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版纳微型猪近交系AO血型A基因的克隆及生物信息学分析
被引量：
1
1
作者
潘伟荣
查星琴
+5 位作者
成文敏
卿玉波
肖晶
魏红江
曾养志
霍金龙
《云南农业大学学报（自然科学版）》
CSCD
北大核心
2018年第1期56-62,共7页
【目的】扩增版纳微型猪近交系AO血型A基因编码区全长序列,并对序列进行生物信息学分析。【方法】提取版纳微型猪近交系猪组织的RNA,反转录成为cDNA,利用RT-PCR方法扩增AO血型A基因编码区全长序列,将纯化的片段与pMD18-T载体连接,转化...
【目的】扩增版纳微型猪近交系AO血型A基因编码区全长序列,并对序列进行生物信息学分析。【方法】提取版纳微型猪近交系猪组织的RNA,反转录成为cDNA,利用RT-PCR方法扩增AO血型A基因编码区全长序列,将纯化的片段与pMD18-T载体连接,转化大肠杆菌DH5α,筛选阳性克隆并测定其序列,利用生物信息学方法分析其序列特征,并与其他12种物种构建系统进化树。【结果】版纳微型猪近交系AO血型A基因编码区全长1 095 bp,编码364个氨基酸,氨基酸序列与GenBank上登录的猪AO基因氨基酸序列相似性为99.5%。【结论】版纳微型猪近交系的AO血型A基因除了与黑猩猩、人和小鼠亲缘关系较远外,与牦牛、藏羚羊、水牛、小须鲸、绵羊、羊驼、野骆驼、山羊的关系都较为接近,其中与山羊的亲缘关系最为接近。
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关键词
版纳微型猪近交系
ao血型a基因
克隆测序
生物信息学
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题名
版纳微型猪近交系AO血型A基因的克隆及生物信息学分析
被引量：
1
1
作者
潘伟荣
查星琴
成文敏
卿玉波
肖晶
魏红江
曾养志
霍金龙
机构
云南农业大学动物科学技术学院
云南省版纳微型猪近交系重点实验室
出处
《云南农业大学学报（自然科学版）》
CSCD
北大核心
2018年第1期56-62,共7页
基金
云南省教育厅科学研究基金项目(2014Z077)
文摘
【目的】扩增版纳微型猪近交系AO血型A基因编码区全长序列,并对序列进行生物信息学分析。【方法】提取版纳微型猪近交系猪组织的RNA,反转录成为cDNA,利用RT-PCR方法扩增AO血型A基因编码区全长序列,将纯化的片段与pMD18-T载体连接,转化大肠杆菌DH5α,筛选阳性克隆并测定其序列,利用生物信息学方法分析其序列特征,并与其他12种物种构建系统进化树。【结果】版纳微型猪近交系AO血型A基因编码区全长1 095 bp,编码364个氨基酸,氨基酸序列与GenBank上登录的猪AO基因氨基酸序列相似性为99.5%。【结论】版纳微型猪近交系的AO血型A基因除了与黑猩猩、人和小鼠亲缘关系较远外,与牦牛、藏羚羊、水牛、小须鲸、绵羊、羊驼、野骆驼、山羊的关系都较为接近,其中与山羊的亲缘关系最为接近。
关键词
版纳微型猪近交系
ao血型a基因
克隆测序
生物信息学
Keywords
Banna mini-pig inbred line
ao
blood group A gene
cloning and sequencing
bioinformatics
分类号
S828.2 [农业科学—畜牧学]
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作者
出处
发文年
被引量
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1
版纳微型猪近交系AO血型A基因的克隆及生物信息学分析
潘伟荣
查星琴
成文敏
卿玉波
肖晶
魏红江
曾养志
霍金龙
《云南农业大学学报（自然科学版）》
CSCD
北大核心
2018
1
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