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不同鸡种BF1基因SNP和Indel比对分析
被引量：
4
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作者
陈博雯
郑圣晗
+5 位作者
张莘
王统苗
王志秀
张扬
陈国宏
常国斌
《江苏农业学报》
CSCD
北大核心
2018年第5期1087-1094,共8页
鸡BF1基因多态性与传染性疾病的抗性有很大关系。鸡BF1基因多态性及功能尚不清楚。本研究直接测定了25个鸡种BF1基因序列,并与从NCBI下载的红色原鸡BF1基因进行了比较,构建系统进化树进行分析。结果显示,在这25个鸡种中共检测到了171个...
鸡BF1基因多态性与传染性疾病的抗性有很大关系。鸡BF1基因多态性及功能尚不清楚。本研究直接测定了25个鸡种BF1基因序列,并与从NCBI下载的红色原鸡BF1基因进行了比较,构建系统进化树进行分析。结果显示,在这25个鸡种中共检测到了171个单核苷酸多态性(SNP),其中外显子上发现了108个SNP。这些外显子中SNP位点编码氨基酸166个,其中有58个氨基酸发生变异,氨基酸序列同源性高于核苷酸。外显子4和外显子1的SNP数量最多,占46%以上,第5、第6、第7、第8外显子属于保守区域。核苷酸序列缺失主要发生在外显子1和内含子5上。25个鸡种根据地理位置和气候环境大致可被分为3大类。说明,BF1基因在核苷酸多态性水平上存在较高的变异性,为鸡抗病育种提供了基础。
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关键词
鸡MHC
bf1基因
SNP
INDEL
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职称材料
鸡MHC-BF1基因的外显子4-8序列分析
2
作者
罗前
刘丽霞
+3 位作者
罗鹏辉
江静文
蔡宏宇
张倩
《甘肃畜牧兽医》
2018年第3期77-78,80,共3页
目的:分析乌鸡、青脚麻鸡、三黄鸡的BF1基因外显子4-8序列及其多态性。方法:利用PCR扩增和克隆测序相结合的方法。结果:乌鸡和青脚麻鸡BF1基因外显子4-8长度为462 bp,共编码154个氨基酸,而三黄鸡的外显子7缺失。将本研究所得三个品种鸡...
目的:分析乌鸡、青脚麻鸡、三黄鸡的BF1基因外显子4-8序列及其多态性。方法:利用PCR扩增和克隆测序相结合的方法。结果:乌鸡和青脚麻鸡BF1基因外显子4-8长度为462 bp,共编码154个氨基酸,而三黄鸡的外显子7缺失。将本研究所得三个品种鸡BF1外显子4-8序列与原鸡相比,发现乌鸡、青脚麻鸡和三黄鸡有6、7和10个碱基突变,分别导致1、4和2个氨基酸发生改变。
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关键词
乌鸡
青脚麻鸡
三黄鸡
bf1基因
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职称材料
题名
不同鸡种BF1基因SNP和Indel比对分析
被引量：
4
1
作者
陈博雯
郑圣晗
张莘
王统苗
王志秀
张扬
陈国宏
常国斌
机构
扬州大学动物科学与技术学院
出处
《江苏农业学报》
CSCD
北大核心
2018年第5期1087-1094,共8页
基金
国家科技支撑计划项目(2015BAD03B03)
江苏省六大人才高峰项目(2015-NY-019)
文摘
鸡BF1基因多态性与传染性疾病的抗性有很大关系。鸡BF1基因多态性及功能尚不清楚。本研究直接测定了25个鸡种BF1基因序列,并与从NCBI下载的红色原鸡BF1基因进行了比较,构建系统进化树进行分析。结果显示,在这25个鸡种中共检测到了171个单核苷酸多态性(SNP),其中外显子上发现了108个SNP。这些外显子中SNP位点编码氨基酸166个,其中有58个氨基酸发生变异,氨基酸序列同源性高于核苷酸。外显子4和外显子1的SNP数量最多,占46%以上,第5、第6、第7、第8外显子属于保守区域。核苷酸序列缺失主要发生在外显子1和内含子5上。25个鸡种根据地理位置和气候环境大致可被分为3大类。说明,BF1基因在核苷酸多态性水平上存在较高的变异性,为鸡抗病育种提供了基础。
关键词
鸡MHC
bf1基因
SNP
INDEL
Keywords
chicken MHC
bf
1
gene
SNP
Indel
分类号
S858.31 [农业科学—临床兽医学]
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职称材料
题名
鸡MHC-BF1基因的外显子4-8序列分析
2
作者
罗前
刘丽霞
罗鹏辉
江静文
蔡宏宇
张倩
机构
西北民族大学生命科学与工程学院
出处
《甘肃畜牧兽医》
2018年第3期77-78,80,共3页
文摘
目的:分析乌鸡、青脚麻鸡、三黄鸡的BF1基因外显子4-8序列及其多态性。方法:利用PCR扩增和克隆测序相结合的方法。结果:乌鸡和青脚麻鸡BF1基因外显子4-8长度为462 bp,共编码154个氨基酸,而三黄鸡的外显子7缺失。将本研究所得三个品种鸡BF1外显子4-8序列与原鸡相比,发现乌鸡、青脚麻鸡和三黄鸡有6、7和10个碱基突变,分别导致1、4和2个氨基酸发生改变。
关键词
乌鸡
青脚麻鸡
三黄鸡
bf1基因
分类号
S813.2 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
不同鸡种BF1基因SNP和Indel比对分析
陈博雯
郑圣晗
张莘
王统苗
王志秀
张扬
陈国宏
常国斌
《江苏农业学报》
CSCD
北大核心
2018
4
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职称材料
2
鸡MHC-BF1基因的外显子4-8序列分析
罗前
刘丽霞
罗鹏辉
江静文
蔡宏宇
张倩
《甘肃畜牧兽医》
2018
0
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