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蛤蜊科3种贝类16S rRNA基因片段及ITS2核苷酸序列分析 被引量：13
1
作者 孟学平 高如承 +4 位作者 董志国 阎斌伦 程汉良 李艳杰 陈建安 《湛江海洋大学学报》 CAS 2006年第4期8-13,共6页
利用PCR技术分别扩增连云港及启东沿海蛤蜊科的西施舌(Coelomactra antiquata)、中国蛤蜊(Mactrachinensis)和四角蛤蜊(Mactra veneriformis)3种双壳贝的16S rRNA基因片段和ITS2核苷酸序列,测序后用DNA star软件分析了核苷酸差异。结果... 利用PCR技术分别扩增连云港及启东沿海蛤蜊科的西施舌(Coelomactra antiquata)、中国蛤蜊(Mactrachinensis)和四角蛤蜊(Mactra veneriformis)3种双壳贝的16S rRNA基因片段和ITS2核苷酸序列,测序后用DNA star软件分析了核苷酸差异。结果显示:三种贝类16S rRNA基因片段长度相同,均为306bp(去除引物),核苷酸存在多态性,共有45个变异位点,54个核苷酸发生了变异,全部为碱基置换。西施舌与中国蛤蜊此片段核苷酸的同源性为88.9%,与四角蛤蜊的同源性为88.6%,中国蛤蜊与四角蛤蜊的同源性为90.6%。三种蛤蜊ITS2序列分别为390 bp(西施舌)4、41 bp(四角蛤蜊)和466 bp(中国蛤蜊),存在长度多态性,ITS2核苷酸差异分析结果显示,西施舌与中国蛤蜊的同源性为70.9%-71.1%,西施舌与四角蛤蜊的为70.5%-71.0%,中国蛤蜊与四角蛤蜊的同源性为88.1%-88.8%。ITS2序列分析结果与16S rRNA基因片段分析结果一致,2种分子分析法均显示中国蛤蜊与四角蛤蜊的亲缘关系近。 展开更多
关键词 西施舌 中国蛤蜊 四角蛤蜊 16S rRNA基因 ITS2
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基于nad5的西施舌漳州群体遗传分化水平分析——以蛤蜊属2个物种差异水平为参照 被引量：1
2
作者 孟学平 申欣 +4 位作者 屠海淼 朱笑琳 赵娜娜 程汉良 阎斌论 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第8期2635-2642,共8页
扩增了西施舌日照、连云港、北海、漳州4个野生群体、四角蛤蜊和中国蛤蜊各1个群体共73个样本的NAD5基因片段,测序获得了480bp核苷酸序列,分析核苷酸的多态性,旨在评估福建漳州西施舌与日照、连云港、北海西施舌之间的分化水平。结果:... 扩增了西施舌日照、连云港、北海、漳州4个野生群体、四角蛤蜊和中国蛤蜊各1个群体共73个样本的NAD5基因片段,测序获得了480bp核苷酸序列,分析核苷酸的多态性,旨在评估福建漳州西施舌与日照、连云港、北海西施舌之间的分化水平。结果:从73个序列中共检测到44种单倍型(Hap),其中西施舌4个群体有29种Haps,四角蛤蜊和中国蛤蜊分别有10种和5种Haps,漳州群体与北海、日照、连云港群体单倍型有明显差异;将西施舌分为北海、日照、连云港组(GP1)和漳州组(GP2)2个组,分析核苷酸差异,GP1与GP2间的T、A、G含量差异极显著(P<0.01)。GP1与GP2间的遗传距离与组内(GP1、GP2)遗传距离之比为25.1—41.8,四角蛤蜊与中国蛤蜊之间的遗传距离与种内个体间遗传距离之比为24.4—36.7,GP1、GP2间的差异达到了四角蛤蜊和中国蛤蜊种间差异水平,而日照、北海群体间的遗传距离只有0.009,北海与日照群体地理位置虽远,但遗传差异则很小;AMOVA分析显示漳州西施舌发生了极显著遗传分化(FST=0.966—0.978,P<0.01)。 展开更多
关键词 西施舌 四角蛤蜊 中国蛤蜊 nad5 差异
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基于线粒体16S rRNA和COI序列的江苏启东海域4种贝类遗传多样性分析 被引量：9
3
作者 闫永斌 葛玉双 +3 位作者 程起群 范瑞良 李楠楠 全为民 《海洋渔业》 CSCD 北大核心 2022年第2期201-208,共8页
采集启东海域的4种贝类,即日本镜蛤(Dosinia japonica)、四角蛤蜊(Mactra veneriformis)、西施舌(Coelomactra antiquata)和中国蛤蜊(Mactra chinensis),对其线粒体16S rRNA和COI基因片段进行PCR扩增和测序,并进行遗传多样性分析。结果... 采集启东海域的4种贝类,即日本镜蛤(Dosinia japonica)、四角蛤蜊(Mactra veneriformis)、西施舌(Coelomactra antiquata)和中国蛤蜊(Mactra chinensis),对其线粒体16S rRNA和COI基因片段进行PCR扩增和测序,并进行遗传多样性分析。结果显示,西施舌和四角蛤蜊的遗传多样性处于一个相对较高的水平,而日本镜蛤和中国蛤蜊的遗传多样性水平相对较低,且同一物种COI基因的变异程度一般高于16S rRNA基因。研究结果可为江苏启东4种贝类种质资源的管理、保护和监测提供参考。 展开更多
关键词 日本镜蛤 四角蛤蜊 西施舌 中国蛤蜊 遗传多样性 16S rRNA COI
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