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利用16S~23S rDNA间隔序列对葡萄酒中的酒酒球菌的鉴定 被引量:1
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作者 周利国 刘树文 +1 位作者 李西柱 王坐京 《酿酒科技》 2009年第5期39-41,共3页
对从宁夏银川地区自然发酵的葡萄酒中分离得到30株菌株,并对菌株进行分子鉴定、生理生化鉴定和酿酒适应性的筛选。从中优选出4株菌株,对筛选出的4株菌株分别进行了PCR扩增,得到它们的16S~23SrDNAITS片段,并测定所得到片段的DNA序列。... 对从宁夏银川地区自然发酵的葡萄酒中分离得到30株菌株,并对菌株进行分子鉴定、生理生化鉴定和酿酒适应性的筛选。从中优选出4株菌株,对筛选出的4株菌株分别进行了PCR扩增,得到它们的16S~23SrDNAITS片段,并测定所得到片段的DNA序列。将测定结果与GenBankDNA数据库已知的菌种对比,确定4株菌株均为酒酒球菌。 展开更多
关键词 微生物 菌株鉴定 16s^23s rDNA间隔序列 PCR 葡萄酒 酒酒球菌
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基于末端产物和基因序列的SRB菌系统发育分析
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作者 赵立军 魏利 +2 位作者 马放 李芬 张建祺 《哈尔滨工业大学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2008年第12期1965-1968,共4页
为实现细菌的多相分类,应用Hungate厌氧技术,从大庆油田采出液中分离到8株硫酸盐还原菌.通过对菌株的气相色谱末端产物测定,16S rDNA、16S~23S rDNA间隔区(ISR)序列克隆进行菌株的系统发育分析.结果表明:8株菌分别属于Salmonella(D2、... 为实现细菌的多相分类,应用Hungate厌氧技术,从大庆油田采出液中分离到8株硫酸盐还原菌.通过对菌株的气相色谱末端产物测定,16S rDNA、16S~23S rDNA间隔区(ISR)序列克隆进行菌株的系统发育分析.结果表明:8株菌分别属于Salmonella(D2、I7)、Clostridium(F4、D10、H1)、Anaerofilum(A8、A18)、Enterobacter(E1).聚类分析表明,菌株的ISR序列长度差异较大,包含的tRNA种类和数目不同,间隔区序列可以作为16S rDNA序列系统发育分类的一个有力的补充;气相色谱末端产物相似的菌株,亲源关系比较接近,可以作为细菌鉴定的依据;其中16S rDNA序列作为细菌分类的主要依据,对存在争议的菌株,应该结合形态、生理生化特征和ISR序列以及气相色谱末端产物等综合对其进行系统分类. 展开更多
关键词 硫酸盐还原菌 16s RDNA 16s^23s rDNA间隔区(IsR) 系统发育分析
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聚丙烯酰胺降解菌株分离及其系统发育分析 被引量:2
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作者 魏利 马放 +2 位作者 陈忠喜 刘广民 敖蕾娜日 《哈尔滨工业大学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2007年第8期1262-1265,1296,共5页
应用Hungate厌氧技术,从大庆油田采油五厂十三区聚合物配注站的母液罐中分离到一株聚丙烯酰胺降解菌株CMW,该菌株为G+,杆状,黑色圆形菌落,最适温度为38℃,最佳pH为7.8,具有硫酸盐还原功能,产H2S,严格厌氧.研究表明,该菌株能以聚丙烯酰... 应用Hungate厌氧技术,从大庆油田采油五厂十三区聚合物配注站的母液罐中分离到一株聚丙烯酰胺降解菌株CMW,该菌株为G+,杆状,黑色圆形菌落,最适温度为38℃,最佳pH为7.8,具有硫酸盐还原功能,产H2S,严格厌氧.研究表明,该菌株能以聚丙烯酰胺为唯一碳源,降解侧链,部分官能团发生改变,质量浓度为500 mg/L时菌株具有较高的聚丙烯酰胺降解能力,其溶液黏度下降效果显著.通过形态、生理生化、16S rDNA以及16S^23S rDNA间隔区序列鉴定,可能为梭菌属的新种,暂时命名为Clostridium.sticklandiiCMW(GenBank登录号为DQ011249).16S rRNA基因序列较为保守更适合属间的鉴定,16S^23S rDNA间隔区序列包含tRNAIle和tRNAAla基因,更适合属内种间鉴定. 展开更多
关键词 聚丙烯酰胺降解菌 聚丙烯酰胺 16s RDNA 16s^23s rDNA间隔区 系统发育
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羊源屎肠球菌的分离鉴定与生物学特性研究 被引量:5
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作者 温峰琴 项海涛 +3 位作者 郝宝成 邢小勇 包世俊 胡永浩 《中兽医医药杂志》 2020年第5期13-16,共4页
某养殖场羔羊突然死亡,为了查明死亡原因,采集病死羔羊病变肺脏等进行细菌的分离培养,分离到1株革兰阳性、短链状排列的球菌,在血琼脂培养基上呈β溶血。通过对该菌的16S r RNA进行扩增和序列分析,其与屎肠球菌的同源性高达99%,应用通... 某养殖场羔羊突然死亡,为了查明死亡原因,采集病死羔羊病变肺脏等进行细菌的分离培养,分离到1株革兰阳性、短链状排列的球菌,在血琼脂培养基上呈β溶血。通过对该菌的16S r RNA进行扩增和序列分析,其与屎肠球菌的同源性高达99%,应用通用引物对16S^23S rRNA的序列进行PCR扩增产生2个条带,分别为522 bp和619 bp。用Vitek 2全自动微生物分析仪鉴定为屎肠球菌,可能性为98%。该菌对万古霉素和米诺环素敏感,对青霉素、庆大霉素等药物表现耐药。结果显示,分离到的细菌为屎肠球菌,且该菌具有多重耐药性,本实验为兽医临床肠球菌的分离和鉴定提供了参考。 展开更多
关键词 屎肠球菌 16s rRNA 16s^23s rRNA 生化试验 药敏试验
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随机扩增多态性DNA技术对绿色气球菌的相关性分析
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作者 王羽 董文龙 +2 位作者 张喜庆 马红霞 高云航 《中国兽药杂志》 北大核心 2017年第12期19-23,共5页
随着分子生物学的发展,16S、23S rRNA以及16S^23S rRNA已应用于菌种鉴定。16S^23S rRNA的基因间隔区相对于前两者有较高的变异性,弥补了16S和23S rRNA保守性强,分化程度不够的缺点。本研究对7株绿色气球菌和两株屎肠球菌扩增16S^23S rRN... 随着分子生物学的发展,16S、23S rRNA以及16S^23S rRNA已应用于菌种鉴定。16S^23S rRNA的基因间隔区相对于前两者有较高的变异性,弥补了16S和23S rRNA保守性强,分化程度不够的缺点。本研究对7株绿色气球菌和两株屎肠球菌扩增16S^23S rRNA基因间隔序列。通过随机扩增多态性DNA技术分析绿色气球菌DNA,评价不同菌株间的克隆相关性及耐药性。 展开更多
关键词 绿色气球菌 16s^23s RRNA 随机扩增多态性DNA技术
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腐败醋中微生物的分离鉴定及乳酸链球菌素对其抑制作用 被引量:22
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作者 李伟丽 赵超 +3 位作者 车建途 李东乐 易武华 赵丽娟 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2015年第1期174-178,共5页
从腐败醋中分离出84株不同微生物菌株,通过对其形态学观察、革兰氏染色、16S rDNA测序,并与Gen Bank中已知序列进行比对,以及进一步测定16S^23S ITS,发现其由20株解淀粉芽孢杆菌、12株地衣芽孢杆菌、6株芽孢杆菌属1NLA3E、12株蜡样芽孢... 从腐败醋中分离出84株不同微生物菌株,通过对其形态学观察、革兰氏染色、16S rDNA测序,并与Gen Bank中已知序列进行比对,以及进一步测定16S^23S ITS,发现其由20株解淀粉芽孢杆菌、12株地衣芽孢杆菌、6株芽孢杆菌属1NLA3E、12株蜡样芽孢杆菌、4株巨大芽孢杆菌、3株短短芽孢杆菌、2株短小芽孢杆菌、11株凝结芽孢杆菌、12株类芽孢杆菌、1株耐酸乳酸菌、1株产气荚膜梭菌组成。除耐酸乳酸菌外,均为革兰氏阳性芽孢杆菌。通过管碟法和比浊法测定了乳酸链球菌素(Nisin)对以上菌株的抑菌效价,显示Nisin对腐败醋中分离得到的微生物菌株均具有明显的抑菌或杀菌活性。 展开更多
关键词 腐败醋 16s RDNA 16s^23s ITs 分离鉴定 乳酸链球菌素
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