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蛋白质序列基于k-字的数值刻画及应用
被引量：
2
1
作者
贾美多
杨闫
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张盈盈
李春
《浙江农业学报》
CSCD
北大核心
2014年第6期1635-1640,共6页
基于氨基酸的一种5-字母分类模型,将蛋白质序列转化为5-字母序列,再借助序列中1-字和2-字的频数,将序列转化为一个30维的向量。通过计算两两向量间的欧氏距离得到物种间的进化距离,进而对两组蛋白质序列进行系统发生分析,结果证实了该...
基于氨基酸的一种5-字母分类模型,将蛋白质序列转化为5-字母序列,再借助序列中1-字和2-字的频数,将序列转化为一个30维的向量。通过计算两两向量间的欧氏距离得到物种间的进化距离,进而对两组蛋白质序列进行系统发生分析,结果证实了该方法的有效性。
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关键词
5-字母分类模型
30维向量
系统发生分析
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职称材料
题名
蛋白质序列基于k-字的数值刻画及应用
被引量：
2
1
作者
贾美多
杨闫
张盈盈
李春
机构
渤海大学数理学院
出处
《浙江农业学报》
CSCD
北大核心
2014年第6期1635-1640,共6页
基金
辽宁省"百千万人才工程"项目(2012921060)
辽宁省高等学校杰出青年学者成长计划(LJQ2011122)
文摘
基于氨基酸的一种5-字母分类模型,将蛋白质序列转化为5-字母序列,再借助序列中1-字和2-字的频数,将序列转化为一个30维的向量。通过计算两两向量间的欧氏距离得到物种间的进化距离,进而对两组蛋白质序列进行系统发生分析,结果证实了该方法的有效性。
关键词
5-字母分类模型
30维向量
系统发生分析
Keywords
5
-
letter classification
30
-
D vector
phylogenetic analysis
分类号
Q51 [生物学—生物化学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
蛋白质序列基于k-字的数值刻画及应用
贾美多
杨闫
张盈盈
李春
《浙江农业学报》
CSCD
北大核心
2014
2
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