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猪黑皮质素受体1基因密码子偏好分析
1
作者
肖红卫
刘西梅
+5 位作者
郑新民
华文君
李莉
张立苹
毕延震
华再东
《江西农业学报》
CAS
2013年第9期95-100,共6页
遗传密码子是生命信息的基本遗传单位，每种氨基酸对应1～6个同义密码子。特定物种在长期进化中形成了适应自身基因环境的密码子使用偏好。运用CHIPS、CUPS和CodonW程序分析猪黑皮质素受体1基因密码子偏好，并与牛、羊、小鼠、人等多种...
遗传密码子是生命信息的基本遗传单位，每种氨基酸对应1～6个同义密码子。特定物种在长期进化中形成了适应自身基因环境的密码子使用偏好。运用CHIPS、CUPS和CodonW程序分析猪黑皮质素受体1基因密码子偏好，并与牛、羊、小鼠、人等多种动物的黑皮质素受体1基因密码子偏好进行比较，以期为转基因动物育种提供依据。结果表明。猪偏好使用以C、G结尾的密码子（96．88％），且在整个编码区序列中G＋C含量（67．81％）大于A＋T（32．19％），该基因在猪体内表达水平很高（CAI=0．849），并且发现，猪的密码子偏好性与牛、犬等动物类似，明显不同于纯、雀、獾、大猩猩等动物。要实现目的基因在猪MClR基因中进行定点整合并成功表达和尽可能地提高其表达量，需对目的基因的部分密码子进行改造。
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关键词
家猪
黑皮质素受体1基因
密码子偏好
聚类分析
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职称材料
大鲵MC1R基因的克隆、序列分析与表达研究
2
作者
邓捷
卫小燕
+5 位作者
张晗
马红英
王启军
赵虎
张红星
姜维
《河北渔业》
2020年第10期24-29,34,共7页
为研究MC1R在两栖动物体色形成中的作用,试验结合转录组分析和电子克隆技术得到大鲵(Andrias davidianus)MC1R部分cDNA序列并进行了生物信息学分析,采用实时荧光定量法检测了大鲵MC1R基因在皮肤、肝脏等10个组织中的表达情况及4种不同...
为研究MC1R在两栖动物体色形成中的作用,试验结合转录组分析和电子克隆技术得到大鲵(Andrias davidianus)MC1R部分cDNA序列并进行了生物信息学分析,采用实时荧光定量法检测了大鲵MC1R基因在皮肤、肝脏等10个组织中的表达情况及4种不同体色大鲵皮肤组织中MC1R基因的表达量。结果表明:得到大鲵MC1R部分cDNA长为295 bp,位于该基因编码区。其与人、小鼠等哺乳动物和鸟类MC1R核苷酸同源性在57%~83%。大鲵MC1R基因与粗皮渍螈的亲缘关系最近。该基因在不同组织中均有表达,以皮肤组织表达量最高。4种不同体色大鲵皮肤组织中,黑色皮肤中MC1R基因表达量高于其他体色。说明大鲵MC1R基因在体色形成过程中可能具有与其他两栖动物不同的调控机制。
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关键词
大鲵(Andrias
davidianus)
体色
黑
色素
黑
皮质素
受体
-1(Melanocortin-1
receptor
MC
1
R)
基因
表达
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职称材料
题名
猪黑皮质素受体1基因密码子偏好分析
1
作者
肖红卫
刘西梅
郑新民
华文君
李莉
张立苹
毕延震
华再东
机构
湖北省农业科学院
出处
《江西农业学报》
CAS
2013年第9期95-100,共6页
基金
转基因生物新品种培育重大专项(2011ZX08006-002
2011ZX08010-3
+2 种基金
2011ZX08006-003
2011ZX08011-030B)
动物胚胎工程及分子育种湖北省重点实验室开放课题(2012ZD121)
文摘
遗传密码子是生命信息的基本遗传单位，每种氨基酸对应1～6个同义密码子。特定物种在长期进化中形成了适应自身基因环境的密码子使用偏好。运用CHIPS、CUPS和CodonW程序分析猪黑皮质素受体1基因密码子偏好，并与牛、羊、小鼠、人等多种动物的黑皮质素受体1基因密码子偏好进行比较，以期为转基因动物育种提供依据。结果表明。猪偏好使用以C、G结尾的密码子（96．88％），且在整个编码区序列中G＋C含量（67．81％）大于A＋T（32．19％），该基因在猪体内表达水平很高（CAI=0．849），并且发现，猪的密码子偏好性与牛、犬等动物类似，明显不同于纯、雀、獾、大猩猩等动物。要实现目的基因在猪MClR基因中进行定点整合并成功表达和尽可能地提高其表达量，需对目的基因的部分密码子进行改造。
关键词
家猪
黑皮质素受体1基因
密码子偏好
聚类分析
Keywords
Pig
MC
1
R gene
Codon bias
Clustering analysis
分类号
S828 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
大鲵MC1R基因的克隆、序列分析与表达研究
2
作者
邓捷
卫小燕
张晗
马红英
王启军
赵虎
张红星
姜维
机构
陕西省动物研究所
西安市临潼区骊山畜牧兽医站
出处
《河北渔业》
2020年第10期24-29,34,共7页
基金
陕西省科学院科技计划项目“大鲵体色性状相关基因克隆表达、序列特征及SNP分析”(2014K-19)
陕西省科学院重点项目“秦巴山区大鲵种质资源调查与遗传多样性分析”(2015K-03)。
文摘
为研究MC1R在两栖动物体色形成中的作用,试验结合转录组分析和电子克隆技术得到大鲵(Andrias davidianus)MC1R部分cDNA序列并进行了生物信息学分析,采用实时荧光定量法检测了大鲵MC1R基因在皮肤、肝脏等10个组织中的表达情况及4种不同体色大鲵皮肤组织中MC1R基因的表达量。结果表明:得到大鲵MC1R部分cDNA长为295 bp,位于该基因编码区。其与人、小鼠等哺乳动物和鸟类MC1R核苷酸同源性在57%~83%。大鲵MC1R基因与粗皮渍螈的亲缘关系最近。该基因在不同组织中均有表达,以皮肤组织表达量最高。4种不同体色大鲵皮肤组织中,黑色皮肤中MC1R基因表达量高于其他体色。说明大鲵MC1R基因在体色形成过程中可能具有与其他两栖动物不同的调控机制。
关键词
大鲵(Andrias
davidianus)
体色
黑
色素
黑
皮质素
受体
-1(Melanocortin-1
receptor
MC
1
R)
基因
表达
Keywords
giant salamander(Andrias davidianus)
body color
melanin
MC
1
R gene
tissue expression
分类号
Q959.9 [生物学—动物学]
Q78 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
猪黑皮质素受体1基因密码子偏好分析
肖红卫
刘西梅
郑新民
华文君
李莉
张立苹
毕延震
华再东
《江西农业学报》
CAS
2013
0
在线阅读
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职称材料
2
大鲵MC1R基因的克隆、序列分析与表达研究
邓捷
卫小燕
张晗
马红英
王启军
赵虎
张红星
姜维
《河北渔业》
2020
0
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已选择
0
条
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参考文献
引证文献
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