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黑素皮质激素受体1(MC1R)基因与猪的毛色 被引量:11
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作者 邓素华 黄路生 +2 位作者 高军 任军 陈克飞 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2001年第1期89-92,共4页
猪的真黑色素与褐黑色素的合成量与分布主要受控于黑素皮质激素受体 1基因。本文综述了该基因的定位、突变与多态检测 ,黑素皮质激素受体的作用机制 ,提出了对黑素皮质激素受体 1基因进一步研究的看法。
关键词 毛色 黑素皮质激素受体1基因
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4种犬科动物黑素皮质激素受体1基因序列比对及遗传进化分析 被引量:1
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作者 徐超 宋兴超 +5 位作者 岳志刚 李光玉 赵蒙 赵伟刚 魏海军 赵家平 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2014年第1期25-29,共5页
基于GenBank中已公布的家犬(Canis familiaris)、赤狐(Vulpes vulpes)、北极狐(Alopex lagopus)和貉(Nyctereutes procyonoides)黑素皮质激素受体1(MC1R)基因序列,利用BioEdit 7.0等生物信息软件,对4种犬科动物MC1R基因进行序列比对和... 基于GenBank中已公布的家犬(Canis familiaris)、赤狐(Vulpes vulpes)、北极狐(Alopex lagopus)和貉(Nyctereutes procyonoides)黑素皮质激素受体1(MC1R)基因序列,利用BioEdit 7.0等生物信息软件,对4种犬科动物MC1R基因进行序列比对和遗传进化分析。结果表明,家犬、赤狐、北极狐及貉MC1R基因为单一外显子,编码区序列长度均为954bp,碱基组成表现为C>G>T>A,且G+C百分含量高于A+T;编码区碱基序列中共检测到20个突变位点,包括16个单一突变和4个简约突变,转换类型多于颠换,核苷酸和氨基酸序列同源性较高;赤狐与北极狐间的遗传距离最短,邻近法(NJ)、最小进化法(ME)和非对组算数平均法(UPGMA)3种方法构建的进化树基本一致,赤狐与北极狐首先聚为一簇,貉比家犬、赤狐和北极狐分化时间更早。 展开更多
关键词 犬科动物 黑素皮质激素受体1 序列比对 遗传进化
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美洲水貂(Neovison vison)黑素皮质激素受体-1(MC1R)基因序列鉴定及生物信息学分析 被引量:3
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作者 宋兴超 徐超 +4 位作者 岳志刚 王雷 丛波 刘琳玲 杨福合 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第5期752-759,共8页
旨在探明美洲水貂黑素皮质激素受体-1(Melanocortin-1receptor,MC1R)基因序列结构特征及其对皮毛颜色的调控机制。根据欧洲水貂MC1R基因(GenBank登录号:AB189820)核苷酸序列设计1对特异性引物,利用PCR及克隆技术测定美洲短毛黑水貂MC1R... 旨在探明美洲水貂黑素皮质激素受体-1(Melanocortin-1receptor,MC1R)基因序列结构特征及其对皮毛颜色的调控机制。根据欧洲水貂MC1R基因(GenBank登录号:AB189820)核苷酸序列设计1对特异性引物,利用PCR及克隆技术测定美洲短毛黑水貂MC1R基因完整编码区序列(CDS),并对该序列进行了BLAST比对及生物信息学预测和分析。结果表明,获得的美洲水貂MC1R基因与欧洲水貂相似性为95%,为单一外显子基因,核苷酸序列长度为1 324bp,包括部分5′UTR(188bp)、CDS(954bp)和3′UTR(182bp),编码区碱基G+C含量高达66.04%,由CDS推导共编码317个氨基酸,预测的MC1R蛋白理论分子质量为34.49ku,等电点(PI)为8.97,不稳定系数是36.63,属于弱碱性稳定蛋白质。进一步分析发现,美洲水貂MC1R基因编码的蛋白存在1个低复杂度结构域和7个典型的跨膜区,N-端不存在信号肽,定位于细胞质膜,具有典型的细胞膜受体结构。分子进化分析显示,美洲水貂与欧洲水貂亲缘关系较近,与二者均属鼬科、鼬属动物的传统动物分类学一致。美洲水貂MC1R基因的获取及序列结构特征分析为揭示其皮毛颜色多样性的分子遗传学机制奠定了详细的生物信息学基础。 展开更多
关键词 美洲水貂 黑素皮质激素受体-1基因 皮毛颜色 跨膜区 生物信息学
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斑马鱼MC1R基因克隆鉴定、生物信息学及序列变异分析
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作者 宋兴超 王莎莎 +3 位作者 王云艳 梅杰 梁正其 巴家文 《南方农业学报》 北大核心 2025年第7期2317-2327,共11页
【目的】克隆鉴定斑马鱼(Danio rerio)黑素皮质激素受体-1(Melanocortin-1 receptor,MC1R)基因编码区(Coding sequence,CDS),并进行生物信息学及序列变异分析,为开展MC1R基因生物学功能研究及揭示斑马鱼体色性状的调控机制提供基础资料... 【目的】克隆鉴定斑马鱼(Danio rerio)黑素皮质激素受体-1(Melanocortin-1 receptor,MC1R)基因编码区(Coding sequence,CDS),并进行生物信息学及序列变异分析,为开展MC1R基因生物学功能研究及揭示斑马鱼体色性状的调控机制提供基础资料。【方法】以红色、黄色和蓝色斑马鱼群体共计219个样本的肌肉组织DNA为模板,通过PCR扩增、克隆测序和拼接获得斑马鱼MC1R基因CDS序列,随后进行生物信息学分析和基因序列变异分析。【结果】获得MC1R基因全长1404 bp,CDS序列长972 bp,共编码323个氨基酸残基。MC1R蛋白含有7个跨膜结构域、4个胞外区和4个胞内区,呈典型的细胞表面受体样结构,主要定位于细胞质膜,存在4个潜在N-糖基化位点和26个磷酸化位点。斑马鱼MC1R基因与团头鲂和鱇浪白鱼的相似性较高,遗传距离最近,亲缘关系较密切。红色、黄色和蓝色斑马鱼群体共鉴定到2个变异位点,其中1个变异位点(g.334T>C)位于CDS,存在TT和TC基因型,该变异未引起氨基酸的改变,另1个变异位点位于3'-非编码区(3'-UTR)(g.276A>T),存在AA和AT基因型,且不同体色间2个变异位点g.334T>C和g.276A>T的基因型频率均一致。【结论】MC1R基因序列在不同鱼类中既具保守性,又存在一定差异,蛋白结构在不同鱼类中可能相对保守且功能类似。MC1R基因可作为开展不同鱼类系统进化关系研究的分子标记,其在红色、黄色和蓝色斑马鱼群体中较保守,存在g.276A>T和g.334T>C变异位点,且2个变异位点可能存在连锁关系。 展开更多
关键词 斑马鱼 黑素皮质激素受体-1基因(MC1R) 变异位点 体色
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真核表达载体pcDNA3.1(+)-GFP-MC1R的构建及在羊驼毛囊干细胞中的表达 被引量:3
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作者 白瑞 王振华 +3 位作者 尹志红 弓慧敏 于志慧 庞全海 《河北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第3期86-90,共5页
旨在构建含有MC1R基因的pcDNA3.1(+)真核重组表达载体,为进一步研究MC1R的生物学功能奠定基础。应用RT-PCR技术从羊驼皮肤cDNA文库中扩增MC1R基因全长cDNA,然后通过双酶切将MC1R基因全长cDNA克隆到真核表达载体pcDNA3.1(+),然后采用脂... 旨在构建含有MC1R基因的pcDNA3.1(+)真核重组表达载体,为进一步研究MC1R的生物学功能奠定基础。应用RT-PCR技术从羊驼皮肤cDNA文库中扩增MC1R基因全长cDNA,然后通过双酶切将MC1R基因全长cDNA克隆到真核表达载体pcDNA3.1(+),然后采用脂质体法转染体外培养的羊驼毛囊干细胞后,通过G418筛选培养,建立稳定的转染体系,直接荧光观察pcDNA3.1/MC1R融合蛋白在细胞中的分布定位,并通过Western Blot方法检测MC1R在羊驼毛囊干细胞中的表达。结果表明,成功构建了pcDNA3.1/MC1R重组表达载体,并且发现试验组的毛囊干细胞中表达MC1R蛋白显著高于空白组(P<0.05)。成功构建了含有绿色荧光蛋白基因的真核表达载体pcDNA3.1/MC1R,且MC1R基因在羊驼毛囊干细胞中获得表达。 展开更多
关键词 羊驼 黑素皮质激素受体1 毛囊干细胞 真核表达载体 转染
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