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题名油棕基因组DNA 3种提取方法的比较研究
被引量：9
- 1
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作者
周丽霞
肖勇
杨耀东
马子龙
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机构
中国热带农业科学院椰子研究所
中国热带农业科学院热带生物技术研究所
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出处
《江西农业学报》
CAS
2013年第8期9-11,共3页
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基金
中国热带农业科学院本级基本科研业务费专项(ITBB120506)
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文摘
采用CTAB小样提取法、PVP法和SDS-CTAB改良法,分别从油棕嫩叶和老叶中提取基因组DNA,并通过紫外分光光度计、琼脂糖凝胶电泳和PCR反应进行检测。研究结果表明:用CTAB小样提取法提取的油棕嫩叶总DNA的质量最好,纯度最高;用其他2种方法提取的DNA的质量均较差。
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关键词
油棕
基因组DNA
提取
ctab小样提取法
PVP法
SDS-ctab改良法
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Keywords
Elaeis guineensis
Genomic DNA
Extract method
ctab method
PVP method
SDS - ctab improved method
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分类号
S792.99
[农业科学—林木遗传育种]
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题名金柑叶片和果实总DNA提取方法比较
被引量：8
- 2
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作者
张宇
唐志鹏
秦荣耀
孙宁静
徐石兰
焦丁华
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机构
广西大学农学院
广西壮族自治区亚热带作物研究所
遂川县果业局
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出处
《经济林研究》
北大核心
2018年第1期158-162,共5页
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基金
广西自然科学基金项目(2016GXNSFAA380164)
国家现代农业创新体系广西柑橘创新团队建设项目(2011A-06)
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文摘
为了研究不同提取方法对金柑总DNA提取质量的影响,以融安金柑等3个金柑品种的叶片和果实为材料,采用SDS提取法、CTAB提取法、试剂盒法提取金柑总DNA,并对所提取DNA的总浓度、A_(260/280)、A_(260/230)、凝胶电泳结果、SCo T扩增产物进行比较分析。结果表明:CTAB提取法和试剂盒提取法能较好地去除金柑叶片和果实中的蛋白质、RNA、多酚、多糖、单宁、色素等大分子物质以及盐类等小分子杂质。提取的总DNA浓度最高达178 ng/μL,A_(260/280)在1.82~1.94之间,A_(260/230)在1.89~2.04之间。SDS提取法、CTAB提取法和试剂盒提取法所提取的金柑叶片和果实总DNA的扩增效果图谱清晰,多态性高。3种提取方法中,CTAB提取法所提取总DNA浓度较高,纯度最好,可用于后续相关研究。
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关键词
金柑
总DNA
SDS提取法
ctab提取法
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Keywords
Fortunella swingle
total DNA
SDS extraction method
ctab extraction method
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分类号
S666.9
[农业科学—果树学]
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题名金柑果肉组织总RNA提取方法比较
被引量：3
- 3
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作者
张宇
唐志鹏
秦荣耀
欧克纬
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机构
广西大学农学院
广西壮族自治区亚热带作物研究所
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出处
《经济林研究》
北大核心
2018年第4期80-85,共6页
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基金
国家现代农业创新体系"广西柑橘创新团队建设项目"(2011A-06)
广西亚热带作物研究所基本科研业务费专项项目(桂热研201807)
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文摘
为给高通量测序等对RNA质量要求较高的后续试验提供基础,以‘桂金柑一号’等5个金柑品种的果实为材料,采用异硫酸胍提取法、CTAB提取法、SDS提取法、试剂盒提取法提取金柑果实总RNA,并对所提取的总RNA浓度、A260/A280、A260/A230、凝胶电泳结果、RT-PCR扩增产物等指标进行比较分析。结果表明:CTAB提取法、SDS提取法和试剂盒提取法能较好地去除金柑果实中的蛋白质、金柑甙、柠檬萜、DNA、多酚、多糖、单宁、色素等大分子物质以及盐类等小分子杂质。采用异硫酸胍提取法所提取的总RNA浓度最高,达到95.9μg/g,其A260/A280在1.69～1.73之间,A260/A230> 2.14;其它RNA提取方法所提取的总RNA浓度最高达到76.9μg/g,其A260/A280分布在1.88～1.97之间,A260/A230分布在2.00～2.09之间,符合高质量RNA的要求范围。除了异硫酸胍提取法所提取的RNA琼脂糖电泳结果未见清晰的5S条带,其余方法所提取的RNA经琼脂糖电泳均可以观察到清晰的28S、18S、5S条带。但采用异硫酸胍提取法、CTAB提取法、SDS提取法和试剂盒提取法所提取的金柑果实总RNA进行反转录均可以得到清晰的扩增产物。在4种提取方法中,采用CTAB提取法所提取金柑果实总RNA浓度较高,纯度也较理想,琼脂糖电泳和RT-PCR效果好,是进行后续相关研究的较佳选择。
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关键词
金柑
总RNA
ctab提取法
SDS提取法
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Keywords
Fortunella japonica
total RNA
ctab extraction method
SDS extraction method
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分类号
S666.1
[农业科学—果树学]
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题名甘薯薯块DNA提取方法研究
被引量：6
- 4
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作者
张道微
张超凡
董芳
黄艳岚
张亚
周虹
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机构
湖南省作物研究所
中南大学研究生院隆平分院
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出处
《湖南农业科学》
2016年第4期5-7,共3页
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基金
国家甘薯产业技术体系(CARS-11-C-16)
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文摘
甘薯薯块富含淀粉、酚类等物质,不利于DNA提取。为了研究甘薯薯块DNA提取的最佳方法,采用经典CTAB法、改良CTAB法一、改良CTAB法二和SDS提取法,对甘薯薯块总DNA提取效果进行比较,以试剂盒法提取结果作对照。结果表明:采用经典CTAB提取法和SDS提取法获得的薯块DNA含有较多杂质,且降解严重,样品质量低;CTAB改良法一能降低DNA样品中多糖等物质的含量,但DNA存在一定程度降解,且耗时较长;CTAB改良法二提取效果最佳,杂质含量低且DNA降解少,与试剂盒提取效果最接近,是一种较为理想的甘薯薯块DNA提取方法。
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关键词
DNA提取
ctab提取法
SDS提取法
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Keywords
DNA extraction
ctab extraction method
SDS extraction method
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分类号
Q946-33
[生物学—植物学]
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题名海洋贝类基因组DNA的提取改进及ITS2扩增
被引量：2
- 5
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作者
张波
孟学平
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机构
淮海工学院海洋学院/江苏省海洋生物技术重点建设实验室
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出处
《江苏农业科学》
CSCD
北大核心
2008年第1期59-61,共3页
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基金
江苏省高校自然科学研究计划(编号:05SJD24002)
淮海工学院引进人才科研启动基金(编号:KK01050)
+1 种基金
江苏省高等学校大学生实践创新训练项目
淮海工学院大学生实验室创新项目
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文摘
目前已报道的常见的基因组DNA提取方法有经典酚醇法、盐析法、碘化钾法、煮沸法等,其中酚醇法根据其裂解液的不同又有CTAB、SDS、ROSE等具体方法,本试验对经典的CTAB法进行了改进,从酒精保存的西施舌组织中提取得到质量高的基因组DNA,以此为模板扩增ITS2效果很好。
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关键词
海洋贝类
基因组DNA
ctab法提取
ITS2扩增
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分类号
Q7
[生物学—分子生物学]
S961.6
[农业科学—水产养殖]
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