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PEDV N蛋白的原核表达纯化及B细胞抗原表位预测分析
被引量：
3
1
作者
郭富城
金丽
+4 位作者
苏强
粟雨芯
李方琳
陈士恩
马晓霞
《浙江农业学报》
CSCD
北大核心
2020年第5期762-769,共8页
本研究旨在对猪流行性腹泻病毒(porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)N基因进行克隆构建、表达与其B细胞抗原表位性质的预测。将PEDV的N基因进行PCR扩增,克隆到原核表达载体pET-28a(+)中,经酶切验证获得阳性克隆,将阳性克隆在表达菌E....
本研究旨在对猪流行性腹泻病毒(porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)N基因进行克隆构建、表达与其B细胞抗原表位性质的预测。将PEDV的N基因进行PCR扩增,克隆到原核表达载体pET-28a(+)中,经酶切验证获得阳性克隆,将阳性克隆在表达菌E.coli BL21(DE3)中表达。通过对表达条件及纯化条件的优化,获得高纯度表达蛋白。利用生物信息同源模型化软件Swiss-Pdb Viewer建立PEDV-N蛋白的3D结构,并根据生物信息学软件DNA-Star预测PEDV-N蛋白的二级结构、抗原性、亲水性和表面可及性分析,综合分析预测其B细胞抗原表位。经预测PEDV-N蛋白氨基酸序列中存在13个B细胞优势抗原表位区域。研究结果将进一步为PEDV-N蛋白体外表达产物的应用及研制基因工程疫苗提供理论基础。
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关键词
猪流行性腹泻病毒
N蛋白
纯化
二级结构
b细胞抗原表位预测
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职称材料
禽波氏杆菌HagA蛋白基因的序列分析及抗原表位预测
2
作者
袁朋
朱瑞良
+1 位作者
崔晨晨
杨萍萍
《浙江农业学报》
CSCD
北大核心
2017年第10期1642-1647,共6页
试验旨在对禽波氏杆菌的血凝素HagA蛋白的二级结构与B细胞抗原优势表位进行预测,探讨以血凝素HagA蛋白制作单克隆抗体的可能性。首先对禽波氏杆菌的血凝素hagA基因进行了PCR扩增以及序列测定,利用生物信息学的相关软件与分析方法,对血凝...
试验旨在对禽波氏杆菌的血凝素HagA蛋白的二级结构与B细胞抗原优势表位进行预测,探讨以血凝素HagA蛋白制作单克隆抗体的可能性。首先对禽波氏杆菌的血凝素hagA基因进行了PCR扩增以及序列测定,利用生物信息学的相关软件与分析方法,对血凝素HagA蛋白的二级结构以及B细胞抗原表位进行分析预测。经综合分析表明,禽波氏杆菌的HagA蛋白氨基酸序列中存在7个B细胞优势抗原表位区域,6个可能的糖基化位点。研究结果为进一步分析禽波氏杆菌HagA蛋白的生物学功能、制备单抗和研制疫苗等奠定了基础。
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关键词
禽波氏杆菌
HagA蛋白
二级结构
b细胞抗原表位预测
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职称材料
题名
PEDV N蛋白的原核表达纯化及B细胞抗原表位预测分析
被引量：
3
1
作者
郭富城
金丽
苏强
粟雨芯
李方琳
陈士恩
马晓霞
机构
西北民族大学生物医学研究中心
西北民族大学生命科学与工程学院
出处
《浙江农业学报》
CSCD
北大核心
2020年第5期762-769,共8页
基金
中央高校基本科研业务费(31920200073)
动物医学生物工程创新团队发展计划(IRT_17R88)。
文摘
本研究旨在对猪流行性腹泻病毒(porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)N基因进行克隆构建、表达与其B细胞抗原表位性质的预测。将PEDV的N基因进行PCR扩增,克隆到原核表达载体pET-28a(+)中,经酶切验证获得阳性克隆,将阳性克隆在表达菌E.coli BL21(DE3)中表达。通过对表达条件及纯化条件的优化,获得高纯度表达蛋白。利用生物信息同源模型化软件Swiss-Pdb Viewer建立PEDV-N蛋白的3D结构,并根据生物信息学软件DNA-Star预测PEDV-N蛋白的二级结构、抗原性、亲水性和表面可及性分析,综合分析预测其B细胞抗原表位。经预测PEDV-N蛋白氨基酸序列中存在13个B细胞优势抗原表位区域。研究结果将进一步为PEDV-N蛋白体外表达产物的应用及研制基因工程疫苗提供理论基础。
关键词
猪流行性腹泻病毒
N蛋白
纯化
二级结构
b细胞抗原表位预测
Keywords
porcine epidemic diarrhea virus
N protein
purification
secondary structure
b
-cell epitope prediction
分类号
S825.28 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
禽波氏杆菌HagA蛋白基因的序列分析及抗原表位预测
2
作者
袁朋
朱瑞良
崔晨晨
杨萍萍
机构
山东农业大学动物科技学院
出处
《浙江农业学报》
CSCD
北大核心
2017年第10期1642-1647,共6页
基金
国家自然科学基金项目(31602067
31272595)
+1 种基金
山东省自然科学基金项目(ZR2014CM044)
山东省"双一流"奖补资金
文摘
试验旨在对禽波氏杆菌的血凝素HagA蛋白的二级结构与B细胞抗原优势表位进行预测,探讨以血凝素HagA蛋白制作单克隆抗体的可能性。首先对禽波氏杆菌的血凝素hagA基因进行了PCR扩增以及序列测定,利用生物信息学的相关软件与分析方法,对血凝素HagA蛋白的二级结构以及B细胞抗原表位进行分析预测。经综合分析表明,禽波氏杆菌的HagA蛋白氨基酸序列中存在7个B细胞优势抗原表位区域,6个可能的糖基化位点。研究结果为进一步分析禽波氏杆菌HagA蛋白的生物学功能、制备单抗和研制疫苗等奠定了基础。
关键词
禽波氏杆菌
HagA蛋白
二级结构
b细胞抗原表位预测
Keywords
b
ordetella avium
HagA
secondary structure
b
-cell epitope prediction
分类号
S858.3 [农业科学—临床兽医学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
PEDV N蛋白的原核表达纯化及B细胞抗原表位预测分析
郭富城
金丽
苏强
粟雨芯
李方琳
陈士恩
马晓霞
《浙江农业学报》
CSCD
北大核心
2020
3
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
禽波氏杆菌HagA蛋白基因的序列分析及抗原表位预测
袁朋
朱瑞良
崔晨晨
杨萍萍
《浙江农业学报》
CSCD
北大核心
2017
0
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职称材料
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