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丙氨酸二肽的酰胺-Ⅰ带振动频率图
1
作者
郑轩
蔡开聪
《光谱学与光谱分析》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2016年第S1期13-14,共2页
基于分子力学力场构建了丙氨酸二肽(ALAD)在重水溶剂中的酰胺-Ⅰ带振动频率图,将溶剂作用以静电势场的形式投影至ALAD分子骨架中,并且引入骨架二面角对酰胺-Ⅰ带的影响,实现处于不同构象态的ALAD中酰胺-Ⅰ带光谱的快速准确预测。
关键词
丙氨酸二肽
振动频率图
酰胺-
ⅰ
带
二级结构
在线阅读
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职称材料
淀粉样蛋白片段结构动力学与酰胺-Ⅰ带振动光谱示踪
2
作者
侯彦君
郑轩
蔡开聪
《光谱学与光谱分析》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2018年第S1期109-110,共2页
借助分子对接方法,获取了β淀粉样蛋白(Amyloidβprotein,Aβ)的核心片段Aβ25-35与乙酰胆碱受体相互作用的最优结合构象,并在此基础上开展结合后的复合物的分子动力学模拟,探索其结构动力学特征。将构建的氨基酸多肽通用型振动频率图...
借助分子对接方法,获取了β淀粉样蛋白(Amyloidβprotein,Aβ)的核心片段Aβ25-35与乙酰胆碱受体相互作用的最优结合构象,并在此基础上开展结合后的复合物的分子动力学模拟,探索其结构动力学特征。将构建的氨基酸多肽通用型振动频率图应用于复合物的全原子运动轨迹,预测与受体结合后的Aβ多肽骨架酰胺-Ⅰ带光谱。其特征吸收峰表明该多肽片段与受体结合后主要呈现无规则卷曲构象,与分子对接和分子动力学轨迹聚类分析所呈现的特征构象一致。借助分子模拟与光谱建模相结合的方法能够帮助我们快速解析实验光谱中所蕴含的多肽构象信息,在分子水平上更好地认识蛋白质的空间结构动力学特征。
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关键词
β淀粉样蛋白
乙酰胆碱受体
酰胺-
ⅰ
带频率图
结构动力学
分子对接
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职称材料
题名
丙氨酸二肽的酰胺-Ⅰ带振动频率图
1
作者
郑轩
蔡开聪
机构
福建师范大学化学与化工学院
福建省理论与计算化学重点实验室
出处
《光谱学与光谱分析》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2016年第S1期13-14,共2页
基金
国家自然科学基金项目(21103021)
福建省教育厅项目(JA13063)资助
文摘
基于分子力学力场构建了丙氨酸二肽(ALAD)在重水溶剂中的酰胺-Ⅰ带振动频率图,将溶剂作用以静电势场的形式投影至ALAD分子骨架中,并且引入骨架二面角对酰胺-Ⅰ带的影响,实现处于不同构象态的ALAD中酰胺-Ⅰ带光谱的快速准确预测。
关键词
丙氨酸二肽
振动频率图
酰胺-
ⅰ
带
二级结构
Keywords
Alanine dipeptide
Vibrational
frequency
map
amide-
ⅰ
band
Secondary structure
分类号
O629.72 [理学—有机化学]
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职称材料
题名
淀粉样蛋白片段结构动力学与酰胺-Ⅰ带振动光谱示踪
2
作者
侯彦君
郑轩
蔡开聪
机构
福建师范大学化学与材料学院
福建省理论与计算化学重点实验室
特色生物化工材料福建省重点实验室宁德师范学院
出处
《光谱学与光谱分析》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2018年第S1期109-110,共2页
基金
国家自然科学基金项目(21103021)
福建省高等学校新世纪优秀人才支持计划项目
北京国家分子科学实验室项目(BNLMS20160101)资助
文摘
借助分子对接方法,获取了β淀粉样蛋白(Amyloidβprotein,Aβ)的核心片段Aβ25-35与乙酰胆碱受体相互作用的最优结合构象,并在此基础上开展结合后的复合物的分子动力学模拟,探索其结构动力学特征。将构建的氨基酸多肽通用型振动频率图应用于复合物的全原子运动轨迹,预测与受体结合后的Aβ多肽骨架酰胺-Ⅰ带光谱。其特征吸收峰表明该多肽片段与受体结合后主要呈现无规则卷曲构象,与分子对接和分子动力学轨迹聚类分析所呈现的特征构象一致。借助分子模拟与光谱建模相结合的方法能够帮助我们快速解析实验光谱中所蕴含的多肽构象信息,在分子水平上更好地认识蛋白质的空间结构动力学特征。
关键词
β淀粉样蛋白
乙酰胆碱受体
酰胺-
ⅰ
带频率图
结构动力学
分子对接
Keywords
Amyloid β protein
Nicotinic acetylcholine receptor
amide-ⅰ frequency map
Structural dynamics
Molecular docking
分类号
R749.16 [医药卫生—神经病学与精神病学]
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作者
出处
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1
丙氨酸二肽的酰胺-Ⅰ带振动频率图
郑轩
蔡开聪
《光谱学与光谱分析》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2016
0
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职称材料
2
淀粉样蛋白片段结构动力学与酰胺-Ⅰ带振动光谱示踪
侯彦君
郑轩
蔡开聪
《光谱学与光谱分析》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2018
0
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职称材料
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