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山核桃APETALA1同源基因的克隆与序列分析 被引量:11
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作者 王正加 黄有军 +3 位作者 夏国华 郑炳松 金松恒 黄坚钦 《浙江林学院学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第4期427-430,共4页
根据植物花分生组织及花器官形成过程中起重要作用的APETALA1(AP1)基因的高度保守区序列,设计合成一对长度为23 bp的聚合酶链式反应(PCR)引物,以山核桃Carya cathayensis基因组DNA为模板,采用PCR方法扩增出长为486 bp的DNA片段,克隆到pM... 根据植物花分生组织及花器官形成过程中起重要作用的APETALA1(AP1)基因的高度保守区序列,设计合成一对长度为23 bp的聚合酶链式反应(PCR)引物,以山核桃Carya cathayensis基因组DNA为模板,采用PCR方法扩增出长为486 bp的DNA片段,克隆到pMD18-T载体。测序和序列分析结果表明,获得了山核桃AP1同源基因中的1个片段,该片段序列包含2个内含子,长度分别为86 bp和291 bp,编码区共编码36个氨基酸。其序列已在GenBank中注册(注册号为EU155118),在GenBank中进行同源性检索结果表明,其氨基酸序列与其他植物AP1同源基因的氨基酸序列同源性高达69%~88%,推测它们在功能上也是相似的。 展开更多
关键词 林木育种学 山核桃 apetala1(ap1)基因 克隆 序列分析
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毛叶枣APETALA1同源基因的克隆 被引量:8
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作者 胡桂兵 徐昌杰 +3 位作者 陈大成 郑启发 安新民 张上隆 《华南农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第3期43-46,共4页
分析在植物花分生组织及花器官形成过程中起重要作用的APETALA1(AP1)基因的保守区序列 ,设计 1对长度为 2 3bp的PCR引物 ,以毛叶枣基因组DNA为模板 ,采用PCR方法扩增出长为 648bp的DNA片段 ,克隆入pUCm T载体 ,测序和序列分析结果表明... 分析在植物花分生组织及花器官形成过程中起重要作用的APETALA1(AP1)基因的保守区序列 ,设计 1对长度为 2 3bp的PCR引物 ,以毛叶枣基因组DNA为模板 ,采用PCR方法扩增出长为 648bp的DNA片段 ,克隆入pUCm T载体 ,测序和序列分析结果表明获得了毛叶枣AP1同源基因中部的 1个片段 ,该片段有 2个内含子 ,长度分别为15 2bp和 386bp ,编码区共编码 36个氨基酸 ,其序列已在GenBank中登记 (登记号为AF35 65 41) .在GenBank中进行同源性检索 ,结果表明其氨基酸序列与其他植物AP1同源基因的氨基酸序列同源性高达 66 %~ 88% 。 展开更多
关键词 毛叶枣 ap1基因 分子克隆 apetalaI 同源基因
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普通枇杷和栎叶枇杷APETALA1同源基因的克隆和序列分析 被引量:8
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作者 刘月学 胡桂兵 +2 位作者 林顺权 刘宗莉 陈厚彬 《福建农林大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2006年第2期173-176,共4页
分析植物花分生组织特征基因APETALA1(AP1)同源基因的保守区序列,设计特异引物;用PCR方法从枇杷栽培品种香钟11号和野生种栎叶枇杷基因组DNA中各扩增出1个350 bp左右的片段;将该片段分别克隆到pUCm-T载体.测序和序列分析结果表明获得了... 分析植物花分生组织特征基因APETALA1(AP1)同源基因的保守区序列,设计特异引物;用PCR方法从枇杷栽培品种香钟11号和野生种栎叶枇杷基因组DNA中各扩增出1个350 bp左右的片段;将该片段分别克隆到pUCm-T载体.测序和序列分析结果表明获得了枇杷AP1同源基因的片段.该基因片段的序列在2个不同种的枇杷间差异较小,均含有2个内含子,特别是外显子部分只有1个碱基的差别;编码区共编码36个氨基酸,氨基酸序列也只有1个氨基酸的差异.其序列已经在GenBank中登记(登录号分别为AY549306和AY571786).同源性比较发现该基因片段与其他作物中已经报道的AP1同源基因的同源性大都在80%以上,特别是与同属于蔷薇科的苹果的同源性最高,达到91%(栽培种)和94%(野生种),推测它们具有相似的功能. 展开更多
关键词 枇杷 apETAL41(ap1)基因 PER 分子克隆 序列分析
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花分生组织决定基因APETALA1转化油菜 被引量:7
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作者 杨郁文 张保龙 +4 位作者 倪万潮 王丹 何晓兰 刘桂华 姚姝 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2007年第6期564-567,共4页
拟南芥的APETALA1(AP1)是花分生组织的决定基因,同时也是萼片和花瓣正常发育的控制因子。本研究构建了含有AP1基因的植物表达载体PCAP,启动子为CaMV35S,通过农杆菌侵染法转化油菜。用PCR方法对转基因植株进行了DNA和RNA水平上的分子检测... 拟南芥的APETALA1(AP1)是花分生组织的决定基因,同时也是萼片和花瓣正常发育的控制因子。本研究构建了含有AP1基因的植物表达载体PCAP,启动子为CaMV35S,通过农杆菌侵染法转化油菜。用PCR方法对转基因植株进行了DNA和RNA水平上的分子检测,证明AP1基因已经整合到转基因植株的基因组中,并且得到了有效的表达。获得的转基因植株也表现出提前开花的特性。试验结果表明,AP1基因在促进成花方面的关键作用不具有种属特异性,利用基因工程可以快速高效地进行油菜早熟性的遗传改良。 展开更多
关键词 油菜 早熟 花分生组织决定基因(ap1)
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芍药AP1(APETALA1)基因密码子使用的偏好性分析 被引量:4
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作者 吴彦庆 葛金涛 陶俊 《湖南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2015年第6期610-615,共6页
在前期克隆芍药AP1基因(登录号为KC354376)的基础上,运用CHIPS、CUSP和Codon W在线程序,分析芍药AP1基因的密码子偏好性,并与其他物种的AP1基因以及模式生物的基因组进行比较。结果表明,芍药AP1基因大部分偏好使用以A/T结尾的密码子,29... 在前期克隆芍药AP1基因(登录号为KC354376)的基础上,运用CHIPS、CUSP和Codon W在线程序,分析芍药AP1基因的密码子偏好性,并与其他物种的AP1基因以及模式生物的基因组进行比较。结果表明,芍药AP1基因大部分偏好使用以A/T结尾的密码子,29种偏好密码子(RSCU值>1)中,偏好性较强的有CCA、AGG、TCA、GTT(RSCU值≥2);通过比较12种植物的AP1基因密码子偏好性,发现AP1基因在芒果和梨中的表达水平相对较高,而在芍药和牡丹等植物中的表达水平一般,并且大多偏好以A/T结尾的密码子,这可能与该基因的特殊功能有关;聚类分析结果表明,芍药科中芍药与牡丹聚为一类,梨和碧桃聚为一类;在密码子的使用频率上,芍药AP1基因与酵母基因组的差异小于与大肠杆菌和拟南芥基因组的差异,酵母真核表达更适合作为芍药AP1基因的外源表达系统。本研究结果可为芍药AP1基因在遗传改良中选择合适的受体植物、选择较佳的外源表达系统以及提高该基因的表达水平提供参考依据。 展开更多
关键词 芍药 ap1基因 密码子偏好性
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毛叶枣APETALA1基因的分子克隆初报 被引量:1
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作者 胡桂兵 郑启发 +2 位作者 陈大成 刘荣维 徐明全 《华南农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2000年第4期93-93,共1页
关键词 毛叶枣 apetala1基因 分子克隆 童期 PCR技术
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Y系山定子AP1同源基因的克隆及序列分析 被引量:6
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作者 王娟 田建保 +4 位作者 杜俊杰 杨廷桢 王骞 孙俊杰 弓桂花 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2014年第5期66-70,共5页
以Y系山定子为试材研究AP1基因,试图为缩短果树童期提供理论依据。根据已登录的苹果AP1基因保守序列设计引物,以Y系山定子的基因组DNA为模板进行PCR扩增,获得1 010 bp的基因片段;PCR产物纯化后,将其连接到pMD18-T载体上,连接产物转化大... 以Y系山定子为试材研究AP1基因,试图为缩短果树童期提供理论依据。根据已登录的苹果AP1基因保守序列设计引物,以Y系山定子的基因组DNA为模板进行PCR扩增,获得1 010 bp的基因片段;PCR产物纯化后,将其连接到pMD18-T载体上,连接产物转化大肠杆菌DH5α菌株感受态细胞,通过蓝白斑筛选、质粒长度和酶切鉴定,获得重组质粒并测序。测序结果表明,该序列有2个外显子、1个内含子及2个内含子的一部分,编码区共编码81个氨基酸;对氨基酸序列保守性分析发现,第13-81个氨基酸为MADS-box基因家族特有的K区域;其氨基酸序列在GenBank中同源性检索表明,Y系山定子与其他植物AP1同源基因的氨基酸序列同源性为67.9%-100%。研究结果为揭示Y系山定子早花现象的分子机制奠定了基础,对果树育种具有重要的理论价值和实际意义。 展开更多
关键词 Y系山定子 ap1(apetala1)基因 PCR 克隆 序列分析
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AP1基因转化地被菊品种‘玉人面’的研究 被引量:20
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作者 吕晋慧 吴月亮 +1 位作者 孙磊 张启翔 《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2007年第9期128-132,共5页
The flower’s meristematic characteristic gene AP1 was introduced into Chrysanthemum morifolium cv. ‘Yu Ren Mian’ mediated by Agrobacterium tumefaciens.The factors influencing genetic transformation protocol were st... The flower’s meristematic characteristic gene AP1 was introduced into Chrysanthemum morifolium cv. ‘Yu Ren Mian’ mediated by Agrobacterium tumefaciens.The factors influencing genetic transformation protocol were studied.The results showed that the leaf explants precultured for 2~8 hours or not precultured were best for transformation by A. tumefaciens. The suitable concentration of bacterial and the time for infecting was OD_ 600 0.5 for 10 minutes. Leaves were cocultivated with bacterial at 23~25 ℃ for 2 days,then delayed selection for 3 days. Kan^r plant were selected by increased selective press from 5 mg·L ~ -1 G418 to 7.5 mg5L~ -1 G418 followed by 10 mg5L~ -1 G418. The integration of AP1 gene into C. morifolium ‘Yu Ren Mian’ was confirmed by PCR and Southern blotting.Two of transgenic plants bloomed 15 days earlier than untransformed plants. 展开更多
关键词 地被菊 ap1基因 根癌农杆菌 遗传转化
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萼脊兰SeAP1-like基因的克隆与表达载体构建 被引量:4
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作者 蒋素华 袁秀云 +3 位作者 王洁琼 武振江 张国付 崔波 《河南农业科学》 CSCD 北大核心 2015年第1期105-109,共5页
根据NCBI网站上萼脊兰AP1-like全长基因序列设计引物,采用RT-PCR法从萼脊兰花瓣中扩增Se AP1-like基因,对扩增产物进行克隆和测序。结果表明,获得的萼脊兰Se AP1-like基因为743 bp,编码247个氨基酸。将Se AP1-like基因插入p CAMBIA1304... 根据NCBI网站上萼脊兰AP1-like全长基因序列设计引物,采用RT-PCR法从萼脊兰花瓣中扩增Se AP1-like基因,对扩增产物进行克隆和测序。结果表明,获得的萼脊兰Se AP1-like基因为743 bp,编码247个氨基酸。将Se AP1-like基因插入p CAMBIA1304载体中,经PCR、双酶切鉴定,证实重组表达质粒中含有目的片段,表明成功构建了高效植物表达载体p CAMBIA1304-Se AP1。对Se AP1-like基因的结构域和所表达蛋白质的亲水性进行了分析,并预测了该基因所表达蛋白的二维结构。结果显示,该基因包含MADS-box和K-box保守域,属于MADS-box基因家族,该蛋白分子属于亲水性蛋白。二级结构分析表明,其包含57.49%的α螺旋、6.07%的延伸链、36.44%的不规则折叠。 展开更多
关键词 萼脊兰 SE ap1-like基因 克隆 载体构建
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中国汉族人群不明原因猝死与NOS1AP基因多态性的相关性 被引量:6
10
作者 黄京璐 郝博 +6 位作者 王小广 刘宏 李明 权力 盛立会 刘超 罗斌 《法医学杂志》 CAS CSCD 2014年第1期27-30,35,共5页
目的研究日常活动中不明原因猝死(sudden unexpected death,SUD)者NOS1AP基因的单核苷酸多态性。方法收集60例一般日常活动中SUD病例心血样本作为SUD组,另外随机抽取80例无关个体的外周血样本作为对照组,提取基因组DNA,用特异性引物对NO... 目的研究日常活动中不明原因猝死(sudden unexpected death,SUD)者NOS1AP基因的单核苷酸多态性。方法收集60例一般日常活动中SUD病例心血样本作为SUD组,另外随机抽取80例无关个体的外周血样本作为对照组,提取基因组DNA,用特异性引物对NOS1AP部分SNP位点(rs10494366、rs10918859、rs12143842、rs12742393、rs3751284、rs348624)进行PCR扩增和直接测序,计算等位基因频率和基因型频率,并分析各SNP位点在SUD组与对照组之间的差异性。结果 NOS1AP第6外显子区域的rs3751284位点的等位基因频率和基因型频率在两组人群中的差异均有统计学意义(P<0.05)。rs3751284位点的最小等位基因的频率在SUD组为0.325,在对照组为0.475。结论 rs3751284位点可能是SUD的易感基因位点。 展开更多
关键词 法医遗传学 法医病理学 多态性 单核苷酸 不明原因猝死 NOS1ap基因
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芥菜AP1基因体外表达及其与FLC相互作用的验证 被引量:3
11
作者 汤青林 许俊强 +1 位作者 宋明 王志敏 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第7期1328-1333,共6页
芥菜花分生组织决定因子AP1与开花路径核心调节子FLC可能存在直接的相互作用,从而调节开花时间。为进一步检测该相互作用,从芥菜"QJ"材料中同源克隆了790bp的AP1cDNA序列,该基因编码256个氨基酸。生物信息学分析表明,AP1属MIK... 芥菜花分生组织决定因子AP1与开花路径核心调节子FLC可能存在直接的相互作用,从而调节开花时间。为进一步检测该相互作用,从芥菜"QJ"材料中同源克隆了790bp的AP1cDNA序列,该基因编码256个氨基酸。生物信息学分析表明,AP1属MIKC型蛋白,其MADS域含有2个螺旋和2个折叠,第1个螺旋内含有1个不保守氨基酸位点;而K域含有3个螺旋,第1、2个螺旋内各有1个不保守位点,第3个螺旋内具有4个不保守位点。同时构建了原核表达质粒pET43.1a-AP1,转化宿主菌大肠杆菌BL21,以IPTG诱导该融合蛋白体外表达。利用pET43.1a-AP1融合蛋白序列中6×His标签与Ni+结合的特点,结合SDS-PAGE分析,证实了体外表达蛋白AP1能与FLC相互作用并形成复合体,该结果为深入研究AP1与FLC互作机制及花分生组织的分子调控奠定了基础。 展开更多
关键词 芥菜 ap1基因 FLC 蛋白互作
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新疆核桃AP1同源基因部分片段的克隆与表达分析 被引量:7
12
作者 叶春秀 牛建新 《石河子大学学报(自然科学版)》 CAS 2011年第6期679-682,共4页
为了分离新疆早实核桃上与花分生组织相关的基因,以早实核桃的花芽为实验材料,通过对不同植物的AP1保守区核苷酸序列分析,设计1对引物,采用RT-PCR的方法克隆获得1条长度为463bp的PCR产物,命名为JrAP1。该片段与其他植物的AP1同源基因序... 为了分离新疆早实核桃上与花分生组织相关的基因,以早实核桃的花芽为实验材料,通过对不同植物的AP1保守区核苷酸序列分析,设计1对引物,采用RT-PCR的方法克隆获得1条长度为463bp的PCR产物,命名为JrAP1。该片段与其他植物的AP1同源基因序列同源性达70%~86%,推测所得的基因为AP1基因的同源基因对其全长和功能将进行进一步研究分析。初步RT-PCR分析的结果表明:JrAP1在早实核桃的顶芽、花芽、枝条、果实、老叶、嫩叶上都有表达,说明了该基因参与了早实核桃的营养生长和生殖生长。而且其在新疆早实核桃及晚实核桃上都能够得到表达,扩增产物亮度早实核桃>晚实核桃,推测其可能在早实机制上起到一定的作用。 展开更多
关键词 核桃 花分生组织 apetala1(ap1)基因 表达特征
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莲瓣兰大雪素AP1 MADS-box基因的克隆和系统发育分析 被引量:5
13
作者 刘涛 普卫琼 +1 位作者 赵银河 于仲艳 《种子》 北大核心 2016年第7期14-17,共4页
随着植物中越来越多的MADS-box基因被克隆出来,人们对经典的ABC模型进行了改进和完善,提出花发育的ABCDE模型,通过RT-PCR和RACE技术从莲瓣兰大雪素花器官中克隆得到AP1同源基因AP1a和AP1b的cDNA全长:AP1a基因全长为1 054bp,其开放阅读框... 随着植物中越来越多的MADS-box基因被克隆出来,人们对经典的ABC模型进行了改进和完善,提出花发育的ABCDE模型,通过RT-PCR和RACE技术从莲瓣兰大雪素花器官中克隆得到AP1同源基因AP1a和AP1b的cDNA全长:AP1a基因全长为1 054bp,其开放阅读框为744bp;AP1b基因全长为944bp,其开放阅读框为516bp。从莲瓣兰大雪素中得到2个AP1同源基因,说明在大雪素中AP1出现基因松弛,所以出现多个拷贝。通过序列比对以及系统发育分析表明,莲瓣兰AP1a基因与春兰具有很高的相似度,达到99.1%,莲瓣兰AP1b基因与萼脊兰具有中等程度的相似度,达75.8%,但从大雪素花器官提取的同源基因AP1a和AP1b的相似度很低,仅为65.4%。这表明AP1基因在不同品种植物间具有保守性,而在同一个物种中又存在着功能的分化。 展开更多
关键词 莲瓣兰大雪素 ap1基因 克隆 系统发育分析
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墨兰CsAP1-A基因克隆及表达分析 被引量:2
14
作者 周荣 刘嘉超 杨凤玺 《广东农业科学》 CAS 2023年第9期99-107,共9页
【目的】AP1基因在植物的花器官发育和开花调控中发挥重要作用,对墨兰AP1基因进行克隆与表达分析可为研究其在墨兰花发育和开花调控中的作用提供前期基础。【方法】以墨兰品种‘小香’为材料,克隆到1个AP1基因,命名为CsAP1-A。通过生物... 【目的】AP1基因在植物的花器官发育和开花调控中发挥重要作用,对墨兰AP1基因进行克隆与表达分析可为研究其在墨兰花发育和开花调控中的作用提供前期基础。【方法】以墨兰品种‘小香’为材料,克隆到1个AP1基因,命名为CsAP1-A。通过生物信息学分析其基因结构、蛋白结构域和进化关系,利用RTqPCR方法分别检测CsAP1-A在墨兰不同器官、不同花发育阶段和不同花组织部位的表达情况;通过转录组测序分析CsAP1-A在5个不同花型墨兰品种花组织部位的表达情况;通过蛋白互作预测软件分析CsAP1-A与其他蛋白的互作关系。【结果】CsAP1-A基因编码区为744 bp,编码248个氨基酸,含有高度保守的MADS-box和K-box结构域,符合MADS-box转录因子家族特征。CsAP1-A与其他兰科植物AP1蛋白相似性较高,其中与春兰AP1/FUL3(APY18447.1)和蕙兰MADS1(AGE15496.1)的同源性最高。RT-qPCR分析结果表明,CsAP1-A在墨兰不同器官中均有表达,在花中表达量最高,且集中在花芽分化初期(S1)高表达。在不同花型的墨兰品种中,CsAP1-A在WT(普通型)、MPV(重瓣花型)、LaPV(花瓣唇瓣化花型)和NLV(唇瓣萼片化花型)4种花型的合蕊柱中表达量均最高,而在萼片中表达量最低;在合蕊柱异常发育的MPV中,CsAP1-A在合蕊柱的表达量显著提高,而在花瓣蕊柱化的梅瓣花型(GPV)中整体表达量最高,且表达区域从合蕊柱扩展到花瓣。蛋白互作预测CsAP1-A蛋白可与MADS1、MADS6、MADS47、MADS8等10个蛋白存在互作关系。【结论】墨兰CsAP1-A的基因结构、进化关系、时空表达情况和蛋白互作预测可为墨兰花发育的研究提供理论依据,对进一步揭示CsAP1-A基因在墨兰成花过程中的作用奠定基础。 展开更多
关键词 墨兰 Cs ap1-A基因 生物信息学 表达分析 花器官发育
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H_2O_2和NO对反季节龙眼成花及AP1基因表达的影响
15
作者 杨子琴 许真 +3 位作者 张蕾 洪继旺 陈业渊 李松刚 《中国南方果树》 北大核心 2016年第1期13-17,共5页
为阐明H2O2和NO对龙眼成花及AP1基因表达的影响,选用9年生反季节储良龙眼结合H2O2和NO促进剂及信号阻断剂喷施,分析成花及AP1基因表达量的动态变化。结果表明,反季节龙眼AP1基因在成花过程中表达量上升,而SNP和MV处理均不同程度上调了... 为阐明H2O2和NO对龙眼成花及AP1基因表达的影响,选用9年生反季节储良龙眼结合H2O2和NO促进剂及信号阻断剂喷施,分析成花及AP1基因表达量的动态变化。结果表明,反季节龙眼AP1基因在成花过程中表达量上升,而SNP和MV处理均不同程度上调了侧花原基形成时顶芽和叶片中AP1基因的表达,尤以SNP处理效果最为显著;DMTU处理显著抑制了侧花原基形成时顶芽和叶片中AP1基因的表达,L-NNA处理对侧花原基形成时叶片AP1基因表达有轻微的抑制作用,对顶芽AP1基因表达影响不大。结合龙眼成花情况,推断加强NO、H2O2信号有助于促进龙眼成花,而阻断H2O2信号将抑制龙眼成花。 展开更多
关键词 龙眼 成花 H2O2 NO ap1基因
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孔雀草试管苗叶片AP1基因的克隆及其生物信息学分析 被引量:3
16
作者 刘敏 赖钟雄 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2012年第10期1778-1783,共6页
以孔雀草试管苗叶片为材料,成功克隆了孔雀草AP1基因的cDNA全长,并对其进行了生物信息学分析。AP1基因全长919 bp(GenBank登录号为JX310277),其中5′-UTR 92bp、3′-UTR 149bp、3′端poly(A)尾巴25 bp,开放阅读框为678 bp,编码225个氨... 以孔雀草试管苗叶片为材料,成功克隆了孔雀草AP1基因的cDNA全长,并对其进行了生物信息学分析。AP1基因全长919 bp(GenBank登录号为JX310277),其中5′-UTR 92bp、3′-UTR 149bp、3′端poly(A)尾巴25 bp,开放阅读框为678 bp,编码225个氨基酸。AP1-1可能存在于细胞核中,为亲水蛋白,不含信号肽,共形成4个卷曲螺旋结构;二级结构主要有α螺旋和无规则卷曲构成,存在亮氨酸拉链结构和1个MADS-box区。此蛋白可能发生磷酸化位点的位置有7个。从系统进化树分析表明,该蛋白与甘菊具有较高的亲缘关系。 展开更多
关键词 孔雀草 试管苗 ap1基因 克隆 生物信息学分析
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铁皮石斛AP1 MADS-box基因克隆与表达分析 被引量:1
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作者 袁慧 邹玉顺 赵银河 《种子》 北大核心 2021年第11期29-33,共5页
铁皮石斛是重要的兰科植物,具有较高的观赏和药用价值。AP1(APETALA1)MADS-box是影响铁皮石斛成花的关键基因。本研究以铁皮石斛为试验材料,采用PCR和RACE技术对铁皮石斛花器官中的两个同源基因AP1-A MADS-box和AP1-B MADS-box进行克隆... 铁皮石斛是重要的兰科植物,具有较高的观赏和药用价值。AP1(APETALA1)MADS-box是影响铁皮石斛成花的关键基因。本研究以铁皮石斛为试验材料,采用PCR和RACE技术对铁皮石斛花器官中的两个同源基因AP1-A MADS-box和AP1-B MADS-box进行克隆,并对该成花基因进行表达分析。结果表明,这两个基因分别编码253个和213个氨基酸,OFR长度分别为762 bp和642 bp,与春兰、建兰等物种的同源性较高。采用RT-PCR和Real-Time PCR技术对这两个基因进行表达分析,发现AP1-A MADS-box和AP1-B MADS-box基因主要在唇瓣和合蕊柱中表达,除此之外,AP1-B MADS-box基因在萼片中的表达量也较高。 展开更多
关键词 铁皮石斛 ap1 MADS-box基因 基因克隆 表达
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三白草AP1基因的表达和进化选择压力分析
18
作者 穆彦峰 何丽莲 +1 位作者 梁受文 赵银河 《种子》 北大核心 2019年第1期1-4,12,共5页
为了探究选择压力对三白草AP1基因进化的影响,本研究在已克隆三白草AP1基因的基础上,对AP1a和AP1b两个同源基因做RT-PCR分析,并对AP1a和AP1b 2个同源基因和29个AP1同源基因做多序列比对,通过生物信息学软件包PAML 4.9中的codeml程序对... 为了探究选择压力对三白草AP1基因进化的影响,本研究在已克隆三白草AP1基因的基础上,对AP1a和AP1b两个同源基因做RT-PCR分析,并对AP1a和AP1b 2个同源基因和29个AP1同源基因做多序列比对,通过生物信息学软件包PAML 4.9中的codeml程序对三白草AP1基因和29个供试物种的AP1基因的CDS序列进行了进化选择压力分析。结果显示,AP1a和AP1b基因在花中的表达明显高于叶;所有的31个CDS序列的选择压力测度参数ω均小于1,表明AP1基因所承受的选择压力总体趋势为纯化选择。而多序列比对结果表明AP1基因在不同品种植物间有所保守,但在同一个物种中AP1基因又存在着分化。 展开更多
关键词 ap1基因 进化 选择压力分析 纯化选择
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荔枝AP1同源基因在花芽中表达最多
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作者 丁宁 《中国果业信息》 2012年第3期64-64,共1页
据《园艺学报》2011年第12期《荔枝APETALA1(AP1)同源基因cDNA全长克隆及其表达研究》(作者丁峰等)报道,应用RT—PCR方法克隆得到荔枝AP1同源基因cDNA全长,
关键词 同源基因 ap1 荔枝 CDNA全长 花芽 PCR方法 克隆
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蕙兰CfMADS1基因的克隆及其时空表达特性 被引量:5
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作者 田云芳 袁秀云 +3 位作者 蒋素华 马杰 苏金乐 崔波 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2015年第7期143-149,154,共8页
【目的】对蕙兰CfMADS1基因cDNA全长进行克隆和时空表达特性研究,为研究成花相关基因的功能提供参考。【方法】以蕙兰萼片cDNA为模板,利用反转录RT-PCR和RACE的方法,克隆获得CfMADS1全长cDNA序列,并对其进行生物信息学分析。以蕙兰各时... 【目的】对蕙兰CfMADS1基因cDNA全长进行克隆和时空表达特性研究,为研究成花相关基因的功能提供参考。【方法】以蕙兰萼片cDNA为模板,利用反转录RT-PCR和RACE的方法,克隆获得CfMADS1全长cDNA序列,并对其进行生物信息学分析。以蕙兰各时期的器官组织为材料,利用荧光定量PCR进行该基因的时空表达分析。【结果】成功克隆了CfMADS1基因(GenBank登录号为KC148540),其cDNA序列全长1 061bp,开放阅读框长744bp,编码247个氨基酸,分子式为C1 244H2 040N370O377S9。其编码的氨基酸序列与AP1/FUL亚家族中金钗石斛MADS1具有较高的同源性(85.43%),与AP1/FUL转录因子亚家族中的蛋白聚为一类。该基因编码蛋白没有明显的信号肽和跨膜域,极可能位于细胞核内,具有MADS保守域(1-61aa)和相对保守的K区(87-178aa),而且在C末端具有AP1/FUL特征基序(LPPWML),二级结构中α-螺旋所占比例较高(55.63%),三级结构与月季、水稻和水仙MADS1蛋白结构非常相似。该基因在盛花期叶中表达最强烈,花蕾期叶、葶、蕾及营养期叶、盛花期葶中表达较为强烈,子房和营养期根中表达较弱,其余器官组织中表达痕量。【结论】从蕙兰萼片中克隆得到了CfMADS1cDNA全长序列,CfMADS1与蕙兰的成花诱导、花发育以及果实形成有关。 展开更多
关键词 蕙兰 ap1/FUL-like基因 时空表达
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