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巴西橡胶树HbCOI1基因5′调控序列的克隆及分析
被引量：
1
1
作者
徐靖
李辉亮
+1 位作者
田维敏
彭世清
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第1期23-27,共5页
利用GenomeWalker方法获得了巴西橡胶树HbCOI1的5’调控序列。通过分析表明，在该序列中除了含有真核生物典型的核心启动子区域（879-928bp，TATAbox存在于886bp）外，一些与真核生物顺式调控元件相似的序列也存在其中，如在63、85和60...
利用GenomeWalker方法获得了巴西橡胶树HbCOI1的5’调控序列。通过分析表明，在该序列中除了含有真核生物典型的核心启动子区域（879-928bp，TATAbox存在于886bp）外，一些与真核生物顺式调控元件相似的序列也存在其中，如在63、85和604bp等处具有CAAT序列；在212、385和427bp处有5’UTRPy-riehstretch元件；在96bp处有1个与茉莉酸应答相关的元件TGACG；在43bp处存在1个与水杨酸应答相关的TCA—element；在145bp处存在1个与抗性和胁迫应答相关的TC丰富重复序列。此外，在626、745、834和864bp处分别有ACGTT—box、GATA—box、ARRlAT和bbox等顺式作用元件。
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关键词
巴西橡胶树
HbCOI1
5’调控序列
克隆
顺式作用元件
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职称材料
毛果杨WND1B基因启动子的克隆与缺失初步分析
被引量：
3
2
作者
黄婷
徐刚标
《中南林业科技大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第4期164-169,共6页
毛果杨Populus trichocarpa WND1B基因是拟南芥纤维细胞次生壁加厚中关键性调控因子SND1的同源基因。根据其序列进行BLAST分析,设计引物,用PCR方法克隆了WND1B起始密码子上游约2100 bp的5’调控序列。序列分析表明,该序列含典型的真核...
毛果杨Populus trichocarpa WND1B基因是拟南芥纤维细胞次生壁加厚中关键性调控因子SND1的同源基因。根据其序列进行BLAST分析,设计引物,用PCR方法克隆了WND1B起始密码子上游约2100 bp的5’调控序列。序列分析表明,该序列含典型的真核生物核心启动子区域,一些与真核生物典型的顺式调控元件相似的TATA-box、增强子元件、CAAT-box、GATA-box也存在于其中,此外还发现了一些与激素、低温胁迫诱导相关的顺式作用元件。分别设计引物,获得WND1B启动子的缺失序列。构建其表达载体pCAMBIA1301POG-1BP/1BP-F2/1BP-F3/1BP-F4-GUS,并进行瞬时表达分析。GUS染色表明,PtrWND1BP/1BP-F3/1BP-F4序列具GUS活性,PtrWND1BP-F2序列不具有。这说明PtrWND1B 5’非编码区影响其启动子活性。
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关键词
启动子
5’调控序列
克隆
生物信息学
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职称材料
题名
巴西橡胶树HbCOI1基因5′调控序列的克隆及分析
被引量：
1
1
作者
徐靖
李辉亮
田维敏
彭世清
机构
中国热带农业科学院热带生物技术研究所
中国热带农业科学院橡胶研究所热带作物栽培生理农业部重点开放实验室
出处
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第1期23-27,共5页
基金
国家自然科学基金项目(30560120,30760203)
热带作物栽培与生理农业部重点开放实验室开放课题(KLOF0504)
文摘
利用GenomeWalker方法获得了巴西橡胶树HbCOI1的5’调控序列。通过分析表明，在该序列中除了含有真核生物典型的核心启动子区域（879-928bp，TATAbox存在于886bp）外，一些与真核生物顺式调控元件相似的序列也存在其中，如在63、85和604bp等处具有CAAT序列；在212、385和427bp处有5’UTRPy-riehstretch元件；在96bp处有1个与茉莉酸应答相关的元件TGACG；在43bp处存在1个与水杨酸应答相关的TCA—element；在145bp处存在1个与抗性和胁迫应答相关的TC丰富重复序列。此外，在626、745、834和864bp处分别有ACGTT—box、GATA—box、ARRlAT和bbox等顺式作用元件。
关键词
巴西橡胶树
HbCOI1
5’调控序列
克隆
顺式作用元件
Keywords
Hevea brasiliensis
HbCOI1
5
＇ regulatory region
cloning
cis-regulatory element
分类号
Q789 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
毛果杨WND1B基因启动子的克隆与缺失初步分析
被引量：
3
2
作者
黄婷
徐刚标
机构
中南林业科技大学林木遗传育种实验室
出处
《中南林业科技大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第4期164-169,共6页
基金
科技部863项目(2009AA10Z101)
文摘
毛果杨Populus trichocarpa WND1B基因是拟南芥纤维细胞次生壁加厚中关键性调控因子SND1的同源基因。根据其序列进行BLAST分析,设计引物,用PCR方法克隆了WND1B起始密码子上游约2100 bp的5’调控序列。序列分析表明,该序列含典型的真核生物核心启动子区域,一些与真核生物典型的顺式调控元件相似的TATA-box、增强子元件、CAAT-box、GATA-box也存在于其中,此外还发现了一些与激素、低温胁迫诱导相关的顺式作用元件。分别设计引物,获得WND1B启动子的缺失序列。构建其表达载体pCAMBIA1301POG-1BP/1BP-F2/1BP-F3/1BP-F4-GUS,并进行瞬时表达分析。GUS染色表明,PtrWND1BP/1BP-F3/1BP-F4序列具GUS活性,PtrWND1BP-F2序列不具有。这说明PtrWND1B 5’非编码区影响其启动子活性。
关键词
启动子
5’调控序列
克隆
生物信息学
Keywords
promoter
5
＇ regulatory region
cloning
bioinformatics
分类号
S731.2 [农业科学—林学]
S757.3 [农业科学—森林经理学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
巴西橡胶树HbCOI1基因5′调控序列的克隆及分析
徐靖
李辉亮
田维敏
彭世清
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2008
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
毛果杨WND1B基因启动子的克隆与缺失初步分析
黄婷
徐刚标
《中南林业科技大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012
3
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职称材料
已选择
0
条
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参考文献
引证文献
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