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高分子量麦谷蛋白1Bx14亚基AS-PCR标记
被引量:
1
1
作者
闫华晓
赵辉
+1 位作者
王宪泽
王芳
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2006年第8期1644-1648,共5页
根据已发表的1Bx14亚基的基因序列在不同位点设计了10对特异引物,从中筛选出1对引物,对HMW-GS在Glu-1Bx位点已知的10个小麦品种进行了PCR扩增.结果表明,具有1Bx14亚基的4个品种都能扩增出1条1 256 bp左右的特异带.用这一特异标记对山东...
根据已发表的1Bx14亚基的基因序列在不同位点设计了10对特异引物,从中筛选出1对引物,对HMW-GS在Glu-1Bx位点已知的10个小麦品种进行了PCR扩增.结果表明,具有1Bx14亚基的4个品种都能扩增出1条1 256 bp左右的特异带.用这一特异标记对山东省种植面积较大的40个品种进行PCR扩增(即等位专一PCR,AS-PCR),发现仅有5个品种携带1Bx14亚基.该AS-PCR标记可用于检测小麦品种在该位点的亚基组成,与SDS-PAGE相比,可显著提高检测的准确性和效率,可为种质鉴定和育种工作提供参考.
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关键词
面包小麦
高分子量谷蛋白亚基
1Bx14
as-pcr
(
等位
专一
pcr
)
分子标记
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职称材料
利用等位基因特异性PCR检测水稻可溶性淀粉合酶基因的单核苷酸多态性
被引量:
3
2
作者
彭小松
朱昌兰
+5 位作者
林华
欧阳林娟
贺晓鹏
陈小荣
傅军如
贺浩华
《江西农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第6期1080-1085,共6页
单核苷酸多态性(SNP)广泛分布于水稻基因组中,SNP分型已成为水稻遗传作图、关联分析、资源鉴定和分子标记辅助选择等研究的重要技术。本文选择水稻可溶性淀粉合酶基因SSIIIa的12个SNP位点,研究了利用等位基因特异性PCR法检测SNP的可行...
单核苷酸多态性(SNP)广泛分布于水稻基因组中,SNP分型已成为水稻遗传作图、关联分析、资源鉴定和分子标记辅助选择等研究的重要技术。本文选择水稻可溶性淀粉合酶基因SSIIIa的12个SNP位点,研究了利用等位基因特异性PCR法检测SNP的可行性。按照等位基因特异性PCR原理设计引物3'末端碱基,并根据每个SNP位点引物3'端的错配类型,在上游引物3'末端第3位引入不同的错配碱基,结果均获得了很好的扩增特异性,PCR检测结果与测序结果吻合。表明,等位基因特异性PCR是一种简便、快捷、可靠和低成本的SNP分型方法,可有效应用于水稻可溶性淀粉合酶基因的种质资源鉴定和分子标记辅助选择育种等相关研究。
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关键词
水稻
可溶性淀粉合酶基因
等位
基因特异性
pcr
(
as-pcr
)
单核苷酸多态性(SNP)
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职称材料
番茄Mi-1基因的SNP分型
被引量:
11
3
作者
李亚玲
李景富
+3 位作者
康立功
张贺
董晓慧
许向阳
《东北农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第10期36-42,共7页
SNP分型是SNP分子标记辅助育种,以及分子遗传作图等研究的重要基础技术。试验利用在番茄Mi-1基因中开发出的一个A/T型SNP位点,应用等位基因聚合酶链式反应技术,成功的对438个F2群体进行了SNP分型。结果表明,这一F2群体中有72个纯合T/T...
SNP分型是SNP分子标记辅助育种,以及分子遗传作图等研究的重要基础技术。试验利用在番茄Mi-1基因中开发出的一个A/T型SNP位点,应用等位基因聚合酶链式反应技术,成功的对438个F2群体进行了SNP分型。结果表明,这一F2群体中有72个纯合T/T基因型,175个杂合A/T基因型,70个纯合A/A基因型,以及121个不明原因缺失的F2单株,已得基因型经卡方测验符合1:2:1分离比例;同时,试验通过在下游引物3′末端第二、三位点引入错配碱基,以及优化PCR反应体系为Mg2+1.875 mmol.L-1,dNTP 100μmol.L-1,提高了反应的准确性,为番茄抗根结线虫辅助育种打下了基础。
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关键词
SNP
等位
基因
pcr
(
as-pcr
)
碱基错配
分型
番茄
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职称材料
李梅杏类种质资源的RAPD分析
被引量:
12
4
作者
杨红花
陈学森
+1 位作者
冯宝春
吴燕
《果树学报》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第3期303-307,共5页
为探讨李梅杏种质资源与其近缘种李、杏之间的亲缘关系,对来源于山东、辽宁等地的李梅杏种质资源及李、杏等品种共30份进行了RAPD和S等位基因的PCR扩增分析,结果表明,李梅杏与李、杏之间亲缘关系较近;聚类分析结果显示大部分李梅杏与中...
为探讨李梅杏种质资源与其近缘种李、杏之间的亲缘关系,对来源于山东、辽宁等地的李梅杏种质资源及李、杏等品种共30份进行了RAPD和S等位基因的PCR扩增分析,结果表明,李梅杏与李、杏之间亲缘关系较近;聚类分析结果显示大部分李梅杏与中国李的遗传距离较近,表明李梅杏的母本可能为李;同时S等位基因的PCR扩增结果显示李梅杏与李的扩增条带数一致,均为一条且位置相近,表明李梅杏与李的进化趋同性可能较杏更近。
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关键词
李梅杏
遗传进化
RAPD
S
等位
基因
专一
性
pcr
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职称材料
番茄抗枯萎病I-2基因的SNP分型
被引量:
3
5
作者
徐薪惟
李景富
+5 位作者
姜景彬
张贺
康立功
陈秀玲
王傲雪
许向阳
《植物保护》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第6期22-26,共5页
利用直接测序方法检测番茄抗感品种I-2基因的DNA序列,发现了2个SNPs。以其为3′端,设计等位基因特异引物及其互补引物,研究了特异引物3′端碱基错配类型和位置对等位基因特异PCR的影响,并对52份种质资源进行了SNP分型。结果表明在下游引...
利用直接测序方法检测番茄抗感品种I-2基因的DNA序列,发现了2个SNPs。以其为3′端,设计等位基因特异引物及其互补引物,研究了特异引物3′端碱基错配类型和位置对等位基因特异PCR的影响,并对52份种质资源进行了SNP分型。结果表明在下游引物3′末端第1、2位引入错配碱基可以提高反应的准确性;引入C-T碱基错配的引物,退火温度在58℃时能把I-2基因的突变位点和感病品种的对应位点区分开来,为番茄抗枯萎病辅助育种提供了有力工具。
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关键词
番茄
枯萎病
I-2基因
SNP
等位
基因特异
pcr
(
as-pcr
)
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职称材料
题名
高分子量麦谷蛋白1Bx14亚基AS-PCR标记
被引量:
1
1
作者
闫华晓
赵辉
王宪泽
王芳
机构
山东科技大学化工学院生物工程系
山东农业大学山东省作物生物学重点实验室
出处
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2006年第8期1644-1648,共5页
基金
山东省科委三O工程(2003-108)项目
文摘
根据已发表的1Bx14亚基的基因序列在不同位点设计了10对特异引物,从中筛选出1对引物,对HMW-GS在Glu-1Bx位点已知的10个小麦品种进行了PCR扩增.结果表明,具有1Bx14亚基的4个品种都能扩增出1条1 256 bp左右的特异带.用这一特异标记对山东省种植面积较大的40个品种进行PCR扩增(即等位专一PCR,AS-PCR),发现仅有5个品种携带1Bx14亚基.该AS-PCR标记可用于检测小麦品种在该位点的亚基组成,与SDS-PAGE相比,可显著提高检测的准确性和效率,可为种质鉴定和育种工作提供参考.
关键词
面包小麦
高分子量谷蛋白亚基
1Bx14
as-pcr
(
等位
专一
pcr
)
分子标记
Keywords
bread wheat
H MW-GS
1Bx14
as-pcr
molecular marker
分类号
Q879 [生物学]
S512.1 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
利用等位基因特异性PCR检测水稻可溶性淀粉合酶基因的单核苷酸多态性
被引量:
3
2
作者
彭小松
朱昌兰
林华
欧阳林娟
贺晓鹏
陈小荣
傅军如
贺浩华
机构
江西农业大学作物生理生态与遗传育种教育部重点实验室/江西省超级稻工程技术研究中心
出处
《江西农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第6期1080-1085,共6页
基金
国家自然科学基金资助项目(30560074
30760118)
+1 种基金
江西省主要学科学术和技术带头人培养计划(2008DD00800)
江西省科技支撑计划
文摘
单核苷酸多态性(SNP)广泛分布于水稻基因组中,SNP分型已成为水稻遗传作图、关联分析、资源鉴定和分子标记辅助选择等研究的重要技术。本文选择水稻可溶性淀粉合酶基因SSIIIa的12个SNP位点,研究了利用等位基因特异性PCR法检测SNP的可行性。按照等位基因特异性PCR原理设计引物3'末端碱基,并根据每个SNP位点引物3'端的错配类型,在上游引物3'末端第3位引入不同的错配碱基,结果均获得了很好的扩增特异性,PCR检测结果与测序结果吻合。表明,等位基因特异性PCR是一种简便、快捷、可靠和低成本的SNP分型方法,可有效应用于水稻可溶性淀粉合酶基因的种质资源鉴定和分子标记辅助选择育种等相关研究。
关键词
水稻
可溶性淀粉合酶基因
等位
基因特异性
pcr
(
as-pcr
)
单核苷酸多态性(SNP)
Keywords
rice
soluble starch synthase genes
allele specific
pcr
single nucleotide polymorphism
分类号
S511.032 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
番茄Mi-1基因的SNP分型
被引量:
11
3
作者
李亚玲
李景富
康立功
张贺
董晓慧
许向阳
机构
东北农业大学园艺学院
黑龙江省农业科学院绥化分院
出处
《东北农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第10期36-42,共7页
基金
国家863计划(2006AA10Z1B9
2006AA100108-4-3)
+1 种基金
农业产业技术体系
黑龙江省普通高校新世纪人才培养计划
文摘
SNP分型是SNP分子标记辅助育种,以及分子遗传作图等研究的重要基础技术。试验利用在番茄Mi-1基因中开发出的一个A/T型SNP位点,应用等位基因聚合酶链式反应技术,成功的对438个F2群体进行了SNP分型。结果表明,这一F2群体中有72个纯合T/T基因型,175个杂合A/T基因型,70个纯合A/A基因型,以及121个不明原因缺失的F2单株,已得基因型经卡方测验符合1:2:1分离比例;同时,试验通过在下游引物3′末端第二、三位点引入错配碱基,以及优化PCR反应体系为Mg2+1.875 mmol.L-1,dNTP 100μmol.L-1,提高了反应的准确性,为番茄抗根结线虫辅助育种打下了基础。
关键词
SNP
等位
基因
pcr
(
as-pcr
)
碱基错配
分型
番茄
Keywords
single nucleotide polymorphism
allele specific polymerase chain reaction
base-mismatch
genotyping
tomato
分类号
S641.2 [农业科学—蔬菜学]
Q754 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
李梅杏类种质资源的RAPD分析
被引量:
12
4
作者
杨红花
陈学森
冯宝春
吴燕
机构
山东农业大学作物生物学国家重点实验室
出处
《果树学报》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第3期303-307,共5页
基金
国家自然科学基金(30471196)
泰山学院科研计划项目(Y04-2-03)。
文摘
为探讨李梅杏种质资源与其近缘种李、杏之间的亲缘关系,对来源于山东、辽宁等地的李梅杏种质资源及李、杏等品种共30份进行了RAPD和S等位基因的PCR扩增分析,结果表明,李梅杏与李、杏之间亲缘关系较近;聚类分析结果显示大部分李梅杏与中国李的遗传距离较近,表明李梅杏的母本可能为李;同时S等位基因的PCR扩增结果显示李梅杏与李的扩增条带数一致,均为一条且位置相近,表明李梅杏与李的进化趋同性可能较杏更近。
关键词
李梅杏
遗传进化
RAPD
S
等位
基因
专一
性
pcr
Keywords
Prunus armeniaca limeixing J.Y. Zhang et Z. M. Wang.
Genetic evolution
RAPD
S allele-specific
pcr
分类号
S662.2 [农业科学—果树学]
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职称材料
题名
番茄抗枯萎病I-2基因的SNP分型
被引量:
3
5
作者
徐薪惟
李景富
姜景彬
张贺
康立功
陈秀玲
王傲雪
许向阳
机构
东北农业大学
出处
《植物保护》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第6期22-26,共5页
基金
现代农业产业技术体系专项资金(CARS-25-A-15)
国家科技支撑计划(2009BAD8B01)
+3 种基金
东北农业大学创新团队基金
东北农业大学博士启动基金(2009RC09)
黑龙江省高等学校创新团队基金(2009td07)
哈尔滨市科技创新人才研究专项资金(2011RFXXN031)
文摘
利用直接测序方法检测番茄抗感品种I-2基因的DNA序列,发现了2个SNPs。以其为3′端,设计等位基因特异引物及其互补引物,研究了特异引物3′端碱基错配类型和位置对等位基因特异PCR的影响,并对52份种质资源进行了SNP分型。结果表明在下游引物3′末端第1、2位引入错配碱基可以提高反应的准确性;引入C-T碱基错配的引物,退火温度在58℃时能把I-2基因的突变位点和感病品种的对应位点区分开来,为番茄抗枯萎病辅助育种提供了有力工具。
关键词
番茄
枯萎病
I-2基因
SNP
等位
基因特异
pcr
(
as-pcr
)
Keywords
tomato
Fusarium wilt
I-2
SNP
allele specific polymerase chain reaction (
as-pcr
)
分类号
S432.23 [农业科学—植物病理学]
S436.412 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
高分子量麦谷蛋白1Bx14亚基AS-PCR标记
闫华晓
赵辉
王宪泽
王芳
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2006
1
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职称材料
2
利用等位基因特异性PCR检测水稻可溶性淀粉合酶基因的单核苷酸多态性
彭小松
朱昌兰
林华
欧阳林娟
贺晓鹏
陈小荣
傅军如
贺浩华
《江西农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012
3
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职称材料
3
番茄Mi-1基因的SNP分型
李亚玲
李景富
康立功
张贺
董晓慧
许向阳
《东北农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010
11
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下载PDF
职称材料
4
李梅杏类种质资源的RAPD分析
杨红花
陈学森
冯宝春
吴燕
《果树学报》
CAS
CSCD
北大核心
2007
12
在线阅读
下载PDF
职称材料
5
番茄抗枯萎病I-2基因的SNP分型
徐薪惟
李景富
姜景彬
张贺
康立功
陈秀玲
王傲雪
许向阳
《植物保护》
CAS
CSCD
北大核心
2012
3
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职称材料
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