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刺参(Apostichopus japonicus)不同组织基因组甲基化状态MSAP分析 被引量：14
1
作者 郭婷婷 孙国华 +2 位作者 杨建敏 赵强 李雪燕 《海洋与湖沼》 CAS CSCD 北大核心 2013年第1期77-82,共6页
利用MSAP技术分析成体刺参的呼吸树、肠、肌肉和体壁等组织的基因组DNA甲基化水平,获得了四个组织基因组甲基化率。甲基化水平由高到低依次是呼吸树、体壁、肌肉和肠,分别是35.77%、33.51%、32.72%和28.0%,其中全甲基化位点各占19.46%、... 利用MSAP技术分析成体刺参的呼吸树、肠、肌肉和体壁等组织的基因组DNA甲基化水平,获得了四个组织基因组甲基化率。甲基化水平由高到低依次是呼吸树、体壁、肌肉和肠,分别是35.77%、33.51%、32.72%和28.0%,其中全甲基化位点各占19.46%、18.39%、19.18%和15.97%。统计学分析结果显示肠组织的甲基化水平与其它组织的差异显著(P<0.05),其余三个组织间差异不显著(P>0.05),但呼吸树与肌肉的半甲基化水平差异显著(P<0.05)。由MSAP分析差异位点克隆得到四个甲基化特异性片段,经测序分析功能未知,推测为刺参基因足非编码区或新功能基因序列。 展开更多
关键词 刺参 基因组 甲基化 msap
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普通刺参(Apostichopus japonicus)和白刺参不同组织基因组DNA的MSAP研究 被引量：6
2
作者 左之良 谭杰 +5 位作者 吴彪 陈四清 高菲 燕敬平 王爽 孙慧玲 《渔业科学进展》 CSCD 北大核心 2016年第3期93-100,共8页
本研究分别以普通刺参(Apostichopus japonicus)和白刺参基因组DNA为实验材料,应用甲基化敏感扩增多态性(Methylation-sensitive amplified polymorphism,MSAP)技术对刺参体壁、呼吸树和消化道3个组织的DNA甲基化水平和甲基化模式进行... 本研究分别以普通刺参(Apostichopus japonicus)和白刺参基因组DNA为实验材料,应用甲基化敏感扩增多态性(Methylation-sensitive amplified polymorphism,MSAP)技术对刺参体壁、呼吸树和消化道3个组织的DNA甲基化水平和甲基化模式进行了研究,初步探讨了DNA甲基化对刺参组织间基因特异性表达的影响。结果显示,筛选得到的9对引物组合能够在普通刺参和白刺参两个群体中得到稳定扩增,在两群体刺参中分别检测到5932和5208个位点,均以未甲基化位点为主,普通刺参和白刺参未甲基化位点数分别为4317和3944,分别占总扩增条带数的72.78%和75.73%。普通刺参体壁的甲基化水平为31.07%,呼吸树为23.36%,消化道为26.34%;白刺参中体壁的甲基化水平为29.88%,呼吸树为23.25%,消化道为19.45%,由此可见,体壁的甲基化率在两群体中是最高的。普通刺参和白刺参同一组织间的甲基化水平和甲基化模式不同,同一群体体壁、呼吸树和消化道不同组织间的甲基化水平和模式也不同。甲基化在普通刺参和白刺参组织分化和发育过程中可能发挥着十分重要的作用。在检测的3个组织中,CCGG序列的全甲基化位点较半甲基化位点多。 展开更多
关键词 刺参 msap CCGG位点 甲基化水平
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仿刺参“化皮病”体壁组织DNA甲基化的MSAP分析 被引量：5
3
作者 高杉 杨爱馥 +7 位作者 董颖 王摆 陈仲 蒋经伟 关晓燕 姜北 孙红娟 周遵春 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第3期637-642,共6页
利用甲基化敏感扩增多态性(Methylation-sensitive amplified polymorphism,MSAP)技术分析了健康仿刺参(Apostichopus japonicus)体壁和"化皮病"仿刺参病变体壁、正常体壁DNA序列中CCGG位点的甲基化情况。结果显示,健康仿刺... 利用甲基化敏感扩增多态性(Methylation-sensitive amplified polymorphism,MSAP)技术分析了健康仿刺参(Apostichopus japonicus)体壁和"化皮病"仿刺参病变体壁、正常体壁DNA序列中CCGG位点的甲基化情况。结果显示,健康仿刺参体壁和"化皮病"仿刺参病变体壁、正常体壁总甲基化水平分别为(18.60±5.61)%、(26.70±6.82)%和(19.53±3.34)%,其中全甲基化水平分别为(13.97±4.86)%、(20.08±5.26)%和(15.42±2.61)%,半甲基化水平分别为(4.63±3.59)%、(6.62±3.80)%和(4.11±2.08)%。"化皮病"仿刺参病变体壁总甲基化水平和全甲基化水平显著高于健康仿刺参体壁和"化皮病"仿刺参正常体壁(P<0.05),健康仿刺参体壁与"化皮病"仿刺参正常体壁总甲基化水平和全甲基化水平差异不显著(P>0.05);三者的半甲基化水平无显著差异(P>0.05)。因此,推测仿刺参体壁"化皮"与DNA甲基化有关。 展开更多
关键词 仿刺参 体壁 甲基化 msap 化皮病
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