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基于全基因组测序技术分析扬州市黄金海岸沙门氏菌病原学特征
1
作者
徐娅雯
王艳
+3 位作者
许蓉蓉
陆荣荣
英航宁
周乐
《中国人兽共患病学报》
北大核心
2025年第6期597-602,共6页
目的分析扬州市黄金海岸沙门氏菌分离株的病原学及基因组特征。方法对2017—2023年扬州地区食源性疾病监测和健康人群体检中分离的黄金海岸沙门氏菌进行复核鉴定、抗生素敏感性实验和全基因组测序,结合CRISPR分型与单核苷酸多态性系统...
目的分析扬州市黄金海岸沙门氏菌分离株的病原学及基因组特征。方法对2017—2023年扬州地区食源性疾病监测和健康人群体检中分离的黄金海岸沙门氏菌进行复核鉴定、抗生素敏感性实验和全基因组测序,结合CRISPR分型与单核苷酸多态性系统进化分析,解析其耐药表型与基因型的关联。结果共检出8株黄金海岸沙门氏菌,检出2~7类抗生素抗性基因。所有菌株的parC基因均存在T57S突变位点。50%(4/8)的菌株携带磺胺类耐药基因sul1或sul3;37.5%(3/8)检出超广谱β-内酰胺酶基因(bla_(CTX-M-55)、bla_(TEM-1))。多位点序列分型结果显示ST358(5株)与ST2529(3株)为优势型别,分别对应CRISPRⅠ群与Ⅱ群。SNP进化分析表明,病例分离株Sal-2214与多地区分离株亲缘关系密切(SNP差异≤20),提示跨地区传播可能。1株4岁腹泻儿童粪便分离株Sal-2214携带β-内酰胺类耐药基因(bla_(CTX-M-55)),对头孢噻肟(CTX)和头孢他啶(CAZ)呈高水平。结论自2022年起,扬州市开始出现黄金海岸沙门氏菌,呈现多重耐药特征,且存在与沿海地区菌株的遗传关联,需加强耐药监测及溯源研究。
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关键词
黄金海岸沙门氏菌
多重耐药
全基因组测序
CRISPR分型
单核苷酸多态性
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题名
基于全基因组测序技术分析扬州市黄金海岸沙门氏菌病原学特征
1
作者
徐娅雯
王艳
许蓉蓉
陆荣荣
英航宁
周乐
机构
扬州市疾病预防控制中心
出处
《中国人兽共患病学报》
北大核心
2025年第6期597-602,共6页
基金
江苏省预防医学科研课题面上项目(No.Ym2023040)
扬州市卫生健康委科研项目(No.2023-2-33)
扬州市疾病预防控制中心本级课题(No.YZJK2023-3)。
文摘
目的分析扬州市黄金海岸沙门氏菌分离株的病原学及基因组特征。方法对2017—2023年扬州地区食源性疾病监测和健康人群体检中分离的黄金海岸沙门氏菌进行复核鉴定、抗生素敏感性实验和全基因组测序,结合CRISPR分型与单核苷酸多态性系统进化分析,解析其耐药表型与基因型的关联。结果共检出8株黄金海岸沙门氏菌,检出2~7类抗生素抗性基因。所有菌株的parC基因均存在T57S突变位点。50%(4/8)的菌株携带磺胺类耐药基因sul1或sul3;37.5%(3/8)检出超广谱β-内酰胺酶基因(bla_(CTX-M-55)、bla_(TEM-1))。多位点序列分型结果显示ST358(5株)与ST2529(3株)为优势型别,分别对应CRISPRⅠ群与Ⅱ群。SNP进化分析表明,病例分离株Sal-2214与多地区分离株亲缘关系密切(SNP差异≤20),提示跨地区传播可能。1株4岁腹泻儿童粪便分离株Sal-2214携带β-内酰胺类耐药基因(bla_(CTX-M-55)),对头孢噻肟(CTX)和头孢他啶(CAZ)呈高水平。结论自2022年起,扬州市开始出现黄金海岸沙门氏菌,呈现多重耐药特征,且存在与沿海地区菌株的遗传关联,需加强耐药监测及溯源研究。
关键词
黄金海岸沙门氏菌
多重耐药
全基因组测序
CRISPR分型
单核苷酸多态性
Keywords
Salmonella enterica serovar Goldcoast
multidrug resistance
Whole Genome Sequencing
CRISPR typing
single nucleotide polymorphism
分类号
R378.2 [医药卫生—病原生物学]
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作者
出处
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1
基于全基因组测序技术分析扬州市黄金海岸沙门氏菌病原学特征
徐娅雯
王艳
许蓉蓉
陆荣荣
英航宁
周乐
《中国人兽共患病学报》
北大核心
2025
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