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地黄UDP-鼠李糖:鼠李糖基转移酶基因家族的生物信息学和表达分析
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作者 周延清 李慧敏 《河南师范大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2024年第6期128-134,I0006,I0007,共9页
尿苷二磷酸鼠李糖基转移酶能将活性鼠李糖基供体转移到其糖基化受体分子上,合成鼠李糖基化的化合物.它们结构多样,活性广泛,具有药理、维持细胞结构、信号转导和化学防御及调节植物体内激素水平等重要作用.迄今,已从多种植物中分离得到... 尿苷二磷酸鼠李糖基转移酶能将活性鼠李糖基供体转移到其糖基化受体分子上,合成鼠李糖基化的化合物.它们结构多样,活性广泛,具有药理、维持细胞结构、信号转导和化学防御及调节植物体内激素水平等重要作用.迄今,已从多种植物中分离得到这类酶,但有关其基因家族的结构特性与在植物次生代谢产物毛蕊花糖苷生物合成中的作用研究较少.以地黄尿苷二磷酸鼠李糖基转移酶基因(RgURT)家族的4个成员RgURT1~RgURT4为材料,利用生物信息学对该家族的特征进行了分析,比较了RgURT在高、低毛蕊花糖苷地黄品种块根中的表达模式.结果表明,其cDNA大小为645~1 422 bp,编码蛋白质分子量为24.05~53.24 kDa,由214~473个氨基酸残基组成,属于糖基转移酶GT-B型超家族,C端具有保守结构域盒(PSPG盒),无信号肽,亚细胞定位在细胞质中,二级结构以无规则卷曲和α-螺旋为主;RgURT4与RgURT1~RgURT3分别聚类为2个簇,RgURT4蛋白与其他3个URT蛋白序列之间的同源性低;RT-qPCR分析表明,RgURT基因在高毛蕊花糖苷地黄块根中的表达量高于低毛蕊花糖苷地黄块根中的表达量.研究首次揭示了地黄RgURT家族的特征,初步验证了RgURT与地黄毛蕊花糖苷合成相关,将为进一步研究毛蕊花糖苷合成提供了重要酶基因. 展开更多
关键词 鼠李糖基转移酶 地黄 RgURT家族的特征 PSPG盒
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马铃薯块茎糖基转移酶基因的克隆及其RNAi载体的构建 被引量:3
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作者 王旺田 张金文 +3 位作者 王蒂 张俊莲 司怀军 陶士珩 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第11期1926-1934,共9页
为探讨鼠李糖基转移酶(rhamnosyltransferase,sgt3)基因与类固醇糖苷生物碱(steroidal glycoalkaloid,SGAs)合成关系,揭示sgt3基因在SGAs合成中的作用,本研究根据GenBank No:DQ266437保守区设计特异引物,通过RT-PCR技术获得马铃薯块... 为探讨鼠李糖基转移酶(rhamnosyltransferase,sgt3)基因与类固醇糖苷生物碱(steroidal glycoalkaloid,SGAs)合成关系,揭示sgt3基因在SGAs合成中的作用,本研究根据GenBank No:DQ266437保守区设计特异引物,通过RT-PCR技术获得马铃薯块茎sgt3相似基因;采用生物信息学相关软件分析,预测sgt3相似基因cDNA序列编码的蛋白质结构和功能,构建基于sgt3基因的植物干扰表达载体。结果表明,克隆的sgt3相似基因与报道的sgt3基因序列相似性达到99.54%,其ORF长为1500bp,编码505个氨基酸残基,具有UDPG糖基转移酶保守结构域及许多重要功能位点;三级结构预测表明,该氨基酸同糖基转移酶单体结构模型相似,为糖基转移酶家族成员,表明可能具有合成类固醇糖苷生物碱功能,基因序列已注册到GenBank,序列登录号为HM188447。以此为靶序列,构建由Actin启动子和CIPP启动子驱动的与sgt1和sgt2基因相似度高的含有sgt3基因序列的干扰表达载体,将为糖苷生物碱的合成、代谢的进一步研究及低糖苷生物碱转基因马铃薯品种的培育奠定基础。 展开更多
关键词 马铃薯 鼠李糖基转移酶 基因克隆 序列分析 RNAI载体
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野菊黄酮类化合物含量综合分析:种质差异性、组织分布和发育阶段变化
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作者 廖家豪 张海琼 +3 位作者 秦志伟 王旭 刘义飞 张景景 《世界科学技术-中医药现代化》 北大核心 2025年第6期1546-1554,共9页
目的旨在探究野菊中黄酮类化合物含量的种质差异性、组织分布特征以及发育阶段的变化,以期为野菊花药材的质量控制和资源的可持续开发提供科学依据。方法采用高效液相色谱法对不同种质、不同组织和不同发育阶段的野菊花样品中的五种主... 目的旨在探究野菊中黄酮类化合物含量的种质差异性、组织分布特征以及发育阶段的变化,以期为野菊花药材的质量控制和资源的可持续开发提供科学依据。方法采用高效液相色谱法对不同种质、不同组织和不同发育阶段的野菊花样品中的五种主要黄酮化合物(蒙花苷、田蓟苷、木犀草苷、芹菜素、金合欢素)进行了定量分析,并利用实时荧光定量PCR(Real-time quantitative,qPCR)技术评估了鼠李糖基转移酶(Rhamnosyltransferase,RhaT)基因在不同发育阶段的相对表达水平。结果不同种质的野菊花在黄酮类化合物的积累上表现出显著差异,其中药材指标成分蒙花苷在湖北二倍体中含量最高。在组织方面,叶片、花蕾和花朵中的黄酮类化合物含量显著高于茎和根。在发育阶段方面,蒙花苷和田蓟苷在花蕾期达到峰值后逐渐下降,而芹菜素和金合欢素的含量则随花朵发育而增加。qPCR分析进一步显示,RhaT基因的表达水平与蒙花苷的积累模式呈现出高度一致性。结论本研究结果揭示了野菊中黄酮类化合物含量受到种质、组织类型和发育阶段的显著影响,为野菊花药材的质量评价和资源的合理开发提供了重要的数据支持。 展开更多
关键词 野菊 种质资源 黄酮类成分 鼠李糖基转移酶
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马铃薯sgt3基因启动子克隆及其功能鉴定 被引量:2
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作者 魏桂民 李德文 +4 位作者 罗莉斯 王少铭 王军 张金文 王蒂 《甘肃农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第5期32-38,共7页
【目的】克隆马铃薯茄啶鼠李糖基转移酶基因(sgt3)的启动子序列并对其进行功能鉴定.【方法】采用染色体步移技术(genome walking)进行启动子的克隆,构建了该启动子驱动报告基因gfp::gus的植物双元表达载体p1304sgt3p,以pCAMBIA1304为阳... 【目的】克隆马铃薯茄啶鼠李糖基转移酶基因(sgt3)的启动子序列并对其进行功能鉴定.【方法】采用染色体步移技术(genome walking)进行启动子的克隆,构建了该启动子驱动报告基因gfp::gus的植物双元表达载体p1304sgt3p,以pCAMBIA1304为阳性对照表达载体,采用农杆菌介导的烟草叶片瞬时表达及稳定遗传转化,结合GUS组织化学染色对其进行功能鉴定.【结果】电泳图表明为1条长约2 500bp的特异扩增条带,瞬时表达和稳定遗传表达的烟草叶片的GUS组织化学染色结果均显示gus基因在转化烟草叶片中高效表达,并且低于阳性对照,非转化烟草叶片中无表达.【结论】成功克隆到sgt3基因起始密码子上游2392bp的启动子序列并且该启动子具有活性. 展开更多
关键词 马铃薯 茄啶鼠李糖基转移酶 启动子克隆 功能鉴定
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