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海南鼠戊型肝炎病毒基因遗传进化分析
1
作者
汤婷
田秀颖
+6 位作者
邓宛心
李子涵
杨聘
雷胜
杜江
尹飞飞
崔秀吉
《海南医学院学报》
CAS
北大核心
2024年第20期1521-1526,共6页
目的:戊型肝炎病毒(hepatitis E virus,HEV)属于戊型肝炎病毒科(Hepeviridae),包括四个属,即HEV-A、-B、-C和-D。HEV是一种正单链,长约7 kb的裸露RNA病毒,可以引起急、慢性戊型肝炎,特别是孕妇感染HEV后死亡率较高。目前,普遍认为只有HE...
目的:戊型肝炎病毒(hepatitis E virus,HEV)属于戊型肝炎病毒科(Hepeviridae),包括四个属,即HEV-A、-B、-C和-D。HEV是一种正单链,长约7 kb的裸露RNA病毒,可以引起急、慢性戊型肝炎,特别是孕妇感染HEV后死亡率较高。目前,普遍认为只有HEV-A对人类具有致病性。然而,近期在中国香港、西班牙和中非等地区陆续报告由HEV-C,即鼠戊型肝炎病毒感染引起的戊型肝炎病例,说明HEV-C也是一种人兽共患病毒,可传染于人类。在前期工作中,课题组从海南省澄迈县捕获的褐家鼠粪便中检测到了HEV-C基因部分片段。为进一步了解海南HEV-C基因分子特征,本研究中扩增了HEV-C全长基因,并对其进行了系统发育分析。方法:使用Trizol试剂从海南省澄迈县捕获的褐家鼠粪便中分离HEV RNA,并利用Oligo dT引物进一步转录合成cDNA。接着用PCR方法扩增HEV的四个ORF区,并用Sanger法测序,拼接全长HEV基因。利用MEGA X软件的Clustal W方法与参考序列进行比对,并构建系统进化树。结果:通过系统进化树分析发现本研究中扩增的HEV-C为C1型,与广东省湛江市褐家鼠中发现的HEV-C1(基因号:LC549184)的同源性是93.1%,但与我国云南省、香港特别行政区和湖北省等地区的同源性比较远,分别为65.7%、65.9%、85.4%。结论:本研究首次针对海南省褐家鼠携带HEV-C1全长基因进行了系统进化分析。该研究结果提示海南省存在HEV-C的鼠-人传播的潜在风险。因此,应继续控制鼠类的同时,也应预防鼠HEV传染人类的风险。
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关键词
肝炎
啮齿类动物
鼠戊型肝炎病毒
海南
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题名
海南鼠戊型肝炎病毒基因遗传进化分析
1
作者
汤婷
田秀颖
邓宛心
李子涵
杨聘
雷胜
杜江
尹飞飞
崔秀吉
机构
海南医学院
中国医学科学院病原生物学研究所
出处
《海南医学院学报》
CAS
北大核心
2024年第20期1521-1526,共6页
基金
海南省自然科学基金重点研发项目(ZDYF2024SHFZ119)。
文摘
目的:戊型肝炎病毒(hepatitis E virus,HEV)属于戊型肝炎病毒科(Hepeviridae),包括四个属,即HEV-A、-B、-C和-D。HEV是一种正单链,长约7 kb的裸露RNA病毒,可以引起急、慢性戊型肝炎,特别是孕妇感染HEV后死亡率较高。目前,普遍认为只有HEV-A对人类具有致病性。然而,近期在中国香港、西班牙和中非等地区陆续报告由HEV-C,即鼠戊型肝炎病毒感染引起的戊型肝炎病例,说明HEV-C也是一种人兽共患病毒,可传染于人类。在前期工作中,课题组从海南省澄迈县捕获的褐家鼠粪便中检测到了HEV-C基因部分片段。为进一步了解海南HEV-C基因分子特征,本研究中扩增了HEV-C全长基因,并对其进行了系统发育分析。方法:使用Trizol试剂从海南省澄迈县捕获的褐家鼠粪便中分离HEV RNA,并利用Oligo dT引物进一步转录合成cDNA。接着用PCR方法扩增HEV的四个ORF区,并用Sanger法测序,拼接全长HEV基因。利用MEGA X软件的Clustal W方法与参考序列进行比对,并构建系统进化树。结果:通过系统进化树分析发现本研究中扩增的HEV-C为C1型,与广东省湛江市褐家鼠中发现的HEV-C1(基因号:LC549184)的同源性是93.1%,但与我国云南省、香港特别行政区和湖北省等地区的同源性比较远,分别为65.7%、65.9%、85.4%。结论:本研究首次针对海南省褐家鼠携带HEV-C1全长基因进行了系统进化分析。该研究结果提示海南省存在HEV-C的鼠-人传播的潜在风险。因此,应继续控制鼠类的同时,也应预防鼠HEV传染人类的风险。
关键词
肝炎
啮齿类动物
鼠戊型肝炎病毒
海南
Keywords
Hepatitis
Rodents
Rat hepatitis E virus
Hainan
分类号
R373.21 [医药卫生—病原生物学]
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作者
出处
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1
海南鼠戊型肝炎病毒基因遗传进化分析
汤婷
田秀颖
邓宛心
李子涵
杨聘
雷胜
杜江
尹飞飞
崔秀吉
《海南医学院学报》
CAS
北大核心
2024
0
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