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肿瘤相关基因ADAM15在结肠癌中一个非同义变异对细胞黏附及侵袭的影响
1
作者
王晶
贺礼兵
+2 位作者
张国燕
刘筱涵
程杉
《首都医科大学学报》
北大核心
2023年第6期1044-1052,共9页
目的解析ADAM15基因单核苷酸变异(single nucleotide variant,SNV)在结肠癌肿瘤发生发展相关的细胞学过程中的具体功能作用。方法首先对具有侵袭表型的结肠癌患者癌组织及癌旁组织全外显子组测序,然后进行野生型/突变型ADAM15结肠癌HCT-...
目的解析ADAM15基因单核苷酸变异(single nucleotide variant,SNV)在结肠癌肿瘤发生发展相关的细胞学过程中的具体功能作用。方法首先对具有侵袭表型的结肠癌患者癌组织及癌旁组织全外显子组测序,然后进行野生型/突变型ADAM15结肠癌HCT-8细胞系细胞功能实验,进而完成野生型/突变型ADAM15细胞系的转录组测序分析。结果采用全外显子组测序在预后不良的患者中检出ADAM15基因SNV rs6427128,提示可能影响结肠癌的进展。细胞功能实验显示,rs6427128损失了ADAM15所具有的上调细胞侵袭能力的作用,而使细胞黏附能力增加约26%。转录组测序分析显示,与野生型相比,rs6427128过表达细胞的差异表达基因富集在细胞黏附、DNA的复制与转录、炎症反应等多种细胞生物学过程,提示rs6427128变异可能通过促进肿瘤细胞的黏附参与调节肿瘤微环境的重塑,从而影响结肠癌的进展。结论结合适当的细胞模型和较为精细的分析方法,深入解析临床样本中所检出的一些高频非同义潜在功能性变异体,可以为肿瘤相关基因的结构功能关系提供有益的提示性实验室数据。
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关键词
结肠癌
adam15基因
细胞黏附
单核苷酸变异
肿瘤微环境
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题名
肿瘤相关基因ADAM15在结肠癌中一个非同义变异对细胞黏附及侵袭的影响
1
作者
王晶
贺礼兵
张国燕
刘筱涵
程杉
机构
首都医科大学基础医学院医学遗传学与发育生物学学系
北京市十一学校
出处
《首都医科大学学报》
北大核心
2023年第6期1044-1052,共9页
文摘
目的解析ADAM15基因单核苷酸变异(single nucleotide variant,SNV)在结肠癌肿瘤发生发展相关的细胞学过程中的具体功能作用。方法首先对具有侵袭表型的结肠癌患者癌组织及癌旁组织全外显子组测序,然后进行野生型/突变型ADAM15结肠癌HCT-8细胞系细胞功能实验,进而完成野生型/突变型ADAM15细胞系的转录组测序分析。结果采用全外显子组测序在预后不良的患者中检出ADAM15基因SNV rs6427128,提示可能影响结肠癌的进展。细胞功能实验显示,rs6427128损失了ADAM15所具有的上调细胞侵袭能力的作用,而使细胞黏附能力增加约26%。转录组测序分析显示,与野生型相比,rs6427128过表达细胞的差异表达基因富集在细胞黏附、DNA的复制与转录、炎症反应等多种细胞生物学过程,提示rs6427128变异可能通过促进肿瘤细胞的黏附参与调节肿瘤微环境的重塑,从而影响结肠癌的进展。结论结合适当的细胞模型和较为精细的分析方法,深入解析临床样本中所检出的一些高频非同义潜在功能性变异体,可以为肿瘤相关基因的结构功能关系提供有益的提示性实验室数据。
关键词
结肠癌
adam15基因
细胞黏附
单核苷酸变异
肿瘤微环境
Keywords
colon cancer
a disintegrin and metalloproteinase
15
(
adam
15
)gene
cell adhesion
single nucleotide variation(SNV)
tumor microenvironment
分类号
R753.3 [医药卫生—皮肤病学与性病学]
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出处
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1
肿瘤相关基因ADAM15在结肠癌中一个非同义变异对细胞黏附及侵袭的影响
王晶
贺礼兵
张国燕
刘筱涵
程杉
《首都医科大学学报》
北大核心
2023
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