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南极产低温几丁质酶菌株的16SrDNA序列分析及其发酵条件及酶学性质研究 被引量：1
1
作者 连明珠 张金伟 曾润颖 《高技术通讯》 CAS CSCD 北大核心 2005年第9期58-61,共4页
从南极深海沉积物中筛选到一株产低温几丁质酶的菌株AC444,经细菌形态观察及16S rDNA序列分析,该菌株属于假交替单胞菌属(Pseudoalteromonas),其最适与最高生长温度分别为15℃和30℃,属于兼性嗜冷菌.AC444菌株能利用多种碳源产酶,在含... 从南极深海沉积物中筛选到一株产低温几丁质酶的菌株AC444,经细菌形态观察及16S rDNA序列分析,该菌株属于假交替单胞菌属(Pseudoalteromonas),其最适与最高生长温度分别为15℃和30℃,属于兼性嗜冷菌.AC444菌株能利用多种碳源产酶,在含胶体几丁质和蛋白胨的培养基中产酶最高,达13.47U,最适产酶温度为20℃.酶的最适反应pH为7.0,最适作用温度为35℃,属中性低温酶. 展开更多
关键词 几丁质酶 菌株 16srdna 序列分析 发酵条件 深海沉积物 假交替单胞菌属
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利用16S rDNA序列分析宜宾芽菜中细菌菌群
2
作者 李东 左勇 +3 位作者 任忠侨 孙琴 张晶 曾林 《中国调味品》 CAS 北大核心 2014年第10期81-84,共4页
使用ClustalX 2.0和MEGA 4.1软件对从宜宾芽菜中分离出的9株细菌(AY,AZ,AH,AI,AJ,AK,AL,AG,AO)的16SrDNA序列进行比对、分析,并绘制系统发育树。经鉴定,该9个菌株可分为3个种群,其中AY,AZ,AH,AL,AK,AJ这6个菌为第一种群;AO,AI为第二种群... 使用ClustalX 2.0和MEGA 4.1软件对从宜宾芽菜中分离出的9株细菌(AY,AZ,AH,AI,AJ,AK,AL,AG,AO)的16SrDNA序列进行比对、分析,并绘制系统发育树。经鉴定,该9个菌株可分为3个种群,其中AY,AZ,AH,AL,AK,AJ这6个菌为第一种群;AO,AI为第二种群;AG为第三种群。结果表明:利用16SrDNA序列的分子生物学方法可以实现细菌菌群的快速分类鉴定,与传统方法相比具有简便、快速等优点。 展开更多
关键词 细菌 16srdna序列分析法 发育树
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利用16S rDNA序列分析鉴定一株产抗菌物质的微生物菌株 被引量：36
3
作者 别小妹 陆兆新 +3 位作者 房耀维 曾泉 吕凤霞 袁勇军 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2006年第11期466-470,共5页
从桃子上分离纯化得到1株产抗菌物质的菌株,命名为fmb3菌,通过抑菌实验发现该菌对革兰氏阳性菌蜡样芽孢杆菌、革兰氏阴性菌大肠埃希菌和真菌扩展青霉等3种常见食品病原菌具有显著的抑菌效果。利用16SrDNA分析对该菌作了系统进化鉴定,首... 从桃子上分离纯化得到1株产抗菌物质的菌株,命名为fmb3菌,通过抑菌实验发现该菌对革兰氏阳性菌蜡样芽孢杆菌、革兰氏阴性菌大肠埃希菌和真菌扩展青霉等3种常见食品病原菌具有显著的抑菌效果。利用16SrDNA分析对该菌作了系统进化鉴定,首先提取fmb3菌基因组DNA,根据不同种属的细菌的16SrDNA序列两端的保守性设计通用引物,对fmb3菌16SrDNA片断进行PCR扩增,对扩增得到的目标片段测序,并且利用NCBIBLAST对测序结果进行比对,构建系统进化树进行分析,初步确定该菌属于枯草芽孢杆菌。 展开更多
关键词 抗菌物质 16srdna 枯草芽孢杆菌 系统发育分析 鉴定
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一株芽孢杆菌16SrRNA的基因序列测定和系统进化分析 被引量：12
4
作者 李瑞芳 赵玉峰 +2 位作者 薛雯雯 田泱源 张长付 《广东农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2011年第3期121-122,125,共3页
从河南黄河稻区土壤中分离出一株具有较强稻瘟病菌拮抗活性的芽孢杆菌菌株BS501,经过形态观察、生理生化特性检测和电镜技术,确定其为芽孢杆菌属细菌。为进一步确定其分类学地位,扩增了BS501基因组的16S rDNA,并将测序结果提交GenBank... 从河南黄河稻区土壤中分离出一株具有较强稻瘟病菌拮抗活性的芽孢杆菌菌株BS501,经过形态观察、生理生化特性检测和电镜技术,确定其为芽孢杆菌属细菌。为进一步确定其分类学地位,扩增了BS501基因组的16S rDNA,并将测序结果提交GenBank数据库(登录号:FJ755787)。利用BLAST软件将该序列与枯草芽孢杆菌、地衣芽孢杆菌等芽孢菌属细菌及大肠杆菌16S rDNA序列进行同源性比对。系统进化树表明,BS501与芽孢菌属细菌在进化关系上组成一个大的分支,与枯草芽孢杆菌最为接近,与大肠杆菌较远。同源性分析表明该序列与枯草芽孢杆菌PRE23同源性达99%,证实该菌株的分类学地位为枯草芽孢杆菌。 展开更多
关键词 芽孢杆菌 16srdna 基因测序 系统进化分析
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副猪嗜血杆菌的分离鉴定及16S rRNA序列分析 被引量：11
5
作者 李富祥 李华春 +5 位作者 宋建领 杨仕标 朱建波 廖德芳 姚俊 高华峰 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2012年第8期68-72,共5页
从云南某规模化养猪场病猪肺脏分离到1株革兰氏阴性小杆菌,经细菌生化鉴定、PCR鉴定和16S rRNA序列比对鉴定为副猪嗜血杆菌。抗生素药物敏感试验结果表明,分离菌株对四环素、红霉素、氯霉素、头孢噻吩高敏;对庆大霉素、氧氟沙星、诺氟... 从云南某规模化养猪场病猪肺脏分离到1株革兰氏阴性小杆菌,经细菌生化鉴定、PCR鉴定和16S rRNA序列比对鉴定为副猪嗜血杆菌。抗生素药物敏感试验结果表明,分离菌株对四环素、红霉素、氯霉素、头孢噻吩高敏;对庆大霉素、氧氟沙星、诺氟沙星中敏;对磺胺甲唑耐药。16S rRNA分析结果表明,该分离株与GenBank中的Hps参考株AB078973(基因登录号)同源性为100%,将分离菌株鉴定为副猪嗜血杆菌。16S rRNA遗传进化关系表明,分离株与副猪嗜血杆菌3株血清5型参考株AB078972、AB078973、AB078974的16S rRNA序列位于一个分支上,遗传进化关系最近,它们之间的核苷酸同源性在99.0%～99.4%之间,初步鉴定为血清5型副猪嗜血杆菌,致病性试验结果表明,分离菌株对小白鼠有强致病性,命名为YN-1株。 展开更多
关键词 副猪嗜血杆菌 分离 鉴定 16S RRNA 序列分析
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温氏附红细胞体16S rRNA基因的序列测定和分析 被引量：6
6
作者 付媛 李树清 +5 位作者 杜凯 刘琴 周艳琴 刘恩勇 姚宝安 赵俊龙 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第5期518-522,共5页
从自然感染附红细胞体的湖北黄牛无菌采集血液,分离附红细胞体并提取病原基因组,用血营养菌的16SrRNA基因的通用引物进行PCR扩增,得到长约1.5 kb的扩增片段,将其克隆到pMD18-T载体后进行测序和分析。结果表明该片段全长为1 471 bp(GenB... 从自然感染附红细胞体的湖北黄牛无菌采集血液,分离附红细胞体并提取病原基因组,用血营养菌的16SrRNA基因的通用引物进行PCR扩增,得到长约1.5 kb的扩增片段,将其克隆到pMD18-T载体后进行测序和分析。结果表明该片段全长为1 471 bp(GenBank收录号为AY946266),同源性分析表明该序列与Neimark公布的温氏附红细胞体(AF016546)的16S rRNA基因序列同源性达到98.7%,证实该病原为温氏附红细胞体,从分子生物学水平证实了温氏附红细胞体在湖北省的存在。将该序列与5种支原体、14种血营养菌及边缘无浆体等的相应序列进行比较,建立系统发育树,结果表明温氏附红细胞体同边缘无浆体的关系较远,而与肺炎支原体组的亲缘关系较近。 展开更多
关键词 温氏附红细胞体 16S RRNA PCR 序列分析
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浅色黄姑鱼线粒体16S rRNA基因片段序列特征分析 被引量：9
7
作者 童馨 杜博 +4 位作者 喻达辉 龚世园 郭奕惠 黄桂菊 李莉好 《海洋水产研究》 CSCD 北大核心 2007年第3期85-91,共7页
PCR扩增100个浅色黄姑鱼个体的线粒体16SrRNA基因片段序列,得到大约620bp的扩增产物。将其中5个个体的扩增产物进行测序和同源比对,得到468bp可供比对分析的片段。比对结果表明,5条序列包括两个单倍型,两个单倍型之间有1个碱基突变。PCR... PCR扩增100个浅色黄姑鱼个体的线粒体16SrRNA基因片段序列,得到大约620bp的扩增产物。将其中5个个体的扩增产物进行测序和同源比对,得到468bp可供比对分析的片段。比对结果表明,5条序列包括两个单倍型,两个单倍型之间有1个碱基突变。PCR-RFLP分析结果显示,两个种群的100个样品中98%的个体为其中一种单倍型,只有2%的个体呈另一种单倍型,表明这两个种群的遗传多样性较低。两个单倍型平均碱基组成为:T22.0%,C26.3%,A29.8%,G21.9%,GC含量平均为48.2%。与GenBank中石首鱼科7属9种的11条同源序列比对,得到429个比对位点,其中包括69个简约信息位点、55个单突变子和16个插入/缺失位点。聚类分析显示,浅色黄姑鱼与黄姑鱼亲缘关系较近,与形态分类相符。 展开更多
关键词 浅色黄姑鱼 线粒体16S RRNA基因 序列分析 RFLP
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云南柑橘黄龙病病原检测及其16S rDNA序列分析 被引量：8
8
作者 董鹏 包改丽 +2 位作者 冉志伟 陈海如 李凡 《云南农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第5期607-611,共5页
利用柑橘黄龙病菌的特异引物,对采自云南红河州建水县和个旧市、玉溪市华宁县、大理州宾川县、昭通市盐津县、德宏州瑞丽市以及保山市隆阳区等地共151个疑似柑橘黄龙病样品进行了黄龙病菌的检测,其中建水县有5个样品检测结果为阳性,检... 利用柑橘黄龙病菌的特异引物,对采自云南红河州建水县和个旧市、玉溪市华宁县、大理州宾川县、昭通市盐津县、德宏州瑞丽市以及保山市隆阳区等地共151个疑似柑橘黄龙病样品进行了黄龙病菌的检测,其中建水县有5个样品检测结果为阳性,检出率为33.3%;个旧市、华宁县和宾川县各有1个样品为阳性,检出率分别为8.3%,5.5%,6.7%;而昭通、德宏和保山的样品均为阴性。表明黄龙病在云南的主要柑橘产区建水、个旧、华宁和宾川均有不同程度的发生,其中建水县发生率较高,生产上应尽快引起重视。对所获得的黄龙病菌16S rDNA进行了克隆和序列测定,发现8个云南柑橘黄龙病菌16S rDNA的序列一致性均为100%,与柑橘黄龙病菌亚洲种(Candidatus Liberibacter asiaticus)相应序列的一致性为98.7%～100%,与柑橘黄龙病菌非洲种(Candidatus Liberibacter africanus)的一致性为97.5%～98.7%,而与柑橘黄龙病菌美洲种(Candidatus Liberibacter americanus)的一致性均为96.5%。表明云南主要柑橘产区发生的黄龙病菌均属于柑橘黄龙病菌亚洲种。 展开更多
关键词 柑橘黄龙病 病原检测 16S RDNA 基因克隆 序列分析
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55株芽孢杆菌16S rRNA基因序列测定与系统发育学分析 被引量：9
9
作者 程池 刘光全 +1 位作者 李金霞 姚粟 《食品与发酵工业》 CAS CSCD 北大核心 2006年第10期20-24,共5页
采用16S rRNA基因序列分析法对中国工业微生物菌种保藏管理中心(CCIC)保藏的55株枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)进行复核鉴定。菌株经纯化培养,以改良CTAB法提取总DNA,采用细菌16S rRNA通用引物、TD-PCR方法(touchdown-PCR)进行16S r... 采用16S rRNA基因序列分析法对中国工业微生物菌种保藏管理中心(CCIC)保藏的55株枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)进行复核鉴定。菌株经纯化培养,以改良CTAB法提取总DNA,采用细菌16S rRNA通用引物、TD-PCR方法(touchdown-PCR)进行16S rRNA基因序列扩增,PCR产物纯化后直接进行序列测定,序列经人工校对后用Clustal X进行比对分析,最后用MEGA3.1软件构建系统发育树。系统发育分析结果表明:55株枯草芽孢杆菌中有52株菌种与原鉴定结果一致,有3株菌种与原鉴定结果存在差异,其中2株鉴定结果为巨大芽孢杆菌(B.megaterium),另1株鉴定结果为地衣芽孢杆菌(B.licheniformis)。 展开更多
关键词 枯草芽孢杆菌 16S RRNA基因 TD-PCR 序列分析 系统发育树
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23株芽孢杆菌16S rRNA基因序列扩增与系统发育分析 被引量：9
10
作者 张晓娟 宋萍 +3 位作者 王柱 张蓓蓓 周光燕 王菊英 《食品与发酵科技》 CAS 2012年第2期9-12,共4页
采用16S rRNA基因序列分析对西南菌种站(SICC)收集保藏的23株芽孢杆菌进行复核鉴定,以改良的CTAB法提取细菌DNA,用通用引物F1、R1对菌株进行16S rRNA扩增,使用Clustal X对序列进行比对分析,并用MEGA 4进行建树分析。鉴定结果表明其中13... 采用16S rRNA基因序列分析对西南菌种站(SICC)收集保藏的23株芽孢杆菌进行复核鉴定,以改良的CTAB法提取细菌DNA,用通用引物F1、R1对菌株进行16S rRNA扩增,使用Clustal X对序列进行比对分析,并用MEGA 4进行建树分析。鉴定结果表明其中13株与原学名一致,1株与原学名不符,其余9株在绘制的N-J发育树中显示同时与枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)、解淀粉芽孢杆菌(B.amyloliquefaciens)汇聚到一个分支,需要用特异PCR方法进一步核实。 展开更多
关键词 芽孢杆菌 16S RRNA 序列分析 系统发育
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利用16S rDNA部分序列聚类分析鉴定乳球菌 被引量：7
11
作者 付晓艳 霍贵成 《中国乳品工业》 CAS 北大核心 2005年第8期7-9,共3页
在表型鉴定的基础上,应用已发表的16S rDNA序列设计引物,扩增L.sp.F001菌株16S rDNA基因,并进行测序,将结果与同属及非同属的乳酸菌进行同源性比较。结果表明,L.sp.F001菌株与同属的乳酸乳球菌同源性为99%以上,尤其与乳酸乳球菌叶蝉亚种... 在表型鉴定的基础上,应用已发表的16S rDNA序列设计引物,扩增L.sp.F001菌株16S rDNA基因,并进行测序,将结果与同属及非同属的乳酸菌进行同源性比较。结果表明,L.sp.F001菌株与同属的乳酸乳球菌同源性为99%以上,尤其与乳酸乳球菌叶蝉亚种NC-DO 2181T同源性为100%,与不同属的肉明串珠菌、漫游球菌、嗜盐四联球菌同源性分别为77.0%,82.1%,78.2%。结论:菌株L.sp.F001为乳酸乳球菌。 展开更多
关键词 16S rDNA 聚类分析 乳酸球菌 16srdna 乳酸乳球菌 分析鉴定 序列设计 同源性比较 聚类
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瓶鼻海豚、中华白海豚和糙齿海豚线粒体16S rRNA基因的序列分析 被引量：5
12
作者 李莉好 郭奕惠 +3 位作者 黄桂菊 江世贵 贾晓平 喻达辉 《南方水产》 2007年第4期38-45,共8页
采用聚合酶链式反应(PCR)技术扩增瓶鼻海豚、中华白海豚和糙齿海豚的线粒体DNA16S rRNA基因,获得了大约600bp的片段。扩增产物直接测序,去除引物序列后分别获得515、519和529bp的核苷酸片段。碱基组成平均为T25·8%,C20·7%,A32... 采用聚合酶链式反应(PCR)技术扩增瓶鼻海豚、中华白海豚和糙齿海豚的线粒体DNA16S rRNA基因,获得了大约600bp的片段。扩增产物直接测序,去除引物序列后分别获得515、519和529bp的核苷酸片段。碱基组成平均为T25·8%,C20·7%,A32·1%,G21·4%,GC含量为42·1%。与35种鲸豚类的55条同源序列比对,去除部分端部序列后得到497个比对位点,包括14个插入/缺失位点和127个变异位点(104个简约信息位点,23个单突变子)。序列比较表明,我国水域的瓶鼻海豚和中华白海豚与国外种存在一定的差异。NJ聚类分析结果与目前的主流观点基本相同,即须鲸亚目形成单系群而齿鲸亚目则为多系群,后者包括海豚总科、抹香鲸总科、喙鲸总科和淡水豚总科。其中抹香鲸总科与须鲸亚目聚合在一起,然后与海豚总科聚合再与喙鲸总科相聚。淡水豚总科为一并系群并处于整个鲸豚类的基部,其中恒河豚科是最早分化的一支。但在海豚总科中,鼠海豚科的江豚则与一角鲸科的白鲸聚合一起,与形态分类不同。 展开更多
关键词 海豚 16S RRNA 序列分析 分子系统学
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宫颈癌患者人乳头瘤病毒16型E6基因的克隆及序列分析 被引量：3
13
作者 高艳娥 张菊 +2 位作者 阎小君 宋天保 李丁 《西安交通大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2003年第1期17-19,共3页
目的　分析中国陕西地区宫颈癌患者人乳头瘤病毒 16型 (HPV16型 )E6基因的结构特点。方法　采用PCR技术扩增了 1例HPV16阳性宫颈癌患者癌组织中HPV16E6基因 ,并对其进行了克隆及全序列分析。结果　成功地克隆了HPV16E6基因 ,与GenBank... 目的　分析中国陕西地区宫颈癌患者人乳头瘤病毒 16型 (HPV16型 )E6基因的结构特点。方法　采用PCR技术扩增了 1例HPV16阳性宫颈癌患者癌组织中HPV16E6基因 ,并对其进行了克隆及全序列分析。结果　成功地克隆了HPV16E6基因 ,与GenBank收录的原型相比 ,E6基因中有 2个碱基发生突变 ,推导其编码的氨基酸有 1个发生了变化。 展开更多
关键词 人乳头瘤病毒16型 E6基因 宫颈癌 序列分析
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阿尔金山盐湖极端嗜盐古生菌的分离及16S rDNA序列分析 被引量：14
14
作者 许学伟 吴敏 黄伟达 《浙江大学学报（工学版）》 EI CAS CSCD 北大核心 2004年第4期508-512,共5页
为了研究分析新疆阿尔金山国家自然保护区阿牙克库木湖嗜盐古生菌物种资源,对分离纯化到的极端嗜盐古生菌AJ2和AJ4,采用PCR方法扩增出其16SrRNA基因(16SrDNA),并测定了基因的核苷酸序列.基于16SrDNA序列的同源性比较和系统发育学分析,... 为了研究分析新疆阿尔金山国家自然保护区阿牙克库木湖嗜盐古生菌物种资源,对分离纯化到的极端嗜盐古生菌AJ2和AJ4,采用PCR方法扩增出其16SrRNA基因(16SrDNA),并测定了基因的核苷酸序列.基于16SrDNA序列的同源性比较和系统发育学分析,发现菌株AJ2是Natrinema属中一个与其他成员不同的新种,命名为Natrinemaajinwuensissp.nov.;菌株AJ4是Haloarcula属中成员argentinensis的一个亚种,取名为Haloar-culaargentinensissubsp.ajinwuensis.菌株AJ2和AJ4的16SrDNA序列已被GenBank数据库收录,其序列号分别为AY208972和AY208973. 展开更多
关键词 阿金山国家自然保护区 极端嗜盐古生菌 阿尔金山盐湖 分离 序列分析 16S RRNA
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猪附红细胞体16S rRNA基因的序列测定和系统进化分析 被引量：23
15
作者 张浩吉 谢明权 +3 位作者 张健騑 覃宗华 顾万军 蔡建平 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第6期596-601,共6页
从确诊为猪附红细胞体感染的猪场,无菌采集血样,抽提猪附红细胞体基因组DNA,采用真细菌的通用引物进行16S rRNA基因扩增,对扩增产物进行克隆和测序。从3 个地理位置不同的猪场均成功地扩增出长度为1 469 bp的核苷酸序列。系统进化分析表... 从确诊为猪附红细胞体感染的猪场,无菌采集血样,抽提猪附红细胞体基因组DNA,采用真细菌的通用引物进行16S rRNA基因扩增,对扩增产物进行克隆和测序。从3 个地理位置不同的猪场均成功地扩增出长度为1 469 bp的核苷酸序列。系统进化分析表明,3个猪场样品所测序列一致性达99 52%以上,具有相同的基因型,但与国外报道的猪附红细胞体Illinois株同源性为95%,属于同一基因群,但基因型不同;所有种类的附红细胞体和血巴尔通氏体组成同一进化分支,这类血营养菌与支原体科,支原体属的病原最靠近(75%),而与立克次氏体目的病原较远(70%)。上述研究证实,广东所流行的猪附红细胞体是一种新基因型的猪附红细胞体,建议命名为猪附红细胞体广东株型;为反映进化关系,猪附红细胞体和其它血营养菌应划归于支原体科的支原体属。 展开更多
关键词 猪附红细胞体 系统进化分析 rRNA基因 16S 序列测定 附红细胞体感染 基因组DNA 核苷酸序列 立克次氏体 支原体 基因型 通用引物 基因扩增 扩增产物 地理位置 进化关系 猪场 真细菌 分析表 一致性 同源性 基因群 体组成
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云南省东方蜜蜂线粒体16S rRNA基因的扩增及序列分析 被引量：4
16
作者 谭宏伟 董霞 和绍禹 《云南农业大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2009年第3期403-407,共5页
扩增、测定和分析了云南省东方蜜蜂16个地理居群线粒体16S rRNA基因部分序列,并结合从GenBank获得的蜜蜂科3个其它种的16S rRNA序列,以离颚细蜂科的Vanhornia eucnemidarum为外群,利用邻接法、最大简约法和最大似然法重构了它们的种系... 扩增、测定和分析了云南省东方蜜蜂16个地理居群线粒体16S rRNA基因部分序列,并结合从GenBank获得的蜜蜂科3个其它种的16S rRNA序列,以离颚细蜂科的Vanhornia eucnemidarum为外群,利用邻接法、最大简约法和最大似然法重构了它们的种系发生关系。结果显示,云南省东方蜜蜂16S RNA基因部分序列很保守,不同地理居群均得到435 bp完全一致的基因序列;通过对蜜蜂科4个种的种系发生关系分析发现,东方蜜蜂与西方蜜蜂位于一个姊妹枝,而熊蜂与无刺蜂位于一个进化枝,4个种得到了有效的区分。因此,16SrRNA可以作为一个理想的分子遗传标记用于蜜蜂科种间鉴定和种系发生关系分析。 展开更多
关键词 东方蜜蜂 线粒体DNA 16S RRNA基因 序列分析
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苜蓿细菌性萎蔫病菌16S rDNA片段的克隆及序列分析(简报) 被引量：3
17
作者 漆艳香 朱水芳 +1 位作者 谢艺贤 肖启明 《草业学报》 CSCD 2006年第3期123-127,共5页
利用细菌16S rDNA保守序列通用引物对16sF/16sR对苜蓿细菌性萎蔫病菌的标准菌株(IPQ0019)总DNA进行扩增,得到了大约1.5 kb的片段。将此片段插入到pGEM-T载体并转化进大肠杆菌DH5α菌株中,经PCR鉴定、限制性内切酶分析及核苷酸序列同源... 利用细菌16S rDNA保守序列通用引物对16sF/16sR对苜蓿细菌性萎蔫病菌的标准菌株(IPQ0019)总DNA进行扩增,得到了大约1.5 kb的片段。将此片段插入到pGEM-T载体并转化进大肠杆菌DH5α菌株中,经PCR鉴定、限制性内切酶分析及核苷酸序列同源性分析均表明克隆成功。该研究为制备苜蓿细菌性萎蔫病菌的DNA分子探针奠定了基础。 展开更多
关键词 苜蓿细菌性萎蔫病菌 16S rDNA克隆 序列分析
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16Sr RNA/rDNA序列分析技术在瘤胃细菌微生态系统研究中的应用 被引量：15
18
作者 黄庆生 王加启 《中国畜牧兽医》 CAS 2003年第1期7-11,共5页
作者指出了反刍动物瘤胃细菌微生态系统研究的难点 ,介绍了细菌分类学中新兴的分子生物学指标 (1 6Sr RNA/r DNA序列同源性 ) ,综述了 1 6S r RNA/r DNA序列分析中所采用的分子生物学方法和技术 ,并阐述了瘤胃分子微生态学研究的流程。
关键词 瘤胃细菌 16S rRNA/rDNA 分子微生态学 反刍动物 基因序列分析 分类
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海南柑桔黄龙病病原16S rDNA片段序列分析 被引量：3
19
作者 彭军 刘元 黄俊生 《中国南方果树》 北大核心 2008年第4期18-19,共2页
关键词 柑桔黄龙病 DNA片段 序列分析 海南 16S 病原 侵染性病害 柑桔生产
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副溶血性弧菌16S rRNA基因序列变异规律分析 被引量：1
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作者 冯博 蓝英 +3 位作者 孙晓红 张炜佳 潘迎捷 赵勇 《食品与生物技术学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第9期928-934,共7页
通过对副溶血性弧菌16S rRNA基因序列进行深度分析，研究其序列变异特点，为开发新的分型溯源靶点奠定基础。对111株分离自生鲜水产品的副溶血性弧菌16S rRNA基因测序，与GenBank中已有的副溶血性弧菌16S rRNA基因标准序列比对分析，对... 通过对副溶血性弧菌16S rRNA基因序列进行深度分析，研究其序列变异特点，为开发新的分型溯源靶点奠定基础。对111株分离自生鲜水产品的副溶血性弧菌16S rRNA基因测序，与GenBank中已有的副溶血性弧菌16S rRNA基因标准序列比对分析，对变异度比较大的序列建立了系统发育树，深入分析了基因的变异规律，并使用ERIC-PCR方法加以验证。不同副溶血性弧菌菌株16S rRNA基因变异主要集中在可变区V1和V2区，50-270 bp的区域内有38个碱基的相似度小于30%，103个碱基的相似度在30%-100%。另外，在V3区和V8区也各有1个碱基有比较明显的差异。副溶血性弧菌16S rRNA基因序列具有一定的变异性，该结果为副溶血性弧菌菌株分型溯源分析提供新的靶点奠定研究基础，同时为其微进化研究奠定理论基础。 展开更多
关键词 副溶血性弧菌 16SrRNA基因序列 ERIC-PCR聚类分析 变异规律分析
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