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题名叶绿体基因组微卫星标记(cpSSR)研究进展
被引量：7
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作者
李博
刘合霞
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机构
桂林师范高等专科学校
南京林业大学森林资源与环境学院
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出处
《安徽农业科学》
CAS
2012年第13期7638-7639,7649,共3页
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文摘
随着测序技术的发展,叶绿体基因组微卫星标记(cpSSRs)的开发和应用越来越普遍。该研究介绍了叶绿体基因组分子标记的特点、用途、开发方法以及已开发的cpSSRs所具有的特点。随着cpSSRs开发成本的降低及研究技术的成熟,新的cpSSRs不断开发,将会有越来越多的叶绿体基因组SSR分子标记应用于群体遗传学、生物地理学和杂交育种的研究。其在野生植物进化过程研究中所具备的潜力在不久的将来将被充分认识和利用。
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关键词
叶绿体基因组
微卫星标记
叶绿体基因组微卫星标记cpssrs
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Keywords
Chloroplast genome
Microsatellite
Chloroplast simple sequence repeats （cpssrs）
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分类号
S188.1
[农业科学—农业基础科学]
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题名蒺藜苜蓿叶绿体微卫星分布规律的研究
被引量：10
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作者
骈瑞琪
李伟
李娜
陈晓阳
倪慧群
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机构
北京林业大学林木花卉遗传育种教育部重点实验室
华南农业大学林学院
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出处
《安徽农业科学》
CAS
北大核心
2008年第9期3531-3534,共4页
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基金
"863"国家高新技术项目(2002AA241111)
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文摘
利用已公布的蒺藜苜蓿(Medicao truntula)叶绿体DNA(cpDNA)全序列测序结果,应用生物信息学软件对蒺藜苜蓿微卫星位点的分布情况进行了统计分析,结果表明:在已公布的124 033 bp的蒺藜苜蓿叶绿体基因组序列中,共有341个SSR序列,SSR的碱基总数达3 987 bp,约占整个基因组的3.2%;在所有SSR序列中,数量最多的是单碱基SSR,数量达到297个,占总数的87.1%,其次是二碱基重复序列,占12.6%,三碱基微卫星序列最少,仅有1个,大于三碱基的微卫星数为0;在单碱基重复中又以A和T重复为主,占单碱基重复总数的84.5%,二碱基重复也以AT和TA为主,占95.5%,单碱基中的纯粹重复类型占总数的65.3%。研究结果为该物种的分子标记的筛选提供了基础信息。
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关键词
蒺藜苜蓿
叶绿体微卫星
分布规律
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Keywords
Medicao truncatula
chlomplast simple sequence repeat（cpssr）
Distribution
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分类号
S188
[农业科学—农业基础科学]
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