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艾BES1基因家族的鉴定及其响应模式分析
1
作者
李晶晶
刘秀玉
+4 位作者
陈随清
王利丽
郭晨宁
马蕊
练从龙
《福建农业学报》
北大核心
2025年第5期476-486,共11页
【目的】从艾(Artemisia argyi)全基因组数据中鉴定出BES1(BRI1-EMS-Suppressor1)基因家族成员,对其进行生物信息学分析,以阐明艾BES1基因家族的表达特性。【方法】使用在线分析软件对艾BES1家族成员的理化性质、启动子元件、系统进化...
【目的】从艾(Artemisia argyi)全基因组数据中鉴定出BES1(BRI1-EMS-Suppressor1)基因家族成员,对其进行生物信息学分析,以阐明艾BES1基因家族的表达特性。【方法】使用在线分析软件对艾BES1家族成员的理化性质、启动子元件、系统进化关系和表达模式进行分析;利用转录组数据,明确各成员在艾不同组织的表达水平以及响应盐碱胁迫的表达情况;并采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术对AaBES1成员进行艾不同组织和应对植物生长调节剂处理的表达模式分析。【结果】从艾基因组中共鉴定获得14个AaBES1基因,AaBES1s蛋白亚细胞定位均在细胞核;AaBES1基因家族启动子含有多种逆境和激素响应元件;艾BES1家族成员响应盐碱与植物生长调节剂的胁迫,大多呈现先升高再下降的表达模式;与茎叶中表达相比,该家族成员在艾根中的表达模式具有组织特异性,表达量明显高于茎叶。【结论】通过对艾BES1基因家族进行鉴定和植物生长调节剂应答分析,表明艾BES1基因在盐碱胁迫和植物生长调节剂应答过程中发挥重要作用,并为进一步开展艾BES1基因功能的研究和植物抗逆性研究奠定理论基础。
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关键词
艾
bes1基因家族
实时荧光定量PCR
植物生长调节剂
盐碱胁迫
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职称材料
小麦BES1基因家族的比较基因组学分析
被引量：
5
2
作者
姜玉梅
姜如云
+3 位作者
李俊畅
杨进威
牛吉山
李磊
《麦类作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第10期1181-1188,共8页
BES1基因是植物体内一类重要的转录因子。本研究利用基因组测序数据,在小麦基因组中鉴定到20个BES1基因家族成员,它们分布在14条染色体上。为进一步研究BES1基因在小麦以及其他禾本科作物(水稻、玉米、高梁、谷子和大麦)中的功能和进化...
BES1基因是植物体内一类重要的转录因子。本研究利用基因组测序数据,在小麦基因组中鉴定到20个BES1基因家族成员,它们分布在14条染色体上。为进一步研究BES1基因在小麦以及其他禾本科作物(水稻、玉米、高梁、谷子和大麦)中的功能和进化关系,对小麦等6种禾本科作物以及十字花科模式植物拟南芥的BES1基因家族进行系统发育关系、结构特性和共线性关系分析,结果发现,系统发育分析将该家族成员分为Group A、Group B、Group C和Group D四类,大部分小麦BES1基因集中在Group A;大部分小麦BES1基因家族成员有2个外显子,最多有10个外显子;小麦与水稻BES1基因之间存在更多的共线性关系。此外,在小麦根和穗中还鉴定到3个具有较高表达水平的BES1基因(TaBES1-3A-2、TaBES1-3B-2和TaBES1-3D-2),表明BES1基因在小麦生长发育过程中发挥着重要作用。
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关键词
小麦
bes1基因家族
系统进化
共线性
表达分析
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职称材料
题名
艾BES1基因家族的鉴定及其响应模式分析
1
作者
李晶晶
刘秀玉
陈随清
王利丽
郭晨宁
马蕊
练从龙
机构
河南中医药大学药学院/河南省中药资源与中药化学重点实验室/豫药全产业链研发河南省协同创新中心
出处
《福建农业学报》
北大核心
2025年第5期476-486,共11页
基金
国家自然科学基金项目(82204551)
中央本级重大增减支项目(2060302)
河南省高等学校重点科研项目(22A360012)。
文摘
【目的】从艾(Artemisia argyi)全基因组数据中鉴定出BES1(BRI1-EMS-Suppressor1)基因家族成员,对其进行生物信息学分析,以阐明艾BES1基因家族的表达特性。【方法】使用在线分析软件对艾BES1家族成员的理化性质、启动子元件、系统进化关系和表达模式进行分析;利用转录组数据,明确各成员在艾不同组织的表达水平以及响应盐碱胁迫的表达情况;并采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术对AaBES1成员进行艾不同组织和应对植物生长调节剂处理的表达模式分析。【结果】从艾基因组中共鉴定获得14个AaBES1基因,AaBES1s蛋白亚细胞定位均在细胞核;AaBES1基因家族启动子含有多种逆境和激素响应元件;艾BES1家族成员响应盐碱与植物生长调节剂的胁迫,大多呈现先升高再下降的表达模式;与茎叶中表达相比,该家族成员在艾根中的表达模式具有组织特异性,表达量明显高于茎叶。【结论】通过对艾BES1基因家族进行鉴定和植物生长调节剂应答分析,表明艾BES1基因在盐碱胁迫和植物生长调节剂应答过程中发挥重要作用,并为进一步开展艾BES1基因功能的研究和植物抗逆性研究奠定理论基础。
关键词
艾
bes1基因家族
实时荧光定量PCR
植物生长调节剂
盐碱胁迫
Keywords
Artemisia argyi
bes
1
family
qRT-PCR
plant hormone
salinity-alkali stress
分类号
R286 [医药卫生—中药学]
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职称材料
题名
小麦BES1基因家族的比较基因组学分析
被引量：
5
2
作者
姜玉梅
姜如云
李俊畅
杨进威
牛吉山
李磊
机构
河南农业大学农学院
河南农业大学国家小麦工程技术研究中心
出处
《麦类作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第10期1181-1188,共8页
基金
国家重点研发计划项目(2017YFD0301101)。
文摘
BES1基因是植物体内一类重要的转录因子。本研究利用基因组测序数据,在小麦基因组中鉴定到20个BES1基因家族成员,它们分布在14条染色体上。为进一步研究BES1基因在小麦以及其他禾本科作物(水稻、玉米、高梁、谷子和大麦)中的功能和进化关系,对小麦等6种禾本科作物以及十字花科模式植物拟南芥的BES1基因家族进行系统发育关系、结构特性和共线性关系分析,结果发现,系统发育分析将该家族成员分为Group A、Group B、Group C和Group D四类,大部分小麦BES1基因集中在Group A;大部分小麦BES1基因家族成员有2个外显子,最多有10个外显子;小麦与水稻BES1基因之间存在更多的共线性关系。此外,在小麦根和穗中还鉴定到3个具有较高表达水平的BES1基因(TaBES1-3A-2、TaBES1-3B-2和TaBES1-3D-2),表明BES1基因在小麦生长发育过程中发挥着重要作用。
关键词
小麦
bes1基因家族
系统进化
共线性
表达分析
Keywords
Triticum aestivum L
bes
1
gene family
Phylogenetic tree
Collinearity
Expression analysis
分类号
S512.1 [农业科学—作物学]
S330 [农业科学—作物遗传育种]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
艾BES1基因家族的鉴定及其响应模式分析
李晶晶
刘秀玉
陈随清
王利丽
郭晨宁
马蕊
练从龙
《福建农业学报》
北大核心
2025
0
在线阅读
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职称材料
2
小麦BES1基因家族的比较基因组学分析
姜玉梅
姜如云
李俊畅
杨进威
牛吉山
李磊
《麦类作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021
5
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职称材料
已选择
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