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茎瘤芥BjuGAPC基因序列特征及其参与茎发育的糖酸含量调控
1
作者
李晓燕
李成双
+2 位作者
金业程
魏小涵
李梦瑶
《江苏农业学报》
CSCD
北大核心
2022年第6期1474-1483,共10页
为明确茎瘤芥瘤状茎形成过程中的糖酸含量变化,揭示茎瘤芥甘油醛-3-磷酸脱氢酶(GAPDH)的主要生理功能,并进一步探究BjuGAPC基因的表达模式对糖酸含量的调控机制,首先对BjuGAPC基因进行克隆,同时,利用生物信息学方法对BjuGAPC的理化性质...
为明确茎瘤芥瘤状茎形成过程中的糖酸含量变化,揭示茎瘤芥甘油醛-3-磷酸脱氢酶(GAPDH)的主要生理功能,并进一步探究BjuGAPC基因的表达模式对糖酸含量的调控机制,首先对BjuGAPC基因进行克隆,同时,利用生物信息学方法对BjuGAPC的理化性质、系统进化发育等多方面进行系统分析,并使用qRT-PCR比较分析BjuGAPC基因在茎瘤芥茎不同发育阶段的表达规律。结果显示:(1)BjuGAPC基因开放阅读框全长1 038 bp,是一个稳定的亲水性蛋白质,同时具有多个蛋白质糖基化位点、磷酸化位点和特异性蛋白质激酶的结合位点;BjuGAPC与其他物种的GAPDH具有高度相似性,亲缘关系与同科的芜菁、油菜、萝卜较近。(2)qRT-PCR分析结果表明,BjuGAPC基因在茎瘤芥茎膨大不同时期的相对表达量差异显著且随着器官膨大相对表达量下调,与转录组的表达丰度一致。(3)相关性分析结果显示,基因表达量与可溶性糖和可滴定酸含量均呈正相关关系,并与糖酸比呈显著正相关关系。说明BjuGAPC基因参与甘油醛-3-磷酸脱氢酶中NAD+-GAPDH的合成,BjuGAPC基因对糖酸含量有正调控作用,可能参与了糖酸的合成过程。
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关键词
茎瘤芥
茎膨大
糖酸含量
bjugapc基因
理化性质
表达分析
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职称材料
题名
茎瘤芥BjuGAPC基因序列特征及其参与茎发育的糖酸含量调控
1
作者
李晓燕
李成双
金业程
魏小涵
李梦瑶
机构
四川农业大学园艺学院
出处
《江苏农业学报》
CSCD
北大核心
2022年第6期1474-1483,共10页
基金
国家自然科学基金项目(32002027)。
文摘
为明确茎瘤芥瘤状茎形成过程中的糖酸含量变化,揭示茎瘤芥甘油醛-3-磷酸脱氢酶(GAPDH)的主要生理功能,并进一步探究BjuGAPC基因的表达模式对糖酸含量的调控机制,首先对BjuGAPC基因进行克隆,同时,利用生物信息学方法对BjuGAPC的理化性质、系统进化发育等多方面进行系统分析,并使用qRT-PCR比较分析BjuGAPC基因在茎瘤芥茎不同发育阶段的表达规律。结果显示:(1)BjuGAPC基因开放阅读框全长1 038 bp,是一个稳定的亲水性蛋白质,同时具有多个蛋白质糖基化位点、磷酸化位点和特异性蛋白质激酶的结合位点;BjuGAPC与其他物种的GAPDH具有高度相似性,亲缘关系与同科的芜菁、油菜、萝卜较近。(2)qRT-PCR分析结果表明,BjuGAPC基因在茎瘤芥茎膨大不同时期的相对表达量差异显著且随着器官膨大相对表达量下调,与转录组的表达丰度一致。(3)相关性分析结果显示,基因表达量与可溶性糖和可滴定酸含量均呈正相关关系,并与糖酸比呈显著正相关关系。说明BjuGAPC基因参与甘油醛-3-磷酸脱氢酶中NAD+-GAPDH的合成,BjuGAPC基因对糖酸含量有正调控作用,可能参与了糖酸的合成过程。
关键词
茎瘤芥
茎膨大
糖酸含量
bjugapc基因
理化性质
表达分析
Keywords
Brassica juncea var.tumida
stem swelling
sugar and acid content
bjugapc
gene
physical and chemical properties
expression analysis
分类号
S637.3 [农业科学—蔬菜学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
茎瘤芥BjuGAPC基因序列特征及其参与茎发育的糖酸含量调控
李晓燕
李成双
金业程
魏小涵
李梦瑶
《江苏农业学报》
CSCD
北大核心
2022
0
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