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Comparative Transmission Genetics of Introgressed Chromatin in Gossypium Species
1
作者 WAGHMARE Vijay N ROGERS Carl J +1 位作者 BOWERS John E PATERSON Andrew H 《棉花学报》 CSCD 北大核心 2008年第S1期117-,共1页
Wild relatives and un-adapted germplasm of crop species harbors several adaptive traits.Introgression of genes for economic and adaptive traits brings in novel genetic variation into the gene
关键词 Comparative Transmission Genetics of Introgressed chromatin in Gossypium Species
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表观遗传学在抑郁症发病机制中的研究进展 被引量：1
2
作者 张瑶 邹蔓姝 +1 位作者 韩远山 王宇红 《中国临床药理学与治疗学》 北大核心 2025年第4期517-525,共9页
抑郁症是一种在世界范围内患病率不断上升的精神疾病,具有高致残率和高自杀率,严重危害人类健康。表观遗传学是21世纪新兴的遗传学说,其主要研究内容是在不涉及DNA序列改变的条件下,对基因转录或翻译的过程进行调控,影响其功能和特性。... 抑郁症是一种在世界范围内患病率不断上升的精神疾病,具有高致残率和高自杀率,严重危害人类健康。表观遗传学是21世纪新兴的遗传学说,其主要研究内容是在不涉及DNA序列改变的条件下,对基因转录或翻译的过程进行调控,影响其功能和特性。主要包括DNA甲基化、组蛋白修饰、染色质重塑和非编码RNA调控。神经系统容易受到表观遗传修饰因子活性变化的影响,并且越来越多的研究表明遗传和环境在抑郁症发生发展中起重要作用。本文将围绕抑郁症的表观遗传学机制进行综述。 展开更多
关键词 抑郁症 表观遗传学 DNA甲基化 组蛋白修饰 非编码RNA调控 染色质重塑
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人胚胎干细胞向神经前体细胞分化的转录组与染色质可及性变化分析研究
3
作者 李林颖 蔡晓东 +7 位作者 童冉 杨晨 王志明 贺潇宇 马子越 张丰 李令杰 周君梅 《上海交通大学学报(医学版)》 北大核心 2025年第4期387-403,共17页
目的·利用人胚胎干细胞(human embryonic stem cell,hESC)体外分化模型和高通量多组学测序技术研究hESC分化成神经前体细胞(neural progenitor cell,NPC)过程中转录组和染色质可及性的变化情况。方法·首先在体外利用拟胚体形... 目的·利用人胚胎干细胞(human embryonic stem cell,hESC)体外分化模型和高通量多组学测序技术研究hESC分化成神经前体细胞(neural progenitor cell,NPC)过程中转录组和染色质可及性的变化情况。方法·首先在体外利用拟胚体形成法诱导hESC分化成NPC,并收集这2个阶段的细胞;通过反转录-实时荧光定量PCR(reverse transcriptionquantitative real-time PCR,RT-qPCR)和免疫荧光染色(immunofluorescence,IF)鉴定细胞表型。应用转录组测序(transcriptome sequencing,RNA-seq)检测并分析hESC和NPC的差异表达基因(differentially expressed gene,DEG)。应用染色质可及性测序(assay for transposase-accessible chromatin with high throughput sequencing,ATAC-seq)技术获取hESC和NPC的染色质可及性变化情况,并对差异的染色质开放区域进行基序富集分析以发现具有潜在调控作用的转录因子。最后对RNA-seq和ATAC-seq多组学数据进行联合分析,并构建蛋白质互作(protein-protein interaction,PPI)网络,寻找体外神经早期分化过程中的关键基因和调控通路。结果·RT-qPCR与IF均显示多能性标志物(NANOG、POU5F1)在hESC阶段表达量高而在NPC阶段表达量明显降低;同时神经早期分化标志物(PAX6、SOX1、NES)在hESC阶段基本不表达而在NPC阶段表达量显著升高。RNA-seq分析结果显示,与hESC阶段相比,NPC阶段中有5597个基因的表达水平呈现上调,而3654个基因的表达水平下降,基因功能富集分析显示NPC阶段上调的基因富集至神经发育相关的功能。ATAC-seq分析结果显示,共27491个基因组区域在hESC向NPC分化过程中染色质可及性发生了显著改变,其中有12381个区域染色质可及性增强,15110个区域染色质可及性减弱;基序富集分析揭示DLX1、LHX2等转录因子基因可能在hESC向NPC分化过程中发挥重要作用。RNA-seq和ATAC-seq的多组学数据联合分析结果显示,在NPC阶段高表达的重叠基因主要富集在轴突导向、前脑发育、神经元迁移等。神经分化后CTNND2、LHX2基因表达水平升高,且相关基因区域染色质可及性也增加。PPI网络分析发现,PRKACA、CDH2、ERBB4等是下游候选基因。结论·利用hESC体外分化模型结合高通量多组学测序技术可用于揭示hESC向NPC分化过程中的转录组及染色质可及性的变化规律;该过程中轴突导向、前脑发育、神经元迁移等通路的相关基因表达水平升高,染色质可及性增强。 展开更多
关键词 人胚胎干细胞 神经前体细胞 染色质可及性测序 转录组测序
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提高小麦面团特性的外源染色体及其特异分子标记开发
4
作者 汪晓璐 王灿国 +6 位作者 韩冉 刘爱峰 李豪圣 曹新有 赵振东 刘建军 刘成 《山西农业科学》 2025年第2期83-91,共9页
为鉴定小麦近缘物种染色体系的面团特性,以中国春为对照,测定济麦22、济麦262以及19份中国春-近缘物种染色体附加系和易位系的面团形成时间、稳定时间和粉质质量指数,利用87对第1同源群的PLUG引物对中国春-两芒山羊草1U^(bi)#1附加系及... 为鉴定小麦近缘物种染色体系的面团特性,以中国春为对照,测定济麦22、济麦262以及19份中国春-近缘物种染色体附加系和易位系的面团形成时间、稳定时间和粉质质量指数,利用87对第1同源群的PLUG引物对中国春-两芒山羊草1U^(bi)#1附加系及中国春进行分子标记筛选。结果表明,中国春-两芒山羊草1U^(bi)#1附加系、中国春-卵穗山羊草1M^(g)#1附加系、中国春-粗穗披碱草1S^(t)附加系等材料的面团形成时间显著长于中国春;中国春-两芒山羊草1U^(bi)#1附加系、中国春-卵穗山羊草1M^(g)#1附加系、中国春-粗穗披碱草1H^(t)S附加系等材料的稳定时间显著长于中国春;中国春-两芒山羊草1U^(bi)#1附加系、中国春-卵穗山羊草1M^(g)#1附加系、中国春-希尔斯山羊草1S^(s)#1附加系等材料的粉质质量指数显著高于中国春,其中,中国春-两芒山羊草1U^(bi)#1附加系的面团形成时间、稳定时间和粉质质量指数最高,分别为8.10、10.73 min和159.7。引物TANC1089和TANC1142仅可以在中国春-两芒山羊草1U^(bi)#1附加系中扩增出长度分别为500 bp和750 bp的特异片段。综上所述,中国春-两芒山羊草1U^(bi)#1染色体导入小麦可显著提高小麦加工品质,建立的中国春-两芒山羊草1U^(bi)#1染色体分子标记TANC1089和TANC1142可用于小麦研究中两芒山羊草1U^(bi)#1染色质的追踪和鉴定。 展开更多
关键词 小麦近缘物种 面团特性 两芒山羊草 分子标记 染色质追踪
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叶酸缺乏对组蛋白H3赖氨酸4甲基化标记增强子变化的影响及其在低叶酸诱导神经管畸形发生中的分子初探
5
作者 谢秋 胡瑾 +1 位作者 李建婷 张霆 《中国医学科学院学报》 北大核心 2025年第5期782-791,共10页
目的探讨叶酸缺乏对组蛋白H3赖氨酸4(H3K4)甲基化(me1)标记增强子变化的影响及其在神经管畸形(NTD)中的分子机制。方法采用无叶酸DMEM培养基(叶酸缺乏组)和4 mg/L叶酸DMEM培养基(正常对照组)分别培养小鼠胚胎干细胞(mESC),通过染色质免... 目的探讨叶酸缺乏对组蛋白H3赖氨酸4(H3K4)甲基化(me1)标记增强子变化的影响及其在神经管畸形(NTD)中的分子机制。方法采用无叶酸DMEM培养基(叶酸缺乏组)和4 mg/L叶酸DMEM培养基(正常对照组)分别培养小鼠胚胎干细胞(mESC),通过染色质免疫共沉淀(ChIP)技术行H3K4me1染色质免疫共沉淀测序(ChIP-seq)。构建低叶酸诱导NTD小鼠模型,对胎鼠脑组织进行转录物组测序(RNA-seq)并分析差异表达,实时荧光定量PCR(qPCR)进行结果验证;通过荧光素酶报告系统实验对H3K4me1修饰差异Peak区域进行活性验证。结果确立连续无叶酸培养基培养后,发现当培养基缺乏叶酸时,mESC内叶酸含量会比正常对照组显著降低(P=0.008)。叶酸缺乏时,mESC中H3K4me1标记增强子导致内含子区域发生明显变化,这些变化集中在代谢和能量代谢过程(q=9.56×10^(-48),P=1.28×10^(-47));mESC内H3K4me1标记增强子所在差异基因主要表现在Wnt信号通路(q=0.004,P=0.0047);ChIP-qPCR实验证实Ldlrap1基因(P=0.008)、Camta1基因(P=0.002)和Apc2基因(P=0.012)差异Peak区域H3K4me1结合显著降低。H3K4去甲基化酶抑制剂T-448能够有效逆转上述基因H3K4me1修饰差异peak区域H3K4me1结合(P=0.01)。NTD胎鼠脑组织RNA seq示Wnt信号通路差异基因显著富集(P=1.52×10^(-5)),脑组织中Apc2、Ldlrap1和Camta1基因H3K4me1标记增强子差异Peak富集同样发生明显改变;Apc2基因差异Peak区域具有转录因子活性(P=0.020)。结论叶酸缺乏可能通过影响组蛋白H3K4me1标记增强子变化参与神经管闭合基因调控,影响NTD发生。 展开更多
关键词 组蛋白 叶酸 胚胎干细胞 神经管畸形 染色质免疫共沉淀
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SWI/SNF染色质重塑复合物在肿瘤耐药中的作用 被引量：1
6
作者 朱桂珍 叶巧 +7 位作者 罗渊 彭洁 王璐 杨昭婷 段峰森 郭丙乾 梅竹松 王广云 《生物化学与生物物理进展》 北大核心 2025年第1期20-31,共12页
肿瘤耐药是化疗和靶向药物治疗面临的重要问题,它是一个涉及染色质重塑的复杂过程。SWI/SNF是肿瘤发生中研究最多的ATP依赖性染色质重塑复合物之一,在染色质结构稳定性、基因表达和翻译后修饰的协调过程中起着重要作用,但其调控肿瘤耐... 肿瘤耐药是化疗和靶向药物治疗面临的重要问题,它是一个涉及染色质重塑的复杂过程。SWI/SNF是肿瘤发生中研究最多的ATP依赖性染色质重塑复合物之一,在染色质结构稳定性、基因表达和翻译后修饰的协调过程中起着重要作用,但其调控肿瘤耐药的机制尚未被系统梳理。SWI/SNF按其亚基组成可分为BAF、PBAF和ncBAF 3种,这3种亚型均包含ATP酶催化亚基、核心亚基和调节亚基,可以通过调控染色质结构来控制基因表达。SWI/SNF复合物亚基的改变是调控肿瘤耐药和进展的重要因素之一,充分了解该复合物在肿瘤耐药中的分子机制可以改善癌症的治疗。本文总结了SWI/SNF复合物的组成、引起肿瘤耐药的突变或异常表达亚基类型、主要的耐药机制以及肿瘤耐药的克服方法等,为临床上SWI/SNF亚基突变或异常表达引起的肿瘤预后不良的诊断和治疗提供了思路。 展开更多
关键词 SWI/SNF染色质重塑复合物 亚基突变 肿瘤耐药
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染色质相关RNA的m^(6)A修饰调控染色质可及性与基因转录研究进展
7
作者 任佳琳 童依泽 蔡瑞 《遗传》 北大核心 2025年第11期1186-1196,共11页
染色质相关RNA(chromatin-associatedRNAs,caRNAs)是一类与染色质结构及功能密切相关的RNA,通过顺式、反式或顺-反式联合的方式与染色质互作,从而调控基因表达,保证细胞过程的有序进行。N6-甲基腺苷(N6-methyladenosine,m^(6)A)是真核生... 染色质相关RNA(chromatin-associatedRNAs,caRNAs)是一类与染色质结构及功能密切相关的RNA,通过顺式、反式或顺-反式联合的方式与染色质互作,从而调控基因表达,保证细胞过程的有序进行。N6-甲基腺苷(N6-methyladenosine,m^(6)A)是真核生物RNA中普遍存在且动态可逆的一种表观遗传修饰,在多种生物学过程中发挥重要的调控作用。caRNAs的m^(6)A修饰能在转录水平调控染色质可及性与基因表达,维持机体的正常生命功能。本文对m^(6)A修饰的caRNAs与染色质的互作机制及其对基因表达的作用进行了总结,以期为解析基因转录调控的分子机理提供科学依据与思路。 展开更多
关键词 染色质相关RNA m^(6)A修饰 染色质可及性 转录调控
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牛胚胎基因组激活研究进展
8
作者 顾洋 张坤 《浙江大学学报(农业与生命科学版)》 北大核心 2025年第5期699-709,共11页
繁殖率低下极大地限制了奶牛与肉牛的生产和遗传改良效率。据统计,奶牛早期胚胎死亡率高达30%~60%,而早期胚胎中发生的胚胎基因组激活(embryonic genome activation, EGA)失败是关键原因之一。EGA标志着卵母细胞-胚胎转换(oocyte-to-emb... 繁殖率低下极大地限制了奶牛与肉牛的生产和遗传改良效率。据统计,奶牛早期胚胎死亡率高达30%~60%,而早期胚胎中发生的胚胎基因组激活(embryonic genome activation, EGA)失败是关键原因之一。EGA标志着卵母细胞-胚胎转换(oocyte-to-embryonic transition, OET)这一核心事件,此时胚胎基因组接管发育调控权,对囊胚形成至关重要。本文综述了牛早期胚胎发育中EGA的调控机制。在时间上,牛EGA发生具有物种特异性窗口期(8—16细胞期),显著晚于小鼠(1—2细胞期)和人类(4—8细胞期)。在分子机制层面,首先,母源因子(如转录抑制蛋白)的时序性降解是启动EGA的前提,其异常滞留将导致牛8—16细胞期胚胎发育阻滞。其次,牛早期胚胎中关键转录因子[含有锌指和SCAN结构域的蛋白4(zinc finger and SCAN domain-containing 4, ZSCAN4)、双同源框A(double homeobox A, DUXA)]可能影响RNA聚合酶Ⅱ(RNA polymeraseⅡ, RNA PolⅡ)进入特定启动子区域的能力,从而促进EGA基因表达;同时,染色质结构(如动态组蛋白修饰、染色质重塑复合体调控)显著提高基因组可及性,从而促进胚胎基因转录。理解这些机制将为优化牛体外胚胎生产体系,提高牛生产和遗传改良效率提供理论依据。 展开更多
关键词 牛 早期胚胎发育 胚胎基因组激活 转录因子 染色质
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DNA甲基转移酶在表观遗传学中的应用研究进展
9
作者 周文健 崔晓楠 施威扬 《生物技术通报》 北大核心 2025年第2期30-39,共10页
DNA甲基转移酶是一类在DNA甲基化过程中起到关键作用的酶。在生物体内,DNA甲基转移酶可以将甲基基团添加到核酸分子上,从而引入DNA甲基化修饰,改变遗传表现并调控基因表达。DNA甲基转移酶可以在体外进行融合重组表达,并导入细胞在染色... DNA甲基转移酶是一类在DNA甲基化过程中起到关键作用的酶。在生物体内,DNA甲基转移酶可以将甲基基团添加到核酸分子上,从而引入DNA甲基化修饰,改变遗传表现并调控基因表达。DNA甲基转移酶可以在体外进行融合重组表达,并导入细胞在染色质上引入人为的DNA甲基化修饰。利用这一特性,近年来,科研人员通过对基因组特定位置进行甲基化标记,并结合高通量测序,开发了多种基于DNA甲基转移酶的表观遗传测序技术,其应用包括染色质可及性测量、核小体定位、转录因子印迹和组蛋白修饰检测等。这些技术在获得表观遗传修饰信息的同时也可以获得基因组学信息以及内源性的DNA甲基化信息,因此成为了表观遗传学的重要检测方法。本文介绍了表观遗传修饰研究方法,综述了多种基于DNA甲基转移酶检测表观遗传修饰的测序技术的原理及应用,并对其未来的发展进行了讨论与展望,以期为表观遗传学的研究提供参考。 展开更多
关键词 DNA甲基转移酶 DNA甲基化 染色质可及性 DNA-蛋白质互作 测序技术
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Signac.UIO:基于R-Shiny技术的单细胞ATAC-seq数据交互式分析平台构建与应用
10
作者 罗玉燕 罗晓敏 +1 位作者 黄洁茹 徐斯文 《中国生物化学与分子生物学报》 北大核心 2025年第11期1579-1589,共11页
单细胞染色质可及性测序(Single-cell assay for transposase-accessible chromatin sequencing,scATAC-seq)是解析细胞异质性与基因调控网络的重要技术,在表观遗传研究中应用广泛。但其数据分析流程复杂和编程门槛高,阻碍了在非程序员... 单细胞染色质可及性测序(Single-cell assay for transposase-accessible chromatin sequencing,scATAC-seq)是解析细胞异质性与基因调控网络的重要技术,在表观遗传研究中应用广泛。但其数据分析流程复杂和编程门槛高,阻碍了在非程序员科研群体中的推广应用。为此,本文基于R语言的Shiny框架,整合Signac与Seurat等主流分析工具,开发了模块化、可视化的scATAC-seq数据分析平台--Signac.UIO。平台包含数据质控、细胞过滤、降维聚类、差异分析、细胞注释、通路富集、模体识别与转录因子足迹等10个功能模块,覆盖分析流程各关键环节。用户可通过图形界面完成操作,获得交互式可视化结果。平台已在PBMC公开数据集上验证其稳定性与实用性,现部署于服务器(https://xulabgdpu.org.cn/Signac.UIO),为单细胞表观组学研究提供了高效和易用的技术支撑。 展开更多
关键词 单细胞染色质可及性 R语言可视化平台 交互式分析平台 数据可视化 生物信息学工具
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电镜下几种凋亡细胞的形态特征 被引量：11
11
作者 沈强 俞彰 +3 位作者 法京 刘懿 高鸿建 钟慈声 《复旦学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2010年第3期322-325,共4页
目的观察不同种类、不同原因引起的凋亡细胞的基本形态及差异。方法用透射电镜观察原位组织和培养细胞在生理条件下和外界因素作用下产生的凋亡细胞,其中有卵巢颗粒膜细胞、烷化剂作用的光感受细胞、培养的人膀胱癌T24细胞株和肝癌细胞... 目的观察不同种类、不同原因引起的凋亡细胞的基本形态及差异。方法用透射电镜观察原位组织和培养细胞在生理条件下和外界因素作用下产生的凋亡细胞,其中有卵巢颗粒膜细胞、烷化剂作用的光感受细胞、培养的人膀胱癌T24细胞株和肝癌细胞株。结果凋亡细胞的基本形态变化有:胞体变小、胞质浓缩、核染色质凝聚,而核膜、质膜及细胞器保存完好。各种凋亡细胞间的形态差异主要表现为核染色质凝聚的形态不同:有的凝聚染色质边移于核膜下,或呈新月形;有的核染色质凝聚成块状,散布于核内;有的呈致密凝聚,占据整个核区。结论电镜下观察到凋亡细胞的核染色质凝聚除边移外还有其他形态,正常组织中的暗细胞和坏死组织中的凝固性坏死细胞应与凋亡细胞相区别。 展开更多
关键词 凋亡细胞 核染色质凝聚 核染色质边移 电子显微镜
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肿瘤发生的表观遗传学:进展与临床意义 被引量：13
12
作者 王先火 赵秀娟 +2 位作者 邱立华 王华庆 王玺 《北京大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2012年第5期701-707,共7页
表观遗传（epigenetics）指所有不通过DNA序列改变就能影响基因表达（从而决定细胞乃至个体表型）的、可遗传的（即可伴随细胞分裂传递下去）调控方式,包括DNA甲基化、组蛋白修饰、染色质重塑、miRNA、朊病毒等。表观遗传调控在干细胞... 表观遗传（epigenetics）指所有不通过DNA序列改变就能影响基因表达（从而决定细胞乃至个体表型）的、可遗传的（即可伴随细胞分裂传递下去）调控方式,包括DNA甲基化、组蛋白修饰、染色质重塑、miRNA、朊病毒等。表观遗传调控在干细胞自我更新、定向分化、器官发育等生命过程中起着至关重要的作用： 展开更多
关键词 表观遗传 肿瘤 DNA甲基化 组蛋白修饰 染色质组装和分解
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组蛋白修饰及其生物学效应 被引量：40
13
作者 王维 孟智启 石放雄 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2012年第7期810-818,共9页
组蛋白是染色质的主要成分之一,其氨基端的氨基酸残基可以被共价修饰,进而改变染色质构型,导致转录激活或基因沉默。组蛋白修饰除了简单地调控基因表达,更在于它可以招募蛋白复合体,影响下游蛋白,从而参与细胞分裂、细胞凋亡和记忆形成... 组蛋白是染色质的主要成分之一,其氨基端的氨基酸残基可以被共价修饰,进而改变染色质构型,导致转录激活或基因沉默。组蛋白修饰除了简单地调控基因表达,更在于它可以招募蛋白复合体,影响下游蛋白,从而参与细胞分裂、细胞凋亡和记忆形成,甚至影响免疫系统和炎症反应等。不仅如此,最近的研究表明,组蛋白修饰与CTD密码、生物节律、DNA修复之间也存在一定的联系。这些发现证明了组蛋白修饰的重要性。在组蛋白的密码形成与密码破译、修饰级联与招募蛋白质过程中,蛋白复合体的特殊结构域起到的中介作用都是无法替代的。因此,这些特殊结构域将是了解"组蛋白密码"的关键。目前质谱分析等技术的广泛应用,正使得许多新的结构域不断被发现。文章旨在对组蛋白密码的基本内容作一述评,同时对可能的研究热点进行展望。 展开更多
关键词 组蛋白修饰 染色质 基因表达 结构域 蛋白复合体
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不育症患者精子DNA碎片化指数与精子常规参数关系的研究 被引量：12
14
作者 孙超 徐志鹏 +1 位作者 石亮 戴玉田 《南京医科大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2011年第4期565-567,570,共4页
目的:近年研究认为精子DNA碎片化是评价精子质量的重要指标,本研究主要运用吖啶橙实验(acridine orangetest,AOT)检测不育症患者精子DNA碎片化指数(DNA fragmentation index,DFI)与精子常规参数之间的关系。方法:收集本院男科门诊376例... 目的:近年研究认为精子DNA碎片化是评价精子质量的重要指标,本研究主要运用吖啶橙实验(acridine orangetest,AOT)检测不育症患者精子DNA碎片化指数(DNA fragmentation index,DFI)与精子常规参数之间的关系。方法:收集本院男科门诊376例不育症患者的精液标本,采用改良的Neubauer血细胞计数板人工分析精子密度,计算机辅助精液分析(CASA)分析精子活力。精子形态分析采用Shorr染色法,分析标准采用WHO推荐的Tygerberg严格标准。采用AOT检测精子DNA碎片化程度。结果:DFI与精子密度呈负相关(r=-0.150,P=0.003)、与精子总活动率呈负相关(r=-0.114,P=0.028)、与精子前向运动率无统计学相关性(r=-0.089,P=0.085)、与精子正常形态率呈负相关(r=-0.155,P=0.003)。结论:精子DNA碎片化指数与精子的密度、总活动率及精子正常形态率具有负相关性,AOT检测的DFI值为男性不育症的诊疗提供了一个新的指标。 展开更多
关键词 精子 染色质 精液分析 不育 男性
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抗菌肽CM4组分对K562癌细胞染色质DNA断裂作用的SCGE研究 被引量：46
15
作者 王芳 张双全 戴祝英 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 1998年第1期64-67,共4页
单细胞凝胶电泳法（ｓｉｎｇｅｃｅｌｇｅｌｅｌｅｃｔｒｏｐｈｏｒｅｓｉｓ，ＳＣＧＥ）是一种快速，敏感的检测单个哺乳动物细胞ＤＮＡ断裂的技术，也叫彗星实验（ｃｏｍｅｔａｓｓａｙ）．此实验首次通过ＳＣＧＥ法观察抗菌肽ＣＭ４... 单细胞凝胶电泳法（ｓｉｎｇｅｃｅｌｇｅｌｅｌｅｃｔｒｏｐｈｏｒｅｓｉｓ，ＳＣＧＥ）是一种快速，敏感的检测单个哺乳动物细胞ＤＮＡ断裂的技术，也叫彗星实验（ｃｏｍｅｔａｓｓａｙ）．此实验首次通过ＳＣＧＥ法观察抗菌肽ＣＭ４组分对人髓样白血病Ｋ５６２细胞和正常人白细胞核染色质ＤＮＡ的影响，从而进一步研究抗菌肽抗癌作用的机制．荧光显微镜观察显示经抗菌肽ＣＭ４组分处理过的Ｋ５６２癌细胞核染色质ＤＮＡ出现断裂，形成一个亮的荧光头部和彗星似的尾部，而经同样处理的正常人白细胞和未经抗菌肽处理的Ｋ５６２癌细胞核染色质ＤＮＡ未出现断裂，核完整，呈圆形．经彗星尾长分析，前者ＤＮＡ损伤率平均为７３６２％，统计学处理Ｐ＜０００１，具高度显著性差异．这表明，抗菌肽ＣＭ４对Ｋ５６２癌细胞核染色质ＤＮＡ有明显的断裂作用，而对正常人白细胞则没有断裂作用． 展开更多
关键词 单细胞凝胶电泳 抗菌肽 K563癌细胞 染色质 DNA
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非生物胁迫下植物表观遗传变异的研究进展 被引量：11
16
作者 王淑妍 郭九峰 +3 位作者 刘晓婷 苑号坤 李亚娇 那日 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第3期631-640,共10页
植物在整个生命过程中固着生长,不能主动躲避外界不良环境的危害,需要通过自身的防御机制来抵御和适应外界胁迫,而表观遗传修饰在调控植物应对不良环境胁迫中起重要作用。该文从DNA甲基化、组蛋白修饰、染色质重塑和非编码RNA等方面进... 植物在整个生命过程中固着生长,不能主动躲避外界不良环境的危害,需要通过自身的防御机制来抵御和适应外界胁迫,而表观遗传修饰在调控植物应对不良环境胁迫中起重要作用。该文从DNA甲基化、组蛋白修饰、染色质重塑和非编码RNA等方面进行了综述,主要阐述了近年来国内外有关非生物胁迫下植物的表观遗传变化,以期为利用表观遗传变异提高植物的抗胁迫能力提供参考。 展开更多
关键词 非生物胁迫 DNA甲基化 组蛋白修饰 染色质重塑 非编码RNA
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绵羊不同直径卵泡卵母细胞特征及染色体形态分析 被引量：7
17
作者 郭延华 周平 +4 位作者 石国庆 王立民 唐红 万鹏程 代蓉 《新疆农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2012年第7期1307-1314,共8页
[目的]剥离不同直径卵泡卵母细胞,比较卵母细胞成熟前后的特征。[方法]测量绵羊卵巢表面卵泡直径后进行剥离,研究卵泡表面直径与卵泡实际直径之间的关系。按表面直径分组(1.0mm以下、1.0～2.0mm、2.1～4.0mm、4.1 mm以上),比较各分组间... [目的]剥离不同直径卵泡卵母细胞,比较卵母细胞成熟前后的特征。[方法]测量绵羊卵巢表面卵泡直径后进行剥离,研究卵泡表面直径与卵泡实际直径之间的关系。按表面直径分组(1.0mm以下、1.0～2.0mm、2.1～4.0mm、4.1 mm以上),比较各分组间卵母细胞透明带厚度、卵丘复合体质量、卵母细胞成熟前后的染色体形态变化的差异。[结果]随着卵泡直径的增大,卵泡实际直径差异极显著(P<0.01);各组间透明带厚度差异不显著(P>0.05),但有降低的趋势;卵丘复合体质量分为A级、B级和C级,A级有增加的趋势,B级C级有降低的趋势;卵母细胞成熟后GV/GVBD比率有下降的趋势,MAT-I、MII有增加的趋势。[结论]随着卵泡直径增大,未成熟卵母细胞的质量提高,卵母细胞核成熟比例增加。 展开更多
关键词 卵泡 卵母细胞 染色体形态
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植物DNA甲基化调控因子研究进展 被引量：7
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作者 夏晗 刘美芹 +2 位作者 尹伟伦 卢存福 夏新莉 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2008年第4期426-432,共7页
DNA甲基化是重要的植物基因组表观遗传修饰。植物中DNA甲基化的建立与维持是由多个调控因子协同作用的结果。不同的甲基转移酶类能直接作用于不同位点胞嘧啶甲基化,其中MET1主要负责保持原初CG位点的甲基化,CMT3主要负责保持CNG位点的... DNA甲基化是重要的植物基因组表观遗传修饰。植物中DNA甲基化的建立与维持是由多个调控因子协同作用的结果。不同的甲基转移酶类能直接作用于不同位点胞嘧啶甲基化,其中MET1主要负责保持原初CG位点的甲基化,CMT3主要负责保持CNG位点的甲基化,并由DRM与CMT3的协同从头甲基化作用来补偿其他相关序列的甲基化。这些甲基转移酶与染色质重塑解旋酶和组蛋白修饰因子协同改变染色质的结构,行使表观遗传的功能。DNA转葡糖基酶有去甲基化活性从而减轻基因沉默。文章综述了以上植物DNA甲基化调控因子的生物学功能及其之间的相互作用和近年来的研究进展,以更好的理解DNA甲基化的建立、保持和去除的机制。 展开更多
关键词 DNA甲基化 表观遗传 组蛋白 染色质
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染色质重塑因子ARID1A的肿瘤抑制作用 被引量：8
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作者 郭晓强 张巧霞 +2 位作者 黄卫人 段相林 蔡志明 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2013年第3期255-261,共7页
哺乳动物SWI/SNF复合物是一种ATP依赖的染色质重塑复合物,在细胞增殖、分化、发育和肿瘤抑制过程中发挥着重要作用。ARID1A是一种SWI/SNF复合物亚基,此外还是一种ARID家族成员,具有非序列特异性DNA结合活性。ARID1A发挥着肿瘤抑制作用,... 哺乳动物SWI/SNF复合物是一种ATP依赖的染色质重塑复合物,在细胞增殖、分化、发育和肿瘤抑制过程中发挥着重要作用。ARID1A是一种SWI/SNF复合物亚基,此外还是一种ARID家族成员,具有非序列特异性DNA结合活性。ARID1A发挥着肿瘤抑制作用,在多种肿瘤如卵巢癌、膀胱癌和胃癌等存在频繁基因突变。ARID1A可通过上调p21和下调E2F-反应基因表达而抑制细胞增殖。ARID1A与肿瘤抑制作用的发现对癌症发生的理解和癌症新治疗有重要裨益。文章介绍了ARID1A的基本特征、肿瘤发生的关联及生物学作用,以期对ARID1A有一个全面理解。 展开更多
关键词 染色质重塑复合物 ARID1A 肿瘤抑制因子 细胞增殖
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叶酸调控鸡脾和胸腺IGF2表达的表观遗传机制探究 被引量：6
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作者 刘艳利 申静 +3 位作者 支丽慧 李世召 姚军虎 杨小军 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第2期296-304,共9页
本试验旨在研究胚期注射叶酸对肉鸡脾和胸腺中IGF2基因表达的影响,并进一步探究其调控基因表达的表观遗传学机制。选择重量和大小相近的种蛋360枚,随机分为4组,在孵化期第11天(E11)分别注射0(对照)、50、100和150μg的叶酸。每个处理选... 本试验旨在研究胚期注射叶酸对肉鸡脾和胸腺中IGF2基因表达的影响,并进一步探究其调控基因表达的表观遗传学机制。选择重量和大小相近的种蛋360枚,随机分为4组,在孵化期第11天(E11)分别注射0(对照)、50、100和150μg的叶酸。每个处理选取体重相近的48只1日龄雏鸡,随机分为6个重复,每个重复8只鸡,在饲养的第21和42天取胸腺和脾组织。用RT-PCR方法检测组织中IGF2的相对表达量;重亚硫酸盐修饰克隆测序法(BSP)检测IGF2启动子区域(-648/-479bp)甲基化水平;DNase I-qPCR方法检测IGF2启动子区域(-847/-616bp)染色质构象。结果表明,胚期注射100和150μg叶酸显著提高了受精蛋孵化率(P<0.05);胚期注射150μg叶酸显著提高了42日龄脾中IGF2的表达量(P<0.05)、降低了42日龄脾中该基因启动子区的甲基化水平(P<0.05),并且也显著增加了42日龄脾中IGF2启动子区的染色质可接近度(P<0.05);然而在21日龄时各叶酸处理组对脾中IGF2的表达均无显著影响(P>0.05)。与脾组织不同,150μg叶酸处理组显著提高了21日龄胸腺中IGF2的表达(P<0.05),对42日龄胸腺中该基因的表达却没有显著影响(P>0.05),并且与对照组相比,150μg叶酸处理组中21日龄胸腺组织IGF2启动子区的染色质可接近度也显著增加(P<0.05)。由此可见,在种蛋孵化第11天注射叶酸可通过影响基因启动子区的甲基化水平和染色质构象来调控组织中IGF2的表达,并且存在组织器官和时间特异性。 展开更多
关键词 叶酸 IGF2 甲基化 染色质构象 表观遗传
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