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人类2-氨基3-羧基粘康酸6-半醛脱羧酶(ACMSD)与底物及抑制剂作用模型的理论研究
被引量:
5
1
作者
楚慧郢
郑清川
+1 位作者
赵勇山
张红星
《高等学校化学学报》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2008年第12期2398-2402,共5页
利用同源模建和分子动力学模拟方法构建了人类2-氨基3-羧基粘康酸6-半醛脱羧酶(hACMSD)的三维结构,并利用Profile-3D和Procheck等方法评估了模型的可靠性.在此基础上,用分子对接程序(Affinity),将其底物2-氨基3-羧基粘康酸6-半醛(ACMS)...
利用同源模建和分子动力学模拟方法构建了人类2-氨基3-羧基粘康酸6-半醛脱羧酶(hACMSD)的三维结构,并利用Profile-3D和Procheck等方法评估了模型的可靠性.在此基础上,用分子对接程序(Affinity),将其底物2-氨基3-羧基粘康酸6-半醛(ACMS)和抑制剂喹啉酸(QA)分别与hACMSD进行对接,获得了复合物结构的理论模型.通过配体与受体之间相互作用能和结构分析给出了底物和抑制剂的具体结合方式,明确了hACMSD与底物和抑制剂结合时起重要作用的氨基酸残基.
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关键词
2-氨基3-羧基粘康酸6-半醛脱羧酶
分子动力学模拟
分子对接
同源模建
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职称材料
题名
人类2-氨基3-羧基粘康酸6-半醛脱羧酶(ACMSD)与底物及抑制剂作用模型的理论研究
被引量:
5
1
作者
楚慧郢
郑清川
赵勇山
张红星
机构
吉林大学理论化学研究所
出处
《高等学校化学学报》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2008年第12期2398-2402,共5页
基金
国家自然科学基金(批准号:20573042)
国家科技支撑计划重点项目(批准号:2006BAE03B01)
高等学校博士点学科专项基金(批准号:20070183046)资助
文摘
利用同源模建和分子动力学模拟方法构建了人类2-氨基3-羧基粘康酸6-半醛脱羧酶(hACMSD)的三维结构,并利用Profile-3D和Procheck等方法评估了模型的可靠性.在此基础上,用分子对接程序(Affinity),将其底物2-氨基3-羧基粘康酸6-半醛(ACMS)和抑制剂喹啉酸(QA)分别与hACMSD进行对接,获得了复合物结构的理论模型.通过配体与受体之间相互作用能和结构分析给出了底物和抑制剂的具体结合方式,明确了hACMSD与底物和抑制剂结合时起重要作用的氨基酸残基.
关键词
2-氨基3-羧基粘康酸6-半醛脱羧酶
分子动力学模拟
分子对接
同源模建
Keywords
2
-
Amino
3
-
carboxymuconate
6
-
semialdehyde Decarboxylase(ACMSD)
Molecular dynamics simulation
Docking
Homology modeling
分类号
O641 [理学—物理化学]
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作者
出处
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被引量
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1
人类2-氨基3-羧基粘康酸6-半醛脱羧酶(ACMSD)与底物及抑制剂作用模型的理论研究
楚慧郢
郑清川
赵勇山
张红星
《高等学校化学学报》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2008
5
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