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题名辣椒CAMTA基因家族生物信息学分析
被引量：4
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作者
蒋宏华
李丽
李雪峰
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机构
湖南省农业科学院蔬菜研究所
湖南省农业科学院科研基地管理中心
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出处
《中国蔬菜》
北大核心
2022年第9期47-56,共10页
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基金
国家大宗蔬菜产业技术体系项目(CARS-23-A07)。
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文摘
为了解辣椒中CAMTA基因家族生物信息学功能,探究其在非生物胁迫下的基因表达规律,进而为辣椒CAMTA基因的功能开发与抗逆育种提供基础,在Plant TFDB网站得到辣椒CAMTA家族成员,并对其基因结构、结构域、蛋白质三级结构、系统进化关系、顺式作用元件、激素处理与非生物胁迫表达情况进行分析。结果表明,在辣椒中有5个CAMTA家族成员,均包含CG-1保守结构域;主要分布在4条染色体上,其基因大小差异明显,氨基酸数目在89~1023个之间,外显子数目为1~13个。进化树分析表明,辣椒CAMTA基因家族可以分为3类,辣椒CAMTA的氨基酸序列与番茄CAMTA的氨基酸序列亲缘关系最近。基因表达量分析表明,辣椒CAMTA基因家族在胁迫后的信号转导和组织发育过程中发挥了作用。
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关键词
辣椒
camta基因家族
生物信息学分析
胁迫
表达分析
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Keywords
pepper
camta gene family
bioinformatics analysis
stress
expression analysis
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分类号
S641.3
[农业科学—蔬菜学]
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