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牛病毒性腹泻病毒反转录及3'-末端克隆测序方法研究
被引量：
2
1
作者
李庆超
苗利光
+3 位作者
李海涛
刘艳环
张广雷
庄风岐
《特产研究》
2010年第2期12-15,共4页
牛病毒性腹泻病毒为黄病毒科瘟病毒属代表种,其基因组为单股正链RNA,无Poly(A)尾。传统的3'-末端快速扩增方法不适用于牛病毒性腹泻病毒的3'-末端克隆测序。本研究根据牛病毒性腹泻病毒基因组3'-末端共有特征碱基,设计回文...
牛病毒性腹泻病毒为黄病毒科瘟病毒属代表种,其基因组为单股正链RNA,无Poly(A)尾。传统的3'-末端快速扩增方法不适用于牛病毒性腹泻病毒的3'-末端克隆测序。本研究根据牛病毒性腹泻病毒基因组3'-末端共有特征碱基,设计回文锚定引物CGend。以BVDVJZ05-1毒株为研究对象,进行了反转录及3'-末端克隆测序。结果表明,CGend的反转录效果优于随机引物和一般特异性下游引物,并且扩增得到了JZ05-1的3'-末端完整序列。本研究为瘟病毒属病毒反转录和3'-末端克隆测序提供了新思路。
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关键词
牛病毒性腹泻病毒
瘟病毒
反转录
3'-末端
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职称材料
杭州郊区马铃薯A病毒分离物的基因组3’-末端序列测定及系统进化分析
被引量：
8
2
作者
程晔
陈炯
陈剑平
《浙江农业学报》
CSCD
2002年第2期71-75,共5页
采用马铃薯Y病毒属通用引物Sprimer扩增了引起浙江杭州郊区发生的马铃薯病毒基因组 3’ 末端 16 87核苷酸序列 ,它包括NIb ,CP和 3’ UTR ,3’ 末端含Poly(A)尾 ,蚜传基序DAG位于多聚蛋白第 2 15～ 2 17氨基酸。BLAST分析表明该病毒为...
采用马铃薯Y病毒属通用引物Sprimer扩增了引起浙江杭州郊区发生的马铃薯病毒基因组 3’ 末端 16 87核苷酸序列 ,它包括NIb ,CP和 3’ UTR ,3’ 末端含Poly(A)尾 ,蚜传基序DAG位于多聚蛋白第 2 15～ 2 17氨基酸。BLAST分析表明该病毒为马铃薯A病毒 (PVA) ,它与已报道的 19个PVA分离物CP氨基酸进行比较 ,PVA浙江分离物与荷兰Alc分离物同源性最高 ,为 99.6 %。系统进化树分析表明 ,PVA分离物间存在一些明显的进化群体。
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关键词
分离物
基因组
3'-末端
序列
马铃薯A病毒
序列分析
系统进化
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职称材料
从LongSAGE标签获取cDNA长片段的3'-RACE方法的建立
被引量：
1
3
作者
黄德培
何俊琳
+3 位作者
刘学庆
陈雪梅
董艳玲
王应雄
《西南大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第4期149-152,共4页
长标签基因表达系列分析和末端快速扩增都是目前人类基因组研究中的重要方法.该文介绍了一种我们改良以后的末端快速扩增方法(3'-RACE),用于从LongSAGE标签扩增基因3'端序列.实验证明该方法技术稳定、重复性好,所获得的3'端...
长标签基因表达系列分析和末端快速扩增都是目前人类基因组研究中的重要方法.该文介绍了一种我们改良以后的末端快速扩增方法(3'-RACE),用于从LongSAGE标签扩增基因3'端序列.实验证明该方法技术稳定、重复性好,所获得的3'端cDNA纯度高、完整性好,表明该方法切实可行.
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关键词
LongSAGE标签
3'-末端
快速扩增
全长cDNA扩增
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职称材料
题名
牛病毒性腹泻病毒反转录及3'-末端克隆测序方法研究
被引量：
2
1
作者
李庆超
苗利光
李海涛
刘艳环
张广雷
庄风岐
机构
中国农业科学院特产研究所
江苏科技大学
吉林省桦甸市八道河子镇农村管理服务中心
出处
《特产研究》
2010年第2期12-15,共4页
基金
中国农科院特产研究基金项目
文摘
牛病毒性腹泻病毒为黄病毒科瘟病毒属代表种,其基因组为单股正链RNA,无Poly(A)尾。传统的3'-末端快速扩增方法不适用于牛病毒性腹泻病毒的3'-末端克隆测序。本研究根据牛病毒性腹泻病毒基因组3'-末端共有特征碱基,设计回文锚定引物CGend。以BVDVJZ05-1毒株为研究对象,进行了反转录及3'-末端克隆测序。结果表明,CGend的反转录效果优于随机引物和一般特异性下游引物,并且扩增得到了JZ05-1的3'-末端完整序列。本研究为瘟病毒属病毒反转录和3'-末端克隆测序提供了新思路。
关键词
牛病毒性腹泻病毒
瘟病毒
反转录
3'-末端
Keywords
Bovine Viral Diarrhea Virus
Pestivirus
Reverse Transcription
3
＇-Terminal
分类号
Q939.4 [生物学—微生物学]
Q753 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
杭州郊区马铃薯A病毒分离物的基因组3’-末端序列测定及系统进化分析
被引量：
8
2
作者
程晔
陈炯
陈剑平
机构
浙江省农业科学院病毒实验室
出处
《浙江农业学报》
CSCD
2002年第2期71-75,共5页
基金
浙江省青年科技人才专项基金 (RC96 0 4 )
浙江省重点实验室专项基金 (0 0 110 75 5 7)
浙江省"十五"重大攻关项目 (0 1110 2 181)
文摘
采用马铃薯Y病毒属通用引物Sprimer扩增了引起浙江杭州郊区发生的马铃薯病毒基因组 3’ 末端 16 87核苷酸序列 ,它包括NIb ,CP和 3’ UTR ,3’ 末端含Poly(A)尾 ,蚜传基序DAG位于多聚蛋白第 2 15～ 2 17氨基酸。BLAST分析表明该病毒为马铃薯A病毒 (PVA) ,它与已报道的 19个PVA分离物CP氨基酸进行比较 ,PVA浙江分离物与荷兰Alc分离物同源性最高 ,为 99.6 %。系统进化树分析表明 ,PVA分离物间存在一些明显的进化群体。
关键词
分离物
基因组
3'-末端
序列
马铃薯A病毒
序列分析
系统进化
Keywords
potato virus A
sequence analysis
分类号
S435.32 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
S432.41 [农业科学—植物病理学]
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职称材料
题名
从LongSAGE标签获取cDNA长片段的3'-RACE方法的建立
被引量：
1
3
作者
黄德培
何俊琳
刘学庆
陈雪梅
董艳玲
王应雄
机构
重庆医科大学公共卫生学院
出处
《西南大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第4期149-152,共4页
基金
重庆市科委重点资助项目(渝科发计字[2004]47号)
重庆市计生委基金资助项目(No.2005-001)
文摘
长标签基因表达系列分析和末端快速扩增都是目前人类基因组研究中的重要方法.该文介绍了一种我们改良以后的末端快速扩增方法(3'-RACE),用于从LongSAGE标签扩增基因3'端序列.实验证明该方法技术稳定、重复性好,所获得的3'端cDNA纯度高、完整性好,表明该方法切实可行.
关键词
LongSAGE标签
3'-末端
快速扩增
全长cDNA扩增
Keywords
LongSAGE tags
3
＇-RACE
cDNA sequence amplification
分类号
Q782 [生物学—分子生物学]
Q786 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
牛病毒性腹泻病毒反转录及3'-末端克隆测序方法研究
李庆超
苗利光
李海涛
刘艳环
张广雷
庄风岐
《特产研究》
2010
2
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
杭州郊区马铃薯A病毒分离物的基因组3’-末端序列测定及系统进化分析
程晔
陈炯
陈剑平
《浙江农业学报》
CSCD
2002
8
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
从LongSAGE标签获取cDNA长片段的3'-RACE方法的建立
黄德培
何俊琳
刘学庆
陈雪梅
董艳玲
王应雄
《西南大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2008
1
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职称材料
已选择
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