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Expression of cyclin-dependent kinases in HL-60 cells during differentiation induced by retinoic acid
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作者 张乾勇 糜漫天 +3 位作者 郎海滨 杨志祥 韦娜 黄国荣 《Journal of Medical Colleges of PLA(China)》 CAS 1998年第1期32-34,39,共4页
This study was designed to investigate the relationship of the expression of cyclin-dependent kinases (CDKs) with theeffects of all-trans retinoic acid (ATRA) on the proliferation of HL-cells. HL-60 cells were treated... This study was designed to investigate the relationship of the expression of cyclin-dependent kinases (CDKs) with theeffects of all-trans retinoic acid (ATRA) on the proliferation of HL-cells. HL-60 cells were treated with ATRA for 1-4 d. Then thecapacity of DNA Synthesis was evaluated with 3H-TdR incorporation and the expression of cyclin E, cyclin D, CDK2 and CDK4protein determined with immunocytochemical staining. In addition, the expression Of CDC2, CDK2 and CDK4 mRNA was deter-mined with in situ hybridization. It was found that ATRA suppressed the proliferation of HL-60 cells and decreased their capacityof DNA synthesis to result in a down-regulation of the expression of cyclin E, cyclin D and CDC2 without comcomittant suppressionon the expression of CDK2 and CDK4. It is concluded that the effects of ATRA on the proliferation of HL-60 cells may be relatedto the down-regulation of the expression of cyclin E, cyclin D and CDC2. 展开更多
关键词 RETINOIC ACID cyclin-dependent kinase cell CYCLE control
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基于机器学习与分子动力学模拟发现CDK2抑制剂
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作者 谭英佳 陈亮 +2 位作者 刘聿琳 那日松 赵熹 《高等学校化学学报》 北大核心 2025年第3期121-131,共11页
通过机器学习和分子动力学模拟方法发现了细胞周期蛋白依赖性激酶2(CDK2)潜在的抑制剂.首先,利用现有的大型活性数据库和机器学习算法,建立了针对CDK2抑制剂的分类模型.采用圆形指纹(ECFP6)的极端梯度提升树模型(XGBoost)筛选Enamine数... 通过机器学习和分子动力学模拟方法发现了细胞周期蛋白依赖性激酶2(CDK2)潜在的抑制剂.首先,利用现有的大型活性数据库和机器学习算法,建立了针对CDK2抑制剂的分类模型.采用圆形指纹(ECFP6)的极端梯度提升树模型(XGBoost)筛选Enamine数据库,并选出了1152个新型化合物.通过分子对接和打分函数对这些潜在化合物在CDK2中的亲和力进行了排序,并采用指纹聚类的方法将化合物分为4类.分别从4类中选择1种对接评分较高的化合物,然后对4种化合物进行了类药性分析和分子动力学模拟.类药性分析结果表明,筛选出的4种潜在的CDK2抑制剂(Z1766368563, Z363564868, Z1891240670和Z2701273053)具有良好的成药性,并在分子动力学模拟结果中具有较高的结合自由能.这4种化合物可作为CDK2的先导化合物进行后续的改造和优化. 展开更多
关键词 cdk2抑制剂 机器学习 分子动力学 结合自由能
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c-Myc、CDK12在胃癌组织中的表达及临床意义 被引量:2
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作者 杨雪 程园园 田瑞华 《中国实用医药》 2024年第2期11-14,共4页
目的 探讨胃癌组织中c-Myc、细胞周期蛋白依赖性激酶12(CDK12)表达及其与患者临床特征及预后的关系。方法 收集80例胃癌患者的胃癌组织和癌旁组织标本,采用免疫组化法检测标本中的c-Myc、CDK12表达水平。比较胃癌组织和癌旁组织中c-Myc... 目的 探讨胃癌组织中c-Myc、细胞周期蛋白依赖性激酶12(CDK12)表达及其与患者临床特征及预后的关系。方法 收集80例胃癌患者的胃癌组织和癌旁组织标本,采用免疫组化法检测标本中的c-Myc、CDK12表达水平。比较胃癌组织和癌旁组织中c-Myc、CDK12阳性表达情况;分析胃癌组织中c-Myc、CDK12阳性表达与患者临床病理特征的关系;分析c-Myc与CDK12阳性表达的相关性,胃癌组织中c-Myc、CDK12阳性表达与胃癌患者预后的关系。结果 胃癌组织中c-Myc、CDK12阳性表达率(77.5%、87.5%)均明显高于癌旁组织(13.8%、15.0%)(P<0.05)。不同年龄、性别、肿瘤最大直径患者胃癌组织中c-Myc、CDK12阳性表达率比较差异无统计学意义(P>0.05);中低分化、Ⅲ~Ⅳ期、侵犯浆膜、有淋巴结转移患者胃癌组织中c-Myc和CDK12阳性表达率分别为88.0%、87.0%、88.9%、90.0%和94.0%、92.6%、97.2%、100.0%,均明显高于高分化、Ⅰ~Ⅱ期、未侵犯浆膜、无淋巴结转移患者胃癌组织的60.0%、57.7%、68.2%、70.0%和76.7%、76.9%、79.5%、80.0%(P<0.05)。相关分析发现,c-Myc、CDK12在胃癌组织中的表达呈正相关性(r=0.487,P=0.016<0.05)。胃癌组织中c-Myc、CDK12阳性患者的3年生存率分别为19.4%、21.4%,均明显低于c-Myc、CDK12阴性患者的55.6%、70.0%(P<0.05)。结论 c-Myc、CDK12在胃癌组织中异常高表达,两者呈正相关性,并与肿瘤的TNM分期、分化程度、肿瘤侵袭深度及淋巴结转移有关,对患者的预后有明显影响,通过检测两者水平可能评估胃癌患者的预后。 展开更多
关键词 胃癌 癌基因 C-MYC 细胞周期蛋白依赖性激酶12 预后
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胃癌组织中CCNB1、CDK1的表达及其与总体生存率的相关性
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作者 王娜 杨迷玲 徐宪伟 《四川生理科学杂志》 2024年第4期718-720,共3页
目的:观察胃癌组织中细胞周期蛋白B1(Cyclin B1,CCNB1)和细胞周期蛋白质依赖激酶1(Cyclin-dependent kinases1,CDK1)的表达与患者总体生存率之间的关系。方法:回顾分析2017年9月至2023年9月于本院完成胃癌根治术和术后5年随访的58例胃... 目的:观察胃癌组织中细胞周期蛋白B1(Cyclin B1,CCNB1)和细胞周期蛋白质依赖激酶1(Cyclin-dependent kinases1,CDK1)的表达与患者总体生存率之间的关系。方法:回顾分析2017年9月至2023年9月于本院完成胃癌根治术和术后5年随访的58例胃癌患者资料,查阅资料,记录癌组织与癌旁组织的CCNB1、CDK1表达情况,重点分析癌组织CCNB1和CDK1表达与胃癌患者术后总体生存率的关系。结果:癌组织CCNB1、CDK1阳性表达占比高于癌旁组织(P<0.05);不同浸润程度患者的CDK1阳性占比比较差异有统计学意义(P<0.05),不同淋巴结转移、肿瘤转移(Tumor Node Metastasis,TNM)分期和分化程度胃癌患者的CCNB1、CDK1阳性占比比较差异有统计学意义(P<0.05);58例患者病死42例,病死率为72.41%;病死组癌组织CCNB1、CDK1阳性占比高于存活组(P<0.05);经相关性检验,胃癌患者癌组织CCNB1和CDK1阳性表达与生存情况(病死)存在正相关关系(r>0,P<0.05)。结论:CCNB1、CDK1在胃癌癌组织中呈异常表达,这种异常表达可能与患者术后总体生存率有关,提示术后病死高风险,应引起临床重视。 展开更多
关键词 胃癌 细胞周期蛋白B1 细胞周期蛋白依赖性激酶1 生存率 相关性
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白血病患者cyclin E2、CDK2的表达与复发的关系
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作者 徐丽粉 郭晓楠 刘英芳 《临床荟萃》 CAS 2012年第5期410-412,共3页
目的探讨急性白血病患者细胞周期蛋白E2(cyclin E2)和细胞周期蛋白依赖性激酶2(CDK2)的表达情况及预后意义。方法急性白血病(AL)患者70例,包括新近诊断急性白血病患者41例、复发患者10例和完全缓解期患者19例。14例健康人为正常对照。... 目的探讨急性白血病患者细胞周期蛋白E2(cyclin E2)和细胞周期蛋白依赖性激酶2(CDK2)的表达情况及预后意义。方法急性白血病(AL)患者70例,包括新近诊断急性白血病患者41例、复发患者10例和完全缓解期患者19例。14例健康人为正常对照。应用半定量反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)方法检测骨髓或外周血单个核细胞cyclin E2和CDK2mRNA表达水平。结果 Cyclin E2和CDK2mRNA在初治的AL患者阳性表达明显高于正常对照组(70.7%vs 0%,P<0.05),cyclin E2在完全缓解组中阳性率低于初治组(47.4%vs 70.7%,P<0.05),初治组CDK2阳性率高于正常对照组(78.0%vs 28.6%,P<0.05)。cyclin E2mRNA阳性表达患者完全缓解率低于阴性表达者(48.3%vs 91.7%,χ2=5.016,P<0.05)。结论 Cyclin E2和CDK2可望成为急性白血病早期预后指标和复发判断指标。 展开更多
关键词 白血病 细胞周期蛋白E 细胞周期蛋白依赖性激酶2
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细胞周期蛋白依赖性激酶16(CDK16)与细胞增殖指标Ki67在食管鳞癌中的表达及意义 被引量:11
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作者 郑皓 景嘉楠 +4 位作者 董慧 轩阁 李铁鹏 夏鑫 董子明 《西安交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期425-431,共7页
目的探讨细胞周期蛋白依赖性激酶16(CDK16)及细胞增殖指标Ki67在人食管鳞癌组织中的表达及其生物学意义,并探讨二者在食管鳞癌中表达的相关性。方法采用免疫组织化学方法检测CDK16、Ki67蛋白在75例食管鳞癌/癌旁组织中的表达,使用数学... 目的探讨细胞周期蛋白依赖性激酶16(CDK16)及细胞增殖指标Ki67在人食管鳞癌组织中的表达及其生物学意义,并探讨二者在食管鳞癌中表达的相关性。方法采用免疫组织化学方法检测CDK16、Ki67蛋白在75例食管鳞癌/癌旁组织中的表达,使用数学统计分析软件分析这两种蛋白的表达与食管鳞癌临床病理特征之间的关系。结果 CDK16在食管鳞癌组织中的表达显著高于癌旁组织中的表达(P<0.05),CDK16的表达与食管鳞癌的分化程度、淋巴结转移及TNM临床分期密切相关(P<0.05),而与食管鳞癌患者的性别、年龄、肿瘤部位、肿瘤最大径及肿瘤的病理形态均无关(P>0.05)。另外,在食管鳞癌组织中,Ki67的表达与食管鳞癌的分化程度、淋巴结转移及TNM临床分期之间存在显著的相关性(P<0.05),且相关性分析显示,食管鳞癌中CDK16与Ki67二者的表达呈显著正相关(χ~2=24.36,P<0.001, Pearson列联系数=0.518)。结论 CDK16蛋白和Ki67蛋白在食管鳞癌中的表达明显升高,联合检测CDK16与Ki67的表达,可作为判断食管鳞癌恶性程度及评估患者预后水平的重要参考指标。 展开更多
关键词 食管鳞癌 细胞周期蛋白依赖性激酶16(cdk16) KI67 组织芯片 免疫组化
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锂对慢性铝暴露大鼠脑内CDK5和PP2A表达的影响 被引量:4
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作者 陆文惠 屈秋民 曹红梅 《西安交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2010年第4期463-466,共4页
目的研究锂对慢性铝暴露大鼠脑内周期蛋白依赖性激酶5(CDK5)和蛋白磷酸酯酶2A(PP2A)表达的影响,进一步探讨锂抑制tau蛋白磷酸化的作用机制。方法慢性铝暴露大鼠12只,随机分为锂治疗组和非治疗组。锂治疗组给予氯化锂[200mg/(kg·d)... 目的研究锂对慢性铝暴露大鼠脑内周期蛋白依赖性激酶5(CDK5)和蛋白磷酸酯酶2A(PP2A)表达的影响,进一步探讨锂抑制tau蛋白磷酸化的作用机制。方法慢性铝暴露大鼠12只,随机分为锂治疗组和非治疗组。锂治疗组给予氯化锂[200mg/(kg·d)]溶液连续灌胃6周;非治疗组以等量生理盐水灌胃。另取6只同月龄非铝暴露大鼠为正常对照组。Morris水迷宫测试3组大鼠学习记忆功能;Western blotting检测大鼠大脑皮层及海马磷酸化tau蛋白、CDK5、PP2A的表达。结果慢性铝暴露非治疗组大鼠脑内磷酸化tau蛋白含量、CDK5表达明显高于正常对照组大鼠(P<0.05),且慢性铝暴露非治疗组大鼠脑内磷酸化tau蛋白含量与CDK5表达呈正相关(r=0.702,P=0.036)。锂治疗组大鼠脑内磷酸化tau蛋白含量、CDK5表达明显低于非治疗组(P<0.05),且锂治疗组大鼠脑内CDK5表达与磷酸化tau蛋白含量呈正相关(r=0.871,P=0.024),而正常组、锂治疗组和非治疗组大鼠皮层及海马PP2A含量无明显差异(P>0.05)。结论抑制脑内CDK5表达可能是锂降低tau蛋白过度磷酸化,减少大鼠脑内神经原纤维缠结的又一途径。 展开更多
关键词 阿尔茨海默病 TAU蛋白磷酸化 周期蛋白依赖性激酶5 蛋白磷酸酯酶2A
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猪Cdk2基因的克隆及其功能研究 被引量:2
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作者 唐青海 张辉 +1 位作者 危艳武 刘长明 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第10期1522-1531,共10页
本研究旨在克隆猪Cdk2基因,并研究其编码蛋白CDK2的生物学功能。采用RT-PCR扩增猪Cdk2基因,运用生物信息学软件分析其核苷酸和编码氨基酸特征,并预测编码蛋白的生物学功能;利用半定量RT-PCR方法分析该基因在猪各个脏器和组织中的表达情... 本研究旨在克隆猪Cdk2基因,并研究其编码蛋白CDK2的生物学功能。采用RT-PCR扩增猪Cdk2基因,运用生物信息学软件分析其核苷酸和编码氨基酸特征,并预测编码蛋白的生物学功能;利用半定量RT-PCR方法分析该基因在猪各个脏器和组织中的表达情况;共聚焦显微镜观察CDK2的亚细胞定位,采用过表达和shRNA干扰技术研究CDK2在细胞周期和细胞增殖中的调控作用。结果表明,猪Cdk2基因开放阅读框(ORF)为897bp(GenBank:JX967576),该基因与绵羊、牛、山羊、人、金仓鼠、小鼠、仓鼠和沟鼠Cdk2的核苷酸相似性依次为94.2%、94.0%、93.8%、93.4%、91.8%、91.0%、90.6%和89.9%,与牛、山羊和绵羊的亲缘关系最近;Cdk2编码298aa,CDK2分子质量为34ku。Cdk2mRNA在猪10个不同脏器和组织中均有表达。CDK2定位于细胞质和细胞核中,并通过蛋白酶体途径降解。猪CDK2在PK-15细胞中过表达引起S期细胞比例显著减少及G2/M期细胞比例显著增加(P<0.05),而G0/G1期无显著变化;相反,CDK2表达量降低引起S期细胞比例显著减少及G0/G1期细胞比例显著增加,而G2/M期无显著变化。本研究成功克隆了猪Cdk2基因并对其编码蛋白生物学功能进行了初步研究。 展开更多
关键词 cdk2 基因克隆 细胞周期 细胞增殖
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绵羊Cdkn1c的DNA甲基化分析 被引量:1
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作者 赵丽霞 赵高平 +2 位作者 郭荣启 王丙萍 周欢敏 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2010年第4期85-88,共4页
为了探究绵羊Cdkn1c的甲基化状态,本研究对绵羊及其它3个物种的Cdkn1c mRNA序列进行了生物信息学分析,并通过亚硫酸氢盐测序法(BSP)对新生羔羊肾脏和肺脏Cdkn1c CpG岛上的CpG位点进行了甲基化分析。结果显示,整个编码区富含CG,为CpG岛;... 为了探究绵羊Cdkn1c的甲基化状态,本研究对绵羊及其它3个物种的Cdkn1c mRNA序列进行了生物信息学分析,并通过亚硫酸氢盐测序法(BSP)对新生羔羊肾脏和肺脏Cdkn1c CpG岛上的CpG位点进行了甲基化分析。结果显示,整个编码区富含CG,为CpG岛;绵羊Cdkn1c所有分析位点均非甲基化,暗示该区域并非差异甲基化区域(DMR)。 展开更多
关键词 cdkn1c BSP DNA甲基化 印记
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miR-210靶向CDK7参与骨关节炎保护的作用机制 被引量:1
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作者 徐志强 李晗 《山西医科大学学报》 CAS 2021年第9期1195-1201,共7页
目的探讨骨关节炎(OA)发生过程中微小RNA-210(microRNA,miR-210)及细胞周期蛋白依赖性激酶7(CDK7)的调控作用。方法SD大鼠随机分为正常对照组、模型组、AgomiR-210组(注射miR-210激动剂,2 nmol/只)、AgomiR-210 NC组(注射miR-210阴性对... 目的探讨骨关节炎(OA)发生过程中微小RNA-210(microRNA,miR-210)及细胞周期蛋白依赖性激酶7(CDK7)的调控作用。方法SD大鼠随机分为正常对照组、模型组、AgomiR-210组(注射miR-210激动剂,2 nmol/只)、AgomiR-210 NC组(注射miR-210阴性对照试剂,2 nmol/只),每组10只。采用膝关节内侧韧带离断与半月板切除术建立OA模型,术后1周经关节腔注射相应药物8周。观察大鼠软骨大体形态;苏木精-伊红染色(HE)观察软骨组织学形态并进行Mankin’s评分;蛋白免疫印迹法(Western blot)测软骨组织中CDK7、核因子-κB活性因子p65(NF-κB p65)及磷酸化NF-κB p65(p-NF-κB p65)、白细胞介素-6(IL-6)、肿瘤坏死因子(TNF-α)表达水平;实时荧光定量聚合酶链反应(RT-qPCR)法检测软骨组织中miR-210表达。双荧光素酶报告试验验证miR-21与CDK7的靶向关系。取人SW1353软骨细胞系,设置为:正常组、OA模型组(10 ng/ml IL-1β诱导建立OA模型)、miR-210 mimic组(转染miR-210过表达试剂)、miR-210 mimic NC组(转染miR-210过表达阴性对照试剂)、miR-210 mimic+pcDNA-CDK7(转染miR-210过表达试剂及CDK7过表达序列)、miR-210 mimic+pcDNA组(转染miR-210过表达试剂+CDK7过表达阴性对照序列);RT-qPCR及Western blot检测miR-210及CDK7、p-NF-κB p65/NF-κB p65、IL-6、TNF-α蛋白表达。结果与正常对照组相比,模型组及AgomiR-210 NC组大鼠关节面糜烂、软骨缺损等病理损伤严重;AgomiR-210组大鼠关节及软骨病变缓解。与正常对照组相比,模型组及AgomiR-210 NC组大鼠Mankin’s评分、CDK7、p-NF-κB p65/NF-κB p65、IL-6、TNF-α蛋白表达升高(P<0.05),miR-210表达降低(P<0.05)。AgomiR-210组大鼠上述指标变化趋势与模型组及AgomiR-210 NC组相反(P<0.05)。双荧光素酶报告试验结果显示,与miR-210 NC+CDK7-3′UTR-WT组比较,miR-210 mimics+CDK7-3′UTR-WT组荧光素酶活性降低(P<0.05)。miR-210 mimic与pcDNA-CDK7共转染,可削弱miR-210 mimic下调CDK7-NF-κB p65通路表达及缓解软骨细胞炎性反应的作用(P<0.05)。结论miR-210可能通过靶向抑制CDK7表达,抑制NF-κB通路活化,进而缓解OA炎症损伤及软骨病变。 展开更多
关键词 骨关节炎 微小RNA-210 细胞周期蛋白依赖性激酶7 软骨细胞 核因子-κB通路
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子宫内膜腺癌中p53和CDK4的表达及意义
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作者 邢兰瑛 高庆 +1 位作者 主改霞 樊江波 《西安交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2004年第2期179-181,共3页
目的 探讨子宫内膜腺癌中调亡相关基因p5 3和细胞周期素依赖性激酶 4 (cyclindependentkinase 4 ,CDK4 )的表达水平及临床意义。方法 采用免疫组化SP法检测 32例子宫内膜腺癌中p5 3和CDK4的表达。结果  32例子宫内膜腺癌中p5 3蛋白... 目的 探讨子宫内膜腺癌中调亡相关基因p5 3和细胞周期素依赖性激酶 4 (cyclindependentkinase 4 ,CDK4 )的表达水平及临床意义。方法 采用免疫组化SP法检测 32例子宫内膜腺癌中p5 3和CDK4的表达。结果  32例子宫内膜腺癌中p5 3蛋白表达阳性率为 4 3.8% ,p5 3阳性表达与子宫内膜腺癌的组织学分级 ,肌层浸润深度和淋巴结转移呈负相关 (P <0 .0 5 ) ,与临床分期无相关关系 (P >0 .0 5 ) ;CDK4在子宫内膜腺癌中的阳性表达率为 6 8.8% (2 2 /32 ) ,CDK4阳性表达与子宫内膜腺癌的浸润深度和淋巴结转移呈正相关 (P >0 .0 5 ) ,与组织学分级和临床分期均无关(P >0 .0 5 ) ,p5 3和CDK4的表达呈负相关 (P <0 .0 5 )。结论 p5 展开更多
关键词 子宫内膜腺癌 P53 cdk4 调亡相关基因 细胞周期素依赖性激酶4
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Cdk5抑制剂Roscovitine对神经病理性疼痛大鼠痛行为学的影响及机制
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作者 钟妤 陈佳林 +1 位作者 谢玉波 陈静 《山东医药》 CAS 2018年第48期41-44,共4页
目的观察Cdk5抑制剂Roscovitine对神经病理性疼痛大鼠痛行为学的影响,并探讨其机制。方法选择SD大鼠64只,随机分为正常对照组(N组)8只、假手术组(S组)8只、坐骨神经结扎(CCI)组(I组)8只、CCI+溶剂组(D组)8只,剩余32只作为CCI+给药组(R组... 目的观察Cdk5抑制剂Roscovitine对神经病理性疼痛大鼠痛行为学的影响,并探讨其机制。方法选择SD大鼠64只,随机分为正常对照组(N组)8只、假手术组(S组)8只、坐骨神经结扎(CCI)组(I组)8只、CCI+溶剂组(D组)8只,剩余32只作为CCI+给药组(R组)。I组、D组和R组行鞘内置管7天后,采用CCI法建立神经病理性疼痛模型,N组不做任何处理,S组暴露坐骨神经但不予结扎。术后第7天,D组鞘内注射5%二甲基亚砜20μL,R组鞘内注射Cdk5抑制剂Roscovitine 100μg,N组、S组和I组不注射药物。分别于术前(T_0)、术后3天(T_1)、术后5天(T_2)、术后7天(T_3)以及给药后0.5(T_4)、2(T_5)、6(T_6)、12 h(T_7),检测各组机械性缩足阈值(PWMT)、热缩足潜伏期(PWTL)。腹腔注射麻醉后,取各组脊髓腰膨大处(L_4~L_6)组织,采用Western blotting法检测脊髓星形胶质细胞胶质纤维酸性蛋白(GFAP)表达。结果与N组、S组比较,I组、D组和R组术后各时间点PWMT、PWTL均明显降低(P均<0.05);与I组相比,R组给药后T_5~T_7时PWMT、PWTL均明显升高(P均<0.05)。与S组比较,I组、D组和R组T_4~T_7时脊髓星形胶质细胞GFAP表达均明显上调(P均<0.05);与D组比较,R组给药后T_5~T_7时脊髓星形胶质细胞GFAP表达均明显下调(P均<0.05)。结论Cdk5抑制剂Roscovitine可减轻大鼠神经病理性疼痛,其机制可能与抑制脊髓星形胶质细胞GFAP表达有关。 展开更多
关键词 神经病理性疼痛 星形胶质细胞 细胞周期依赖性蛋白激酶5 大鼠
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胃癌干细胞差异表达基因筛选及其对肿瘤发生能力的调控机制
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作者 徐桂华 董志会 +1 位作者 谭雪怡 申杰 《山东医药》 2025年第3期58-63,共6页
目的筛选胃癌干细胞差异表达基因,分析其对胃癌干细胞肿瘤发生能力的调控机制。方法采用FACSCalibur流式细胞仪分选人胃癌细胞系MKN-45中的CD44^(+)、CD44^(-)细胞,并经CD44^(+)表达率、细胞球集落形成实验、裸鼠成瘤实验证实CD44^(+)... 目的筛选胃癌干细胞差异表达基因,分析其对胃癌干细胞肿瘤发生能力的调控机制。方法采用FACSCalibur流式细胞仪分选人胃癌细胞系MKN-45中的CD44^(+)、CD44^(-)细胞,并经CD44^(+)表达率、细胞球集落形成实验、裸鼠成瘤实验证实CD44^(+)胃癌细胞具有干细胞特性。取CD44^(+)、CD44^(-)胃癌细胞,HiSeq4000测序仪测序后筛选差异表达基因,经实时荧光定量PCR法和Westen blotting法证实差异具有统计学意义的仅有细胞周期蛋白依赖激酶抑制剂1A(CDKN1A)。设计CDKN1A siRNA1、siRNA2、siRNA3,其中CDKN1A siRNA2仅抑制CD44^(+)胃癌细胞CDKN1A mRNA表达但不会影响细胞存活率和细胞凋亡率。取CD44^(+)胃癌细胞,分为GAPDH siRNA组、NC siRNA组和CDKN1A siRNA2组,分别使用Lipofectamine2000转染GAPDH siRNA、NC siRNA、CDKN1A siRNA2,采用细胞球集落形成实验检测细胞球集落形成数量,BrdU标记法检测BrdU阳性细胞率,流式细胞术检测细胞周期比例。利用Webgestalt软件预测CD44^(+)胃癌细胞中调控CDKN1A表达的上游微小核糖核酸(miRNA),实时荧光定量PCR法证实CD44^(+)、CD44^(-)胃癌细胞中差异具有统计学意义的仅有miR-20a。取CD44^(+)胃癌细胞,随机分为mimic组、mimic NC组、inhibitor组、inhibitor NC组、空白对照组,分别使用Lipofectamine2000转染miR-20a mimic、miR-20a mimic阴性对照、miR-20a inhibitor、miR-20a inhibitor阴性对照和等量PBS,采用实时荧光定量PCR法检测miR-20a、CDKN1A mRNA表达,Westen blotting法检测CDKNIA蛋白表达,流式细胞术检测细胞周期比例,裸鼠成瘤实验检测其在裸鼠体内的成瘤能力(记录注射后0~24 d的肿瘤体积)。结果与NC siRNA组和GAPDH siRNA组比较,CDKN1A siRNA2组细胞集落形成数量、BrdU阳性细胞率、S期细胞比例均升高而G1期细胞比例降低(P均<0.05)。与Control组、mimic NC组、inhibitor NC组比较,mimic组miR-20a表达升高而CDKN1A mRNA及蛋白相对表达量降低,inhibitor组miR-20a表达降低而CDKN1A mRNA及蛋白相对表达量升高(P均<0.05)。与Control组、mimic NC组、inhibitor NC组比较,mimic组G1期细胞比例降低而S期细胞比例、15~24 d肿瘤体积均升高,inhibitor组G1期细胞比例升高而S期细胞比例、15~24 d肿瘤体积均降低(P均<0.05)。各组0~12 d肿瘤体积比较差异均无统计学意义(P均>0.05)。结论差异表达基因miR-20a可通过负向靶控CDKN1A表达而调控胃癌干细胞的细胞周期,从而增强其肿瘤发生能力。 展开更多
关键词 微小核糖核酸20a 胃癌干细胞 细胞周期蛋白依赖激酶抑制剂1A 细胞周期 肿瘤发生能力
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细胞质唾液酸酶(Neu2)通过Cdk2通路抑制FBJ-LL细胞生长 被引量:2
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作者 陈阳 吴英良 +1 位作者 山形贞子 山形达也 《沈阳药科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第2期147-151,共5页
目的研究细胞质唾液酸酶(neuraminidase 2,Neu2)调控FBJ-LL细胞生长的作用机制。方法利用逆转录聚合酶链式反应(reverse transcriptional-polymerase chain reaction,RT-PCR)检测细胞内Neu2及周期蛋白依赖性激酶2(cyclin dependent kina... 目的研究细胞质唾液酸酶(neuraminidase 2,Neu2)调控FBJ-LL细胞生长的作用机制。方法利用逆转录聚合酶链式反应(reverse transcriptional-polymerase chain reaction,RT-PCR)检测细胞内Neu2及周期蛋白依赖性激酶2(cyclin dependent kinase 2,Cdk2)的mRNA表达水平,采用酶活性检测法检测细胞内总唾液酸酶的活性,细胞活性法检测细胞的生长情况,碘化丙啶染色法辅助流式细胞仪分析处于不同细胞周期的DNA含量分布。结果Neu2 sense cDNA转染的FBJ-LL细胞中Neu2 mRNA的表达显著升高,其总唾液酸酶的活性也随之升高。FBJ病毒诱导的小鼠骨肉瘤(FBJ-LL)细胞中Neu2的过量表达可以抑制该细胞的生长,升高该细胞中处于细胞周期G1期细胞的相对数量,同时抑制了该细胞中的Cdk2的mRNA表达水平。结论Neu2通过抑制细胞周期分子Cdk2的表达来阻碍FBJ-LL细胞DNA合成,从而实现对FBJ-LL细胞的生长抑制。 展开更多
关键词 细胞质唾液酸酶2 周期蛋白依赖性激酶2 FBJ细胞 细胞生长抑制 细胞周期G1
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RNA干扰技术沉默星形胶质细胞Cdk5模型的建立 被引量:1
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作者 龙根 谢敏杰 +2 位作者 王伟 徐沙贝 刘晨辰 《生物医学工程与临床》 CAS 2018年第3期315-319,共5页
目的建立星形胶质细胞细胞周期蛋白依赖性激酶5(Cdk5)沉默模型。方法新生24 h内无特定病原(SPF)级SD雄性大鼠乳鼠240只。培养及鉴定SD雄性大鼠星形胶质细胞。设计合成针对星形胶质细胞Cdk5的小干扰RNA(siRNA)3种(Si-r-Cdk5-001、Si-r-Cd... 目的建立星形胶质细胞细胞周期蛋白依赖性激酶5(Cdk5)沉默模型。方法新生24 h内无特定病原(SPF)级SD雄性大鼠乳鼠240只。培养及鉴定SD雄性大鼠星形胶质细胞。设计合成针对星形胶质细胞Cdk5的小干扰RNA(siRNA)3种(Si-r-Cdk5-001、Si-r-Cdk5-002及Si-r-Cdk5-003),将3种siRNA分为SiT1组、SiT2组、SiT3组,在Lipofectamine 2000介导下转染星形胶质细胞;阴性对照组加入阴性对照si RNA。应用荧光染色观察转染效率,通过实时聚合酶链反应(PCR)和Western blot检测沉默效率。结果成功将Cdk5 siRNA转染入星形胶质细胞,转染效率为85%。与阴性对照组相比,SiT1组、SiT2组及SiT3组Cdk5 mRNA及蛋白表达均降低(P<0.01),其中SiT3组沉默效果最佳,分子水平沉默效率为68%,蛋白水平沉默效率为79%。结论成功通过RNA干扰技术建立星形胶质细胞Cdk5特异性沉默模型。 展开更多
关键词 星形胶质细胞 细胞周期蛋白依赖性激酶5(cdk5) RNA干扰 特异性模型
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CDK抑制剂SNS-032联合AD55-Apoptin对肝癌细胞Huh-7的体外抗癌作用 被引量:1
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作者 孙笑竹 吕春伟 +2 位作者 秦云 韩建翠 王毅刚 《浙江理工大学学报(自然科学版)》 2016年第2期290-296,共7页
通过CDK抑制剂SNS-032联合AD55-Apoptin处理肝癌Huh-7细胞,以探究两者联合作用的体外抗癌作用。采用MTT法分别检测SNS-032、AD55-Apoptin以及SNS-032与AD55-Apoptin联合对肝癌细胞株Huh-7生长的抑制作用;利用Hoechst33342染色观察所处... 通过CDK抑制剂SNS-032联合AD55-Apoptin处理肝癌Huh-7细胞,以探究两者联合作用的体外抗癌作用。采用MTT法分别检测SNS-032、AD55-Apoptin以及SNS-032与AD55-Apoptin联合对肝癌细胞株Huh-7生长的抑制作用;利用Hoechst33342染色观察所处理细胞的凋亡形态学变化,采用流式细胞术对凋亡进行量化,Western Blot检测凋亡相关蛋白表达情况。结果表明:10MOI的AD55-Apoptin联合100ng/mL的SNS-032处理96h后,Huh-7细胞的存活率仅为4%,而10 MOI的AD55-Apoptin和100ng/mL SNS-032分别单独处理后细胞存活率为60%和8%(P〈0.05);Hoechst33342染色、流式检测及Western Blot结果表明,联合处理组细胞凋亡现象更明显。实验结果证明SNS-032联合AD55-Apoptin能有效的抑制肝癌细胞Huh-7生长,并诱导其凋亡。 展开更多
关键词 cdk抑制剂(SNS-032) AD55-Apoptin 肝癌 体外 抗癌作用
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细胞周期蛋白D2同源模建及其与CDKs抑制剂对接研究
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作者 杜亚男 陈靖峰 +4 位作者 先正平 曹洪玉 唐乾 王立皓 郑学仿 《化学研究与应用》 CAS 北大核心 2023年第12期2871-2879,共9页
细胞周期蛋白D2(CyclinD2,CCND2)在细胞中的异常表达会诱发肿瘤等疾病,设计高选择性CCND2药物对抑制肿瘤具有重要意义。本文选用PDB数据库中与CCND2一级序列同源性最高的3G33为模板蛋白建模,通过Loop环区能量优化最终得到具有较高合理... 细胞周期蛋白D2(CyclinD2,CCND2)在细胞中的异常表达会诱发肿瘤等疾病,设计高选择性CCND2药物对抑制肿瘤具有重要意义。本文选用PDB数据库中与CCND2一级序列同源性最高的3G33为模板蛋白建模,通过Loop环区能量优化最终得到具有较高合理性和可信度的三维蛋白结构模型,最优模型VerifyScore为100.920,预测获得10个可能的活性位点。构建药物小分子的最低能量结构,将小分子对接至蛋白活性位点,根据对接模型确定不同药物小分子与蛋白活性位点的相互作用方式,筛选细胞周期依赖性激酶(CDKs)类似物作为药物小分子配体,实验结果对进一步研究CyclinD2的结构、功能具有理论指导意义,也为相关疾病的临床治疗奠定了理论基础。 展开更多
关键词 细胞周期蛋白D2 细胞周期依赖性激酶 同源建模 分子对接
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HNRNPU通过调控衰老相关基因CDK2表达促进胃癌的进展 被引量:2
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作者 李红君 郑丽端 《巴楚医学》 2021年第1期21-26,共6页
目的:探讨RNA结合蛋白核不均一核糖核蛋白U(HNRNPU)在胃癌发生发展中的作用及机制。方法:在胃癌细胞MGC-803中过表达或者敲低HNRNPU,并获得稳定表达的细胞株。通过MTT、软琼脂克隆形成、基质胶侵袭等体外细胞功能实验,研究HNRNPU对胃癌... 目的:探讨RNA结合蛋白核不均一核糖核蛋白U(HNRNPU)在胃癌发生发展中的作用及机制。方法:在胃癌细胞MGC-803中过表达或者敲低HNRNPU,并获得稳定表达的细胞株。通过MTT、软琼脂克隆形成、基质胶侵袭等体外细胞功能实验,研究HNRNPU对胃癌增殖和侵袭的影响。综合分析GEO、ENCORI、KOBAS、CSGene等公用数据库,寻找胃癌中HNRNPU可能调控的靶基因,并在胃癌细胞系中,利用实时定量PCR、Western Blot进行验证。结果:过表达HNRNPU可以促进MGC-803的增殖和侵袭。通过对公用数据库的深入挖掘以及实验验证发现,在胃癌中HNRNPU可上调衰老相关基因细胞周期蛋白依赖性激酶2(CDK2)的表达。结论:HNRNPU通过正向调控衰老相关基因CDK2表达,促进胃癌细胞的增殖和侵袭。 展开更多
关键词 核不均一核糖核蛋白U 细胞周期蛋白依赖性激酶2 胃癌
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MMP-9、CDK8和VEGF-C的表达与宫颈癌临床病理特点的关系 被引量:10
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作者 王海清 胡杏军 +3 位作者 刘芳 梁少群 詹雪梅 练晓勤 《中国实用医药》 2017年第25期9-11,共3页
目的探讨基质金属蛋白酶9(MMP-9)、细胞周期蛋白依赖性蛋白激酶8(CDK8)和血管内皮生长因子C(VEGF-C)在宫颈癌组织中的表达及临床意义。方法应用二步法免疫组织化学染色对70例宫颈癌组织进行MMP-9、CDK8及VEGF-C蛋白检测,观察三者表达情... 目的探讨基质金属蛋白酶9(MMP-9)、细胞周期蛋白依赖性蛋白激酶8(CDK8)和血管内皮生长因子C(VEGF-C)在宫颈癌组织中的表达及临床意义。方法应用二步法免疫组织化学染色对70例宫颈癌组织进行MMP-9、CDK8及VEGF-C蛋白检测,观察三者表达情况及其表达与临床病理特征的关系,并分析宫颈癌组织MMP-9表达与CDK8、VEGF-C表达的关系。结果 MMP-9、CDK8、VEGF-C在临床分期Ⅲ期的阳性表达高于Ⅱ期,有淋巴转移者的阳性表达高于无淋巴转移者,宫颈浸润深度≥2/3者的阳性表达高于深度<2/3者,组织分化低的阳性表达高于高、中分化,差异均具有统计学意义(P<0.05)。宫颈癌组织中MMP-9与CDK8表达呈正相关(rs=0.518,P<0.05),MMP-9与VEGF-C表达呈正相关(rs=0.657,P<0.05)。结论 MMP-9、CDK8和VEGF-C的过表达促进宫颈癌的浸润转移,具有正协同作用。联合检测MMP-9、CDK8和VEGF-C蛋白可作为预测宫颈癌的浸润转移及评价患者预后的生物学指标。 展开更多
关键词 宫颈癌 基质金属蛋白酶9 细胞周期蛋白依赖性蛋白激酶8 血管内皮生长因子C 免疫组织化学
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Computational study of non-catalytic T-loop pocket on CDK proteins for drug development 被引量:1
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作者 王慧雯 王凯丽 +5 位作者 管泽雨 简弋人 贾亚 Fatah Kashanchi 曾辰 赵蕴杰 《Chinese Physics B》 SCIE EI CAS CSCD 2017年第12期32-40,共9页
Cyclin-dependent kinases (CDKs) are critical to the cell cycle and many other biological processes, and as such, are considered as one of the promising targets for therapy against cancer and other diseases. Most pan... Cyclin-dependent kinases (CDKs) are critical to the cell cycle and many other biological processes, and as such, are considered as one of the promising targets for therapy against cancer and other diseases. Most pan-CDK inhibitors bind to the highly conserved catalytic ATP-binding pocket and therefore lack the specificity to prevent side effects. It is desirable to develop drugs targeting non-catalytic pockets for specificity towards individual CDKs. Here we performed a systematic analysis of non-catalytic pockets on CDKs and identified a region underneath the T-loop, which we term TL pocket, for potential inhibitor development. Specifically, we compared the TL pockets of human CDK2 and CDK7-homolog Pfmrk of Plasmodium falciparum, a malaria-causing parasite. Molecular dynamics simulations of several short peptides revealed that this less conserved TL pocket could be used to design potentially specific inhibitors against malaria disease. 展开更多
关键词 cyclin-dependent kinases NON-CATALYTIC TL pocket inhibitor design
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