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黄瓜和南瓜Bcl-2相关抗凋亡家族全基因组鉴定与表达模式分析
1
作者 胡永波 雷雨田 +6 位作者 杨永森 陈馨 林黄昉 林碧英 刘爽 毕格 申宝营 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第6期219-237,共19页
【目的】分析Bcl-2相关抗凋亡(Bcl-2 associated athanogene,BAG)家族蛋白成员在黄瓜和南瓜中响应非生物胁迫以及在黄瓜/南瓜嫁接愈合过程中响应光照的表达模式,为解析黄瓜/南瓜嫁接苗嫁接愈合机理及黄瓜和南瓜等蔬菜的抗性分子育种提... 【目的】分析Bcl-2相关抗凋亡(Bcl-2 associated athanogene,BAG)家族蛋白成员在黄瓜和南瓜中响应非生物胁迫以及在黄瓜/南瓜嫁接愈合过程中响应光照的表达模式,为解析黄瓜/南瓜嫁接苗嫁接愈合机理及黄瓜和南瓜等蔬菜的抗性分子育种提供有利基因。【方法】基于黄瓜和南瓜基因组信息,利用生物信息学手段,对黄瓜和南瓜中BAG基因家族进行鉴定,并对其理化特性、染色体定位、基因结构、系统发育和共线性进行了分析。基于公共数据库及黄瓜/南瓜嫁接苗在嫁接愈合过程中转录组测序数据,分析BAG基因在黄瓜和南瓜中响应非生物胁迫以及在嫁接愈合过程中响应光照的表达模式。【结果】在黄瓜和南瓜中分别鉴定到12和18个BAG家族基因,均分为2个亚族,基因成员保守性高,I亚家族的BAG主要参与基因调控和逆境响应,而II亚家族的BAG主要参与植物的发育过程。黄瓜和南瓜BAG基因分别与拟南芥、水稻、番茄存在多种线性关系,但CsaV3_1G017210与拟南芥、水稻、番茄和南瓜中的BAG基因均不存在线性关系。不同BAG基因具有组织特异性表达模式。CsaV3_6G000970和CmoCh08G008520(BAG family molecular chaperone regulator 6)在黄瓜和南瓜响应非生物胁迫以及黄瓜/南瓜嫁接苗嫁接愈合过程中均发生上调表达。【结论】BAG家族基因在黄瓜和南瓜对非生物胁迫的响应以及黄瓜/南瓜嫁接苗嫁接愈合过程中对光的响应中具有差异性,协同调控了黄瓜和南瓜的生长发育及嫁接愈合,在黄瓜和南瓜非生物胁迫以及黄瓜/南瓜嫁接苗嫁接愈合过程中发挥着重要作用。 展开更多
关键词 黄瓜 南瓜 bag基因家族 生物信息学 嫁接愈合
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BAG家族基因表达与肺腺癌易感性的相关性研究 被引量：1
2
作者 李颖 刘红雨 +7 位作者 王竞 李永文 吴蘅 杜欣欣 王伟强 岳蛟 周清华 陈军 《中国肺癌杂志》 CAS 2010年第10期942-946,共5页
背景与目的 BAG(Bcl-2-associated athanogene)家族是一个多功能的抗凋亡家族,其表达与多种肿瘤的发病及预后相关。BAG基因是近年发现的抗凋亡基因家族,调节各种生理过程,包括细胞凋亡、肿瘤发生、神经分化、应激反应和细胞周期等。BAG... 背景与目的 BAG(Bcl-2-associated athanogene)家族是一个多功能的抗凋亡家族,其表达与多种肿瘤的发病及预后相关。BAG基因是近年发现的抗凋亡基因家族,调节各种生理过程,包括细胞凋亡、肿瘤发生、神经分化、应激反应和细胞周期等。BAG家族的表达状态与某些肿瘤的发病和预后相关。本研究的目的是探讨BAG家族基因表达水平与肺腺癌易感性的关系,在分子水平探讨肺腺癌发病的相关危险因素。方法采用基因表达谱芯片技术检测29例肺腺癌患者癌组织及癌旁肺组织BAG家族基因的表达,应用配对t检验和Cox回归拟合单因素条件Logistic回归方法。并利用美国GEO数据库验证相关结果。结果 BAG-1、BAG-2、BAG-5基因癌旁肺组织中表达高于癌组织且为肺腺癌发生的保护因素(P<0.05,OR<1);BAG-4基因在癌组织中表达高于癌旁肺组织且为肺腺癌发生的危险因素(P<0.05,OR>1);BAG-3基因在癌组织及癌旁正常组织表达差别无统计学意义(P>0.05)。结论 BAG-1、BAG-2、BAG-5基因可能是为肺腺癌发生的保护性因素,BAG-4基因可能是为肺腺癌发生的危险性因素。 展开更多
关键词 肺肿瘤 bag家族基因 危险因素
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杨树BAG基因的鉴定及表达模式分析 被引量：2
3
作者 张扬 杜琳 +3 位作者 唐贤丰 刘唤唤 周功克 柴国华 《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2019年第1期138-145,共8页
【目的】杨树是我国人工林的重要组成部分,也是公认的模式木本植物。植物BAG蛋白作为保守的分子伴侣,在生长发育和抗逆性中起到关键作用。研究杨树BAG蛋白家族的进化与表达模式,鉴定BAG基因的生物学功能对于林木遗传改良具有重要的指导... 【目的】杨树是我国人工林的重要组成部分,也是公认的模式木本植物。植物BAG蛋白作为保守的分子伴侣,在生长发育和抗逆性中起到关键作用。研究杨树BAG蛋白家族的进化与表达模式,鉴定BAG基因的生物学功能对于林木遗传改良具有重要的指导意义。【方法】以拟南芥7个BAG蛋白为诱饵,搜索毛果杨、水稻和小立碗藓在线数据库(https://phytozome.jgi.doe.gov)获得这3个物种同源的BAG蛋白。利用生物信息学构建毛果杨、拟南芥、水稻和小立碗藓BAG蛋白的系统进化树,分析这些蛋白的生化特性及进化关系。结合杨树芯片(http://bar.utoronto.ca)数据,利用qRT-PCR检测杨树BAG基因的组织和逆境(旱和热胁迫)表达模式。【结果】毛果杨包含14个BAG基因,按照国际命名法(以染色体位置进行排序),将其命名为PtrBAG1—PtrBAG14。系统进化树表明杨树、拟南芥、水稻和小立碗藓BAG蛋白相对保守,大体可以分为2个亚家族。第1个亚家族中,大部分BAG蛋白N端含有UBL结构域,可能作为分子桥梁参与降解某些蛋白;第2个亚家族的大部分BAG蛋白含有IQ结构域,意味着这些蛋白可能与Ca^(2+)信号相关。杨树BAG基因在不同逆境处理(热胁迫和干旱胁迫)条件下有不同的表达模式。热处理诱导所有BAGs基因表达发生变化,其中BAG1、BAG4、BAG6、BAG7和BAG8表达被激活,而另9个BAG基因的表达被抑制;特别是,热诱导BAG4和BAG6表达上调超过90倍。干旱胁迫条件下,大部分BAG表达变化幅度很小。组织表达模式分析表明,大部分杨树BAG基因在根、叶、芽、小苗、雌花序、雄花序和木质部中表达量很低,只有BAG2和BAG12在木质部中大量表达。【结论】杨树BAG家族共有14个成员,大体分为2个亚家族,在进化上与本文选用的陆生植物拟南芥和水稻BAG蛋白有更高的相似性。杨树14个BAG基因可能都参与了热胁迫调控,但不同成员在抗热过程中起不同作用。相比而言,大部分杨树BAG基因可能并不参与抗旱。值得指出的是,杨树BAG4和BAG6可能在热胁迫中作用最明显,而BAG2和BAG12可能参与木材形成。 展开更多
关键词 杨树 bag基因家族 基因表达 进化
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