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题名黄瓜霜霉病抗性相关基因的AFLP标记
被引量：12
- 1
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作者
张素勤
顾兴芳
张圣平
王晓武
邹志荣
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机构
中国农业科学院蔬菜花卉研究所
贵州大学农学院
西北农林科技大学园艺学院
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出处
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第7期1320-1324,共5页
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基金
国家863项目(2001AA241121
2002AA24401
+1 种基金
2003AA207120)
农业部重点实验室项目
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文摘
运用AFLP技术,采用集群分析法研究与黄瓜霜霉病抗性基因相关的分子标记.结果表明,在F2群体中E25M63-103标记与霜霉病病情指数的相关系数(0.337)和回归分析的F值(20.98)都达到了极显著水平.用E25M63-103标记对国内外的其它27份黄瓜材料进行检测,该标记与霜霉病病情指数的相关系数为0.555,也达到极显著相关水平,进一步证明该标记与控制黄瓜霜霉病感病的相关基因是连锁的.E25M63-103片段长度为103bp,通过BLAST查询,该片段的同源性较小,表明E25M63-103标记可能是黄瓜基因组特有的一段DNA序列.
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关键词
黄瓜
霜霉病
抗性
aflp
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Keywords
cucumber （cucumis sativus l.）
downy mildew
resistance
aflp
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分类号
Q789
[生物学—分子生物学]
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题名黄瓜AFLP反应体系的优化
被引量：3
- 2
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作者
张素勤
顾兴芳
张圣平
王晓武
邹志荣
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机构
中国农业科学院蔬菜花卉研究所
西北农林科技大学园艺学院
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出处
《西北农业学报》
CSCD
北大核心
2008年第3期271-273,共3页
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基金
国家863资助项目(2001AA2411212002AA244012003AA207120)
农业部重点实验室项目
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文摘
对影响AFLP(Amplified fragment length polymorphism)扩增的关键因素进行了摸索,以期获得清晰稳定的黄瓜AFLP反应体系。结果发现,最佳的预扩增体系为:20反应体系中包含0.5 UTaqDNA poly-merase、2.0μL dNTP(2 mmol/L)、1.2μL 25 mmol/L Mg2+、0.6μL 50 ng/μL每种引物、1×PCR Buffer和4μL模板DNA;最优的选择性扩增体系为20μL反应体系中含有1.0 UTaqDNA polymerase、2.0μL dNTP(2 mmol/L)、1.0μL 25 mmol/L Mg2+、1.0μL 50 ng/μL每种引物、3.0μL稀释40倍的预扩增产物和1×PCR Buffer。体系优化后,扩增产物稳定,条带十分清晰,无背景干扰。
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关键词
黄瓜
aflp
反应体系
优化
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Keywords
cucumber（cucumis sativus l）,aflp,reaction system,optimization
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分类号
S642.2
[农业科学—蔬菜学]
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题名黄瓜基因组DNA提取及AFLP体系优化研究
被引量：5
- 3
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作者
宋晓飞
李晓丽
冯志红
闫立英
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机构
河北科技师范学院
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出处
《安徽农业科学》
CAS
北大核心
2009年第29期14035-14037,共3页
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基金
河北省自然基金项目(C2007000725)
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文摘
[目的]提取黄瓜基因组DNA,并对AFLP体系进行优化。[方法]以黄瓜嫩叶为材料,利用改进的CTAB法提取高质量的黄瓜叶片总DNA,通过优化酶切连接、预扩增、选择性扩增等试验条件建立适合黄瓜的AFLP银染体系,得到清晰的黄瓜AFLP指纹图谱。[结果]DNA模板的质量影响酶切以及后续的连接扩增反应,改良的CTAB提取法可用于黄瓜AFLP分析,形成清晰的AFLP指纹。优化的酶切连接体系为:以37℃酶切连接12 h为宜,酶切连接的基因组DNA用量为200ng,预扩增时Taq酶用量为0.5U/20μl体系,预扩增产物稀释40倍作为选择性扩增的模板。在此优化的体系下引物E41M47扩增出清晰的条带。[结论]为黄瓜品种的分子标记和黄瓜品种间亲缘关系等研究奠定了基础。
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关键词
黄瓜
DNA提取
aflp反应体系
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Keywords
cucumber（ Cucnmis sativus l. ）
Extraction of DNA
aflp reaction system
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分类号
S642.2
[农业科学—蔬菜学]
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题名利用AFLP标记鉴别黄瓜栽培品种的亲缘关系
被引量：1
- 4
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作者
李丽
郑晓鹰
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机构
北京市农林科学院蔬菜研究中心
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出处
《中国蔬菜》
北大核心
2006年第B10期63-67,共5页
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基金
北京市科委成果转化基金（02EFN211101004）
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文摘
利用AFLP分子标记技术对78个黄瓜栽培品种进行亲缘关系分析。获得1个扩增条带清晰丰富、多态性极高的引物组合，此对引物可将78个黄瓜品种完全区分开来。采用全联法进行遗传聚类分析，以欧氏距离系数4为阈值，将78个黄瓜品种分为五大类。第一类是津研、津春、津优系列等；第二类多数是长春密刺和津研4号血缘的品种，瓜瘦长、刺瘤明显、肉质较脆；第三类主要是东北的旱黄瓜；第四类是含荷兰温室和日本少刺型遗传背景的杂交种；第五类多为保护地密刺型。
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关键词
黄瓜
指纹图谱
亲缘关系
aflp
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Keywords
cucumber（ cucumis sativus l. ）, Fingerprint,Genetic relationship, aflp
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分类号
S68
[农业科学—观赏园艺]
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题名黄瓜果实扩张蛋白基因克隆与分析(英文)
被引量：3
- 5
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作者
孙涌栋
张兴国
罗未蓉
李新峥
刘遵春
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机构
河南科技学院园林学院
西南大学园艺园林学院
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出处
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第2期233-236,共4页
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基金
国家“863”计划项目(2003AA207120)
教育部优秀青年教师资助计划项目[教育司(2003)355号]资助
河南科技学院重点科研项目资助基金(6011)
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文摘
以非单性结实的全雌黄瓜为实验材料,利用cDNA-AFLP技术比较了授粉前后黄瓜幼果的基因表达差异。以ASE-AT/TAQ-CAG为引物对从授粉后黄瓜幼果组织中分离到1条特异片段,该片段仅在授粉后黄瓜幼果组织中表达,将该片段回收测序并翻译成氨基酸序列,用blastp程序在NCBI GenBank数据库中进行同源性检索和相似性比对,结果发现该片段推导的氨基酸序列与黄瓜扩张蛋白CsEXP1～9的相似性依次分别为71%、58%、63%、75%、85%、82%、67%、68%和85%,可能是一个新的黄瓜扩张蛋白基因,命名为CsEXP10,表明扩张蛋白基因可能与黄瓜果实膨大生长有密切关系。
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关键词
黄瓜(cucumis
sativus
l.)
果实膨大生长
CDNA-aflp
扩张蛋白
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Keywords
cucumber（cucumis sativus l.）
fruit expansive growth
cDNA-aflp
expansin
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分类号
Q789
[生物学—分子生物学]
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题名黄瓜DNA提取及其RAPD-PCR反应体系的优化
被引量：6
- 6
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作者
孙敏
乔爱民
王和勇
曾建军
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机构
西南师范大学生命科学学院
仲凯农业技术学院园艺系
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出处
《种子》
CSCD
北大核心
2004年第6期9-14,共6页
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基金
广东省自然科学基金资助项目
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文摘
利用改良的 SDS方法提取黄瓜干种子与一步法提取的黄花苗总 DNA进行 RAPD扩增 ,其结果与传统的 CTAB和 SDS的结果一样。这两种方法不仅节约成本 ,且简单快速 ,大大降低了 DNA的提取难度 ,适宜黄瓜杂交种子纯度鉴定。不同组织材料对 RAPD无影响。研究了 RAPD的影响因素 ,改进及优化了 RAPD反应程序。结果表明 :Mg2 +浓度的范围为 1.5～ 3.0 mmol· L- 1 ,d NTPs浓度范围为 0 .15～ 0 .2 5 mmol· L- 1 ,Taq聚合酶浓度范围为 0 .5～ 1.5 U,模板DNA浓度为 2 0～ 10 0 ng,反应以及引物浓度为 0 .2～ 0 .4μmol· L- 1 。引物的碱基组成以及不同存放时间的引物对 RAPD扩增也有影响。 DNA预变性 94℃进行 4 min,94℃变性 30 s,37℃退火 30 s,72℃延伸 1min,循环 35次后
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关键词
黄瓜
DNA提取
RAPD-PCR反应体系
优化
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Keywords
cucumber (cucumis sativus l.) DNA extraction RAPD PCR Condition optimization
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分类号
S642.2
[农业科学—蔬菜学]
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