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茎腐病胁迫下甘薯CC-NBS-LRR基因家族鉴定及转录组分析
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作者 田沺 林祥胜 +5 位作者 丁夏威 汤法江 邹宏达 王章英 梁雪莲 黄立飞 《植物保护》 北大核心 2025年第3期122-134,共13页
由达旦提狄克氏菌Dickeya dadantii引起的细菌性病害是甘薯的主要病害之一,是我国南方甘薯主产区发病面积最大,危害最为严重的病害。本研究对参与响应茎腐病胁迫的甘薯CC-NBS-LRR基因家族进行鉴定,并对其蛋白质理化性质、基因结构、保... 由达旦提狄克氏菌Dickeya dadantii引起的细菌性病害是甘薯的主要病害之一,是我国南方甘薯主产区发病面积最大,危害最为严重的病害。本研究对参与响应茎腐病胁迫的甘薯CC-NBS-LRR基因家族进行鉴定,并对其蛋白质理化性质、基因结构、保守基序、进化关系、染色体定位、顺式作用元件、表达部位等进行分析,进一步通过转录组测序和荧光定量PCR分析CC-NBS-LRR基因在抗病品种‘广薯87’和感病品种‘心香’受茎腐病菌侵染后的表达差异。结果表明,甘薯中有17个CC-NBS-LRR基因参与了茎腐病胁迫响应,其编码蛋白长度为787~1241 aa,等电点为6.46~9.14,主要分布在3号染色体上。它们与甘薯野生种Ipomoea trifida和I.triloba的CC-NBS-LRR基因聚类为一簇,与拟南芥Arabidopsis thaliana的4个CC-NBS-LRR基因亲缘关系较近,多数基因的启动子为响应光反应的顺式作用元件,其中IbCNL11和IbCNL13基因在甘薯根、茎和叶中表达量较高,IbCNL1、IbCNL2和IbCNL11与茎腐病抗性密切相关。综上,本研究明确了参与响应茎腐病胁迫的CC-NBS-LRR基因家族的特征、进化和表达模式,筛选出3个抗病候选基因,为解析甘薯抗茎腐病机制奠定了基础。 展开更多
关键词 甘薯 cc-nbs-lrr基因家族 生物信息学 茎腐病
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花生CC-NBS-LRR家族基因鉴定及在青枯病和网斑病胁迫下的表达分析
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作者 汪晓 齐飞艳 +7 位作者 孙子淇 郑峥 徐静 王娟 韩锁义 黄冰艳 董文召 张新友 《中国油料作物学报》 北大核心 2025年第2期344-355,共12页
为明确花生基因组中CC-NBS-LRR(CNL)的家族成员及其功能,对其基因家族成员进行生物信息学分析和表达模式分析,研究花生如何响应病害胁迫。以花生基因组序列为参考,利用Pfam、HMMER、NCBI和Coiled-Coil等软件和在线网站筛选,共鉴定得到85... 为明确花生基因组中CC-NBS-LRR(CNL)的家族成员及其功能,对其基因家族成员进行生物信息学分析和表达模式分析,研究花生如何响应病害胁迫。以花生基因组序列为参考,利用Pfam、HMMER、NCBI和Coiled-Coil等软件和在线网站筛选,共鉴定得到85个AhCNL家族成员,分布在20条染色体中的15条上,以A02和A12染色体上分布最多,并且大多成簇存在于染色体末端;系统进化树分析表明其可分为4个亚族,每个亚族中的基因成员保守性较高;共线性分析表明在物种内有16对基因存在共线性关系,物种间分析表明相比于拟南芥和苜蓿,花生与大豆的CNL具有较高的同源性;启动子上含有大量与激素相关和抗病相关的顺式作用元件;大部分CNL家族基因在病菌入侵前后均不表达,少部分基因受到病菌诱导后表达量有变化。 展开更多
关键词 花生 cc-nbs-lrr 青枯病 网斑病 表达分析
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陆地棉CC-NBS-LRR基因的克隆及特征分析 被引量:7
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作者 张保龙 杨郁文 +6 位作者 倪万潮 佘建明 沈新莲 何晓兰 张香桂 徐英俊 姚姝 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2006年第4期351-355,共5页
根据抗病基因核苷酸结合位点(Nuc leotide b ind ing site,NBS)设计简并性引物,从陆地棉cDNA中进行RT-PCR扩增。获得含NBS保守域的EST,进一步用RACE技术和TAIL PCR技术获得其中1个EST的全长基因序列,并获得GHNBS基因的5′调控序列。此... 根据抗病基因核苷酸结合位点(Nuc leotide b ind ing site,NBS)设计简并性引物,从陆地棉cDNA中进行RT-PCR扩增。获得含NBS保守域的EST,进一步用RACE技术和TAIL PCR技术获得其中1个EST的全长基因序列,并获得GHNBS基因的5′调控序列。此基因被命名为GHNBS。该基因的编码区长2 583 bp,编码861个氨基酸,GHNBS编码的氨基酸序列与拟南芥R基因具有28%的同源性。GHNBS与拟南芥的其他几个NBS-LRR基因比较发现,它们在保守区外的相似性相当低。Southern杂交和网上数据库搜索分析都表明GHNBS是1个寡拷贝基因。通过半定量RT-PCR分析发现GHNBS在棉花的蕾、花瓣、韧皮部、根及叶中均有表达且在根、叶中表达量比其它部位强,在木质部基本不表达。 展开更多
关键词 陆地棉 cc—nbs—lrr基因 GHnbs 基因表达
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青花菜CC-NBS-LRR抗病基因BoCNL1的克隆与分析
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作者 黄笑梅 金建峰 +4 位作者 张雪 朱思眉 朱柯柯 赵罗鹏 蒋明 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2016年第2期259-263,共5页
根据已知序列设计PCR引物,从青花菜中克隆1个NBS-LRR(核苷酸结合位点-富含亮氨酸重复)抗病基因BoCNL1;在生物信息学分析的基础上,利用RT-PCR研究该基因在不同器官中的表达模式。测序结果表明,BoCNL1基因的编码区全长为2 550 bp,编码849... 根据已知序列设计PCR引物,从青花菜中克隆1个NBS-LRR(核苷酸结合位点-富含亮氨酸重复)抗病基因BoCNL1;在生物信息学分析的基础上,利用RT-PCR研究该基因在不同器官中的表达模式。测序结果表明,BoCNL1基因的编码区全长为2 550 bp,编码849个氨基酸;编码蛋白具CC(卷曲螺旋)、NBS和LRR结构域;进化分析结果表明,BoCNL1与不结球白菜的关系最近,在进化树上处于同一分支,与醉蝶花的关系最远;RT-PCR结果表明,BoCNL1在根、花茎、叶、花蕾、开放的花和嫩角果中均有表达,但表达量低。 展开更多
关键词 青花菜 抗病基因 cc-nbs-lrr 基因克隆
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草莓NBS-LRR家族基因FaNBS1的克隆与表达分析 被引量:12
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作者 刘建成 段可 +3 位作者 李静 叶正文 苏建宇 高清华 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第6期1025-1031,共7页
利用同源克隆结合RACE技术从久香草莓茎尖cDNA中分离到一个抗病相关TIR-NBS-LRR类基因FaNBS1(GenBank登录号:HQ845018),解析了该基因及其编码蛋白的组织结构和同源特征;并采用半定量RT-PCR技术分析了该基因在不同组织中的表达差异... 利用同源克隆结合RACE技术从久香草莓茎尖cDNA中分离到一个抗病相关TIR-NBS-LRR类基因FaNBS1(GenBank登录号:HQ845018),解析了该基因及其编码蛋白的组织结构和同源特征;并采用半定量RT-PCR技术分析了该基因在不同组织中的表达差异和外源植物生长物质处理下的表达变化。该基因在基因组上长为2434bp,由3个外显子组成的转录本包含长1893bp的读码框。所编码蛋白含630个氨基酸残基,在15~146是保守的TIR结构域,191~492是NB-ARC结构域。FaNBS1与大豆TIR-NBS-LRR抗性蛋白ADF78118的全序列一致性为50.20%,在NB-ARC保守结构域的一致性为52.06%。半定量RT-PCR分析显示,FaNBS1在检测的所有组织中都表汰佃存摹套分年组织中表达水平最高,日存叶中的表达水平明显受到外源水杨酸和脱落酸处理的影响. 展开更多
关键词 草莓 nbs—lrr基因 同源克隆 基因结构 进化树 RT—PCR
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香蕉NBS-LRR抗病基因类似序列的克隆和分析(英文) 被引量:3
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作者 莫庭辉 黄俊生 +2 位作者 杜中军 徐立 陈业渊 《热带作物学报》 CSCD 2006年第3期46-50,共5页
根据大多数抗病基因的核苷酸结合区(NBS)和富含亮氨酸重复序列(LRR)保守区的氨基酸序列设计PCR简并引物,利用快速而又可行的简并PCR技术获得NBS-LRR类抗病基因类似序列。笔者利用该技术从香蕉cDNA中获得了一个NBS-LRR类抗病基因类似序列... 根据大多数抗病基因的核苷酸结合区(NBS)和富含亮氨酸重复序列(LRR)保守区的氨基酸序列设计PCR简并引物,利用快速而又可行的简并PCR技术获得NBS-LRR类抗病基因类似序列。笔者利用该技术从香蕉cDNA中获得了一个NBS-LRR类抗病基因类似序列,命名为B-NB(SAY739270)。结构域分析发现,B-NBS含有NBS蛋白所具有的P-Loop、Kinase-2、Kinase-3a和下游疏水GLPLAL结构域(HD,GLPLAL)4个保守基序。聚类分析发现,B-NBS与已报道的6个植物抗病基因的NBS基序的遗传距离在21.7之内。因此,B-NBS是一个香蕉NBS-LRR类抗病基因类似序列。本研究将为香蕉抗病基因克隆和抗病机理研究提供新的抗病候选基因资源。 展开更多
关键词 香蕉 抗病基因 类似序列 nbs—lrr
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小麦NBS-LRR类抗病基因同源cDNA序列的克隆与表达分析 被引量:8
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作者 任晓娣 刘彦慧 +4 位作者 李建嫄 张娜 彭巧慧 杨文香 刘大群 《河北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第2期69-74,79,共7页
为获得小麦抗叶锈病相关基因,以小麦近等基因系TcLr19所构建的非亲和cDNA文库中获得的EST序列(Contig 914)为靶序列,用RT-PCR方法和cDNA末端快速扩增技术,分离克隆到片段为3 042bp的全长cDNA序列。序列分析表明该序列符合典型单子叶植物... 为获得小麦抗叶锈病相关基因,以小麦近等基因系TcLr19所构建的非亲和cDNA文库中获得的EST序列(Contig 914)为靶序列,用RT-PCR方法和cDNA末端快速扩增技术,分离克隆到片段为3 042bp的全长cDNA序列。序列分析表明该序列符合典型单子叶植物的CC-NBS-LRR结构模式,命名为TaNLR。该基因包含一个完整的2 739bp的开放阅读框(ORF),具有连续的Poly A尾和典型的加尾信号AATTAA。ProtParam程序预测表明该基因编码912个氨基酸。发育树分析显示该氨基酸序列与大麦的NBS-LRR类抗病基因蛋白同源性最高达89%。荧光定量PCR分析表明,在小麦与叶锈菌互作中,TaNLR基因受叶锈菌诱导下调表达。本研究在TcLr19小麦中成功获得了抗病同源基因,这为明确NBS-LRR在小麦抗叶锈病中的作用奠定了基础。 展开更多
关键词 小麦 核苷酸结合位点(nbs) 富含亮氨酸重复(lrr) 抗病基因同源序列(RGAs) cDNA末端快速扩增技术(RACE) 实时定量PCR(real-time PCR)
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芝麻NBS-LRR类抗病基因同源序列的分离与分析 被引量:2
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作者 高树广 刘红彦 +2 位作者 王俊美 倪云霞 田保明 《河南农业科学》 CSCD 北大核心 2011年第9期81-85,共5页
分离和分析芝麻抗、感茎点枯病材料的抗病基因同源序列(resistance gene analogs,RGAs),可以为芝麻抗茎点枯病相关基因的克隆奠定基础。根据已知植物抗病基因的NBS-LRR类保守结构域,合成了1对简并引物和2对特异引物,对6个抗茎点枯病芝... 分离和分析芝麻抗、感茎点枯病材料的抗病基因同源序列(resistance gene analogs,RGAs),可以为芝麻抗茎点枯病相关基因的克隆奠定基础。根据已知植物抗病基因的NBS-LRR类保守结构域,合成了1对简并引物和2对特异引物,对6个抗茎点枯病芝麻品种中的抗病基因进行扩增,结果得到11条抗病基因同源序列。BLAST X分析发现,获得的11条RGAs与已知的RGAs有较高的相似性,氨基酸相似性为42%~57%。聚类分析将其分成5个亚类,均属于non-TIR-NBS-LRR类抗病基因。其氨基酸序列都不同程度地含有NBS保守区的典型特征基序,其中P-loop-GLPL区域氨基酸序列与已知抗病基因对应区域的相似性为18.2%~49.7%。 展开更多
关键词 芝麻 茎点枯病 nbs—lrr 抗病基因同源序列
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巴西橡胶NBS-LRR抗病基因类似物多样性分析 被引量:1
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作者 游启孙 莫廷辉 +3 位作者 曾丽星 张影波 解辉 欧阳超 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第3期371-376,共6页
【目的】克隆巴西橡胶抗病基因同源序列,为巴西橡胶抗病R基因的获取奠定基础。【方法】根据已知抗病基因(Resistance gene, R gene)编码的蛋白质NBS-LRR保守结构设计一对简并引物 P1/P2,采集经水杨酸(SA)处理0、12、24、48 h的... 【目的】克隆巴西橡胶抗病基因同源序列,为巴西橡胶抗病R基因的获取奠定基础。【方法】根据已知抗病基因(Resistance gene, R gene)编码的蛋白质NBS-LRR保守结构设计一对简并引物 P1/P2,采集经水杨酸(SA)处理0、12、24、48 h的巴西橡胶叶片,进行cDNA同源序列克隆。【结果】序列分析结果表明,克隆获得的RGAs经系统进化分析分为TIR-NBS-LRR和non-TIR-NBS-LRR 两种类型和9个基因家族;多重比较发现,克隆获得的RGAs具有典型的NBS类抗病基因保守结构域,在与已知植物NBS类序列相似性比较中,与I2c-2基因相似性最高,为46.2%,而巴西橡胶NBS类RGAs之间氨基酸相似性为22.1%~100.0%。进一步研究发现,核苷酸非同义替换和同义替换的比率小于1,有低水平的重组,表明点突变逐步积累是导致纯化选择的主要力量。【结论】通过SA诱导作用和NBS类抗病基因结合得到的巴西橡胶NBS类RGAs具有广泛的遗传多样性,并与已知抗病基因氨基酸序列具高度相似性,这些RGAs候补序列可能与某抗病基因有密切联系。 展开更多
关键词 巴西橡胶 水杨酸 nbs—lrr 抗病基因同源序列(RGAs) 核苷酸结合位点(nbs)
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Characterization of an Organ Specific and Pathogen Responsive CC-NBS-LRR Gene from Cotton(Gossypium hirsutum L.) 被引量:3
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作者 ZHANG Bao-long,NI Wan-chao,YANG Yu-wen,SHEN Xin-lian(Institute of Agro-biotechnology,Jiangsu Academy of Agricultural Sciences,Zhongling Street 50,Nanjing 210014,China) 《棉花学报》 CSCD 北大核心 2008年第S1期74-,共1页
Cotton diseases represent a major challenge to cotton growth.Cloning of a cotton pathogen response gene and promoter is of great importance to improve disease resistance.In this study,a
关键词 lrr nbs Characterization of an Organ Specific and Pathogen Responsive cc-nbs-lrr Gene from Cotton cc
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植物TIR-NB-LRR类型抗病基因各结构域的研究进展 被引量:12
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作者 尹玲 方辉 +2 位作者 黄羽 卢江 曲俊杰 《广西植物》 CAS CSCD 北大核心 2017年第2期186-190,共5页
植物抗病反应是一个多基因调控的复杂过程,在这个过程中R基因发挥了非常重要的作用。根据其氨基酸基序组成以及跨膜结构域的不同,R基因可以分为多种类型,其中NBS-LRR类型是植物基因组中最大的基因家族之一。TIR-NB-LRR类型的抗病基因又... 植物抗病反应是一个多基因调控的复杂过程,在这个过程中R基因发挥了非常重要的作用。根据其氨基酸基序组成以及跨膜结构域的不同,R基因可以分为多种类型,其中NBS-LRR类型是植物基因组中最大的基因家族之一。TIR-NB-LRR类型的抗病基因又是NB-LRR类型中的一大类,也是目前抗病基因研究的热点。该文总结了TIR-NB-LRR类型抗病基因各个结构域的功能和相关的研究进展。相关研究表明,TIR结构域主要通过自身或异源的二聚体化介导抗性信号的转导,但也有部分研究表明,该结构域可能参与病原菌的特异性识别。NBS结构域常被认为具有"分子开关"的功能,它可以通过结合ADP或ATP来调节植物抗病蛋白的构象变化,从而调节下游抗病信号的传导。LRR结构域在植物与病原菌互作的过程中可以通过与病原菌的无毒蛋白直接或间接互作来特异识别病原菌。也有研究发现,LRR结构域具有调节信号传导的功能。这些信息将为研究植物抗病机理提供理论依据,也为将来通过基因编辑技术对作物进行定向抗病育种提供思路。 展开更多
关键词 抗病基因 TIR结构域 nbs结构域 lrr结构域
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巴西橡胶NBS类抗病基因同源序列的克隆与分析 被引量:4
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作者 张影波 庞玉新 +3 位作者 莫廷辉 董美超 解辉 蔡秀清 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2009年第24期11453-11455,共3页
[目的]探讨巴西橡胶NBS类抗病基因同源序列的克隆与序列分析。[方法]以高抗炭疽病的巴西橡胶无性系R042为材料,根据抗病基因Prf、L6、N等的P-loop和GLPL保守结构域设计简并引物,从R042扩增具有抗病基因同源序列的片段,对分离获得的抗病... [目的]探讨巴西橡胶NBS类抗病基因同源序列的克隆与序列分析。[方法]以高抗炭疽病的巴西橡胶无性系R042为材料,根据抗病基因Prf、L6、N等的P-loop和GLPL保守结构域设计简并引物,从R042扩增具有抗病基因同源序列的片段,对分离获得的抗病基因同源序列进行Blastn、氨基酸同源性分析、序列比较和系统进化分析。[结果]从巴西橡胶高抗炭疽病无性系R042基因组DNA中分离获得1个NBS类抗病基因同源序列,经Blastn比对后发现,该抗病基因同源序列与毛果杨中的一个CC-NBS-LRR抗病蛋白的mRNA的序列同源性为66%,Blastn的E值为2e-24,推测氨基酸序列与已知抗病基因的相似性在26.9%~43.2%。[结论]序列比对与系统进化分析表明,该抗病基因同源序列具有NBS类抗病基因的所有保守序列,且与Xa1的亲缘关系最近。 展开更多
关键词 巴西橡胶 核苷酸结合位点(nbs) 亮氨酸重复(lrr) 抗病基因同源序列(RGA)
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番茄SlNBRP1基因的克隆及抗病性的研究 被引量:1
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作者 黄曼 于淑坤 +2 位作者 张琳 刘永胜 苗敏 《合肥工业大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2020年第8期1131-1135,共5页
作物病害是农业生产的主要限制因子之一,利用植物抗病基因(R基因)培育抗性品种是防治植物病害最环保、有效、直接的手段。植物体内绝大多数R基因编码含有卷曲螺旋结构、核苷酸结合位点和富含亮氨酸重复序列(coiled-coil nucleotide-bind... 作物病害是农业生产的主要限制因子之一,利用植物抗病基因(R基因)培育抗性品种是防治植物病害最环保、有效、直接的手段。植物体内绝大多数R基因编码含有卷曲螺旋结构、核苷酸结合位点和富含亮氨酸重复序列(coiled-coil nucleotide-binding site and leucine-rich-repeat,CC-NBS-LRR)结构域的蛋白质。文章通过酵母双杂筛选鉴定得SlNBRP1基因,利用植物基因工程技术,构建植物过表达载体pBI121-35S::SlNBRP1;通过农杆菌介导法,将SlNBRP1基因导入野生型番茄基因组中,得到转基因植株。通过生物信息学分析SlNBRP1蛋白序列,发现含有高度保守的CC结构域和NBS结构域。采用Real-time聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)分析转基因植株中SlNBRP1 mRNA的表达情况,结果显示SlNBRP1的表达量显著下调,表现出共抑制(co-suppression,CoR),即基因间相互作用引起的失活现象。番茄病原菌丁香假单胞菌(Pseudomonas syringae pv.Tomato DC3000,Pst DC3000)侵染野生型和共抑制转基因植株发现,共抑制转基因植株抗病性下降且叶片菌量增加,表明SlNBRP1基因正调控植物对病原菌的免疫反应。该文为遗传育种改良作物抗病性增加了新的分子靶标。 展开更多
关键词 番茄 cc-nbs-lrr结构域 共抑制 Pst DC3000 抗病性
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拟南芥NDR1基因介导的广谱抗病性研究进展 被引量:1
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作者 龚前园 张超 +1 位作者 李为民 张永强 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第6期29-33,共5页
抗病基因的研究是抗病育种及防治植物病害的基础。拟南芥NDR1(Non-race-specific disease resistance 1)基因,编码一个质膜定位蛋白,在R基因介导的抗性中具有重要作用。NDR1能与CC-NB-LRR(卷曲螺旋核酸结合或富亮氨酸重复)类抗病蛋白相... 抗病基因的研究是抗病育种及防治植物病害的基础。拟南芥NDR1(Non-race-specific disease resistance 1)基因,编码一个质膜定位蛋白,在R基因介导的抗性中具有重要作用。NDR1能与CC-NB-LRR(卷曲螺旋核酸结合或富亮氨酸重复)类抗病蛋白相互作用。以拟南芥抗病基因NDR1及其蛋白结构的研究进展为基础,综述了NDR1的广谱抗病性和抗病分子机理。 展开更多
关键词 抗病基因 NDR1 cc-nb/lrr
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番茄中一个抗病基因功能的研究
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作者 许伟 苗敏 +1 位作者 唐晓凤 刘永胜 《合肥工业大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2017年第4期547-552,共6页
植物中最大的一类抗病基因(R)编码的蛋白质含有卷曲螺旋结构(coiled-coil,CC)、核苷酸结合位点(nucleotide-binding site,NBS)和富含亮氨基酸的重复序列(leucine-rich repeat,LRR)结构域。R基因以抗病著称。文章通过酵母双杂筛选方式获... 植物中最大的一类抗病基因(R)编码的蛋白质含有卷曲螺旋结构(coiled-coil,CC)、核苷酸结合位点(nucleotide-binding site,NBS)和富含亮氨基酸的重复序列(leucine-rich repeat,LRR)结构域。R基因以抗病著称。文章通过酵母双杂筛选方式获得了DDI3基因,该基因与番茄中重要功能基因DDB1具有相互作用,而又含有CC-NBS-LRR结构,预测具有R基因抗病性,参与植物抗病。研究中构建了DDI3过表达载体并通过根瘤农杆菌介导转化到野生型番茄中,筛选获得DDI3高表达的阳性转基因株系。通过病菌接种实验,观察植株发病情况和统计细菌菌落数,结果发现,转基因植株的抗病性明显高于野生型番茄。DDI3基因对提高番茄的抗病性有很高的价值,为采用基因工程方法改良番茄植株抗病性做出新的尝试,同时又与番茄DDB1基因具有相互作用,对研究DDB1基因在参与植物抗病途径中的功能研究提供新的方向。 展开更多
关键词 DD13基因 cc-nbs-lrr结构域 基因番茄 抗病性
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马铃薯抗晚疫病种质资源中抗病基因的筛选 被引量:3
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作者 李晓川 王朝海 +9 位作者 周平 马维 陈军 陆燚 吴显 王宗明 吴瑞 宋治豪 马杰 付毅 《贵州农业科学》 CAS 2023年第2期1-7,共7页
【目的】筛选晚疫病抗病种质资源的晚疫病抗病基因,为马铃薯晚疫病抗性种质创新与利用提供依据。【方法】利用转录组测序技术分析马铃薯抗感晚疫病材料(广谱晚疫病抗性材料野生种Solanum demissum品系cs47)和易感材料(卡它丁、大西洋、... 【目的】筛选晚疫病抗病种质资源的晚疫病抗病基因,为马铃薯晚疫病抗性种质创新与利用提供依据。【方法】利用转录组测序技术分析马铃薯抗感晚疫病材料(广谱晚疫病抗性材料野生种Solanum demissum品系cs47)和易感材料(卡它丁、大西洋、底西瑞)间差异表达基因,利用GO数据库预测差异表达基因的功能,Clustal Omega程序比对氨基酸序列,MEGA6绘制氨基酸序列进化树。【结果】利用马铃薯抗病种质资源cs47筛选得到PGSC0003DMP400045185、PGSC0003DMP400015105和PGSC0003DMP400015107共3个潜在的晚疫病抗性基因,与3个易感晚疫病品种比分别有6 084~6 547个和6 264~6 316个基因表达水平显著上升和显著下降。在显著差异表达水平的基因中,3个cc-NBS-LRR类基因和已克隆的晚疫病抗性基因拥有类似的蛋白结构域。【结论】广谱晚疫病抗性材料野生种S.demissum品系cs47含有PGSC0003DMP400045185、PGSC0003DMP400015105和PGSC0003DMP400015107共3个潜在的晚疫病抗性基因,转录组测序技术有助于分离晚疫病抗病基因。 展开更多
关键词 马铃薯 晚疫病 抗病基因 转录组测序 cc-nbs-lrr基因
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