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扩增共有序列遗传标记(ACGM)及其在植物中的应用价值
被引量:
5
1
作者
何俊平
阮松林
+1 位作者
祝水金
马华升
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第9期913-920,共8页
扩增共有序列遗传标记(Amplified consensus genetic markers,ACGM)是建立在亲缘关系较近的物种间同源基因中编码序列(外显子)存在高度保守性,而非编码区(内含子)存在潜在多态性基础之上的一种基于PCR的新型DNA分子标记技术。随着比较...
扩增共有序列遗传标记(Amplified consensus genetic markers,ACGM)是建立在亲缘关系较近的物种间同源基因中编码序列(外显子)存在高度保守性,而非编码区(内含子)存在潜在多态性基础之上的一种基于PCR的新型DNA分子标记技术。随着比较基因组学和生物信息学的迅猛发展,ACGM技术已成为物种间同源基因比较、系统发生关系分析和感兴趣基因定位的有效工具。文章就ACGM技术尤其是它在芸薹属和禾本科物种中的应用研究做详细介绍。同时,对ACGM技术可能的应用前景进行了展望。
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关键词
acgm
基因组进化
基因定位
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职称材料
利用ACGM和EST-SSR标记对云贵高原野生山蚂蝗属种质的遗传多样性分析
被引量:
9
2
作者
贺欣
刘国道
+2 位作者
刘迪秋
罗富成
黄必志
《草业学报》
CSCD
2008年第6期102-111,共10页
山蚂蝗属野生种质是一个具有巨大经济价值的资源。本研究利用基于基因表达序列数据库开发的2种分子标记ACGM和ESTSSR共85对引物对山蚂蝗属9个种46个野生种质资源进行多样性分析。结果显示,ACGM引物中有扩增产物的引物比例为86.49%,...
山蚂蝗属野生种质是一个具有巨大经济价值的资源。本研究利用基于基因表达序列数据库开发的2种分子标记ACGM和ESTSSR共85对引物对山蚂蝗属9个种46个野生种质资源进行多样性分析。结果显示,ACGM引物中有扩增产物的引物比例为86.49%,远高于EST—SSR引物的54.17%。同时,ACGM的多态性比率也大于EST-SSR,可见ACGM在山蚂蝗属野生种质中的转移性优于EST—SSR。通过ACGM和EST—SSR分析得到的遗传相似性系数为0.523-0.967,平均相似系数为0.703,这表明山蚂蝗属野生种质资源间存在较高的遗传多样性。此外,ACGM分析能有效区分46个山蚂蝗属种质基因型,而EST—SSR只能区分绝大多数山蚂蝗属基因型。在UPGMA聚类图上46个供试材料被分成9组,与传统分类结果不完全一致。说明基于禾本科和豆科基因表达序列开发的分子标记能用于山蚂蝗属植物的遗传分析,同时这也为其他野生种质资源的遗传多样性研究提供了有益的借鉴。
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关键词
山蚂蝗属
遗传多样性
acgm
EST—SSR
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职称材料
遗传标记在植物上的发展与应用
被引量:
11
3
作者
李柱刚
崔崇士
+1 位作者
马荣才
曹鸣庆
《东北农业大学学报》
CAS
CSCD
2001年第4期396-401,共6页
详细地介绍了遗传标记的发展历程 ,并就分子标记的主要类型做一简单叙述 ,并比较了常用分子标记之间的优缺点 ,为更好地利用分子标记提供了理论依据。本文还增加了新兴的分子标记 (Single- Nucleotide polymorphism,单核苷酸多态性 ) ,...
详细地介绍了遗传标记的发展历程 ,并就分子标记的主要类型做一简单叙述 ,并比较了常用分子标记之间的优缺点 ,为更好地利用分子标记提供了理论依据。本文还增加了新兴的分子标记 (Single- Nucleotide polymorphism,单核苷酸多态性 ) ,和 ACGM标记 (Amplified ConsensusSequence Genetic Marker,扩增共有遗传标记 )。最后 。
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关键词
遗传标记
植物
发展
应用
分子标记
形态标记
细胞学
生化标记
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职称材料
多花黑麦草遗传连锁图的构建
被引量:
6
4
作者
丁成龙
沈益新
+1 位作者
顾洪如
三浦优一
《草地学报》
CAS
CSCD
2006年第3期223-230,共8页
利用多花黑麦草(Loliummu ltiflorum)细胞质雄性不育(CMS)F1群体(124个个体),以来自父本和母本的分离位点采用SSR、AFLP、EST-CAPS(表达序列标签酶切扩增多态性)和RGA-CAPS(抗病基因类似物酶切扩增多态性)等标记方法进行多态性的选择并...
利用多花黑麦草(Loliummu ltiflorum)细胞质雄性不育(CMS)F1群体(124个个体),以来自父本和母本的分离位点采用SSR、AFLP、EST-CAPS(表达序列标签酶切扩增多态性)和RGA-CAPS(抗病基因类似物酶切扩增多态性)等标记方法进行多态性的选择并对父、母本分别构建遗传连锁图。母本连锁图包含362个标记位点,分别包含SSR标记240个、AFLP标记84个、EST-CAPS标记24个和RGA-CAPS标记14个,由7个连锁群组成,覆盖全长776.4cM,各连锁群长度在85.8至135 cM之间,相邻标记之间的平均距离为2.14 cM;父本7个连锁群,包含376个标记,其中SSR标记252个、AFLP标记82个、EST-CAPS标记29个和RGA-CAPS标记13个,连锁图全长710.0 cM,相邻标记之间的平均距离为1.89 cM;标记密度高、标记分布均匀、连锁图长度中等。
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关键词
多花黑麦草(Lolium
multiflorum)
遗传连锁图
SSR(简单重复序列)
AFLP(扩增片段长度多态性)
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职称材料
题名
扩增共有序列遗传标记(ACGM)及其在植物中的应用价值
被引量:
5
1
作者
何俊平
阮松林
祝水金
马华升
机构
浙江大学农业与生物技术学院
杭州市农业科学研究院生物技术研究所
出处
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第9期913-920,共8页
基金
中国博士后科学基金资助项目(编号:20080441230)
文摘
扩增共有序列遗传标记(Amplified consensus genetic markers,ACGM)是建立在亲缘关系较近的物种间同源基因中编码序列(外显子)存在高度保守性,而非编码区(内含子)存在潜在多态性基础之上的一种基于PCR的新型DNA分子标记技术。随着比较基因组学和生物信息学的迅猛发展,ACGM技术已成为物种间同源基因比较、系统发生关系分析和感兴趣基因定位的有效工具。文章就ACGM技术尤其是它在芸薹属和禾本科物种中的应用研究做详细介绍。同时,对ACGM技术可能的应用前景进行了展望。
关键词
acgm
基因组进化
基因定位
Keywords
amplified
consensus
genetic
marker
s (
acgm
)
genome evolution
gene mapping
分类号
Q943 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
利用ACGM和EST-SSR标记对云贵高原野生山蚂蝗属种质的遗传多样性分析
被引量:
9
2
作者
贺欣
刘国道
刘迪秋
罗富成
黄必志
机构
云南省肉牛与牧草研究中心
云南农业大学动物科学技术学院
中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所
昆明理工大学生命科学与技术学院
出处
《草业学报》
CSCD
2008年第6期102-111,共10页
基金
农业部草地农业生态系统学重点开放实验室开放基金(2006-2)资助
文摘
山蚂蝗属野生种质是一个具有巨大经济价值的资源。本研究利用基于基因表达序列数据库开发的2种分子标记ACGM和ESTSSR共85对引物对山蚂蝗属9个种46个野生种质资源进行多样性分析。结果显示,ACGM引物中有扩增产物的引物比例为86.49%,远高于EST—SSR引物的54.17%。同时,ACGM的多态性比率也大于EST-SSR,可见ACGM在山蚂蝗属野生种质中的转移性优于EST—SSR。通过ACGM和EST—SSR分析得到的遗传相似性系数为0.523-0.967,平均相似系数为0.703,这表明山蚂蝗属野生种质资源间存在较高的遗传多样性。此外,ACGM分析能有效区分46个山蚂蝗属种质基因型,而EST—SSR只能区分绝大多数山蚂蝗属基因型。在UPGMA聚类图上46个供试材料被分成9组,与传统分类结果不完全一致。说明基于禾本科和豆科基因表达序列开发的分子标记能用于山蚂蝗属植物的遗传分析,同时这也为其他野生种质资源的遗传多样性研究提供了有益的借鉴。
关键词
山蚂蝗属
遗传多样性
acgm
EST—SSR
Keywords
Desmodium
genetic
diversity
amplified
consensus
genetic
marker
s
expressed
sequence
tag-simple
sequence
repeat
分类号
S54 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
遗传标记在植物上的发展与应用
被引量:
11
3
作者
李柱刚
崔崇士
马荣才
曹鸣庆
机构
东北农业大学园艺学院
北京农业生物技术研究中心
出处
《东北农业大学学报》
CAS
CSCD
2001年第4期396-401,共6页
文摘
详细地介绍了遗传标记的发展历程 ,并就分子标记的主要类型做一简单叙述 ,并比较了常用分子标记之间的优缺点 ,为更好地利用分子标记提供了理论依据。本文还增加了新兴的分子标记 (Single- Nucleotide polymorphism,单核苷酸多态性 ) ,和 ACGM标记 (Amplified ConsensusSequence Genetic Marker,扩增共有遗传标记 )。最后 。
关键词
遗传标记
植物
发展
应用
分子标记
形态标记
细胞学
生化标记
Keywords
genetic
marker
molecular
marker
morphological
marker
cytological
marker
biochemical
marker
s
acgm
(
amplified
consensus
sequence
genetic
marker
)
分类号
Q943 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
多花黑麦草遗传连锁图的构建
被引量:
6
4
作者
丁成龙
沈益新
顾洪如
三浦优一
机构
南京农业大学动物科技学院
江苏省农业科学院畜牧研究所
日本畜产草地种子协会饲料作物研究所
出处
《草地学报》
CAS
CSCD
2006年第3期223-230,共8页
基金
中日合作项目"饲料作物基因组解析"
日本赛马协会提供资助
文摘
利用多花黑麦草(Loliummu ltiflorum)细胞质雄性不育(CMS)F1群体(124个个体),以来自父本和母本的分离位点采用SSR、AFLP、EST-CAPS(表达序列标签酶切扩增多态性)和RGA-CAPS(抗病基因类似物酶切扩增多态性)等标记方法进行多态性的选择并对父、母本分别构建遗传连锁图。母本连锁图包含362个标记位点,分别包含SSR标记240个、AFLP标记84个、EST-CAPS标记24个和RGA-CAPS标记14个,由7个连锁群组成,覆盖全长776.4cM,各连锁群长度在85.8至135 cM之间,相邻标记之间的平均距离为2.14 cM;父本7个连锁群,包含376个标记,其中SSR标记252个、AFLP标记82个、EST-CAPS标记29个和RGA-CAPS标记13个,连锁图全长710.0 cM,相邻标记之间的平均距离为1.89 cM;标记密度高、标记分布均匀、连锁图长度中等。
关键词
多花黑麦草(Lolium
multiflorum)
遗传连锁图
SSR(简单重复序列)
AFLP(扩增片段长度多态性)
Keywords
Lolium multiflorum
genetic
map
Simple
sequence
repeat
marker
s (SSR)
amplified
fragmentlength polymorphism
marker
s (AFLP)
分类号
S812 [农业科学—草业科学]
Q943 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
扩增共有序列遗传标记(ACGM)及其在植物中的应用价值
何俊平
阮松林
祝水金
马华升
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2009
5
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
利用ACGM和EST-SSR标记对云贵高原野生山蚂蝗属种质的遗传多样性分析
贺欣
刘国道
刘迪秋
罗富成
黄必志
《草业学报》
CSCD
2008
9
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
遗传标记在植物上的发展与应用
李柱刚
崔崇士
马荣才
曹鸣庆
《东北农业大学学报》
CAS
CSCD
2001
11
在线阅读
下载PDF
职称材料
4
多花黑麦草遗传连锁图的构建
丁成龙
沈益新
顾洪如
三浦优一
《草地学报》
CAS
CSCD
2006
6
在线阅读
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职称材料
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