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应用ABEEM/MM模型研究水分子团簇(H_2O)_n(n=11～16)的性质被引量：9: 1; 作者钱萍杨忠志《物理化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2006年第5期561-568,共8页; 应用ABEEM/MM模型计算了较大的水分子团簇(H2O)n(n=11￣16)的各种性质,如:优化的几何构型,氢键个数,结合能,稳定性,ABEEM电荷分布,偶极矩,以及结构参数、平均氢键个数和强度,增加的团簇结合能等.结果表明,从立方体结构到笼状结构的过渡... 展开更多; 关键词 abeem/MM模型原子-键电负性均衡方法分子力场水分子团簇; 在线阅读下载PDF 职称材料

原子-键电负性均衡方法融合进分子力场(ABEEM/MM)应用于蛋白质分子(Crambin)模拟被引量：9: 2; 作者张强杨忠志《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2005年第12期2345-2347,共3页; 建立应用于多肽和蛋白质模拟的ABEEM/MM浮动电荷力场.利用该模型和参数,对实际蛋白质分子Cramb in(植物种子中的一种小的蛋白质)进行模拟,得到了满意的结果,为其更广泛的应用开辟了道路.; 关键词原子-键电负性均衡方法分子力场 CRAMBIN; 在线阅读下载PDF 职称材料

分子ABEEM电荷分布的图形表示: 3; 作者杨忠志李洋 +1 位作者宫利东赵东霞《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2009年第8期1600-1604,共5页; 利用M atlab软件编写程序,将基于密度泛函理论和电负性均衡原理发展的原子-键电负性均衡方法σ-π模型(ABEEMσ-π)计算的电荷分布,特别是键电荷和孤对电子的电荷分布,用图形表现出来,对分子的电荷分布给出直观形象的认识,并以腺嘌呤、... 展开更多; 关键词电荷分布原子-键电负性均衡方法图形表示 MATLAB软件; 在线阅读下载PDF 职称材料

应用ABEEM/MM力场探究Na^+与氮-甲基乙酰胺及水的相互作用: 4; 作者潘一鸣张静 +4 位作者田博姚菁菁宫利东刘翠杨忠志《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2018年第11期2468-2476,共9页; 应用量子化学方法 MP2/6-311++G(d,p)//B3LYP/6-31+G(d,p)和原子-键电负性均衡浮动电荷分子力场(ABEEM/MM),对[Na(H_2O)n]+(n=3～8),[Na(NMA)n]+(n=3～8)和[Na(NMA)n(H_2O)m]+(n+m=4,6)(NMA=氮-甲基乙酰胺)体系的结构、结合能和电荷分... 展开更多; 关键词原子-键电负性均衡浮动电荷分子力场钠离子氮-甲基乙酰胺可极化力场; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名应用ABEEM/MM模型研究水分子团簇(H_2O)_n(n=11～16)的性质被引量：9: 1; 作者钱萍杨忠志; 机构辽宁师范大学化学化工学院; 出处《物理化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2006年第5期561-568,共8页; 基金国家自然科学基金(20373021)资助项目; 文摘应用ABEEM/MM模型计算了较大的水分子团簇(H2O)n(n=11￣16)的各种性质,如:优化的几何构型,氢键个数,结合能,稳定性,ABEEM电荷分布,偶极矩,以及结构参数、平均氢键个数和强度,增加的团簇结合能等.结果表明,从立方体结构到笼状结构的过渡出现在n=12的水分子团簇中,随着类似于笼状结构特点的不断增强,五元环的富集程度有所增加.; 关键词 abeem/MM模型原子-键电负性均衡方法分子力场水分子团簇; Keywords abeem/MM model, The atom-bond electronegativity equalization method, Molecular mechanics, Water clusters; 分类号 O641.1 [理学—物理化学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名原子-键电负性均衡方法融合进分子力场(ABEEM/MM)应用于蛋白质分子(Crambin)模拟被引量：9: 2; 作者张强杨忠志; 机构辽宁师范大学化学系; 出处《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2005年第12期2345-2347,共3页; 基金国家自然科学基金(批准号:20373021 20073018)资助; 文摘建立应用于多肽和蛋白质模拟的ABEEM/MM浮动电荷力场.利用该模型和参数,对实际蛋白质分子Cramb in(植物种子中的一种小的蛋白质)进行模拟,得到了满意的结果,为其更广泛的应用开辟了道路.; 关键词原子-键电负性均衡方法分子力场 CRAMBIN; Keywords atom-bond electronegativity equalization method （ abeem ） Molecular mechanics （ MM ） Crambin; 分类号 O641 [理学—物理化学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名分子ABEEM电荷分布的图形表示: 3; 作者杨忠志李洋宫利东赵东霞; 机构辽宁师范大学化学化工学院辽宁师范大学物理与电子技术学院; 出处《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2009年第8期1600-1604,共5页; 基金国家自然科学基金(批准号:20633050 20703022)资助; 文摘利用M atlab软件编写程序,将基于密度泛函理论和电负性均衡原理发展的原子-键电负性均衡方法σ-π模型(ABEEMσ-π)计算的电荷分布,特别是键电荷和孤对电子的电荷分布,用图形表现出来,对分子的电荷分布给出直观形象的认识,并以腺嘌呤、腺嘌呤脱氧核苷酸以及丙烯与氯化氢的马氏亲电加成反应为例,进行应用说明.; 关键词电荷分布原子-键电负性均衡方法图形表示 MATLAB软件; Keywords Charge distribution atom-bond electronegativity equalization method（abeem） Graphical representation Matlab software; 分类号 O641 [理学—物理化学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名应用ABEEM/MM力场探究Na^+与氮-甲基乙酰胺及水的相互作用: 4; 作者潘一鸣张静田博姚菁菁宫利东刘翠杨忠志; 机构辽宁师范大学化学化工学院; 出处《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2018年第11期2468-2476,共9页; 基金国家自然科学基金(批准号:21133005 21603091) +1 种基金辽宁师范大学创新实践项目(批准号:cx201801012)资助~~; 文摘应用量子化学方法 MP2/6-311++G(d,p)//B3LYP/6-31+G(d,p)和原子-键电负性均衡浮动电荷分子力场(ABEEM/MM),对[Na(H_2O)n]+(n=3～8),[Na(NMA)n]+(n=3～8)和[Na(NMA)n(H_2O)m]+(n+m=4,6)(NMA=氮-甲基乙酰胺)体系的结构、结合能和电荷分布进行研究.在计算结果的基础上,构建上述体系的ABEEM/MM可极化势能函数,优选并确定相关参数.结果表明,ABEEM/MM的计算结果与量子化学的计算结果相符:Na+与配体间距离的平均绝对偏差(AAD)小于0. 007 nm,相对均方根偏差(RRMSD)小于3. 5%,夹角的AAD小于2. 4°,RRMSD小于2. 0%,结合能的AAD小于8. 9 k J/mol,RRMSD小于12. 4%;ABEEM/MM电荷分布与量子力学(QM)电荷分布的线性相关系数在0. 97以上.; 关键词原子-键电负性均衡浮动电荷分子力场钠离子氮-甲基乙酰胺可极化力场; Keywords atom-bond electronegativity equalization method fused into molecular mechanics(abeem/MM) Sodium ion N-Methylacetamide Polarizable force field; 分类号 O641 [理学—物理化学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

	题名	作者	出处	发文年	被引量	操作
1	应用ABEEM/MM模型研究水分子团簇(H_2O)_n(n=11～16)的性质	钱萍杨忠志	《物理化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心	2006	9	在线阅读下载PDF 职称材料
2	原子-键电负性均衡方法融合进分子力场(ABEEM/MM)应用于蛋白质分子(Crambin)模拟	张强杨忠志	《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心	2005	9	在线阅读下载PDF 职称材料
3	分子ABEEM电荷分布的图形表示	杨忠志李洋宫利东赵东霞	《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心	2009	0	在线阅读下载PDF 职称材料
4	应用ABEEM/MM力场探究Na^+与氮-甲基乙酰胺及水的相互作用	潘一鸣张静田博姚菁菁宫利东刘翠杨忠志	《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心	2018	0	在线阅读下载PDF 职称材料