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核桃JrCOR413基因家族鉴定与表达分析 被引量:3
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作者 刘凯 李瑶玲 +4 位作者 李洋 王红霞 赵书岗 安秀红 张志华 《河北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第2期14-20,共7页
为解析核桃COR413基因家族在响应冷胁迫中的作用,本研究利用生物信息学技术在核桃全基因组筛选并鉴定COR413家族基因,对该家族成员进行结构和表达分析。结果表明,核桃COR413基因家族包含6个基因,编码7条蛋白,分布在4条染色体上,开放阅... 为解析核桃COR413基因家族在响应冷胁迫中的作用,本研究利用生物信息学技术在核桃全基因组筛选并鉴定COR413家族基因,对该家族成员进行结构和表达分析。结果表明,核桃COR413基因家族包含6个基因,编码7条蛋白,分布在4条染色体上,开放阅读框为549~804 bp,翻译蛋白范围为182~267个氨基酸,等电点为8.15~9.93,全部为碱性稳定蛋白;含有典型的WCOR413高度保守的结构域。聚类分析发现,该类基因可与拟南芥高度同源,并分为2个亚组。在低温胁迫48 h后经转录表达分析,JrCOR5在2个核桃品种中显著升高,并且在花器官和嫩茎转录表达较高;结合qPCR分析,JrCOR5在冷胁迫48 h显著升高,达到90倍以上。因此,推测JrCOR5可能在核桃响应冷胁迫过程中起到重要作用。本研究结果将为解析核桃JrCOR413基因家族成员在响应冷胁迫过程中的分子机制研究奠定基础。 展开更多
关键词 核桃 冷胁迫 cor413基因家族 表达分析
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甘蓝型油菜及其二倍体祖先种COR413家族基因生物信息学分析 被引量:1
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作者 袁淑培 张付贵 +3 位作者 黄倩 程希 高桂珍 伍晓明 《中国油料作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期507-516,共10页
COR413(cold- regulated 413)是植物响应低温与冷害胁迫的重要基因家族,为深入解析油菜耐寒分子机制,利用生物信息学方法在甘蓝型油菜、白菜和甘蓝基因组中分别筛选和鉴定到11、6和6个COR413基因,它们大部分定位在质膜和叶绿体膜上。COR... COR413(cold- regulated 413)是植物响应低温与冷害胁迫的重要基因家族,为深入解析油菜耐寒分子机制,利用生物信息学方法在甘蓝型油菜、白菜和甘蓝基因组中分别筛选和鉴定到11、6和6个COR413基因,它们大部分定位在质膜和叶绿体膜上。COR413家族蛋白高度保守,具疏水性,较稳定,含有COR大家族其它类型蛋白所没有的色氨酸,不含信号肽。拟南芥、白菜和甘蓝组织表达特异性分析发现,亚家族I中的基因大部分在根和叶中有较高的表达量,亚家族II中的基因在茎和叶中有高表达。 展开更多
关键词 甘蓝型油菜 cor413基因家族 低温 生物信息学
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蜡梅Chimonanthus praecox(L.)Link COR413蛋白基因(Cpcor413pm1)的分子特性与表达分析 被引量:13
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作者 秦华 眭顺照 +2 位作者 李名扬 雷兴华 余国武 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第7期547-552,共6页
为研究蜡梅冬季开花过程的抗寒分子机理,在构建蜡梅花cDNA文库及EST分析的基础上,通过随机克隆测序,克隆了1个蜡梅COR413蛋白的cDNA基因,命名为Cpcor413pm1.Cpcor413pm1cDNA长946bp,推测的编码蛋白CpCOR413PM1包含201个氨基酸.CpCOR413... 为研究蜡梅冬季开花过程的抗寒分子机理,在构建蜡梅花cDNA文库及EST分析的基础上,通过随机克隆测序,克隆了1个蜡梅COR413蛋白的cDNA基因,命名为Cpcor413pm1.Cpcor413pm1cDNA长946bp,推测的编码蛋白CpCOR413PM1包含201个氨基酸.CpCOR413PM1蛋白N端保守性差,没有信号肽,具有5个保守的跨膜区,1个潜在的GPI锚点,具有可能对蛋白结构或活性十分重要的位置保守的7个Pro、1个Cys,1个被富Gly区一分为二的α螺旋区域,以及Tyr、Thr、Ser磷酸化位点各1个.序列比较分析表明,Cpcor413pm1是首次从蜡梅中克隆到的COR413蛋白基因.RT-PCR分析表明,该基因在蜡梅的萌动期、蕾期、露瓣期、初开期、盛开期、衰老期均有表达,但在初开期和盛开期表达丰度更高,推测Cpcor413pm1与蜡梅花的抗冻性有密切关系. 展开更多
关键词 蜡梅 cor413蛋白 Cpcor413pm1基因 抗寒
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丹参COR413基因克隆及表达分析 被引量:8
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作者 徐鹍 王喆之 《陕西师范大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2010年第5期77-81,共5页
从丹参EST数据库筛选出一条与冷调节基因(cold-regulated gene,COR)家族同源性较高的基因序列,并利用PCR方法得到该基因的DNA序列,命名为SmCOR413.该基因DNA序列长1708 bp,包含4个外显子和3个内含子,编码171个氨基酸,与其他9种植物中... 从丹参EST数据库筛选出一条与冷调节基因(cold-regulated gene,COR)家族同源性较高的基因序列,并利用PCR方法得到该基因的DNA序列,命名为SmCOR413.该基因DNA序列长1708 bp,包含4个外显子和3个内含子,编码171个氨基酸,与其他9种植物中的COR413高度相似,相似性介于66%~78%之间,推测为COR413基因家族的一个新基因.生物信息学分析表明,SmCOR413所编码蛋白的分子量为19.77 kD,理论等电点为8.95,不具备信号肽.实时定量PCR检测的结果显示,SmCOR413在丹参根、茎和叶中都有表达,在叶、茎中表达量较高,根部的表达量最低. 展开更多
关键词 丹参 cor413基因 实时定量PCR
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山葡萄北冰红冷适应蛋白COR413-I2基因分离及特征分析 被引量:1
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作者 王学娟 《江苏农业科学》 2018年第19期17-20,共4页
温度是植物种子萌发及生长发育的关键环境因素之一。冷适应蛋白作为植物冷调节的基因,在植物生命周期中起着重要的作用。以耐寒品种北冰红葡萄叶片为材料,设计特异性引物,克隆北冰红冷适应蛋白基因。该基因序列全长609 bp,共编码202个... 温度是植物种子萌发及生长发育的关键环境因素之一。冷适应蛋白作为植物冷调节的基因,在植物生命周期中起着重要的作用。以耐寒品种北冰红葡萄叶片为材料,设计特异性引物,克隆北冰红冷适应蛋白基因。该基因序列全长609 bp,共编码202个氨基酸,将其命名为Vv COR413-I2,该基因编码蛋白的分子量为22. 6 ku,等电点值为9. 88。氨基酸序列同源性对比结果显示,该序列与其他植物的COR413蛋白一致性在78%以上。对该蛋白的结构分析显示,它具有WCOR413蛋白功能域,是WCOR413超家族成员,二级结构分析该蛋白含有5个跨膜结构域。 展开更多
关键词 山葡萄北冰红 冷适应蛋白基因(cor413) 基因克隆 特征分析
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山葡萄北冰红VvCOR413-I1基因克隆及生物信息学分析
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作者 王学娟 《安徽农业科学》 CAS 2018年第14期109-112,共4页
[目的]从山葡萄北冰红中克隆耐寒基因COR413,并对其功能进行生物信息学分析。[方法]利用RT-PCR法克隆山葡萄北冰红基因COR413,并利用生物信息学对其进行分析。[结果]它包括630 bp完整的开放阅读框,推测编码210个氨基酸,蛋白的分子量(MW)... [目的]从山葡萄北冰红中克隆耐寒基因COR413,并对其功能进行生物信息学分析。[方法]利用RT-PCR法克隆山葡萄北冰红基因COR413,并利用生物信息学对其进行分析。[结果]它包括630 bp完整的开放阅读框,推测编码210个氨基酸,蛋白的分子量(MW)为59.18 k D,等电点(p I)值为10.74。其蛋白结构以α-螺旋、延伸链为主,其次为无规则卷曲,β-转角所占比例最少,含有4个跨膜结构域。多重序列比对表明VvCOR413-I1与其他植物COR413的氨基酸序列相似性为63.00%~68.33%。[结论]该研究为深入了解VvCOR413-I1功能奠定了基础。 展开更多
关键词 冷适应蛋白基因(cor413) 山葡萄北冰红 克隆 生物信息学分析
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转柽柳冷适应蛋白基因水稻的获得及抗冷性分析 被引量:3
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作者 符楠 殷奎德 +2 位作者 郭晓红 刘芳 吕艳东 《上海农业学报》 CSCD 2016年第2期14-18,共5页
利用农杆菌介导法将柽柳ThCAP基因导入到粳稻基因组中,对T_0、T_1代潮霉素抗性植株进行PCR、qRT-PCR及Western Blot检测分析表明,ThCAP基因已整合到粳稻基因组中,并能转录和翻译出相应的产物。在4℃低温处理条件下,比较了转基因植株的... 利用农杆菌介导法将柽柳ThCAP基因导入到粳稻基因组中,对T_0、T_1代潮霉素抗性植株进行PCR、qRT-PCR及Western Blot检测分析表明,ThCAP基因已整合到粳稻基因组中,并能转录和翻译出相应的产物。在4℃低温处理条件下,比较了转基因植株的脯氨酸含量、相对电导率和丙二醛(MDA)含量等指标。结果表明:4℃低温处理7 d后,转基因植株T_2 L-6脯氨酸含量最高,是野生型对照的175.44%;相对电导率和丙二醛(MDA)含量均显著低于对照。ThCAP基因的转入提高了转基因水稻的抗冷性。 展开更多
关键词 柽柳 水稻 cor413 基因 抗冷性
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