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应用抑制性消减杂交法筛选与红曲菌产桔霉素相关的基因 被引量:8
1
作者 赖卫华 许杨 +1 位作者 熊勇华 李燕萍 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2005年第3期63-66,共4页
为了筛选与红曲菌产桔霉素相关的基因,应用抑制性消减杂交(SSH)构建了两个红曲菌的cDNA消减文库。利用分子生物学软件从这两个文库中找出八条同源序列,通过Blast软件对这八条序列进行分析,结果显示,它们可能是新的基因片段,递交后被Genb... 为了筛选与红曲菌产桔霉素相关的基因,应用抑制性消减杂交(SSH)构建了两个红曲菌的cDNA消减文库。利用分子生物学软件从这两个文库中找出八条同源序列,通过Blast软件对这八条序列进行分析,结果显示,它们可能是新的基因片段,递交后被Genbank接收。 展开更多
关键词 抑制性消减杂交 基因 blast软件 筛选 CDNA消减文库 红曲 分子生物学 桔霉素
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HSV-2的生物信息学分析及其Oligo探针设计 被引量:1
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作者 赵海全 马文丽 +2 位作者 莫小阳 张亚莉 郑文岭 《山东医药》 CAS 北大核心 2005年第35期21-22,共2页
目的设计单纯疱疹病毒2型(HSV-2)诊断芯片的O ligo探针。方法利用BLA ST软件对HSV-2的DNA序列进行序列比对,得到有意义的特异序列;用生物学软件O ligo6.0设计特异性高、Tm值相近、长度均一的O ligo探针。结果获得13条60-m er O ligo探... 目的设计单纯疱疹病毒2型(HSV-2)诊断芯片的O ligo探针。方法利用BLA ST软件对HSV-2的DNA序列进行序列比对,得到有意义的特异序列;用生物学软件O ligo6.0设计特异性高、Tm值相近、长度均一的O ligo探针。结果获得13条60-m er O ligo探针。结论利用BLA ST系统和生物学软件O ligo6.0设计HSV-2诊断芯片的探针,可为后期打印成DNA芯片,用于HSV-2的检测打下基础。 展开更多
关键词 单纯疱疹病毒2型 生物芯片 Oligo探针 blast软件
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B19微小病毒70-mer寡核苷酸探针的设计 被引量:1
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作者 刘佳 郑文岭 马文丽 《山西医科大学学报》 CAS 2004年第2期104-106,共3页
目的 设计B19微小病毒诊断基因芯片的寡核苷酸探针。方法 以微小病毒B19为例 ,利用BLAST软件对其序列进行比对并获得特异序列 ;利用软件Oligo 6设计特异性高、Tm值接近、长度均一的寡核苷酸探针。 结果 获得 12条 70 mer寡核苷酸探... 目的 设计B19微小病毒诊断基因芯片的寡核苷酸探针。方法 以微小病毒B19为例 ,利用BLAST软件对其序列进行比对并获得特异序列 ;利用软件Oligo 6设计特异性高、Tm值接近、长度均一的寡核苷酸探针。 结果 获得 12条 70 mer寡核苷酸探针 ,用于芯片打印及病毒检测。结论 利用BLAST系统和生物学软件Oligo 展开更多
关键词 blast软件 基因芯片 寡核苷酸探针 分子生物学 微小病毒B19
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