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基于分子对接技术的拟南芥植酸酶的水解特性
1
作者
袁凡
周敏
+4 位作者
丁君辉
彭晓赟
徐文忠
萧浪涛
王若仲
《湖南农业大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第5期485-490,495,共7页
采用生物信息学、同源建模、分子对接等方法,对拟南芥植酸酶(ATMINPP)的功能结构及其与植酸的分子对接模式进行了预测。结果表明:ATMINPP由487个氨基酸组成,其二级结构由18个α螺旋、6个β折叠、伸展片段和无规则卷曲等4个主要部分构成...
采用生物信息学、同源建模、分子对接等方法,对拟南芥植酸酶(ATMINPP)的功能结构及其与植酸的分子对接模式进行了预测。结果表明:ATMINPP由487个氨基酸组成,其二级结构由18个α螺旋、6个β折叠、伸展片段和无规则卷曲等4个主要部分构成;保守半胱氨酸在螺旋结构之间形成4个二硫键;ATMINPP蛋白有2个结构域(α/β–结构域和α–结构域),活性位点位于2个结构域的中间;对接时,带负电的植酸结合在ATMINPP带正电的亲水性口袋内;保守序列RHGARYP中的His 66对植酸氢键所结合的磷酸基团进行亲核攻击,形成中间复合物,中间复合物水解得到磷酸和磷酸肌醇衍生物,His 343为解离基团氧原子提供质子,使得磷酸基团解离。
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关键词
拟南芥植酸酶
水解
生物信息学
同源建模
分子对接
植酸
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职称材料
题名
基于分子对接技术的拟南芥植酸酶的水解特性
1
作者
袁凡
周敏
丁君辉
彭晓赟
徐文忠
萧浪涛
王若仲
机构
植物激素与生长发育湖南省重点实验室
中国科学院植物研究所
出处
《湖南农业大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第5期485-490,495,共7页
基金
国家自然科学基金项目(31671777、31871714)
长沙市科技局计划项目(KQ1801024)
文摘
采用生物信息学、同源建模、分子对接等方法,对拟南芥植酸酶(ATMINPP)的功能结构及其与植酸的分子对接模式进行了预测。结果表明:ATMINPP由487个氨基酸组成,其二级结构由18个α螺旋、6个β折叠、伸展片段和无规则卷曲等4个主要部分构成;保守半胱氨酸在螺旋结构之间形成4个二硫键;ATMINPP蛋白有2个结构域(α/β–结构域和α–结构域),活性位点位于2个结构域的中间;对接时,带负电的植酸结合在ATMINPP带正电的亲水性口袋内;保守序列RHGARYP中的His 66对植酸氢键所结合的磷酸基团进行亲核攻击,形成中间复合物,中间复合物水解得到磷酸和磷酸肌醇衍生物,His 343为解离基团氧原子提供质子,使得磷酸基团解离。
关键词
拟南芥植酸酶
水解
生物信息学
同源建模
分子对接
植酸
Keywords
arabidopsis
thaliana
multiple
inositol
polyphosphate
phosphatase
(
atminpp
)
hydrolysis
bioinformatics
homology modeling
molecular docking
phytic acid
分类号
Q754 [生物学—分子生物学]
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作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于分子对接技术的拟南芥植酸酶的水解特性
袁凡
周敏
丁君辉
彭晓赟
徐文忠
萧浪涛
王若仲
《湖南农业大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2019
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