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用于研制柑橘DArT芯片的DNA探针文库的制备
被引量:
1
1
作者
马香
刘小刚
+1 位作者
李利改
周志钦
《西南大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第12期1-8,共8页
以柑橘属Swingle分类系统界定的16种柑橘物种的基因组DNA为材料,构建了研制柑橘DArT芯片的DNA探针文库,进而从中随机挑选出15 000条探针用于柑橘DArT芯片的开发.柑橘物种的基因组DNA采用改良CTAB法提取并等量混合,经Eco RI和Mse I双酶...
以柑橘属Swingle分类系统界定的16种柑橘物种的基因组DNA为材料,构建了研制柑橘DArT芯片的DNA探针文库,进而从中随机挑选出15 000条探针用于柑橘DArT芯片的开发.柑橘物种的基因组DNA采用改良CTAB法提取并等量混合,经Eco RI和Mse I双酶切后连接接头序列,再使用选择性引物进行PCR扩增,并将扩增产物转化大肠杆菌,构建探针文库.从探针文库中随机挑选出15 000个阳性单克隆,通过PCR扩增和纯化获得了15 000条用于制备DArT芯片的DNA探针.凝胶电泳检测显示所制备的DNA探针的纯度和浓度均满足了研制DArT芯片的要求.为采用DArT芯片快速鉴定柑橘物种并研究其进化关系奠定了基础.
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关键词
柑橘属
dart芯片
探针
文库
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职称材料
长江中下游麦区小麦地方种质千粒重全基因组关联分析
被引量:
1
2
作者
程宇坤
李健
+7 位作者
姚方杰
蒋云峰
江千涛
李伟
蒲至恩
邓梅
魏育明
陈国跃
《四川农业大学学报》
CSCD
北大核心
2019年第4期434-441,458,共9页
【目的】高产是小麦育种的永恒主题,千粒重是产量构成的三因子之一。因此,发掘控制小麦千粒重QTL(quantitative trait loci)区段及其优异等位变异,对利用分子标记辅助选择进行小麦产量性状的遗传改良具有重要意义。【方法】以来自长江...
【目的】高产是小麦育种的永恒主题,千粒重是产量构成的三因子之一。因此,发掘控制小麦千粒重QTL(quantitative trait loci)区段及其优异等位变异,对利用分子标记辅助选择进行小麦产量性状的遗传改良具有重要意义。【方法】以来自长江中下游麦区188份小麦地方种质为材料,在3个环境下对小麦千粒重进行表型鉴定;利用DArT芯片(diversity arrays technology)进行全基因组扫描,基于一般线性模型(Q+K)对小麦千粒重进行关联分析。【结果】千粒重表型鉴定发现来自江苏、浙江和湖北小麦地方种质具有较高千粒重;通过全基因关联分析,共获得8个DArT标记在2个及以上的环境中均与小麦千粒重显著关联,分布于小麦染色体1B、1D、3B、4B和5B上,其表型贡献率9.19%~12.65%。【结论】长江中下游麦区小麦地方种质千粒重表型变异丰富;在不同环境中均能关联到的标记为较为稳定的控制小麦千粒重位点。
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关键词
千粒重
关联分析
小麦地方种质
dart芯片
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职称材料
题名
用于研制柑橘DArT芯片的DNA探针文库的制备
被引量:
1
1
作者
马香
刘小刚
李利改
周志钦
机构
西南大学园艺园林学院
出处
《西南大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第12期1-8,共8页
基金
国家自然科学基金项目(NSFC31171930)
西南大学博士基金项目(SWU111028)
中央高校基本科研业务费专项资金项目(XDJK2013C027)
文摘
以柑橘属Swingle分类系统界定的16种柑橘物种的基因组DNA为材料,构建了研制柑橘DArT芯片的DNA探针文库,进而从中随机挑选出15 000条探针用于柑橘DArT芯片的开发.柑橘物种的基因组DNA采用改良CTAB法提取并等量混合,经Eco RI和Mse I双酶切后连接接头序列,再使用选择性引物进行PCR扩增,并将扩增产物转化大肠杆菌,构建探针文库.从探针文库中随机挑选出15 000个阳性单克隆,通过PCR扩增和纯化获得了15 000条用于制备DArT芯片的DNA探针.凝胶电泳检测显示所制备的DNA探针的纯度和浓度均满足了研制DArT芯片的要求.为采用DArT芯片快速鉴定柑橘物种并研究其进化关系奠定了基础.
关键词
柑橘属
dart芯片
探针
文库
Keywords
Citrus
dart
array
probe
library
分类号
S666 [农业科学—果树学]
S602.3 [农业科学—园艺学]
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职称材料
题名
长江中下游麦区小麦地方种质千粒重全基因组关联分析
被引量:
1
2
作者
程宇坤
李健
姚方杰
蒋云峰
江千涛
李伟
蒲至恩
邓梅
魏育明
陈国跃
机构
四川农业大学小麦研究所
四川农业大学农学院
出处
《四川农业大学学报》
CSCD
北大核心
2019年第4期434-441,458,共9页
基金
国家重点研发计划(2016YFD0102000)
四川省科技厅国际科技创新合作项目(2019YFH0063)
文摘
【目的】高产是小麦育种的永恒主题,千粒重是产量构成的三因子之一。因此,发掘控制小麦千粒重QTL(quantitative trait loci)区段及其优异等位变异,对利用分子标记辅助选择进行小麦产量性状的遗传改良具有重要意义。【方法】以来自长江中下游麦区188份小麦地方种质为材料,在3个环境下对小麦千粒重进行表型鉴定;利用DArT芯片(diversity arrays technology)进行全基因组扫描,基于一般线性模型(Q+K)对小麦千粒重进行关联分析。【结果】千粒重表型鉴定发现来自江苏、浙江和湖北小麦地方种质具有较高千粒重;通过全基因关联分析,共获得8个DArT标记在2个及以上的环境中均与小麦千粒重显著关联,分布于小麦染色体1B、1D、3B、4B和5B上,其表型贡献率9.19%~12.65%。【结论】长江中下游麦区小麦地方种质千粒重表型变异丰富;在不同环境中均能关联到的标记为较为稳定的控制小麦千粒重位点。
关键词
千粒重
关联分析
小麦地方种质
dart芯片
Keywords
thousand kernel weight
genome-wide association analysis
wheat landraces
dart
-seq
分类号
S326 [农业科学—作物遗传育种]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
用于研制柑橘DArT芯片的DNA探针文库的制备
马香
刘小刚
李利改
周志钦
《西南大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2015
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
长江中下游麦区小麦地方种质千粒重全基因组关联分析
程宇坤
李健
姚方杰
蒋云峰
江千涛
李伟
蒲至恩
邓梅
魏育明
陈国跃
《四川农业大学学报》
CSCD
北大核心
2019
1
在线阅读
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职称材料
已选择
0
条
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引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
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