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DAP-seq和RNA-seq揭示转录因子APETALA3-3调控铁皮石斛花型变化机理: 1; 作者宋雅蓉朱洪凤 +3 位作者敖叠刘安祺陆德银和凤美《热带作物学报》北大核心 2025年第5期1052-1063,共12页; 兰花唇瓣是特化的花瓣,因其多样性具有极大观赏价值和生物学价值,但其形成机理迄今仍未解决。APETALA3-3(AP3-3)是花器官身份基因,与兰花唇瓣形成有关,但其如何调控兰花唇瓣多样性形成机理目前未见报道。本研究以铁皮石斛野生型植株和... 展开更多; 关键词 apetala3-3 铁皮石斛 DNA亲和纯化测序 DAP-seq 转录组测序花型发育; 在线阅读下载PDF 职称材料

油菜APETALA3基因5′调控序列的克隆及分析被引量：1: 2; 作者石红杰周云涛 +2 位作者左丽娟王茂林赵云《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第11期2168-2173,共6页; 利用单引物PCR方法获得了甘蓝型油菜APETALA3重复基因拷贝BnAP3-3和BnAP3-4的5′调控序列。分析结果表明,两段调控区序列一致性为80.43%,大多数的保守功能元件如TATA盒和CAAT盒没有明显差异,都含有一些应对环境胁迫及诱导的元件,如MYB1A... 展开更多; 关键词甘蓝型油菜 apetala3基因克隆调控序列顺式作用元件; 在线阅读下载PDF 职称材料

日本晚樱同源异型基因PrseAP3的克隆及其在单瓣与重瓣花中的表达分析被引量：8: 3; 作者刘志雄于先泥《华中农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第5期578-583,共6页; 用同源克隆的方法和3′RACE技术,从日本晚樱(Prunus lannesiana)中分离得到了1个AP3同源基因PrseAP3的cDNA全长,GenBank登录号为JF710371。其cDNA全长977bp,包括1个编码235个氨基酸共708bp的开放阅读框。序列比对和分子系统发生分析表明... 展开更多; 关键词日本晚樱花发育花同源异型基因 apetala3 同源克隆 3′RACE技术半定量RT-PCR; 在线阅读下载PDF 职称材料

拟南芥AP3基因植物表达载体的构建及在烟草中的遗传转化被引量：3: 4; 作者刘彩霞代丽娟 +2 位作者刘轶葛晓兰曲冠证《山东农业科学》 2016年第2期7-11,共5页; 拟南芥花器官B类特征基因属于MADS-box基因家族,其中APETALA3(AP3)基因在花瓣和雄蕊中特异性地表达。为探讨AP3基因在花瓣和雄蕊发育中的功能,本研究从拟南芥(Arabidopsis thaliana)花序中克隆At AP3基因构建植物表达载体,并转化烟草(Ni... 展开更多; 关键词拟南芥 apetala3(AP3) 转基因烟草雄蕊发育; 在线阅读下载PDF 职称材料

毛白杨AP3同源基因(PtAP3)的克隆及其在烟草中的正反义转化初报被引量：4: 5; 作者王冬梅张志毅 +2 位作者安新民李善文何承忠《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2005年第6期35-42,共8页; 根据毛果杨AP3同源基因(PTD)设计一对PCR引物,以毛白杨基因组DNA为模板,通过PCR技术分离克隆了毛白杨AP3同源基因PtAP3.分析表明该基因全长1 813 bp(包括引入的酶切位点),包括7个外显子和6个内含子,编码238个氨基酸.在GenBank中进行blas... 展开更多; 关键词毛白杨 AP3同源基因克隆转化; 在线阅读下载PDF 职称材料

大豆B类花器官特征基因的生物信息学分析: 6; 作者王曦昕蒋炳军 +4 位作者袁珊武婷婷孙石张亮生韩天富《大豆科学》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期129-138,共10页; 大豆花器官较小且闭花授粉,导致人工杂交效率低,品种遗传基础狭窄。MADS-box基因家族成员APETALA3(AP3)和PISTILLATA(PI)作为花发育ABCDE模型中的B类基因,共同控制花瓣与雄蕊的形成,在花器官形态建成中发挥重要作用。为明确大豆中B类基... 展开更多; 关键词大豆 apetala3 PISTILLATA MADS-BOX 花器官特征基因; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名DAP-seq和RNA-seq揭示转录因子APETALA3-3调控铁皮石斛花型变化机理: 1; 作者宋雅蓉朱洪凤敖叠刘安祺陆德银和凤美; 机构云南农业大学园林园艺学院; 出处《热带作物学报》北大核心 2025年第5期1052-1063,共12页; 基金国家自然科学基金项目(No.32260419) 云南省教育厅项目(No.A3032024393)。; 文摘兰花唇瓣是特化的花瓣,因其多样性具有极大观赏价值和生物学价值,但其形成机理迄今仍未解决。APETALA3-3(AP3-3)是花器官身份基因,与兰花唇瓣形成有关,但其如何调控兰花唇瓣多样性形成机理目前未见报道。本研究以铁皮石斛野生型植株和铁皮石斛DoAP3-3过表达植株的花器官为研究对象,通过DAP-seq和RNA-seq联合分析,从铁皮石斛转录因子DoAP3-3调控下游靶基因的角度探讨唇瓣多样性形成机制。结果表明:共鉴定出MADS6、NAC029、NAC054、WOX3、AS2、ERECTA、AG等7个关键候选靶基因,这些靶基因可能通过特异性调控或在DoAP3-3的作用下与其他基因互作调控花器官发育和花型发育。酵母单杂交实验验证表明转录因子DoAP3-3与MADS6之间存在相互作用,影响花型发育。该研究为初步解析花器官特征基因DoAP3-3与其靶基因之间的调控机制,探究兰科植物中高度特化和多样化的花形态形成机理奠定基础。; 关键词 apetala3-3 铁皮石斛 DNA亲和纯化测序 DAP-seq 转录组测序花型发育; Keywords apetala3-3 Dendrobium officinale DNA affinity purification sequencing DAP-seq RNA-seq flower morphologies development; 分类号 S682.31 [农业科学—观赏园艺]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名油菜APETALA3基因5′调控序列的克隆及分析被引量：1: 2; 作者石红杰周云涛左丽娟王茂林赵云; 机构四川大学生命科学学院; 出处《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第11期2168-2173,共6页; 基金国家自然科学基金资助项目(30571174 30871540); 文摘利用单引物PCR方法获得了甘蓝型油菜APETALA3重复基因拷贝BnAP3-3和BnAP3-4的5′调控序列。分析结果表明,两段调控区序列一致性为80.43%,大多数的保守功能元件如TATA盒和CAAT盒没有明显差异,都含有一些应对环境胁迫及诱导的元件,如MYB1AT、GATABOX和DOFCOREZM等。少数顺式作用元件存在较大差异,其中CGACGOSAMY3、CArG box、CARGCW8GAT及CAREOSREP1为BnAP3-3的5′调控序列所特有,而BnAP3-4的5′调控序列则含有GT1CONSENSUS。半定量RT-PCR显示,BnAP3-3表达量远高于BnAP3-4,可能与二者调控区某些功能元件序列差异有关。; 关键词甘蓝型油菜 apetala3基因克隆调控序列顺式作用元件; Keywords Brassica napus apetala3 gene clone regulatory region cis-regulatory element; 分类号 Q789 [生物学—分子生物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名日本晚樱同源异型基因PrseAP3的克隆及其在单瓣与重瓣花中的表达分析被引量：8: 3; 作者刘志雄于先泥; 机构长江大学园艺园林学院; 出处《华中农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第5期578-583,共6页; 基金国家自然科学基金项目(31101202) 长江大学博士启动基金项目(801190010118); 文摘用同源克隆的方法和3′RACE技术,从日本晚樱(Prunus lannesiana)中分离得到了1个AP3同源基因PrseAP3的cDNA全长,GenBank登录号为JF710371。其cDNA全长977bp,包括1个编码235个氨基酸共708bp的开放阅读框。序列比对和分子系统发生分析表明,PrseAP3是拟南芥的AP3同源基因,其蛋白质的C末端具有2个保守基元:PI-derived模体和paleoAP3模体,属B类转录因子中paleoAP3进化系。半定量RT-PCR分析表明,PrseAP3主要在单瓣日本晚樱品种大岛的萼片、花瓣和雄蕊中表达;在重瓣品种一叶的花瓣、雄蕊和叶化心皮中表达。其表达组织特异性在2个品种间表现出明显的差异,并与拟南芥的AP3基因有一定的差别。; 关键词日本晚樱花发育花同源异型基因 apetala3 同源克隆 3′RACE技术半定量RT-PCR; Keywords Prunus lannesiana flower development floral homeotic gene apetala3 homolo-gous cloning 3＇-RACE method semiquantitative RT-PCR; 分类号 S685 [农业科学—观赏园艺]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名拟南芥AP3基因植物表达载体的构建及在烟草中的遗传转化被引量：3: 4; 作者刘彩霞代丽娟刘轶葛晓兰曲冠证; 机构东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室; 出处《山东农业科学》 2016年第2期7-11,共5页; 基金国家自然科学基金项目(31370661) 教育部新世纪优秀人才支持计划项目(NCET-12-0808); 文摘拟南芥花器官B类特征基因属于MADS-box基因家族,其中APETALA3(AP3)基因在花瓣和雄蕊中特异性地表达。为探讨AP3基因在花瓣和雄蕊发育中的功能,本研究从拟南芥(Arabidopsis thaliana)花序中克隆At AP3基因构建植物表达载体,并转化烟草(Nicotiana tobacum)。通过PCR及q RT-PCR分析,表明At AP3基因成功转入烟草基因组并表达转录。表型观测显示转基因烟草雄蕊与野生型相比明显变短,说明AP3基因特异性地参与雄蕊的发育并起着至关重要的作用。; 关键词拟南芥 apetala3(AP3) 转基因烟草雄蕊发育; Keywords Arabidopsis thaliana apetala3（AP3） Transgene Nicotiana tobacum Stamen development; 分类号 S188.1 [农业科学—农业基础科学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名毛白杨AP3同源基因(PtAP3)的克隆及其在烟草中的正反义转化初报被引量：4: 5; 作者王冬梅张志毅安新民李善文何承忠; 机构北京林业大学林木花卉遗传育种教育部重点开放实验室; 出处《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2005年第6期35-42,共8页; 基金国家自然科学基金(30371175) 中国博士后基金(2002032041)资助。; 文摘根据毛果杨AP3同源基因(PTD)设计一对PCR引物,以毛白杨基因组DNA为模板,通过PCR技术分离克隆了毛白杨AP3同源基因PtAP3.分析表明该基因全长1 813 bp(包括引入的酶切位点),包括7个外显子和6个内含子,编码238个氨基酸.在GenBank中进行blast检索,发现其氨基酸序列与大丁草、矮牵牛、百合、玫瑰、苹果、毛果杨AP3同源基因的氨基酸序列具有52%～82%的同源性.PtAP3蛋白具有非常保守的MADS-box序列,推测其为转录因子.Southern杂交分析发现,该基因在毛白杨雄株中为双拷贝,而在雌株中则为单拷贝.为进行功能分析,构建了正反义表达载体,通过农杆菌介导转化获得了一些转基因烟草植株.; 关键词毛白杨 AP3同源基因克隆转化; Keywords Populus tomentosa apetala3 homologous gene cloning transformation; 分类号 S792.117 [农业科学—林木遗传育种] S718.46 [农业科学—林学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名大豆B类花器官特征基因的生物信息学分析: 6; 作者王曦昕蒋炳军袁珊武婷婷孙石张亮生韩天富; 机构东北农业大学农学院中国农业科学院作物科学研究所浙江大学农业与生物技术学院; 出处《大豆科学》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期129-138,共10页; 基金国家重点研发计划(2023YFD1201300) 现代农业产业技术体系建设专项(CARS-04)。; 文摘大豆花器官较小且闭花授粉,导致人工杂交效率低,品种遗传基础狭窄。MADS-box基因家族成员APETALA3(AP3)和PISTILLATA(PI)作为花发育ABCDE模型中的B类基因,共同控制花瓣与雄蕊的形成,在花器官形态建成中发挥重要作用。为明确大豆中B类基因的进化模式,并探究其在不同大豆品种中的遗传变异,本研究通过生物信息学手段对大豆B类基因进行了基因结构、系统进化、保守基序、共线性、单倍型分析及物理性质预测等研究。结果显示:大豆基因组中11个B类基因,分别属于3个亚组,其中GmAP304(Glyma.04G027200)、GmAP306(Glyma.06G027200)、GmAP303(Glyma.03G111500)、GmAP316(Glyma.16G105600)和GmAP312(Glyma.12G118100)属于paleoAP3亚组,GmTM601(Glyma.01G169600)和GmTM611(Glyma.11G073700)属于TM6亚组,GmPI13(Glyma.13G034100)、GmPI14(Glyma.14G155100)、GmPI04(Glyma.04G245500)和GmPI06(Glyma.06G117600)属于PI亚组,且各亚组B类基因结构相对保守;大豆B类基因编码的蛋白中共有10个motif,其中motif 1、motif 4和motif 5与MADS结构域重叠。表达量数据分析显示,GmAP304、GmAP306、GmPI04、GmPI06、GmPI13、GmPI14、GmTM601和GmTM611在大豆花中有较高表达。结合单倍型分析发现,GmAP304、GmAP312、GmPI06、GmPI13和GmPI14在栽培大豆中只包含1种单倍型,比其它大豆B类基因更加保守,可能在控制花器官形成中行使更为重要的功能。本研究结果有助于完善大豆花器官发育模型,进一步阐明B类基因的功能,为大豆花器官的改造提供分子靶点,对提高大豆育种效率、拓宽品种遗传基础具有重要意义。; 关键词大豆 apetala3 PISTILLATA MADS-BOX 花器官特征基因; Keywords soybean apetala3 PISTILLATA MADS-box floral organ identity genes; 分类号 S565.1 [农业科学—作物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

	题名	作者	出处	发文年	被引量	操作
1	DAP-seq和RNA-seq揭示转录因子APETALA3-3调控铁皮石斛花型变化机理	宋雅蓉朱洪凤敖叠刘安祺陆德银和凤美	《热带作物学报》北大核心	2025	0	在线阅读下载PDF 职称材料
2	油菜APETALA3基因5′调控序列的克隆及分析	石红杰周云涛左丽娟王茂林赵云	《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心	2009	1	在线阅读下载PDF 职称材料
3	日本晚樱同源异型基因PrseAP3的克隆及其在单瓣与重瓣花中的表达分析	刘志雄于先泥	《华中农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心	2012	8	在线阅读下载PDF 职称材料
4	拟南芥AP3基因植物表达载体的构建及在烟草中的遗传转化	刘彩霞代丽娟刘轶葛晓兰曲冠证	《山东农业科学》	2016	3	在线阅读下载PDF 职称材料
5	毛白杨AP3同源基因(PtAP3)的克隆及其在烟草中的正反义转化初报	王冬梅张志毅安新民李善文何承忠	《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心	2005	4	在线阅读下载PDF 职称材料
6	大豆B类花器官特征基因的生物信息学分析	王曦昕蒋炳军袁珊武婷婷孙石张亮生韩天富	《大豆科学》 CAS CSCD 北大核心	2024	0	在线阅读下载PDF 职称材料