 位作者周军谢昊星陈容平赵耀戎俊张剑《经济林研究》北大核心 2024年第1期11-19,共9页; 【目的】为挖掘和利用耐寒普通油茶Camellia oleifera遗传资源提供参考。【方法】基于普通油茶的冷胁迫转录组数据,对其CCCH型锌指蛋白基因进行鉴定,并对CCCH型锌指蛋白进行理化性质分析、系统发育分析、保守结构域预测、二级结构预测... 展开更多; 关键词普通油茶 CCCH型锌指蛋白基因家族生物信息学分析冷胁迫转录组; 在线阅读下载PDF 职称材料

核桃Q型C2H2锌指蛋白基因家族全基因组鉴定及表达分析被引量：2: 3; 作者马乃膺雒宏佳 +5 位作者李建红辛国张瑞王双成张仲兴王延秀《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第6期920-934,共15页; 【目的】Q型C2H2锌指蛋白在植物抵抗非生物胁迫中起重要作用。为深入了解核桃Q型C2H2锌指蛋白基因家族在核桃全基因组中的特征,对核桃Q型C2H2锌指蛋白(JrZFP)基因家族进行全基因组鉴定与分析,并研究其在核桃干旱和盐胁迫应答过程中的表... 展开更多; 关键词核桃 Q型C2H2锌指蛋白基因家族基因表达; 在线阅读下载PDF 职称材料

油棕C2H2基因家族鉴定及低温胁迫下的表达分析被引量：2: 4; 作者程秋如刘子凡曾宪海《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2023年第3期453-467,共15页; C2H2型锌指蛋白是最常见的锌指蛋白之一,广泛存在于真核生物中,在植物的生长发育、盐、低温、干旱胁迫等非生物胁迫响应中扮演重要作用。本研究以拟南芥C2H2氨基酸序列作为探针,在油棕基因组数据库中进行本地BLASTP比对和保守结构域预... 展开更多; 关键词油棕 C2H2型锌指蛋白基因家族低温胁迫; 在线阅读下载PDF 职称材料

腓骨肌萎缩症合并小脑性共济失调的临床及遗传学特点被引量：1: 5; 作者朱啸巍钟平 +1 位作者曹立栾兴华《上海交通大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2023年第3期350-357,共8页; 腓骨肌萎缩症(Charcot-Marie-Tooth disease,CMT)是一组以周围神经病变为主的遗传性运动感觉神经病。主要临床症状包括进行性对称性肢体远端无力、萎缩、感觉障碍和腱反射减退或消失。根据神经电生理表现和病理特点,CMT可分为以脱髓鞘... 展开更多; 关键词腓骨肌萎缩症小脑性共济失调基因突变神经丝蛋白轻链 MORC家族CW型锌指结构蛋白2; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名基于转录组的油茶DHHC型锌指蛋白基因家族的鉴定及分析被引量：2: 1; 作者徐嘉娟朱亚艳李芳许杰王港; 机构贵州省林业科学研究院; 出处《西北林学院学报》 CSCD 北大核心 2022年第1期81-88,共8页; 基金贵州省科技计划项目(黔科合服企[2018]4003) 油茶果皮厚度控制分子机理研究(黔科合平台人才[2019]5643) 特色林业产业项目(特林研2020-15)。; 文摘 DHHC型锌指蛋白参与细胞内蛋白质的棕榈酰化修饰,对植物的生长发育、器官形成、生殖发育及胁迫响应等生命活动具有重要的调控作用。基于油茶叶片转录组数据,筛选出23个DHHC型锌指蛋白基因,应用生物信息学方法对其蛋白理化性质、结构域、系统进化等进行了分析。结果表明,23个DHHC型锌指蛋白的序列大小为195~725 aa,均包含一个保守的DHHC-CRD结构域,大部分DHHC型锌指蛋白具有4个跨膜区,主要定位于细胞核和细胞膜中。系统进化分析将其分为4类,与拟南芥和水稻均有不同程度的同源关系,DHHC型锌指蛋白在不同物种间具有遗传保守性。23个DHHC型锌指蛋白基因在结实量大和结实量小的单株的不同发育时期叶片中均有不同程度的表达。CoDHHC9、CoDHHC13、CoDHHC22在油茶抽梢生长期的叶片中表达上调;CoDHHC6、CoDHHC12、CoDHHC18、CoDHHC23在花芽分化时期和果实成熟时期的叶片中表达量较高,且在结实量较小而开花较多的单株中表达上调更为明显,这些基因可能参与油茶花芽分化及花朵发育过程;CoDHHC5、CoDHHC11、CoDHHC15在不同时期的叶片中表达量均较低。研究结果为进一步对油茶DHHC型锌指蛋白家族基因的克隆和功能分析提供依据,有助于进一步研究该基因家族在油茶生殖发育中的调控功能。; 关键词油茶 dhhc型锌指蛋白家族蛋白质酰基转移酶生物信息学分析; Keywords Camellia oleifera dhhc-type zinc finger protein family protein S-acyltransferases(PAT) bioinformation analysis; 分类号 S794.4 [农业科学—林木遗传育种]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名冷胁迫下普通油茶CCCH型锌指蛋白基因家族的鉴定和分析被引量：2: 2; 作者邢凯峰姚杏子周军谢昊星陈容平赵耀戎俊张剑; 机构南昌大学生命科学学院; 出处《经济林研究》北大核心 2024年第1期11-19,共9页; 基金国家自然科学基金项目(32260306,32270238)。; 文摘【目的】为挖掘和利用耐寒普通油茶Camellia oleifera遗传资源提供参考。【方法】基于普通油茶的冷胁迫转录组数据,对其CCCH型锌指蛋白基因进行鉴定,并对CCCH型锌指蛋白进行理化性质分析、系统发育分析、保守结构域预测、二级结构预测等相关生物信息学分析,并以庐山高海拔油茶(LSG)和栽培油茶品种赣无1(GW1)为材料,对CCCH型锌指蛋白基因在冷胁迫下的表达情况进行分析。【结果】在普通油茶的冷胁迫转录组数据中共鉴定到24个CCCH型锌指蛋白基因,参考水稻分类方法,将24个CCCH型锌指蛋白聚类到2个亚家族中。保守基序分析结果表明,在24个基因中仅有3种CCCH型锌指蛋白基序类型,即C-X8-C-X5-C-X3-H、C-X7-C-X5-C-X3-H和C-X5-C-X4-C-X3-H,数目分别为92、4和4。转录组表达谱分析结果表明:在野外冷胁迫试验中CoC3H17基因在D4、D5和D6时期的表达量高于D1、D2和D3时期,在室内冷胁迫试验中庐山高海拔油茶和赣无1的CoC3H17基因一直表现为更高的转录本丰度;CoC3H14和CoC3H24基因在野外试验的D4、D5和D6时期均表现为表达量明显上升,且在室内冷胁迫试验中庐山高海拔油茶的这2个基因的表达量高于赣无1。【结论】CoC3H17、CoC3H14和CoC3H24基因可能是普通油茶应对冷胁迫的关键基因。; 关键词普通油茶 CCCH型锌指蛋白基因家族生物信息学分析冷胁迫转录组; Keywords Camellia oleifera CCCH type zinc finger protein gene family bioinformatics analysis cold stress transcriptome; 分类号 S602.4 [农业科学—园艺学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名核桃Q型C2H2锌指蛋白基因家族全基因组鉴定及表达分析被引量：2: 3; 作者马乃膺雒宏佳李建红辛国张瑞王双成张仲兴王延秀; 机构甘肃农业大学园艺学院甘肃省林业科学技术推广总站陇南市经济林研究院核桃研究所; 出处《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第6期920-934,共15页; 基金中央财政林业科技推广示范项目(2020ZYFG22) 甘肃省林业和草原科技创新项目(KJCX202004) 甘肃省科技重大专项计划(18ZD2NA006-5)。; 文摘【目的】Q型C2H2锌指蛋白在植物抵抗非生物胁迫中起重要作用。为深入了解核桃Q型C2H2锌指蛋白基因家族在核桃全基因组中的特征,对核桃Q型C2H2锌指蛋白(JrZFP)基因家族进行全基因组鉴定与分析,并研究其在核桃干旱和盐胁迫应答过程中的表达模式。【方法】利用生物信息学方法鉴定了核桃全基因组中的Q型C2H2锌指蛋白基因家族成员,并对其理化性质、染色体定位、进化关系和基因结构进行分析;根据JrZFP基因家族进化树随机挑选15个JrZFP基因,并通过实时荧光定量PCR(real-time quantitative PCR,qRT-PCR)方法检测15个基因在干旱和盐胁迫下的响应特性。【结果】在核桃中共鉴定出82个Q型C2H2锌指蛋白基因,其蛋白质序列长度介于59~636个氨基酸之间,亚细胞定位主要位于细胞核中;该基因家族成员不均匀分布在15条染色体上,其中有11对JrZFPs基因为串联重复基因,63个JrZFP基因参与片段重复事件;基因结构分析表明,75个JrZFP基因无内含子,其余成员含有1~10个外显子;上游启动子区分析发现,该基因家族成员含有参与逆境胁迫和激素响应相关的顺式作用元件。表达分析结果显示,在盐胁迫下15个JrZFP基因均显著上调,以JrZFP55最为明显,推测JrZFP55在核桃NaCl胁迫中起正向调节作用;在干旱胁迫下15个JrZFP基因中上调6个,其中JrZFP12上调最为显著,下调9个,以JrZFP4、JrZFP55和JrZFP57下调程度最大,推测这3个基因在核桃干旱胁迫中起负调控作用。【结论】核桃全基因组中有82个JrZFP家族成员都具有Q型C2H2锌指蛋白典型结构域,且通过qRT-PCR对随机挑选基因进行分析以发现可能参与干旱和盐胁迫的JrZFPs基因,为深入研究核桃JrZFP参与干旱胁迫和盐胁迫提供理论依据。; 关键词核桃 Q型C2H2锌指蛋白基因家族基因表达; Keywords Walnut Q-type C2H2 gene family Gene expression; 分类号 S664.1 [农业科学—果树学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名油棕C2H2基因家族鉴定及低温胁迫下的表达分析被引量：2: 4; 作者程秋如刘子凡曾宪海; 机构中国热带农业科学院橡胶研究所/农业农村部儋州油棕种质资源圃/海南省油棕种质资源圃/农业农村部儋州热带作物科学观测实验站海南大学热带作物学院; 出处《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2023年第3期453-467,共15页; 基金农业农村部品种改良提升专项(No.NYPZ2020108) 农业农村部热带作物种质资源保护项目“油棕种质资源保护”(No.18210007)。; 文摘 C2H2型锌指蛋白是最常见的锌指蛋白之一,广泛存在于真核生物中,在植物的生长发育、盐、低温、干旱胁迫等非生物胁迫响应中扮演重要作用。本研究以拟南芥C2H2氨基酸序列作为探针,在油棕基因组数据库中进行本地BLASTP比对和保守结构域预测分析,筛选出油棕C2H2型锌指蛋白家族成员,利用生物信息学手段对基因家族成员的理化性质、进化关系、染色体位置、基因结构、保守基序和启动子顺式元件进行分析,并利用转录组数据和荧光定量PCR方法分析EgC2H2基因家族成员在低温胁迫下的表达情况。结果显示:从油棕基因组中共鉴定出73个C2H2型锌指蛋白家族成员,EgC2H2家族成员氨基酸的数目为128~556个,分子量为14176.73~58983.30 Da,等电点为4.99~9.62,不稳定系数为38.84~86.01,亲水性为–1.154~-0.226,亚细胞定位显示C2H2基因家族所有成员均定位于细胞核;系统进化树分析显示EgC2H2家族成员可以分为4个亚家族,EgC2H2家族成员多数归类于第Ⅰ亚家族和第Ⅱ亚家族,且同一亚家族成员的结构域具有较高的一致性;染色体定位结果显示,EgC2H2家族成员不均匀地分布于油棕的16条染色体上;启动子顺式元件分析显示,EgC2H2家族包含许多光响应元件、植物激素响应元件和逆境胁迫响应元件;转录组数据分析显示,大部分EgC2H2基因响应低温胁迫,且大多数EgC2H2基因在耐寒材料中高表达,在冷敏感材料中低表达;荧光定量PCR分析显示,EgC2H2-23、EgC2H2-11、EgC2H2-19、EgC2H2-17和EgC2H2-21显著上调表达,且在耐寒材料中的表达量显著高于冷敏感材料,推测这些基因可能在油棕低温响应中发挥关键作用,可以作为候选基因进一步深入研究。本研究为深入研究油棕C2H2基因家族功能提供理论参考。; 关键词油棕 C2H2型锌指蛋白基因家族低温胁迫; Keywords oil palm C2H2 zinc finger protein gene family low temperature stress; 分类号 S565.9 [农业科学—作物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名腓骨肌萎缩症合并小脑性共济失调的临床及遗传学特点被引量：1: 5; 作者朱啸巍钟平曹立栾兴华; 机构上海交通大学医学院附属第六人民医院神经内科安徽医科大学附属宿州医院神经内科; 出处《上海交通大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2023年第3期350-357,共8页; 基金国家自然科学基金(81870889,82071258)。; 文摘腓骨肌萎缩症(Charcot-Marie-Tooth disease,CMT)是一组以周围神经病变为主的遗传性运动感觉神经病。主要临床症状包括进行性对称性肢体远端无力、萎缩、感觉障碍和腱反射减退或消失。根据神经电生理表现和病理特点,CMT可分为以脱髓鞘为主的CMT1型和轴索病变为主的CMT2型。除了周围神经系统病变外,CMT部分表型可同时累及中枢神经系统或其他脏器;其中小脑系统受累的CMT患者同时合并小脑性共济失调,可见于神经丝蛋白轻链(neurofilament light chain,NEFL)基因突变所致的CMT1F型和CMT2E型,MORC家族CW型锌指结构蛋白2 (MORC family CW-type zinc finger 2,MORC2)基因突变所致的CMT2Z型,溶质载体家族25成员46 (solute carrier family 25 member 46,SLC25A46)基因突变所致的伴视神经萎缩的CMT6B型,以及多核苷酸激酶3′-磷酸酶(polynucleotide kinase 3′-phosphatase,PNKP)基因突变所致的CMT2B2型等。近年来,CMT重叠表型成为研究的热点,其中CMT合并小脑性共济失调具有高度临床异质性和遗传异质性,临床上易发生误诊。该文就合并小脑性共济失调的CMT表型的临床及遗传学特点进行综述,旨在为该类患者的早期诊断和治疗提供参考。; 关键词腓骨肌萎缩症小脑性共济失调基因突变神经丝蛋白轻链 MORC家族CW型锌指结构蛋白2; Keywords Charcot-Marie-Tooth disease(CMT) cerebellar ataxia gene mutation neurofilament light chain(NEFL) MORC family CW-type zinc finger 2(MORC2); 分类号 R746.4 [医药卫生—神经病学与精神病学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

	题名	作者	出处	发文年	被引量	操作
1	基于转录组的油茶DHHC型锌指蛋白基因家族的鉴定及分析	徐嘉娟朱亚艳李芳许杰王港	《西北林学院学报》 CSCD 北大核心	2022	2	在线阅读下载PDF 职称材料
2	冷胁迫下普通油茶CCCH型锌指蛋白基因家族的鉴定和分析	邢凯峰姚杏子周军谢昊星陈容平赵耀戎俊张剑	《经济林研究》北大核心	2024	2	在线阅读下载PDF 职称材料
3	核桃Q型C2H2锌指蛋白基因家族全基因组鉴定及表达分析	马乃膺雒宏佳李建红辛国张瑞王双成张仲兴王延秀	《果树学报》 CAS CSCD 北大核心	2022	2	在线阅读下载PDF 职称材料
4	油棕C2H2基因家族鉴定及低温胁迫下的表达分析	程秋如刘子凡曾宪海	《热带作物学报》 CSCD 北大核心	2023	2	在线阅读下载PDF 职称材料
5	腓骨肌萎缩症合并小脑性共济失调的临床及遗传学特点	朱啸巍钟平曹立栾兴华	《上海交通大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心	2023	1	在线阅读下载PDF 职称材料