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题名茶树BURP基因家族全基因组鉴定与表达分析
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作者
孙明慧
刘丹丹
吴琼
焦小雨
王文杰
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机构
安徽省农业科学院茶叶研究所
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出处
《江苏农业科学》
北大核心
2025年第4期242-253,共12页
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基金
国家自然科学基金联合基金(编号:U23A20213)
安徽省茶叶产业技术体系项目(编号:AHCYJSTX-11)
安徽省农业科学院成果转化项目(编号:2024YL041)。
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文摘
茶[Camellia sinensis(L.)Kuntze]因其极高的营养价值和经济重要性而在全球范围内种植。为了研究茶树中BURP的作用,基于茶树全基因组对茶树中BURP基因家族进行筛选和鉴定。通过TBtools查找筛选包含有PF03181结构域的序列,使用生物信息学对其编码的蛋白质进行染色体定位、系统进化关系、蛋白质理化性质和共线性关系等分析。基于转录组数据挑选对胁迫响应较强烈的基因4个,即CsBURP14、CsBURP7、CsBURP10和CsBURP15,利用实时荧光定量聚合酶链式反应(real-time fluorescent quantitative PCR,qPCR)方法检测其在冷、盐和干旱胁迫下的表达情况。利用茶树基因组数据鉴定出17个BURP基因,聚类为3个亚组,其中PG1β-like包含5条,BNM2-like包含8条,RD22-like包含4条。结构域预测发现只有11条基因包含完整的BURP结构域,6条序列只包含其中的1或2个motif,而CsBURP1不包含这3个motif。CsBURP14、CsBURP7、CsBURP10和CsBURP15均响应干旱胁迫、冷胁迫和盐胁迫。CsBURP7响应最剧烈,在低温处理下为负调控,保持在初始表达量的1/3左右,干旱处理则为正调控,12 h时为初始值的6倍。CsBURP家族对低温胁迫、盐胁迫和干旱胁迫均有响应,推测其在茶树抗逆中发挥重要作用。
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关键词
burp基因家族
茶树
基因表达
非生物胁迫
全基因组鉴定
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分类号
S188
[农业科学—农业基础科学]
S571.101
[农业科学—茶叶生产加工]
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