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蜡状芽胞杆菌群16S rDNA分析
被引量：
3
1
作者
邹寰
喻子牛
孙明
《华中农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第4期478-482,共5页
蜡状芽胞杆菌群主要包括炭疽芽胞杆菌(Bacillus anthracis)、蜡状芽胞杆菌(Bacillus cereus)、苏云金芽胞杆菌(Bacillus thuringiensis)。GenBank已有这个群的8个菌株完成了全基因组序列测定。对这8株蜡状芽胞杆菌群菌株中98条16S rDNA...
蜡状芽胞杆菌群主要包括炭疽芽胞杆菌(Bacillus anthracis)、蜡状芽胞杆菌(Bacillus cereus)、苏云金芽胞杆菌(Bacillus thuringiensis)。GenBank已有这个群的8个菌株完成了全基因组序列测定。对这8株蜡状芽胞杆菌群菌株中98条16S rDNA的序列进行相互BLAST比较,发现在同一基因组内各个16S rDNA拷贝全局相似度最低为96.47%,在不同基因组间16S rDNA局部片段比对最小相似度达到99.72%,对应片段长度也有1 417 bp。这点充分说明,该群的细菌完全共用同一种16S rDNA,根据16S rDNA给细菌分类的特点,它们应该属于同一个种。在亲缘关系上,枯草芽胞杆菌离蜡状芽胞杆菌群最近。
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关键词
蜡状芽胞杆菌群
16S
RDNA
blast序列分析
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题名
蜡状芽胞杆菌群16S rDNA分析
被引量：
3
1
作者
邹寰
喻子牛
孙明
机构
华中农业大学生命科学技术学院/农业微生物学国家重点实验室
出处
《华中农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第4期478-482,共5页
基金
国家“863”高技术研究发展计划项目(2006AA02Z174、2006AA10A212)
国家“973”项目(2003CB114201)资助
文摘
蜡状芽胞杆菌群主要包括炭疽芽胞杆菌(Bacillus anthracis)、蜡状芽胞杆菌(Bacillus cereus)、苏云金芽胞杆菌(Bacillus thuringiensis)。GenBank已有这个群的8个菌株完成了全基因组序列测定。对这8株蜡状芽胞杆菌群菌株中98条16S rDNA的序列进行相互BLAST比较,发现在同一基因组内各个16S rDNA拷贝全局相似度最低为96.47%,在不同基因组间16S rDNA局部片段比对最小相似度达到99.72%,对应片段长度也有1 417 bp。这点充分说明,该群的细菌完全共用同一种16S rDNA,根据16S rDNA给细菌分类的特点,它们应该属于同一个种。在亲缘关系上,枯草芽胞杆菌离蜡状芽胞杆菌群最近。
关键词
蜡状芽胞杆菌群
16S
RDNA
blast序列分析
Keywords
Bacillus cereus group
16S rDNA
blast
analysis
分类号
Q939.124 [生物学—微生物学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
蜡状芽胞杆菌群16S rDNA分析
邹寰
喻子牛
孙明
《华中农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2008
3
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