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题名谷子CPP基因家族鉴定及外源硒响应分析
被引量：1
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作者
杨馥熔
杜冰
郭浩杰
王成
张富厚
孟超敏
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机构
河南科技大学农学院
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出处
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第8期1250-1260,共11页
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基金
河南省产业科技特派员项目(2018HNCYTPY01)
河南省旱地绿色智慧农业特色骨干学科群建设项目(17100001)。
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文摘
【目的】探究谷子CPP基因家族成员特征及在外源硒处理下的响应模式,为谷子富硒高叶酸新品种选育提供遗传材料。【方法】借助生物信息学工具鉴定谷子CPP家族成员,用qRT-PCR技术对CPP基因在不同组织及外源硒处理下的表达水平进行检测。【结果】(1)谷子基因组中包含9个CPP基因,定位于6条染色体上,分别命名为SiCPP1-SiCPP9,所有成员均定位在细胞核,蛋白质二级结构中无规则卷曲占比最重。(2)谷子CPP蛋白可分为4个亚家族,相同亚家族之间保守基序和结构域的数目及分布相似。(3)启动子分析发现谷子CPP家族中存在大量光、生长发育、激素及胁迫响应元件。(4)谷子CPP家族成员在根、茎、叶和穗中差异表达,SiCPP5、SiCPP6、SiCPP7和SiCPP8对外源硒响应最强烈。【结论】谷子CPP家族成员具有组织表达特异性,且对外源硒存在不同程度响应。
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关键词
谷子
cpp基因家族
外源硒
生物信息学分析
表达模式
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Keywords
Setaria italica L.
cpp gene family
exogenous selenium
bioinformatics analysis
expression pattern
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分类号
Q789
[生物学—分子生物学]
S515
[农业科学—作物学]
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