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题名椰子ALDH基因家族的鉴定及生物信息学分析
被引量：3
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作者
武映宏
黄东益
王永
张大鹏
刘蕊
孙熹微
肖勇
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机构
海南大学热带作物学院
中国热带农业科学院椰子研究所/海南省热带油料作物生物学重点实验室
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出处
《热带生物学报》
2022年第6期541-549,共9页
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基金
海南省重大科技计划项目(zdkj201902)。
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文摘
为了鉴定椰子的ALDH基因家族,分析其基因结构、保守结构域、系统发育树以及其表达模式,通过下载OsALDH基因家族的蛋白质序列,并与椰子的蛋白质的数据库进行比对,鉴定出12个CnALDH基因,分属于9个亚族。结果表明,ALDH编码的氨基酸等电点为5.35~8.68,多数分布在叶绿体中。表达谱分析结果显示,除CnALDH12_A1和CnALDH22_A1外,其他的CnALDH基因家族成员均在叶片中有高水平表达。而CnALDH10_A8在不同组织以及不同时期展现组成性表达,推测该基因参与椰子的一些基础性功能,是不可或缺的基因。
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关键词
椰子
aldh基因家族
生物信息学分析
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Keywords
coconut
aldh gene family
bioinformatics analysis
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分类号
S667.4
[农业科学—果树学]
Q78
[生物学—分子生物学]
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