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题名褶纹冠蚌线粒体基因组全序列分析
被引量：5
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作者
蒋文枰
李家乐
郑润玲
汪桂玲
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机构
上海海洋大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室
上海市高校水产养殖学E研究院
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出处
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第2期153-162,共10页
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基金
国家自然科学基金项目(编号:30871923)
国家科技支撑项目(编号:2006BAD01A13)
+1 种基金
973计划前期研究专项(编号:2009CB126000)
上海市科委地方院校能力建设项目(083905101001)资助
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文摘
采用LA-PCR(Long amplification polymerase chain reaction)扩增方法首次获得褶纹冠蚌(Cristariaplicata)线粒体基因组全序列。分析表明:序列全长15712bp,包括13个蛋白质基因、22个tRNA基因、2个rRNA基因和26个长度为2～328bp的非编码区。A、T、C、G碱基组成分别为36.54%、27.22%、23.22%、13.02%。大部分基因在L链编码,其中ND3～ND5、ND4L、COI～COIII、ATP6、ATP8、tRNAAsp和tRNAHis在H链编码。基因排列与同科的射线佩饰真珠蚌(Lampsilis ornata)一致,与三角帆蚌(Hyriopsis cumingii)在COII和12SrRNA之间存在差异。13个蛋白质基因具有I(AUU、AUC)、V(GUG)、M(AUA、AUG)3种起始密码子,除ND2终止密码子为不完整的T,其余基因均为典型的UAA或UAG。22个tRNA中,除tRNAThr、tRNALys、tRNASer(UCN)、tRNAAsp、tRNAArg、tRNATyr和tRNAMet之外,其他15个tRNA都具有典型三叶草结构。与其他淡水双壳贝类一样,褶纹冠蚌具有ATP8基因,该基因可能与细胞质的渗透压平衡有关。
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关键词
褶纹冠蚌
线粒体基因组
序列分析
atp8基因
系统进化
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Keywords
cristaria plicata mitochondrial genome sequence analysis atp8 gene phylogeny
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分类号
S917.4
[农业科学—水产科学]
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