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紫花苜蓿果糖-1,6-二磷酸醛缩酶基因全长克隆及分析
被引量:
12
1
作者
龙瑞才
杨青川
+2 位作者
康俊梅
王凭青
秦智慧
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第6期1075-1082,共8页
根据已知的与盐胁迫相关的EST序列,采用SMART RACE方法克隆了紫花苜蓿果糖-1,6-二磷酸醛缩酶(ALD)全长cDNA,命名为MsALD(GenBank accession No.FJ896113)。序列分析结果表明,该cDNA全长1 487bp,包含一个1 194 bp的最大开放阅读框,编码39...
根据已知的与盐胁迫相关的EST序列,采用SMART RACE方法克隆了紫花苜蓿果糖-1,6-二磷酸醛缩酶(ALD)全长cDNA,命名为MsALD(GenBank accession No.FJ896113)。序列分析结果表明,该cDNA全长1 487bp,包含一个1 194 bp的最大开放阅读框,编码398个氨基酸。经同源比对和进化树分析,MsALD基因编码的氨基酸与红三叶草、马铃薯、烟草等的果糖-1,6-二磷酸醛缩酶(ALD)氨基酸序列一致性高达90%以上,确定其属于第Ⅰ类果糖-1,6-二磷酸醛缩酶。半定量RT-PCR分析表明,MsALD基因可能与紫花苜蓿抗盐机理相关。
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关键词
紫花苜蓿
果糖
-
1
6
-
二磷酸
醛缩酶
(
ald
)
SMART
RACE
进化树
半定量RT
-
PCR
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职称材料
油菜FBA基因克隆、表达分析及其与抗旱性的关系
被引量:
3
2
作者
谢小玉
何巧丽
+2 位作者
侯爽
张小短
马仲炼
《生态学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第16期5708-5717,共10页
为了解果糖-1,6-二磷酸醛缩酶(fructose-1,6-bisphosphate aldolase,FBA)在油菜抗旱中的作用,揭示油菜干旱胁迫下FBA基因表达量、光合指标、产量等之间的关系,为油菜等作物抗旱性鉴定和抗旱性改良提供依据。以抗旱性强的甘蓝型油菜9400...
为了解果糖-1,6-二磷酸醛缩酶(fructose-1,6-bisphosphate aldolase,FBA)在油菜抗旱中的作用,揭示油菜干旱胁迫下FBA基因表达量、光合指标、产量等之间的关系,为油菜等作物抗旱性鉴定和抗旱性改良提供依据。以抗旱性强的甘蓝型油菜94005为材料,在初花期进行干旱胁迫处理,以正常浇水作为对照;测定叶片光合参数和FBA酶活性,通过实时荧光定量PCR(RT-qPCR)分析FBA基因的表达量;采用RACE方法对FBA基因进行全长克隆,并对测序结果进行生物信息学分析;复水后生长至成熟期测定产量,分析产量、光合指标、FBA基因表达量等之间的关系。结果表明,随着干旱的加剧,油菜叶片的净光合速率(Pn)、气孔导度(Gs)、蒸腾速率(Tr)、产量均下降,FBA活性和FBA基因的表达量上升。在轻度、中度和重度干旱胁迫下,油菜叶片胞间CO2浓度(Ci)显著下降,水分利用率(WUE)上升;极度胁迫下,Ci上升,WUE下降;油菜产量、净光合速率与FBA活性和FBA表达量呈显著负相关。FBA基因全长序列1440bp,ORF(开放阅读框)位于60—1172区域,编码370个氨基酸;蛋白分子量为38.51 KDa,等电点6.92;同源性对比显示,甘蓝型油菜FBA基因与拟南芥FBA基因的一致性在87%以上。二级结构预测结果表明FBA蛋白由α-螺旋、无规则卷曲、延伸链以及β-转角组成,4种二级结构元件所占比例分别为43.85%、31.28%、17.60%、7.26%。因此,干旱胁迫下油菜的净光合速率下降、产量降低,随着胁迫的加剧,降低幅度增大。FBA基因与干旱胁迫密切相关,干旱胁迫下,FBA基因主要通过抑制光合、降低蒸腾、促进糖酵解和有氧呼吸等途径来提高植物对干旱胁迫的适应性。
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关键词
甘蓝型油菜
干旱胁迫
光合
果糖
-
1
6
-
二磷酸
醛缩酶
(FBA)
基因克隆
表达分析
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职称材料
题名
紫花苜蓿果糖-1,6-二磷酸醛缩酶基因全长克隆及分析
被引量:
12
1
作者
龙瑞才
杨青川
康俊梅
王凭青
秦智慧
机构
中国农业科学院北京畜牧兽医研究所
重庆大学生物工程学院
出处
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第6期1075-1082,共8页
基金
国家科技支撑计划(2008BADB3B05)
国家科技支撑计划子课题(2008BADB3B04-1)
文摘
根据已知的与盐胁迫相关的EST序列,采用SMART RACE方法克隆了紫花苜蓿果糖-1,6-二磷酸醛缩酶(ALD)全长cDNA,命名为MsALD(GenBank accession No.FJ896113)。序列分析结果表明,该cDNA全长1 487bp,包含一个1 194 bp的最大开放阅读框,编码398个氨基酸。经同源比对和进化树分析,MsALD基因编码的氨基酸与红三叶草、马铃薯、烟草等的果糖-1,6-二磷酸醛缩酶(ALD)氨基酸序列一致性高达90%以上,确定其属于第Ⅰ类果糖-1,6-二磷酸醛缩酶。半定量RT-PCR分析表明,MsALD基因可能与紫花苜蓿抗盐机理相关。
关键词
紫花苜蓿
果糖
-
1
6
-
二磷酸
醛缩酶
(
ald
)
SMART
RACE
进化树
半定量RT
-
PCR
Keywords
Medicago sativa L.
fructose
-
1
6
-
bisphosphate
ald
olase(
ald
)
SMART RACE
phylogenetic tree
RT
-
PCR
分类号
Q785 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
油菜FBA基因克隆、表达分析及其与抗旱性的关系
被引量:
3
2
作者
谢小玉
何巧丽
侯爽
张小短
马仲炼
机构
西南大学农学与生物科技学院
出处
《生态学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第16期5708-5717,共10页
基金
国家自然科学基金项目(31871583)
公益性行业(农业)科研专项(201503127)。
文摘
为了解果糖-1,6-二磷酸醛缩酶(fructose-1,6-bisphosphate aldolase,FBA)在油菜抗旱中的作用,揭示油菜干旱胁迫下FBA基因表达量、光合指标、产量等之间的关系,为油菜等作物抗旱性鉴定和抗旱性改良提供依据。以抗旱性强的甘蓝型油菜94005为材料,在初花期进行干旱胁迫处理,以正常浇水作为对照;测定叶片光合参数和FBA酶活性,通过实时荧光定量PCR(RT-qPCR)分析FBA基因的表达量;采用RACE方法对FBA基因进行全长克隆,并对测序结果进行生物信息学分析;复水后生长至成熟期测定产量,分析产量、光合指标、FBA基因表达量等之间的关系。结果表明,随着干旱的加剧,油菜叶片的净光合速率(Pn)、气孔导度(Gs)、蒸腾速率(Tr)、产量均下降,FBA活性和FBA基因的表达量上升。在轻度、中度和重度干旱胁迫下,油菜叶片胞间CO2浓度(Ci)显著下降,水分利用率(WUE)上升;极度胁迫下,Ci上升,WUE下降;油菜产量、净光合速率与FBA活性和FBA表达量呈显著负相关。FBA基因全长序列1440bp,ORF(开放阅读框)位于60—1172区域,编码370个氨基酸;蛋白分子量为38.51 KDa,等电点6.92;同源性对比显示,甘蓝型油菜FBA基因与拟南芥FBA基因的一致性在87%以上。二级结构预测结果表明FBA蛋白由α-螺旋、无规则卷曲、延伸链以及β-转角组成,4种二级结构元件所占比例分别为43.85%、31.28%、17.60%、7.26%。因此,干旱胁迫下油菜的净光合速率下降、产量降低,随着胁迫的加剧,降低幅度增大。FBA基因与干旱胁迫密切相关,干旱胁迫下,FBA基因主要通过抑制光合、降低蒸腾、促进糖酵解和有氧呼吸等途径来提高植物对干旱胁迫的适应性。
关键词
甘蓝型油菜
干旱胁迫
光合
果糖
-
1
6
-
二磷酸
醛缩酶
(FBA)
基因克隆
表达分析
Keywords
Brassica napus L.
drought stress
photosynthetic characteristics
fructose
-
1
6
-
bisphosphate
ald
olase(FBA)
gene clone
gene expression analysis
分类号
S565.4 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
紫花苜蓿果糖-1,6-二磷酸醛缩酶基因全长克隆及分析
龙瑞才
杨青川
康俊梅
王凭青
秦智慧
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010
12
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
油菜FBA基因克隆、表达分析及其与抗旱性的关系
谢小玉
何巧丽
侯爽
张小短
马仲炼
《生态学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020
3
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