目的:探讨CD19在AML1-ETO阳性急性髓系白血病(Acute myelogenous leukemia with AML1-ETO positive,AML with AML1-ETO positive)患者中的表达及对预后的影响。方法:收集我中心2010年1月至2015年12月共66例初治AML1-ETO阳性AML患者资料...目的:探讨CD19在AML1-ETO阳性急性髓系白血病(Acute myelogenous leukemia with AML1-ETO positive,AML with AML1-ETO positive)患者中的表达及对预后的影响。方法:收集我中心2010年1月至2015年12月共66例初治AML1-ETO阳性AML患者资料,回顾性分析CD19表达与一般临床特征的关系及对生存期的影响。结果:AML1-ETO阳性AML患者初诊时CD19的表达率为50.0%。CD19阳性与阴性患者在年龄、性别、初诊时血红蛋白、血小板、骨髓原始细胞比例、染色体核型、基因突变无统计学差异(P>0.05)。CD19阳性患者初诊时白细胞计数低于阴性患者,有统计学差异(P=0.027)。CD19阳性患者总体生存率明显优于CD19阴性患者(P=0.030),CD19阳性患者无复发生存率较阴性患者高,但差异无统计学意义(P=0.105)。多因素分析结果提示CD19阳性是AML1-ETO阳性AML患者OS的独立预后良好因素。结论:CD19阳性可能是AML1-ETO阳性AML患者预后良好的标志。展开更多
目的研究t(8;21)急性髓系白血病(AML)中AML1-ETO(AE)融合基因与细胞内N6-甲基腺嘌呤(m6A)修饰的关系。方法利用RNA-蛋白免疫共沉淀和高通量测序技术(MeRIP-Seq)在AE(+)和敲除AE的AML细胞系中进行RNAm6A测序,分析整个转录组m6A修饰的变...目的研究t(8;21)急性髓系白血病(AML)中AML1-ETO(AE)融合基因与细胞内N6-甲基腺嘌呤(m6A)修饰的关系。方法利用RNA-蛋白免疫共沉淀和高通量测序技术(MeRIP-Seq)在AE(+)和敲除AE的AML细胞系中进行RNAm6A测序,分析整个转录组m6A修饰的变化。利用高通量测序技术进行转录组测序(RNA-seq)。进一步通过GO分析、KEGG通路富集分析对差异修饰的mRNA进行功能注释。实时荧光定量PCR检测m6A相关酶表达量变化。结果RNAm6A甲基化测序在敲除AE和表达AE的AML细胞系中共检测到26441个基因,包含了72036个m6A peak。AE敲除后细胞内m6A peak的数目由37042个变成34994个,其中有1278个m6A peak升高,1225个下降。AE敲除后新出现了1316个m6A修饰的基因,1830个基因失去了m6A修饰。差异的peak主要在癌症、人类T淋巴细胞白血病病毒Ⅰ等通路中富集。RNA-seq结果显示,AE敲除后有2483个基因表达上调,3913个基因表达下调。MeRIP-Seq和RNA-Seq联合分析结果显示,与非m6A修饰的基因相比,m6A所修饰的基因表达水平均相对较高(SKNO-1:0.6116±1.263 vs 2.010±1.655,P<0.0001;SKNO-1 siAE:0.5528±1.257 vs 2.067±1.686,P<0.0001)。m6A修饰位于3'UTR或5'UTR的基因较位于外显子区的基因表达量更高(SKNO-1:2.177±1.633 vs 1.333±1.470 vs 2.449±1.651,P<0.0001;SKNO-1 siAE:2.304±1.671 vs 1.336±1.522 vs 2.394±1.649,P<0.05)。RNA-seq结果显示,有3种m6A相关酶METTL14、WTAP、ALKBH5的mRNA表达升高(WTAP:5.36±0.5657 vs 13.19±0.3253,METTL14:2.850±0.1556 vs 8.815±1.761,ALKBH5:13.70±0.4596 vs 39.84±6.067,P<0.05)。实时荧光定量PCR检测METTL14、WTAP、ALKBH5的表达量变化发现敲除AE后WTAP、ALKBH5的表达量升高,而METTL14的表达量降低(P<0.05)。结论AE敲除造成m6A相关酶差异,推测AE融合基因或许可以调控一种或多种m6A相关酶的表达控制细胞内的甲基化水平,影响m6A修饰模式。展开更多
文摘目的:探讨CD19在AML1-ETO阳性急性髓系白血病(Acute myelogenous leukemia with AML1-ETO positive,AML with AML1-ETO positive)患者中的表达及对预后的影响。方法:收集我中心2010年1月至2015年12月共66例初治AML1-ETO阳性AML患者资料,回顾性分析CD19表达与一般临床特征的关系及对生存期的影响。结果:AML1-ETO阳性AML患者初诊时CD19的表达率为50.0%。CD19阳性与阴性患者在年龄、性别、初诊时血红蛋白、血小板、骨髓原始细胞比例、染色体核型、基因突变无统计学差异(P>0.05)。CD19阳性患者初诊时白细胞计数低于阴性患者,有统计学差异(P=0.027)。CD19阳性患者总体生存率明显优于CD19阴性患者(P=0.030),CD19阳性患者无复发生存率较阴性患者高,但差异无统计学意义(P=0.105)。多因素分析结果提示CD19阳性是AML1-ETO阳性AML患者OS的独立预后良好因素。结论:CD19阳性可能是AML1-ETO阳性AML患者预后良好的标志。
文摘目的研究t(8;21)急性髓系白血病(AML)中AML1-ETO(AE)融合基因与细胞内N6-甲基腺嘌呤(m6A)修饰的关系。方法利用RNA-蛋白免疫共沉淀和高通量测序技术(MeRIP-Seq)在AE(+)和敲除AE的AML细胞系中进行RNAm6A测序,分析整个转录组m6A修饰的变化。利用高通量测序技术进行转录组测序(RNA-seq)。进一步通过GO分析、KEGG通路富集分析对差异修饰的mRNA进行功能注释。实时荧光定量PCR检测m6A相关酶表达量变化。结果RNAm6A甲基化测序在敲除AE和表达AE的AML细胞系中共检测到26441个基因,包含了72036个m6A peak。AE敲除后细胞内m6A peak的数目由37042个变成34994个,其中有1278个m6A peak升高,1225个下降。AE敲除后新出现了1316个m6A修饰的基因,1830个基因失去了m6A修饰。差异的peak主要在癌症、人类T淋巴细胞白血病病毒Ⅰ等通路中富集。RNA-seq结果显示,AE敲除后有2483个基因表达上调,3913个基因表达下调。MeRIP-Seq和RNA-Seq联合分析结果显示,与非m6A修饰的基因相比,m6A所修饰的基因表达水平均相对较高(SKNO-1:0.6116±1.263 vs 2.010±1.655,P<0.0001;SKNO-1 siAE:0.5528±1.257 vs 2.067±1.686,P<0.0001)。m6A修饰位于3'UTR或5'UTR的基因较位于外显子区的基因表达量更高(SKNO-1:2.177±1.633 vs 1.333±1.470 vs 2.449±1.651,P<0.0001;SKNO-1 siAE:2.304±1.671 vs 1.336±1.522 vs 2.394±1.649,P<0.05)。RNA-seq结果显示,有3种m6A相关酶METTL14、WTAP、ALKBH5的mRNA表达升高(WTAP:5.36±0.5657 vs 13.19±0.3253,METTL14:2.850±0.1556 vs 8.815±1.761,ALKBH5:13.70±0.4596 vs 39.84±6.067,P<0.05)。实时荧光定量PCR检测METTL14、WTAP、ALKBH5的表达量变化发现敲除AE后WTAP、ALKBH5的表达量升高,而METTL14的表达量降低(P<0.05)。结论AE敲除造成m6A相关酶差异,推测AE融合基因或许可以调控一种或多种m6A相关酶的表达控制细胞内的甲基化水平,影响m6A修饰模式。
