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蜡状芽胞杆菌群16S rDNA分析 被引量:3
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作者 邹寰 喻子牛 孙明 《华中农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第4期478-482,共5页
蜡状芽胞杆菌群主要包括炭疽芽胞杆菌(Bacillus anthracis)、蜡状芽胞杆菌(Bacillus cereus)、苏云金芽胞杆菌(Bacillus thuringiensis)。GenBank已有这个群的8个菌株完成了全基因组序列测定。对这8株蜡状芽胞杆菌群菌株中98条16S rDNA... 蜡状芽胞杆菌群主要包括炭疽芽胞杆菌(Bacillus anthracis)、蜡状芽胞杆菌(Bacillus cereus)、苏云金芽胞杆菌(Bacillus thuringiensis)。GenBank已有这个群的8个菌株完成了全基因组序列测定。对这8株蜡状芽胞杆菌群菌株中98条16S rDNA的序列进行相互BLAST比较,发现在同一基因组内各个16S rDNA拷贝全局相似度最低为96.47%,在不同基因组间16S rDNA局部片段比对最小相似度达到99.72%,对应片段长度也有1 417 bp。这点充分说明,该群的细菌完全共用同一种16S rDNA,根据16S rDNA给细菌分类的特点,它们应该属于同一个种。在亲缘关系上,枯草芽胞杆菌离蜡状芽胞杆菌群最近。 展开更多
关键词 蜡状芽胞杆菌群 16S RDNA blast序列分析
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人工湿地不同季节与单元之间根际微生物多样性 被引量:8
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作者 陈永华 吴晓芙 +3 位作者 张珍妮 蒋丽娟 李科林 柳俊 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第22期7247-7254,共8页
采用选择性平板培养基法和PCR-DGGE法比较研究了三级垂直潜流人工湿地污水处理系统中不同季节与单元之间根际微生物数量与多样性,结果表明,随着"秋-冬-春-夏"的季节的变化,2种方法测定的微生物数量都呈现"高-低-高"... 采用选择性平板培养基法和PCR-DGGE法比较研究了三级垂直潜流人工湿地污水处理系统中不同季节与单元之间根际微生物数量与多样性,结果表明,随着"秋-冬-春-夏"的季节的变化,2种方法测定的微生物数量都呈现"高-低-高"季节性变化现象,但选择性平板培养基法显示秋季数量最多,PCR-DGGE法显示夏季数量最多。从三级处理单元的1—3级,两种方法测定的微生物数量都呈现"低-高-低"的规律。除土样11外,其余相同季节的土样均出现聚集在同一个分支下。得到的4个差异序列(YP1—YP 4),经BLAST比较,分别找到同源性最近的已知类群,分别为肠杆菌属、弧菌、欧文氏菌、产酸克雷伯菌。BLASTX比较发现YP1与细菌代谢分解有机物有关;YP2蜡样芽胞杆菌生命活动相关,具有解磷的作用;YP3与APOE载脂蛋白e功能相似,参与细菌的分解代谢;YP4功能可能与细菌去氮有关。 展开更多
关键词 人工湿地 根际微生物 选择性平板培养基法 PCR-DGGE blast分析
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耐药型大肠杆菌引发的仔猪大肠杆菌病的PCR快速鉴定 被引量:1
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作者 王选 赵瑞利 +3 位作者 马吉飞 胡烨 路垚 朱蕴暖 《天津农学院学报》 CAS 2014年第4期26-28,共3页
利用菌落PCR方法对临床致病菌进行快速鉴定,以天津地区某猪场病死猪胃、肠内容物作为病料进行细菌分离培养,并对所分离的细菌进行药敏试验鉴定。设计16S r RNA通用引物并利用菌落PCR方法扩增所分离细菌的16S r RNA序列,对该序列进行测定... 利用菌落PCR方法对临床致病菌进行快速鉴定,以天津地区某猪场病死猪胃、肠内容物作为病料进行细菌分离培养,并对所分离的细菌进行药敏试验鉴定。设计16S r RNA通用引物并利用菌落PCR方法扩增所分离细菌的16S r RNA序列,对该序列进行测定和BLAST分析。结果发现,该细菌为一株多重耐药性大肠杆菌。试验建立了仔猪大肠杆菌病的临床快速检测方法。 展开更多
关键词 仔猪 耐药性 大肠杆菌 PCR blast分析
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棉花纤维特异/优势表达基因的染色体定位
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作者 余渝 王夏青 +2 位作者 冯常辉 林忠旭 张献龙 《棉花学报》 CSCD 北大核心 2009年第6期435-441,共7页
棉纤维是研究植物细胞伸长和细胞壁建成以及纤维素生物合成的优良模型,迄今为止,已经分离了许多纤维特异/优势表达的基因。为了便于这些基因的图位克隆使其能够应用于棉花纤维品质的改良中,本研究采用分离群体定位法和Blast分析法对这... 棉纤维是研究植物细胞伸长和细胞壁建成以及纤维素生物合成的优良模型,迄今为止,已经分离了许多纤维特异/优势表达的基因。为了便于这些基因的图位克隆使其能够应用于棉花纤维品质的改良中,本研究采用分离群体定位法和Blast分析法对这些基因进行染色体定位。利用陆地棉、海岛棉BC1种间分离群体,将GhCFE定位在第6染色体,GhGLP1-250定位在第19染色体。Blast分析将11个基因定位到棉花染色体上。这些基因与棉纤维的伸长和细胞壁的合成相关,与这些基因连锁标记的获得有助于棉花纤维长度和强度的分子标记辅助选择。 展开更多
关键词 棉花 纤维特异/优势表达基因 blast分析 染色体定位
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