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中国绵羊ASIP基因突变研究 被引量:5
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作者 付冬丽 杨广礼 +4 位作者 郎侠 成述儒 王玉涛 方素栎 罗玉柱 《甘肃农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第1期35-40,共6页
研究通过直接测序法检测ASIP基因编码区和部分内含子区域突变位点,以确定ASIP基因突变是否影响中国绵羊的被毛表型变化.结果表明:2个缺失突变(9-bp,c.10-18,D9;5-bp,c.100-105,D5)位于ASIP基因第2外显子上,3个SNPs(g.672G>A,g.1580G&... 研究通过直接测序法检测ASIP基因编码区和部分内含子区域突变位点,以确定ASIP基因突变是否影响中国绵羊的被毛表型变化.结果表明:2个缺失突变(9-bp,c.10-18,D9;5-bp,c.100-105,D5)位于ASIP基因第2外显子上,3个SNPs(g.672G>A,g.1580G>A和g.1617G>A)位于第2内含子区域;D9和D5缺失突变在10个绵羊群体中都存在,而且在‘岷县黑裘皮绵羊’和‘多浪羊’群体内各出现1只D5D5基因型个体,在所有检测个体中没有发现D9D9基因型;结合绵羊被毛表型相关分析,D9和D5缺失突变与所研究的绵羊品种被毛表型不存在相关或不完全相关,即ASIP基因编码的蛋白质区域变异不能解释中国绵羊群体毛色表型的变异. 展开更多
关键词 绵羊 asip基因 突变 被毛表型
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水貂ASIP基因单倍型检测及其皮肤组织mRNA差异表达分析 被引量:3
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作者 宋兴超 刘琳玲 +8 位作者 王淑明 宋姗姗 徐超 杨童奥 刘宗岳 丛波 张志明 杨福合 彭英华 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2019年第10期2998-3006,共9页
试验旨在探究鼠灰色(agouti signaling protein,ASIP)基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)形成的单倍型及皮肤组织差异表达mRNA对水貂被毛色素沉积的影响。通过PCR扩增、Sanger测序技术对金州黑水貂、红眼白水貂... 试验旨在探究鼠灰色(agouti signaling protein,ASIP)基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)形成的单倍型及皮肤组织差异表达mRNA对水貂被毛色素沉积的影响。通过PCR扩增、Sanger测序技术对金州黑水貂、红眼白水貂和名威银蓝水貂ASIP基因进行SNPs单倍型检测分析,利用实时荧光定量PCR技术检测3种毛色皮肤组织ASIP基因的表达量,分析单倍型及mRNA差异表达与毛色表型的相关性。结果表明,301个样本中共检测到10个SNPs,内含子2中4个SNPs(G18A、A159G、G235T、C1189T)共形成10种单倍型(Hap1~Hap10),其中Hap1(GAGC)和Hap2(GAGT)是3种不同毛色水貂群体的共享单倍型;部分内含子3中6个SNPs(C252T、A290C、G298C、A340G、T343C、T379C)形成4种单倍型(Hap1~Hap4),且Hap2(CCCGCC)是名威银蓝水貂群体的主体单倍型。5个位点(A290C、G298C、A340G、T343C、T379C)均处于完全连锁不平衡状态。实时荧光定量PCR检测显示,金州黑水貂和名威银蓝水貂ASIP基因mRNA表达量分别是红眼白水貂的1.25和0.95倍,三者间差异不显著(P>0.05)。研究结果初步提示,ASIP基因调控水貂不同毛色表型形成的分子机制可能存在差异。 展开更多
关键词 水貂 asip基因 单倍型 差异表达 被毛颜色
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不同毛色山羊皮肤组织Agouti基因mRNA及其编码ASIP差异表达研究 被引量:8
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作者 张天 张丽英 +2 位作者 李祥龙 周荣艳 李兰会 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第12期1932-1938,共7页
旨在探讨Agouti基因调控山羊毛色机制,采用SYBR Green real-time PCR和蛋白免疫印迹方法分别检测了不同毛色山羊皮肤组织中Agouti基因mRNA及其所编码ASIP蛋白的差异表达。结果表明,Agouti基因mRNA在白色、黑色、棕色山羊皮肤组织中的表... 旨在探讨Agouti基因调控山羊毛色机制,采用SYBR Green real-time PCR和蛋白免疫印迹方法分别检测了不同毛色山羊皮肤组织中Agouti基因mRNA及其所编码ASIP蛋白的差异表达。结果表明,Agouti基因mRNA在白色、黑色、棕色山羊皮肤组织中的表达量依次为白色>黑色>棕色;mRNA表达量在棕色和白色、棕色和黑色山羊皮肤之间均存在显著差异(P<0.05),在白色和黑色山羊皮肤之间差异不显著(P>0.05)。ASIP在白色、黑色、棕色山羊皮肤组织中的表达量:白色>棕色>黑色;ASIP表达量在白色和黑色山羊皮肤组织之间存在显著差异(P<0.05),但在白色和棕色、棕色和黑色山羊皮肤组织之间差异均不显著(P>0.05)。研究结果提示,Agouti基因在不同毛色山羊皮肤组织中可能存在不同调控机制。 展开更多
关键词 山羊 Agouti基因 皮肤组织 mRNA asip 差异表达
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彩色獭兔agouti位点基因突变及蛋白结构改变对其毛色的影响 被引量:2
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作者 杨翠军 葛剑 +3 位作者 陈赛娟 刘亚娟 陈宝江 谷子林 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2015年第12期2071-2077,共7页
彩色獭兔是世界上重要的特种经济动物,其毛色种类繁多,因此有必要对其毛色基因开展深入研究。以不同颜色的獭兔为试验对象,首先检测彩色獭兔的agouti基因多态性,预测蛋白质的结构,构建进化树。结果发现,彩色獭兔agouti位点共发现3个等... 彩色獭兔是世界上重要的特种经济动物,其毛色种类繁多,因此有必要对其毛色基因开展深入研究。以不同颜色的獭兔为试验对象,首先检测彩色獭兔的agouti基因多态性,预测蛋白质的结构,构建进化树。结果发现,彩色獭兔agouti位点共发现3个等位基因,海狸色和青紫蓝色为野生型agouti,即A,紫貂色为tanagouti,即a^t;黑色、黄色和蓝色为non-agouti,即a。3种基因序列与其他兔类的同源性和进化树分析结果显示,与欧洲野兔亲缘关系最近,野生型的刺豚鼠信号蛋白(ASIP)和tan ASIP蛋白的基因均编码133个氨基酸序列,其空间结构具有24个氨基酸残基的分泌信号肽,具有富含赖氨酸的区域,C末端具有富含半胱氨酸的疏水区域,具有重要的生物学活性,而2种蛋白在序列上的差别,尤其是保守区的差别造成真黑素和棕黑素的沉积发生改变,由此造成被毛颜色的不同,non-agouti基因编码的蛋白为21个氨基酸序列,很不稳定,ASIP不能产生,导致黑色素产生和积累。 展开更多
关键词 彩色獭兔 AGOUTI asip 多态性
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新疆巴什拜羊不同毛色与有关基因多态性分析 被引量:6
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作者 包敖敦格日乐 姚力丹 +3 位作者 曼则热·朱尔丁 梁小鹏 张振良 决肯·阿尼瓦什 《新疆农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2019年第6期1166-1176,共11页
【目的】以不同毛色(红棕色73只,黑色53只,青灰色40只)新疆巴什拜羊为研究对象,采用PCR-SSCP技术检测ASIP、TYR、TYRP1和TYRP2基因多态性,并分析其与被毛表型的相关性。【方法】采用随机抽样的方法选取出三种毛色的巴什拜羊,用枸橼酸钠... 【目的】以不同毛色(红棕色73只,黑色53只,青灰色40只)新疆巴什拜羊为研究对象,采用PCR-SSCP技术检测ASIP、TYR、TYRP1和TYRP2基因多态性,并分析其与被毛表型的相关性。【方法】采用随机抽样的方法选取出三种毛色的巴什拜羊,用枸橼酸钠抗凝管进行采血。运用软件PIC-CALC和POPGENE 32计算巴什拜羊ASIP、TYR、TYRP1和TYRP2基因的多态信息含量和基因型频率、等位基因频率、纯合度、杂合度、有效等位基因数,并对该位点基因型的分布进行Hardy-Weinberg平衡的卡方检验。将所得数据输入Excel表中进行整理,并用SPSS 19.0软件进行差异性分析。【结果】ASIP基因在不同毛色的巴什拜羊群体中有两种基因型分别为AA型和AB型,等位基因B为红色被毛群体中的优势等位基因;等位基因A为黑色和青灰色两种被毛群体中的优势等位基因。处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05),红色被毛多态信息含量处于中度多态,而黑色和青灰色被毛多态信息含量处于低度多态。TYR基因在不同毛色的巴什拜羊群体中有两种基因型分别为AA型、AG型和GG型,等位基因G为3种毛色的优势等位基因TYR基因在巴什拜羊黑色和青色被毛群体中处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05),而红色被毛群体中处于不平衡状态(P<0.05)。TYRP1基因存在两种基因型:AA型和GG型,等位基因A为红色和青灰色两种毛色的优势等位基因;等位基因G为黑色被毛群体的优势等位基因。TYRP1基因在巴什拜羊群体中处于Hardy-Weinberg平衡状态。红色被毛多态信息含量处于高度多态,黑色和青灰色被毛多态信息含量处于低度多态。TYRP2基因PCR-SSCP检测结果没有显示多态。【结论】ASIP、TYR、TYRP1和TYRP2基因多态性与巴什拜羊的毛色性状有相关性。 展开更多
关键词 巴什拜羊 asip基因 TYR基因 TYRP1基因 TYRP2基因
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基于RNA-Seqs的乌苏里貉agouti基因结构特征预测及分子进化分析 被引量:1
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作者 张浩 赵家平 +6 位作者 吴琼 杨颖 杜站宇 郭跃跃 邢秀梅 徐超 张林波 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2016年第10期2527-2533,共7页
为了进一步分析agouti基因的分子结构特征,利用生物信息学方法对RNA-Seqs试验获得乌苏里貉agouti基因的完整编码区序列的碱基组成及其编码蛋白的结构特征进行了预测和分析,并采用非对组算数平均法(UPGMA)法构建系统发育树。结果表明,获... 为了进一步分析agouti基因的分子结构特征,利用生物信息学方法对RNA-Seqs试验获得乌苏里貉agouti基因的完整编码区序列的碱基组成及其编码蛋白的结构特征进行了预测和分析,并采用非对组算数平均法(UPGMA)法构建系统发育树。结果表明,获得的乌苏里貉agouti基因cDNA长度为530bp,含396bp开放阅读框(ORF),编码131个氨基酸。预测乌苏里貉agouti蛋白分子质量为14.41ku,等电点(pI)为9.68,为不稳定疏水性蛋白;含有11个磷酸化位点、1个糖基化位点和1个长达24个氨基酸的信号肽;预测发现无规则卷曲为其主要二级结构。系统进化树结果显示乌苏里貉与赤狐、家犬遗传距离最近,这与传统的动物分类学一致。通过对乌苏里貉agouti基因分子结构特征的分析,为揭示其影响毛色多样性的分子遗传学机制提供理论依据。 展开更多
关键词 agouti基因 agouti信号蛋白 生物信息学
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