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DNA条形码技术及其在保护生物学中的应用
被引量：
7
1
作者
杨帆
雷光春
张爱兵
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第5期58-63,共6页
物质文明及生活水平的提升为人类带来诸多好处的同时,也使人们越来越清晰地意识到保护生物多样性及生态系统稳定性的重大意义。DNA条形码技术作为现今生物分类学中重要的分子技术,可以快速准确地鉴定物种。多国科学家都在致力于对DNA条...
物质文明及生活水平的提升为人类带来诸多好处的同时,也使人们越来越清晰地意识到保护生物多样性及生态系统稳定性的重大意义。DNA条形码技术作为现今生物分类学中重要的分子技术,可以快速准确地鉴定物种。多国科学家都在致力于对DNA条形码的研究,以便能共同组建数据库。将现有物种正确分类并期望用于发现新种,为生物的保护及生态系统的维护作出巨大贡献。细胞色素C氧化酶亚单位I(COI)是现在动物种类鉴定中最常用的基因之一。综述DNA条形编码技术的产生、原理、发展概况与操作及其在保护动物分类中的应用。阐明该技术在保护生物学中应用的意义与可行性,并讨论DNA条形编码在生物分类应用中可能存在的问题。
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关键词
DNA条形码
细胞色素
c
氧化酶
亚
单位i
(
coi
)
DNA分类
物种保护
物种多样性
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职称材料
DNA条形码识别Ⅰ.DNA条形码研究进展及应用前景
被引量：
63
2
作者
莫帮辉
屈莉
+3 位作者
韩松
何建伟
赵明
曾晓茂
《四川动物》
CSCD
北大核心
2008年第2期303-306,共4页
DNA条形码(DNA Barcoding)是近年来生物分类学中引人注目的发展热点。本文综述了DNA条形码的发展历史、识别原理以及公共数据库,并讨论了DNA条形码在检疫检验领域的应用前景。DNA条形码与DNA芯片技术的结合,将推动传统物种鉴定方法的更...
DNA条形码(DNA Barcoding)是近年来生物分类学中引人注目的发展热点。本文综述了DNA条形码的发展历史、识别原理以及公共数据库,并讨论了DNA条形码在检疫检验领域的应用前景。DNA条形码与DNA芯片技术的结合,将推动传统物种鉴定方法的更新,可在检疫检验领域中实现非专家检定,这对进出口口岸生物监测具有重要的理论意义和应用价值。
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关键词
细胞色素
c
氧化酶
亚
单位i
(
c
O
I)
DNA条形码
DNA芯片
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职称材料
福建省蛇源裂头蚴的分子鉴定及遗传分析
被引量：
1
3
作者
宋肇程
陈育琪
+4 位作者
黄潇航
魏坤亚
张龙
殷光文
黄志坚
《动物医学进展》
北大核心
2021年第1期37-45,共9页
裂头蚴病是由于裂头蚴感染引起的一种人兽共患病,为了对福建省养殖蛇类的裂头蚴感染情况进行调查并鉴定虫种,对采自福建省三明市、漳州市和南平市等地蛇场的蛇类进行剖检,分离得到了裂头蚴,记录寄生部位和数量。提取裂头蚴虫体基因组,采...
裂头蚴病是由于裂头蚴感染引起的一种人兽共患病,为了对福建省养殖蛇类的裂头蚴感染情况进行调查并鉴定虫种,对采自福建省三明市、漳州市和南平市等地蛇场的蛇类进行剖检,分离得到了裂头蚴,记录寄生部位和数量。提取裂头蚴虫体基因组,采用PCR对虫体ITS、NAD4和COX3基因进行了扩增。同时,将扩增得到的目的基因连接到pEASY-Blunt Simple载体上,转化Trans I-T1感受态细胞,培养得到单菌落,对菌落进行扩增测序。将测序结果与NCBI公布的裂头蚴ITS、NAD4和COX3基因序列进行比对分析,测定突变率和位点,并且进行样本之间的同源性分析和测定遗传距离。结果发现,三明市、漳州市和南平市某蛇场裂头蚴的感染率分别为75%、20%和0。分离到的裂头蚴ITS基因序列长为1360 bp~1380 bp,与NCBI中Spirometra erinaceieuropaei(FJ886747.1)的ITS基因同源性为95.70%~98.68%,样本之间平均遗传距离为0.0016;分离到的裂头蚴NAD4基因序列长为356 bp~650 bp,与NCBI中Spirometra erinaceieuropaei(HM475076.1)的NAD4基因同源性为96.73%~100%,样本之间平均遗传距离为0.0041;分离到的裂头蚴COX3基因序列总长为379 bp~408 bp,与NCBI中Spirometra erinaceieuropaei(HM475033.1)的COX3基因同源性为98.94%~100%,样本之间平均遗传距离为0.0038。结果表明,此次分离得到的裂头蚴虫体的ITS基因、NAD4基因和COX3基因与欧猥迭宫绦虫裂头蚴同源性较近,证明此次分离的蛇源裂头蚴属于欧猥迭宫绦虫裂头蚴。同时,经过对各虫体间NAD4和COX3基因分析发现,不同地区的裂头蚴虫体在进化树上存在分支。
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关键词
蛇源裂头蚴
内部转录间隔区
烟酰胺腺嘌呤二核苷酸脱氢酶
亚
单位
4
线粒体细胞色素
c
氧化酶
第Ⅲ
亚
基
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职称材料
题名
DNA条形码技术及其在保护生物学中的应用
被引量：
7
1
作者
杨帆
雷光春
张爱兵
机构
北京林业大学自然保护区学院
首都师范大学生命科学学院
出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第5期58-63,共6页
基金
中国主要陆地生态系统服务功能与生态安全(2009CB421103)
北京市自然基金重点项目(KZ201010028028)
国家自然基金面上项目(31071963)
文摘
物质文明及生活水平的提升为人类带来诸多好处的同时,也使人们越来越清晰地意识到保护生物多样性及生态系统稳定性的重大意义。DNA条形码技术作为现今生物分类学中重要的分子技术,可以快速准确地鉴定物种。多国科学家都在致力于对DNA条形码的研究,以便能共同组建数据库。将现有物种正确分类并期望用于发现新种,为生物的保护及生态系统的维护作出巨大贡献。细胞色素C氧化酶亚单位I(COI)是现在动物种类鉴定中最常用的基因之一。综述DNA条形编码技术的产生、原理、发展概况与操作及其在保护动物分类中的应用。阐明该技术在保护生物学中应用的意义与可行性,并讨论DNA条形编码在生物分类应用中可能存在的问题。
关键词
DNA条形码
细胞色素
c
氧化酶
亚
单位i
(
coi
)
DNA分类
物种保护
物种多样性
Keywords
DNA bar
c
odes
c
yto
c
hrome
c
oxidase subunit Ⅰ（
coi
） Taxonomy Spe
c
ies
c
onservation Spe
c
ies diversity
分类号
Q19 [生物学—普通生物学]
Q16 [生物学—普通生物学]
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职称材料
题名
DNA条形码识别Ⅰ.DNA条形码研究进展及应用前景
被引量：
63
2
作者
莫帮辉
屈莉
韩松
何建伟
赵明
曾晓茂
机构
中国科学院成都计算机应用研究所
四川出入境检验检疫局
中国科学院成都生物研究所
出处
《四川动物》
CSCD
北大核心
2008年第2期303-306,共4页
基金
国家重点基础研究发展规划(批准号:2004CB318003)
中国科学院知识创新重要方向基金资助项目(批准号:KJCX2-YW-S02)
+1 种基金
国家自然科学基金(30570250)
国家质检总局科技计划项目(2006IK189)
文摘
DNA条形码(DNA Barcoding)是近年来生物分类学中引人注目的发展热点。本文综述了DNA条形码的发展历史、识别原理以及公共数据库,并讨论了DNA条形码在检疫检验领域的应用前景。DNA条形码与DNA芯片技术的结合,将推动传统物种鉴定方法的更新,可在检疫检验领域中实现非专家检定,这对进出口口岸生物监测具有重要的理论意义和应用价值。
关键词
细胞色素
c
氧化酶
亚
单位i
(
c
O
I)
DNA条形码
DNA芯片
Keywords
c
yto
c
hrome
c
oxidase subunit I （
coi
）, DNA Bar
c
oding, DNA
c
hip
分类号
Q523 [生物学—生物化学]
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职称材料
题名
福建省蛇源裂头蚴的分子鉴定及遗传分析
被引量：
1
3
作者
宋肇程
陈育琪
黄潇航
魏坤亚
张龙
殷光文
黄志坚
机构
福建农林大学动物科学学院/福建省动物药物工程实验室
出处
《动物医学进展》
北大核心
2021年第1期37-45,共9页
基金
国家自然科学基金项目(31872466)
福建省科技厅引导性项目(2019N0005)
福建农林大学科技创新专项基金项目(KF2015017,CXZX2017235,CXZX2017487,CXZX2019070G)。
文摘
裂头蚴病是由于裂头蚴感染引起的一种人兽共患病,为了对福建省养殖蛇类的裂头蚴感染情况进行调查并鉴定虫种,对采自福建省三明市、漳州市和南平市等地蛇场的蛇类进行剖检,分离得到了裂头蚴,记录寄生部位和数量。提取裂头蚴虫体基因组,采用PCR对虫体ITS、NAD4和COX3基因进行了扩增。同时,将扩增得到的目的基因连接到pEASY-Blunt Simple载体上,转化Trans I-T1感受态细胞,培养得到单菌落,对菌落进行扩增测序。将测序结果与NCBI公布的裂头蚴ITS、NAD4和COX3基因序列进行比对分析,测定突变率和位点,并且进行样本之间的同源性分析和测定遗传距离。结果发现,三明市、漳州市和南平市某蛇场裂头蚴的感染率分别为75%、20%和0。分离到的裂头蚴ITS基因序列长为1360 bp~1380 bp,与NCBI中Spirometra erinaceieuropaei(FJ886747.1)的ITS基因同源性为95.70%~98.68%,样本之间平均遗传距离为0.0016;分离到的裂头蚴NAD4基因序列长为356 bp~650 bp,与NCBI中Spirometra erinaceieuropaei(HM475076.1)的NAD4基因同源性为96.73%~100%,样本之间平均遗传距离为0.0041;分离到的裂头蚴COX3基因序列总长为379 bp~408 bp,与NCBI中Spirometra erinaceieuropaei(HM475033.1)的COX3基因同源性为98.94%~100%,样本之间平均遗传距离为0.0038。结果表明,此次分离得到的裂头蚴虫体的ITS基因、NAD4基因和COX3基因与欧猥迭宫绦虫裂头蚴同源性较近,证明此次分离的蛇源裂头蚴属于欧猥迭宫绦虫裂头蚴。同时,经过对各虫体间NAD4和COX3基因分析发现,不同地区的裂头蚴虫体在进化树上存在分支。
关键词
蛇源裂头蚴
内部转录间隔区
烟酰胺腺嘌呤二核苷酸脱氢酶
亚
单位
4
线粒体细胞色素
c
氧化酶
第Ⅲ
亚
基
Keywords
sparganum from snake
ITS
NAD4
c
OX3
分类号
S852.734 [农业科学—基础兽医学]
S858.99 [农业科学—临床兽医学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
DNA条形码技术及其在保护生物学中的应用
杨帆
雷光春
张爱兵
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2011
7
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
DNA条形码识别Ⅰ.DNA条形码研究进展及应用前景
莫帮辉
屈莉
韩松
何建伟
赵明
曾晓茂
《四川动物》
CSCD
北大核心
2008
63
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
福建省蛇源裂头蚴的分子鉴定及遗传分析
宋肇程
陈育琪
黄潇航
魏坤亚
张龙
殷光文
黄志坚
《动物医学进展》
北大核心
2021
1
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