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草菇泰国1号菌株交配型A因子分子遗传学及生物信息学解析
被引量：
4
1
作者
汪虹
陈明杰
+2 位作者
冯爱萍
谭琦
鲍大鹏
《食用菌学报》
CSCD
北大核心
2015年第1期1-7,共7页
采用简并PCR引物获得mip基因保守片段后,通过长片段PCR技术从草菇(Volvariella volvacea)菌株泰国1号孢子单核体中扩增获得了A1、A2交配型位点的DNA序列,结果表明:每个交配型位点均含2个交配型基因(HD1和HD2),其中A1位点的交配型基因为H...
采用简并PCR引物获得mip基因保守片段后,通过长片段PCR技术从草菇(Volvariella volvacea)菌株泰国1号孢子单核体中扩增获得了A1、A2交配型位点的DNA序列,结果表明:每个交配型位点均含2个交配型基因(HD1和HD2),其中A1位点的交配型基因为HD1-A1-TG和HD2-A1-TG,长度分别为1341bp和1450bp,各编码446和429个氨基酸残基;A2位点的交配型基因为HD1-A2-TG和HD2-A2-TG,长度分别为1442bp和1501bp,各编码463和443个氨基酸残基。利用生物信息学方法分析了泰国1号及另外两株草菇代表性菌株V23和屏优的交配型基因编码的HD蛋白序列,结果表明:HD蛋白均含有同源异形结构域。根据系统进化树可以看出,泰国1号与V23、屏优菌株A位点HD1和HD2基因序列所编码的氨基酸序列之间亲缘关系复杂,可能具有不同的起源。
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关键词
草菇
a交配型基因
同源异形结构域蛋白
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职称材料
题名
草菇泰国1号菌株交配型A因子分子遗传学及生物信息学解析
被引量：
4
1
作者
汪虹
陈明杰
冯爱萍
谭琦
鲍大鹏
机构
上海市农业科学院食用菌研究所
出处
《食用菌学报》
CSCD
北大核心
2015年第1期1-7,共7页
基金
上海市科技兴农推广项目[沪农科推字(2014)第2-2号]
国家科技支撑计划项目子课题(2013BAD16B02)
上海市科技人才计划项目(13XD1424700)的部分研究内容
文摘
采用简并PCR引物获得mip基因保守片段后,通过长片段PCR技术从草菇(Volvariella volvacea)菌株泰国1号孢子单核体中扩增获得了A1、A2交配型位点的DNA序列,结果表明:每个交配型位点均含2个交配型基因(HD1和HD2),其中A1位点的交配型基因为HD1-A1-TG和HD2-A1-TG,长度分别为1341bp和1450bp,各编码446和429个氨基酸残基;A2位点的交配型基因为HD1-A2-TG和HD2-A2-TG,长度分别为1442bp和1501bp,各编码463和443个氨基酸残基。利用生物信息学方法分析了泰国1号及另外两株草菇代表性菌株V23和屏优的交配型基因编码的HD蛋白序列,结果表明:HD蛋白均含有同源异形结构域。根据系统进化树可以看出,泰国1号与V23、屏优菌株A位点HD1和HD2基因序列所编码的氨基酸序列之间亲缘关系复杂,可能具有不同的起源。
关键词
草菇
a交配型基因
同源异形结构域蛋白
Keywords
Volvariella volvacea
mating type A gene
hmeodomain protein
分类号
S646.13 [农业科学—蔬菜学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
草菇泰国1号菌株交配型A因子分子遗传学及生物信息学解析
汪虹
陈明杰
冯爱萍
谭琦
鲍大鹏
《食用菌学报》
CSCD
北大核心
2015
4
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