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天祝白牦牛和甘南牦牛DRB3基因外显子2多态性研究
被引量：
1
1
作者
沙日耐
安天午
+1 位作者
俄广鑫
韩建林
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2016年第3期746-753,共8页
试验通过对天祝白牦牛和甘南牦牛DRB3基因外显子2部分CDS序列进行分析,获得其准确单倍型,通过直接测序与聚合酶链式扩增阻碍突变系统(ARMS)扩增法获得干净的单链,对高度杂合的双链进行分型。结果发现65个SNPs,1个密码子的插入缺失,获得3...
试验通过对天祝白牦牛和甘南牦牛DRB3基因外显子2部分CDS序列进行分析,获得其准确单倍型,通过直接测序与聚合酶链式扩增阻碍突变系统(ARMS)扩增法获得干净的单链,对高度杂合的双链进行分型。结果发现65个SNPs,1个密码子的插入缺失,获得30个单倍型,其中有7个单倍型是首次发现,应该是天祝白牦牛和甘南牦牛特有的单倍型。通过对已知牛属所有DRB3基因外显子2单倍型与本研究发现的单倍型进行分析发现天祝白牦牛和甘南牦牛分享普通牛和瘤牛单倍型,可能有普通黄牛和瘤牛的遗传背景,且DRB3基因外显子2的4、25、30、53、59、62、63、66、78氨基酸位点受到了正选择的影响,主要发生在天祝白牦牛群体里,这与天祝白牦牛长期选育白毛有一定的关系。
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关键词
天祝白牦牛
甘南牦牛
drb
3
基因
外显子
2
多态性
在线阅读
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职称材料
部分中国黄牛BoLA-DRB3基因序列分析
被引量：
2
2
作者
王昆
张沅
孙东晓
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第7期853-857,共5页
通过DNA测序,分别对4个中国黄牛地方品种的MHC-Ⅱ类基因DRB3外显子2的多态性进行分析。通过序列比对,共检测到DRB3*exon2等位基因259种,其中新等位基因131个。等位基因的分布具有品种特异性。各等位基因之间存在大量多态位点,统计分析表...
通过DNA测序,分别对4个中国黄牛地方品种的MHC-Ⅱ类基因DRB3外显子2的多态性进行分析。通过序列比对,共检测到DRB3*exon2等位基因259种,其中新等位基因131个。等位基因的分布具有品种特异性。各等位基因之间存在大量多态位点,统计分析表明:发生非同义替换的多态位点均主要分布在抗原结合位点对应的编码序列中,共有17个变异位点的氨基酸组成在品种间具有显著差异,其中7个位点差异显著(P<0.05);10个位点差异极显著(P<0.01)。在变异位点中,有8个位点为抗原结合位点。
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关键词
中国黄牛
bola—drb3外显子2
等位基因
序列测定
多态性
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职称材料
题名
天祝白牦牛和甘南牦牛DRB3基因外显子2多态性研究
被引量：
1
1
作者
沙日耐
安天午
俄广鑫
韩建林
机构
中国农业科学院北京畜牧兽医研究所
四川省草原科学研究院
西南大学
出处
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2016年第3期746-753,共8页
基金
国家"十一五"科技支撑重点项目(2008BADB2B01)
文摘
试验通过对天祝白牦牛和甘南牦牛DRB3基因外显子2部分CDS序列进行分析,获得其准确单倍型,通过直接测序与聚合酶链式扩增阻碍突变系统(ARMS)扩增法获得干净的单链,对高度杂合的双链进行分型。结果发现65个SNPs,1个密码子的插入缺失,获得30个单倍型,其中有7个单倍型是首次发现,应该是天祝白牦牛和甘南牦牛特有的单倍型。通过对已知牛属所有DRB3基因外显子2单倍型与本研究发现的单倍型进行分析发现天祝白牦牛和甘南牦牛分享普通牛和瘤牛单倍型,可能有普通黄牛和瘤牛的遗传背景,且DRB3基因外显子2的4、25、30、53、59、62、63、66、78氨基酸位点受到了正选择的影响,主要发生在天祝白牦牛群体里,这与天祝白牦牛长期选育白毛有一定的关系。
关键词
天祝白牦牛
甘南牦牛
drb
3
基因
外显子
2
多态性
Keywords
Tianzhu White yak
Gannan yak
drb
3
gene
exon
2
polymorphism
分类号
S813.3 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
部分中国黄牛BoLA-DRB3基因序列分析
被引量：
2
2
作者
王昆
张沅
孙东晓
机构
河北省农林科学院粮油作物研究所
中国农业大学动物科技学院
出处
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第7期853-857,共5页
基金
河北省科学技术研究与发展计划项目(05547006D-3)
国家自然科学基金项目(3017067630170676)资助
文摘
通过DNA测序,分别对4个中国黄牛地方品种的MHC-Ⅱ类基因DRB3外显子2的多态性进行分析。通过序列比对,共检测到DRB3*exon2等位基因259种,其中新等位基因131个。等位基因的分布具有品种特异性。各等位基因之间存在大量多态位点,统计分析表明:发生非同义替换的多态位点均主要分布在抗原结合位点对应的编码序列中,共有17个变异位点的氨基酸组成在品种间具有显著差异,其中7个位点差异显著(P<0.05);10个位点差异极显著(P<0.01)。在变异位点中,有8个位点为抗原结合位点。
关键词
中国黄牛
bola—drb3外显子2
等位基因
序列测定
多态性
Keywords
Chinese Yellow cattle
bola
-
drb
3
＊ exon2
allele
sequencing
polymorphism
分类号
S823.2 [农业科学—畜牧学]
Q78 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
天祝白牦牛和甘南牦牛DRB3基因外显子2多态性研究
沙日耐
安天午
俄广鑫
韩建林
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2016
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
部分中国黄牛BoLA-DRB3基因序列分析
王昆
张沅
孙东晓
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2008
2
在线阅读
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职称材料
已选择
0
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参考文献
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